# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pf10976.fasta.huge -Q ../query/KIAA0581.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0581, 1218 aa vs ./tmplib.23663 library 1986287 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6995+/-0.00915; mu= -6.5191+/- 0.615 mean_var=355.3169+/-93.551, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 80 in 1/39 Lambda= 0.068040 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1516 ( 2304 res) fh10631s2 (2304) 627 77.1 3.6e-14 KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182) 612 75.3 6.4e-14 KIAA1092 ( 1154 res) hk04417 (1154) 561 70.3 2e-12 KIAA1069 ( 787 res) hj05486 ( 787) 509 65.0 5.4e-11 KIAA1964 ( 757 res) ph00746 ( 757) 505 64.5 7e-11 >>KIAA1516 ( 2304 res) fh10631s2 (2304 aa) initn: 705 init1: 245 opt: 627 Z-score: 346.2 bits: 77.1 E(): 3.6e-14 Smith-Waterman score: 939; 27.668% identity (55.337% similar) in 965 aa overlap (271-1068:1346-2289) 250 260 270 280 290 300 KIAA05 YLTVDQMMDFINLKQRDPRLNEILYPPLKQEQVQVLIEKYEPNNSLARKGQISVDGFMRY ... .:.:.::. :. ..: .: .:: :. 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KIAA15 P-QQRKMAEIFKTVFGEKLVTKFLFETDFSDDPMLPSPDQLRKKVLLKNKKLKAHQTPVD 1500 1510 1520 1530 1540 1550 480 490 500 510 KIAA05 SGKKKLSEQAS---NTYSDSSSMFEPSSPGAGEA-------DTESDDDD----------- :.: . :: ..:. ... .:.. : : :: .:: KIAA15 ILKQKAHQLASMQVQAYNGGNANPRPANNEEEEDEEDEYDYDYESLSDDNILEDRPENKS 1560 1570 1580 1590 1600 1610 520 530 540 KIAA05 --------------------DDDDCKKSS-----------MDEGTAGSEAMATEEMSNLV :.. :.:.. .:.. :. .: : .:.:: KIAA15 CNDKLQFEYNEEIPKRIKKADNSACNKGKVYDMELGEEFYLDQNKKESRQIAPE-LSDLV 1620 1630 1640 1650 1660 1670 550 560 570 KIAA05 NYIQPVKFESFEI----------SKKRNKSF-----------EMSSFVET------KGLE : : ::: .. .: ::. : .:: .: .:.. KIAA15 IYCQAVKFPGLSTLNASGSSRGKERKSRKSIFGNNPGRMSPGETASFNKTSGKSSCEGIR 1680 1690 1700 1710 1720 1730 580 590 600 KIAA05 QL---TKSPV-----------------------------------EFVEYNKMQLSRIYP : ..::. ...... :: : :: KIAA15 QTWEESSSPLNPTTSLSAIIRTPKCYHISSLNENAAKRLCRRYSQKLTQHTACQLLRTYP 1740 1750 1760 1770 1780 1790 610 620 630 640 650 660 KIAA05 KGTRVDSSNYMPQLFWNAGCQMVALNFQTMDLAMQINMGMYEYNGKSGYRLKPEFMRRPD .::.:::: : .:: : :.::::.:: :: ...: .:.: :: :: ::: . . KIAA15 AATRIDSSNPNPLMFWLHGIQLVALNYQTDDLPLHLNAAMFEANGGCGYVLKPPVLWDKN 1800 1810 1820 1830 1840 1850 670 680 690 700 710 KIAA05 ----KHFDPFTEGIVDGIVANTLSVKIISGQFLS-DKKVGTY-VEVDMFGLPVDTRRKAF ..:.:. : .:.. . :. :.::: . ....:. .:::..:.:.:. . : KIAA15 CPMYQKFSPL-ERDLDSMDPAVYSLTIVSGQNVCPSNSMGSPCIEVDVLGMPLDSCH--F 