# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh01779.fasta.nr -Q ../query/KIAA0562.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0562, 931 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825877 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8668+/-0.000189; mu= 11.0288+/- 0.011 mean_var=93.7703+/-18.286, 0's: 53 Z-trim: 59 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.132447 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119591887|gb|EAW71481.1| glycine-, glutamate-, ( 925) 6113 1178.9 0 gi|108995980|ref|XP_001084851.1| PREDICTED: glycin ( 925) 5953 1148.3 0 gi|74207979|dbj|BAE29108.1| unnamed protein produc ( 926) 4895 946.1 0 gi|109477769|ref|XP_001076921.1| PREDICTED: simila ( 931) 4832 934.1 0 gi|126329492|ref|XP_001365476.1| PREDICTED: simila ( 928) 4581 886.1 0 gi|148683004|gb|EDL14951.1| cDNA sequence BC046331 ( 890) 3629 704.2 6.7e-200 gi|149024754|gb|EDL81251.1| glycine-, glutamate-, ( 881) 3523 683.9 8.3e-194 gi|221043936|dbj|BAH13645.1| unnamed protein produ ( 422) 2714 529.1 1.6e-147 gi|148725499|emb|CAK04127.2| novel protein [Danio ( 728) 2511 490.5 1.2e-135 gi|47222795|emb|CAG01762.1| unnamed protein produc ( 892) 2492 486.9 1.7e-134 gi|1289336|gb|AAA99783.1| glycine-, glutamate-, th ( 470) 2484 485.2 3e-134 gi|74217139|dbj|BAC38002.2| unnamed protein produc ( 414) 1921 377.6 6.5e-102 gi|210099977|gb|EEA48062.1| hypothetical protein B ( 859) 1737 342.7 4.4e-91 gi|89273985|emb|CAJ82034.1| novel protein [Xenopus ( 218) 1252 249.6 1.2e-63 gi|190583875|gb|EDV23945.1| hypothetical protein T ( 918) 1192 238.6 1e-59 gi|210082694|gb|EEA31375.1| hypothetical protein B (1156) 1168 234.0 3e-58 gi|119591888|gb|EAW71482.1| glycine-, glutamate-, ( 210) 977 197.0 7.7e-48 gi|109475893|ref|XP_575968.2| PREDICTED: similar t ( 924) 851 173.4 4.3e-40 gi|89297589|gb|EAR95577.1| hypothetical protein TT ( 872) 763 156.6 4.7e-35 gi|91085735|ref|XP_973537.1| PREDICTED: similar to ( 900) 691 142.8 6.7e-31 gi|54645635|gb|EAL34373.1| GA10101 [Drosophila pse ( 946) 682 141.1 2.3e-30 gi|194115099|gb|EDW37142.1| GL26083 [Drosophila pe ( 946) 682 141.1 2.3e-30 gi|190616503|gb|EDV32027.1| GF14244 [Drosophila an ( 924) 671 139.0 9.7e-30 gi|194160754|gb|EDW75655.1| GK23988 [Drosophila wi ( 952) 653 135.6 1.1e-28 gi|157013982|gb|EAA14484.4| AGAP009750-PA [Anophel ( 956) 630 131.2 2.3e-27 gi|156540017|ref|XP_001600698.1| PREDICTED: simila ( 875) 628 130.8 2.8e-27 gi|193899904|gb|EDV98770.1| GH13419 [Drosophila gr ( 914) 620 129.3 8.2e-27 gi|134061186|emb|CAM38208.1| hypothetical protein, ( 876) 613 127.9 2e-26 gi|194134260|gb|EDW55776.1| GM17360 [Drosophila se ( 920) 597 124.9 1.7e-25 gi|194191954|gb|EDX05530.1| GD24217 [Drosophila si ( 620) 593 124.0 2.2e-25 gi|16183288|gb|AAL13682.1| GH24474p [Drosophila me ( 941) 595 124.5 2.3e-25 gi|94733284|emb|CAK04128.1| novel protein [Danio r ( 143) 583 121.6 2.6e-25 gi|194176821|gb|EDW90432.1| GE13265 [Drosophila ya ( 940) 593 124.1 3e-25 gi|190657425|gb|EDV54638.1| GG21191 [Drosophila er ( 941) 581 121.8 1.5e-24 gi|156215359|gb|EDO36321.1| predicted protein [Nem ( 192) 555 116.3 1.3e-23 gi|156217530|gb|EDO38444.1| predicted protein [Nem ( 566) 561 117.8 1.4e-23 gi|215491136|gb|EEC00777.1| conserved hypothetical ( 272) 529 111.5 5.5e-22 gi|124391486|emb|CAK57024.1| unnamed protein produ ( 449) 523 110.5 1.8e-21 gi|74190177|dbj|BAE37207.1| unnamed protein produc ( 97) 513 108.1 2.1e-21 gi|167874690|gb|EDS38073.1| conserved hypothetical ( 941) 524 110.9 2.8e-21 gi|124414030|emb|CAK79155.1| unnamed protein produ ( 823) 519 109.9 4.9e-21 gi|158280702|gb|EDP06459.1| flagellar associated p ( 740) 491 104.5 1.8e-19 gi|134069084|emb|CAM67230.1| hypothetical protein, ( 875) 484 103.2 5.3e-19 gi|68126057|emb|CAJ07110.1| hypothetical protein, ( 875) 469 100.4 3.9e-18 gi|194141259|gb|EDW57678.1| GJ18223 [Drosophila vi ( 912) 410 89.1 9.9e-15 gi|193913527|gb|EDW12394.1| GI17656 [Drosophila mo ( 907) 409 88.9 1.1e-14 gi|162673619|gb|EDQ60139.1| predicted protein [Phy (1380) 411 89.4 1.2e-14 gi|70884756|gb|EAN97603.1| hypothetical protein, c ( 851) 402 87.6 2.7e-14 gi|70877029|gb|EAN90417.1| hypothetical protein, c ( 851) 398 86.8 4.6e-14 gi|70833350|gb|EAN78854.1| hypothetical protein, c ( 850) 387 84.7 2e-13 >>gi|119591887|gb|EAW71481.1| glycine-, glutamate-, thie (925 aa) initn: 6113 init1: 6113 opt: 6113 Z-score: 6310.0 bits: 1178.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 6113; 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