# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj00933.fasta.huge -Q ../query/KIAA0584.ptfa ./tmplib.23663 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0584, 738 aa
 vs ./tmplib.23663 library

1986767 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4248+/-0.00814; mu= 6.4360+/- 0.555
 mean_var=273.6340+/-66.118, 0's: 0 Z-trim: 1  B-trim: 136 in 1/39
 Lambda= 0.077533

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA1502  ( 560 res)   hk02042                     ( 560) 1938 230.3   4e-61


>>KIAA1502  ( 560 res)   hk02042                          (560 aa)
 initn: 1927 init1: 1543 opt: 1938  Z-score: 1189.3  bits: 230.3 E(): 4e-61
Smith-Waterman score: 1938;  54.361% identity (80.325% similar) in 493 aa overlap (202-694:67-558)

             180       190       200       210       220       230 
KIAA05 LARNAAHTLPHFLGCLERLDYPKSRMAIWAATDHNVDNTTEIFREWLKNVQRLYHYVEWR
                                     :::::::::::...:::  :   :  : ::
KIAA15 KVLVLWGQGCLGVQSCGCAPSAFFLPVPRCATDHNVDNTTEMLQEWLAAVGDDYAAVVWR
         40        50        60        70        80        90      

             240       250       260       270       280       290 
KIAA05 PMDEPESYPDEIGPKHWPTSRFAHVMKLRQAALRTAREKWSDYILFIDVDNFLTNPQTLN
       :  ::. :::: :::::   :   .:.:.: ::  ::.  .::::: :.::.::: ::: 
KIAA15 PEGEPRFYPDEEGPKHWTKERHQFLMELKQEALTFARNWGADYILFADTDNILTNNQTLR
        100       110       120       130       140       150      

             300       310       320       330       340       350 
KIAA05 LLIAENKTIVAPMLESRGLYSNFWCGITPKGFYKRTPDYVQIREWKRTGCFPVPMVHSTF
       ::....  .:::::.:.  ::::::::::.:.:.:: .:   .. .: ::: ::::::::
KIAA15 LLMGQGLPVVAPMLDSQTYYSNFWCGITPQGYYRRTAEYFPTKNRQRRGCFRVPMVHSTF
        160       170       180       190       200       210      

             360       370       380       390       400       410 
KIAA05 LIDLRKEASDKLTFYPPHQDYTWTFDDIIVFAFSSRQAGIQMYLCNREHYGYLPIPLKPH
       : .:: :..:.:.::::: .::: ::::::::.. . ::.....::...:::. .:.: :
KIAA15 LASLRAEGADQLAFYPPHPNYTWPFDDIIVFAYACQAAGVSVHVCNEHRYGYMNVPVKSH
        220       230       240       250       260       270      

             420       430       440       450       460       470 
KIAA05 QTLQEDIENLIHVQIEAMIDRPPMEPSQYVSVVPKYPDKMGFDEIFMINLKRRKDRRDRM
       : :...  :.::. .::..: : :. : .:.   : :.:.::::.:.:.: :: :::.::
KIAA15 QGLEDERVNFIHLILEALVDGPRMQASAHVTRPSKRPSKIGFDEVFVISLARRPDRRERM
        280       290       300       310       320       330      

             480       490       500       510       520       530 
KIAA05 LRTLYEQEIEVKIVEAVDGKALNTSQLKALNIEMLPGYRDPYSSRPLTRGEIGCFLSHYS
       : .:.:.::  ..:.::::  ::.: .. :....::::.::::.: ::.::.::::::::
KIAA15 LASLWEMEISGRVVDAVDGWMLNSSAIRNLGVDLLPGYQDPYSGRTLTKGEVGCFLSHYS
        340       350       360       370       380       390      

             540       550       560       570       580       590 
KIAA05 VWKEVIDRELEKTLVIEDDVRFEHQFKKKLMKLMDNIDQAQLDWELIYIGRKRMQVKEPE
       .:.::. : : ..::.::::::: .:. .: .::....  .:.:.:::.:::...  : :
KIAA15 IWEEVVARGLARVLVFEDDVRFESNFRGRLERLMEDVEAEKLSWDLIYLGRKQVN-PEKE
        400       410       420       430       440       450      

             600       610       620       630       640       650 
KIAA05 KAVPNVANLVEADYSYWTLGYVISLEGAQKLVGANPFGKMLPVDEFLPVMYNKHPVAEYK
        :: .. .:: : ::::::.:.. : ::.::....:. .:::::::::.:...::  .::
KIAA15 TAVEGLPGLVVAGYSYWTLAYALRLAGARKLLASQPLRRMLPVDEFLPIMFDQHPNEQYK
         460       470       480       490       500       510     

             660       670       680       690       700       710 
KIAA05 EYYESRDLKAFSAEPLLIYPTHYTGQPGYLSDTETSTIWDNETVATDWDRTHAWKSRKQS
        ..  ::: ::::.:::  ::::.:.  .:::::::. ::...                 
KIAA15 AHFWPRDLVAFSAQPLLAAPTHYAGDAEWLSDTETSSPWDDDSGR               
         520       530       540       550       560               

             720       730        
KIAA05 RIYSNAKNTEALPPPTSLDTVPSRDEL




738 residues in 1 query   sequences
1986767 residues in 2037 library sequences
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]