1860 1870 1880 1890 1900 720 730 740 750 760 770 KIAA05 KTKTSQGNAVNPVWEEEPIVFKKVVLPTLACLRIAVYEEGGKFI-GHRILPVQAIRPGYH .:: . :..::.:.:. ..:. : . :. ::.:: :.... . ..::.:..:.. ::. KIAA15 RTKPIHRNTLNPMWNEQ-FLFR-VHFEDLVFLRFAVVENNSSAVTAQRIIPLKALKRGYR 1910 1920 1930 1940 1950 1960 780 790 800 810 820 KIAA05 YICLRNERNQPLTLPAVFVYIEVKDYVPDTYADVIEALS--NPIRYVNLMEQR------- .. ::: .:. : . ..: :. . . .. .... : : : . :. .: KIAA15 HLQLRNLHNEVLEISSLF--INSRRMEENSSGNTMSASSMFNTEERKCLQTHRVTVHGVP 1970 1980 1990 2000 2010 2020 830 840 850 860 KIAA05 ---------------AKQLAALTLEDEEEVKKEA------DPGETPSEAPSEARTTPAEN :::: : .:...: . . :. .: : : . KIAA15 GPEPFTVFTINGGTKAKQLLQQILTNEQDIKPVTTDYFLMEEKYFISKEKNECRKQPFQR 2030 2040 2050 2060 2070 2080 870 880 890 900 910 920 KIAA05 GVNHTTTLTPKPPSQALHSQPAPGSVKAPAKTEDLIQSVLTEVEAQTIEELKQQKSFVKL ... . . :. . . : . .. :.: .. ... . ..: .... ::.. KIAA15 AIGPEEEIM-QILSSWFPEEGYMGRIVLKTQQENLEEKNIVQDDKEVILSSEEESFFVQV 2090 2100 2110 2120 2130 2140 930 940 950 960 970 KIAA05 QKKHYKEMKDLVKRHHKKTT-DLIKEHTTK----YNEIQNDYLRRRAALEKSAKKDSKKK . .. . ..: . .:. :.:.. : :. ..: . ::. .: ..:: KIAA15 HDVSPEQPRTVIKAPRVSTAQDVIQQTLCKAKYSYSILSNPNPSDYVLLEEVVKDTTNKK 2150 2160 2170 2180 2190 2200 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA05 SEPSSPDHGSSTIEQDLAALDAEMTQKLIDLKDKQQQQLLNLRQEQYYSEKYQKREHIKL . ..: .. .. .. ...:. : . .:.:. :: . . .:.. :.. KIAA15 T--TTPKSSQRVLLDQECVFQAQSKWK------GAGKFILKLK-EQVQASREDKKKGISF 2210 2220 2230 2240 2250 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA05 L--IQKLTDVAEECQN----NQLKKLKEICEKEKKELKKKMDKKRQEKITEAKSKDKSQM ..::: ... .. .:: . : ::.: KIAA15 ASELKKLTKSTKQPRGLTSPSQLLTSESIQTKEEKPVGGLSSSDTMDYRQ 2260 2270 2280 2290 2300 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA05 EEEKTEMIRSYIQEVVQYIKRLEEAQSKRQEKLVEKHKEIRQQILDEKPKLQVELEQEYQ >>KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182 aa) initn: 865 init1: 355 opt: 612 Z-score: 341.7 bits: 75.3 E(): 6.4e-14 Smith-Waterman score: 1095; 30.540% identity (57.635% similar) in 871 aa overlap (43-799:82-909) 20 30 40 50 60 70 KIAA05 LQLKPVCVSDSLKKGTKFVKWDDDSTIVTPIILRTDPQGFF-FYWTDQNKETELLDLSLV . :: .:. ::. :... KIAA04 PAMEEPGPPGGLSQDQVERCMGAMQEGMQMVKLRGGSKGLVRFYYLDEHRSCIRW----- 60 70 80 90 100 80 90 100 110 120 KIAA05 KDARCGRHAKAPKDPKLRELLDVGNIGRLEQRMITVVYGPD----LVNISH---LNLVAF . .: ...:: : ...:. . : ... ::. . :. . . :: :.::. KIAA04 RPSRKNEKAKISID-SIQEVSE-GRQSEVFQRYPDGSFDPNCCFSIYHGSHRESLDLVST 110 120 130 140 150 160 130 140 150 160 170 KIAA05 