# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ph00195.fasta.huge -Q ../query/KIAA0606.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0606, 1369 aa vs ./tmplib.23663 library 1986136 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2112+/-0.00911; mu= 6.8590+/- 0.622 mean_var=351.8359+/-83.335, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.068376 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 2002 212.6 3.6e-55 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 425 56.5 1.6e-08 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 334 48.2 1.4e-05 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 240 38.2 0.0046 >>KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258 aa) initn: 2843 init1: 1096 opt: 2002 Z-score: 1082.4 bits: 212.6 E(): 3.6e-55 Smith-Waterman score: 4064; 51.399% identity (75.380% similar) in 1251 aa overlap (122-1350:86-1250) 100 110 120 130 140 150 KIAA06 AAAVAPGGLQSTPGRSGVTAEKAPPPPPPPTLYVQLHGETTRRLEAEEKPLQIQNDYLFQ .::.::::. .:::: :.:::: ::: . 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