QEEVAKEWTNEVFSLATNL-----LAQNM-SRDAFLEKAYTKLKLQVTPEGRIPLKNIYR . :::. :.. . : ... ::. . .:: .:.... . . . .: . . .. . KIAA04 SSEVARTWVTGLRYLMAGISDEDSLARRQRTRDQWLKQTFDE--ADKNGDGSLSIGEVLQ 170 180 190 200 210 220 180 190 200 210 220 230 KIAA05 LF-----SADRKRVETALEACSLPSSRNDSIPQEDFTPEVYRVFLNNLCPRPEIDNIFSE :. . :.::. .. .. .: : . : . .: . . : .. .. KIAA04 LLHKLNVNLPRQRVKQMFRE----ADTDDH--QGTLGFEEFCAFYKMMSTRRDLYLLMLT 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 KIAA05 FGAKSKPYLTVDQMMDFINLKQRDPRLNEILYPPLKQEQVQVLIEKYEPNNSLARKGQIS . .. : .: . ... :....:. . . :. : .::..:: :: .. KIAA04 Y-SNHKDHLDAASLQRFLQVEQK--------MAGVTLESCQDIIEQFEPCPENKSKGLLG 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 350 KIAA05 VDGFMRYLSGEENGVVSPEKLDLNEDMSQPLSHYFINSSHNTYLTAGQLAGNSSVEMYRQ .::: : . . . .::. ...::.::::::::.:::::::.. :: ..: :.:: KIAA04 IDGFTNYTRSPAGDIFNPEHHHVHQDMTQPLSHYFITSSHNTYLVGDQLMSQSRVDMYAW 330 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 410 KIAA05 VLLSGCRCVELDCWKGRTAEEEPVITHGFTMTTEISFKEVIEAIAECAFKTSPFPILLSF :: .::::::.::: : . ::.. ::.:.:..: ::.:::.: . :: . .:..::. KIAA04 VLQAGCRCVEVDCWDG--PDGEPIVHHGYTLTSKILFKDVIETINKYAFIKNEYPVILSI 390 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 KIAA05 ENHVDSPKQQAKMAEYCRLIFGDALLMEPLEKYPLESGVPLPSPMDLMYKILVKNKK--- ::: : :: :::.: :.:: : : . :... ::::. : :::::.:: KIAA04 ENHC-SVIQQKKMAQYLTDILGDKL---DLSSVSSEDATTLPSPQMLKGKILVKGKKLPA 450 460 470 480 490 500 480 490 KIAA05 --------------------------------KSHKSSEGSGKKKLSEQASNT-YSD--- ..: :...:.::. ... : KIAA04 NISEDAEEGEVSDEDSADEIDDDCKLLNGDASTNRKRVENTAKRKLDSLIKESKIRDCED 510 520 530 540 550 560 500 510 520 KIAA05 ----SSSMFEPSSP----GAGEADTESDDD-------------------DDDDDCKKS-S : : . ::. . .: :.:: .: . ::. : KIAA04 PNNFSVSTLSPSGKLGRKSKAEEDVESGEDAGASRRNGRLVVGSFSRRKKKGSKLKKAAS 570 580 590 600 610 620 530 540 550 560 570 KIAA05 MDEGTAGSEAM------ATEE---------MSNLVNYIQPVKFESFEISKKRNKSFEMSS ..:: :... ::.. .:.::.: . : ...:. . .:...:: KIAA04 VEEGDEGQDSPGGQSRGATRQKKTMKLSRALSDLVKYTKSVATHDIEM--EAASSWQVSS 630 640 650 660 670 580 590 600 610 620 630 KIAA05 FVETKGLEQLTKSPVEFVEYNKMQLSRIYPKGTRVDSSNYMPQLFWNAGCQMVALNFQTM : :::. . : ..:......:..:::::::.. ::::::: :: ::::::::::::.:. KIAA04 FSETKAHQILQQKPAQYLRFNQQQLSRIYPSSYRVDSSNYNPQPFWNAGCQMVALNYQSE 680 690 700 710 720 730 640 650 660 670 680 KIAA05 DLAMQINMGMYEYNGKSGYRLKPEFMRRPDKHFDPFTEGIVDGIVANTLSVKIISGQ--- .:.: . . :: :: ::: : . :.: .: . : . . : ..::::: KIAA04 GRMLQLNRAKFSANGGCGYVLKPGCMCQG--VFNPNSEDPLPGQLKKQLVLRIISGQQLP 740 750 760 770 780 790 690 700 710 720 730 740 KIAA05 -----FLSDKK--VGTYVEVDMFGLPVDTRRKAFKTKTSQGNAVNPVWEEEPIVFKKVVL .:.:. . .:::...::::: :. .:.. . :. ::.::: .:: : . KIAA04 KPRDSMLGDRGEIIDPFVEVEIIGLPVDCSRE--QTRVVDDNGFNPTWEET-LVFM-VHM 800 810 820 830 840 850 750 760 770 780 790 KIAA05 PTLACLRIAVYEE---GGKFIGHRILPVQAIRPGYHYICLRNERNQPLTLPAVFVYIEVK : .: .:. :... : :::.: : ... :::... :.. . ..::.. :. KIAA04 PEIALVRFLVWDHDPIGRDFIGQRTLAFSSMMPGYRHVYLEG-----MEEASIFVHVAVS 860 870 880 890 900 800 810 820 830 840 850 KIAA05 DYVPDTYADVIEALSNPIRYVNLMEQRAKQLAALTLEDEEEVKKEADPGETPSEAPSEAR : KIAA04 DISGKVKQALGLKGLFLRGPKPGSLDSHAAGRPPARPSVSQRILRRTASAPTKSQKPGRR 910 920 930 940 950 960 >>KIAA1092 ( 1154 res) hk04417 (1154 aa) initn: 886 init1: 365 opt: 561 Z-score: 314.8 bits: 70.3 E(): 2e-12 Smith-Waterman score: 1151; 30.970% identity (59.453% similar) in 804 aa overlap (19-799:166-909) 10 20 30 40 KIAA05 AQMAGAQPGVHALQLKPVCVSDSLKKGTKFVKWDDDSTIV-TPIILRT :. .:. .:... : ..: : ..: . KIAA10 KDGTKQKRERKKTVSFSSMPTEKKISSASDCI-NSMVEGSELKKVRSNSRIYHRYFLLDA 140 150 160 170 180 190 50 60 70 80 90 100 KIAA05 DPQGFFFYWTDQNKETELLDLSLVKDARCGRHAKAPKDPKLRELLDVGNIGRLEQRMITV : :.. . . ...: .:.. .:..: :... .. . . .. :. ..: KIAA10 DMQSLRWEPSKKDSEKAKIDIKSIKEVRTGKNTDIFRSNGISDQIS-------EDCAFSV 200 210 220 230 240 110 120 130 140 150 KIAA05 VYGPDLVNISHLNLVAFQEEVAKEWTNEVFSLAT------NLL--AQNMSRDAFLEKAYT .:: : :.::: . .::. :.. . : . ..: .:. : ... . .. KIAA10 IYGE---NYESLDLVANSADVANIWVTGLRYLISYGKHTLDMLESSQDNMRTSWVSQMFS 250 260 270 280 290 300 160 170 180 190 200 210 KIAA05 KLKLQVTPEGRIPLKNIY---RLFSADRKRVETALEACSLPSSRNDSIPQEDFTPEVYRV . ..: :.: : : : .. : . :. : .:. :. : : .: KIAA10 E--IDVDNLGHITLCNAVQCIRNLNPGLKTSKIELKFKELHKSK-DKAGTEVTKEEFIEV 310 320 330 340 350 360 220 230 240 250 260 270 KIAA05 FLNNLCPRPEIDNIFSEFGAKSKPYLTVDQMMDFINLKQRDPRLNEILYPPLKQEQVQVL : ..:: :::: .. .: ...: .: . ..: :.. .: ..:: : . KIAA10 F-HELCTRPEIYFLLVQF-SSNKEFLDTKDLMMFLEAEQGVAHINE--------EISLEI 370 380 390 400 410 280 290 300 310 320 330 KIAA05 IEKYEPNNSLARKGQISVDGFMRYLSGEENGVVSPEKLDLNEDMSQPLSHYFINSSHNTY :.::::.. .:: .:.::: :: . . . .::. . .::.::::::::::::::: KIAA10 IHKYEPSKEGQEKGWLSIDGFTNYLMSPDCYIFDPEHKKVCQDMKQPLSHYFINSSHNTY 420 430 440 450 460 470 340 350 360 370 380 390 KIAA05 LTAGQLAGNSSVEMYRQVLLSGCRCVELDCWKGRTAEEEPVITHGFTMTTEISFKEVIEA : :. : :.. : ..: ::: :::: : : ..:::: : :::..: :. ::. KIAA10 LIEDQFRGPSDITGYIRALKMGCRSVELDVWDG--PDNEPVIYTGHTMTSQIVFRSVIDI 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 KIAA05 IAECAFKTSPFPILLSFENHVDSPKQQAKMAEYCRLIFGDALLMEPLEKYPLESGVPLPS : . :: .: .:..: .::: : ::: :... . ..:: : : ::: KIAA10 INKYAFFASEYPLILCLENHC-SIKQQKVMVQHMKKLLGDKLYTTS----PNVEESYLPS 530 540 550 560 570 580 460 470 480 490 500 510 KIAA05 PMDLMYKILVKNKKKSHKSSEGSGKKKLSEQASNTYSDSSSMFEPSSPGAGEADTESDDD : : :::.: :::: . :.. .: .. . .. . . :. .. KIAA10 PDVLKGKILIK-------------AKKLSSNCSGVEGDVTDE-DEGAEMSQRMGKENMEQ 590 600 610 620 630 520 530 540 550 560 570 KIAA05 DDDDDCKKSSMDEGTAGSEAMATEEMSNLVNYIQPVKFESFEISKKRNKSFEMSSFVETK .. :. .. .:.:.::. . :.:. :..: . .: .:. :: :. KIAA10 PNNVPVKRFQL-----------CKELSELVSICKSVQFKEFQVSFQVQKYWEVCSFNEVL 640 650 660 670 580 590 600 610 620 630 KIAA05 GLEQLTKSPVEFVEYNKMQLSRIYPKGTRVDSSNYMPQLFWNAGCQMVALNFQTMDLAMQ . . ...: .::.::: :.:..:. :.::::. :: ::. :::.::.:::: : :. KIAA10 ASKYANENPGDFVNYNKRFLARVFPSPMRIDSSNMNPQDFWKCGCQIVAMNFQTPGLMMD 680 690 700 710 720 730 640 650 660 670 680 690 KIAA05 INMGMYEYNGKSGYRLKPEFMRRPDKHFDPFTEGIVDGIVANTLSVKIISGQFLSDKK-- .:.: .. ::. :: :.: .::. . :. :. : :. . : .:::::: . : KIAA10 LNIGWFRQNGNCGYVLRPAIMREEVSFFSANTKDSVPGVSPQLLHIKIISGQNFPKPKGS 740 750 760 770 780 790 700 710 720 730 740 KIAA05 ------VGTYVEVDMFGLPVDTRRKAFKTKTSQGNAVNPVWEEEPIVFKKVVLPTLACLR : :: :.. :.:.: .. .::: . :. :...: . :. . :: :: .: KIAA10 GAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQ--RTKTVHQNGDAPIFDES-FEFQ-INLPELAMVR 800 810 820 830 840 850 750 760 770 780 790 800 KIAA05 IAVYEE---GGKFIGHRILPVQAIRPGYHYICLRNERNQPLTLPAVFVYIEVKDYVPDTY ..: .. : .:::. .: . .. ::... :.. .. :. ..::.. . . 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KIAA10 -TDYCLDIIKKFEVSEENKVKNVLGIEGFTNFMRSPACDIFNPLHHEVYQDMDQPLCNYY 40 50 60 70 80 90 330 340 350 360 370 380 KIAA05 INSSHNTYLTAGQLAGNSSVEMYRQVLLSGCRCVELDCWKGRTAEEEPVITHGFTMTTEI : ::::::::. :: ..:.:.:: .:: ::::::.::: : . :::. ::.:.:..: KIAA10 IASSHNTYLTGDQLLSQSKVDMYARVLQEGCRCVEVDCWDG--PDGEPVVHHGYTLTSKI 100 110 120 130 140 150 390 400 410 420 430 440 KIAA05 SFKEVIEAIAECAFKTSPFPILLSFENHVDSPKQQAKMAEYCRLIFGDALLMEPLEKYPL :..:.:.: . :: . ::..::.::: : .:: :.:.: . :::: : . .. KIAA10 LFRDVVETINKHAFVKNEFPVILSIENHC-SIQQQRKIAQYLKGIFGDKLDLSSVDTGEC 160 170 180 190 200 210 450 460 470 480 490 500 KIAA05 ESGVPLPSPMDLMYKILVKNKKKSHKSSEGSGKKKLSEQASNTYSDSSSMFE-PSSPGAG .. ::::..: :::::.:: .. .. . . ..:.. : .. :. : :. KIAA10 KQ---LPSPQSLKGKILVKGKKLPYHLGDDAEEGEVSDEDSADEIEDECKFKLHYSNGTT 220 230 240 250 260 510 520 530 KIAA05 EADTES---------------DDDDDDDDCK----------------KSSMDEGTAGSEA : ..:: : .: :. :.: : .:... 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