# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh01334.fasta.huge -Q ../query/KIAA0557.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0557, 493 aa vs ./tmplib.23663 library 1987012 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5802+/-0.00807; mu= 4.2975+/- 0.547 mean_var=249.3951+/-60.867, 0's: 0 Z-trim: 74 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.081214 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 701 94.9 1.4e-20 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 699 95.0 2.4e-20 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 663 90.6 3.9e-19 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 653 89.3 7.6e-19 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 645 88.4 1.5e-18 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 646 88.7 1.6e-18 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 641 87.9 1.9e-18 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 639 87.7 2.4e-18 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 640 87.9 2.4e-18 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 635 87.1 2.9e-18 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 633 87.1 4.2e-18 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 629 86.4 4.6e-18 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 631 87.0 6.1e-18 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 626 86.4 8.6e-18 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 620 85.3 9.7e-18 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 618 85.2 1.3e-17 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 618 85.2 1.3e-17 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 618 85.3 1.4e-17 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 613 84.6 1.9e-17 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 612 84.4 1.9e-17 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 615 85.0 1.9e-17 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 616 85.2 2e-17 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 611 84.4 2.3e-17 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 610 84.5 3.3e-17 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 606 83.8 3.5e-17 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 607 84.1 3.8e-17 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 603 83.5 4.4e-17 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 598 83.1 8.2e-17 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 593 82.4 1.1e-16 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 584 81.2 2e-16 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 583 81.0 2e-16 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 582 81.0 2.5e-16 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 582 81.2 3e-16 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 571 79.5 4.8e-16 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 572 79.8 5.2e-16 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 568 79.3 7.3e-16 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 557 78.0 1.7e-15 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 534 75.4 1.2e-14 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 524 74.2 2.7e-14 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 516 72.9 3.5e-14 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 512 72.9 8e-14 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 464 67.2 3.6e-12 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 406 60.8 6e-10 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 387 58.2 2e-09 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 373 55.8 2.7e-09 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 376 56.9 4.7e-09 KIAA0760 ( 1224 res) hk04642s1 (1224) 357 55.0 3.3e-08 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 356 55.1 4.4e-08 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 348 53.9 6.3e-08 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 317 50.4 8.6e-07 >>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa) initn: 5471 init1: 687 opt: 701 Z-score: 461.2 bits: 94.9 E(): 1.4e-20 Smith-Waterman score: 707; 41.026% identity (58.013% similar) in 312 aa overlap (215-474:37-347) 190 200 210 220 230 240 KIAA05 EEARFSSQQPPAQLSHRPQRGPLLWPERGPPAPRHQEMASASPFLSAWSQVPVNLEDVAV : : . :. .: : ::.::..::.:. KIAA17 SRSLRFWRRRSSGSFAGQERCLLAAFPALSPWRRTLVLEMAATLLMAGSQAPVTFEDMAM 10 20 30 40 50 60 250 260 270 KIAA05 YLSGEEPRCMDPAQRD----APLENEGPGIQL-----------------ED---G----- ::. :: : .: :::: . :: : ..: :: : KIAA17 YLTREEWRPLDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSENEVNPKQEISEDVQFGTTSER 70 80 90 100 110 120 280 290 300 310 320 KIAA05 -GDGREDAPLRMEWYRVLSARCQGPGHPLPGQR----P-APVRGLVRPDQPRGG------ ... :. : : .. . : . : ... : :: :. . . : KIAA17 PAENAEENPESEEGFES-GDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHIC 130 140 150 160 170 180 330 340 350 360 370 KIAA05 PPPGR-----------RASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQRTHTGERPYKCLVCG :. . .: .:.:: : :::::::..::: .::::::::::: : :: KIAA17 SHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECG 190 200 210 220 230 240 380 390 400 410 420 430 KIAA05 KGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSGERPYACTQCGKRFN :.:. :.. :: .::::::. : :::: : . : :. :.::::::.:: : .::: :. KIAA17 KSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFS 250 260 270 280 290 300 440 450 460 470 480 490 KIAA05 NSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGSLPTLQPVAPGGPGAK :::.. :.::::::::: : ::::: . .:: :: :.: : KIAA17 RSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSD 310 320 330 340 350 360 KIAA05 A KIAA17 LVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITH 370 380 390 400 410 420 >>KIAA0326 ( 927 res) hg00579 (927 aa) initn: 4838 init1: 652 opt: 699 Z-score: 457.1 bits: 95.0 E(): 2.4e-20 Smith-Waterman score: 699; 38.827% identity (58.380% similar) in 358 aa overlap (129-474:6-344) 100 110 120 130 140 150 KIAA05 KEQILELLVLEQFLTVLPGEIQARVREQQPESGEEAVVLVEGLQRKPRKHRQRGSELLSD :: : : : : :: . .: :: KIAA03 RVLSLESPLEKDPRVLGAQSVPRGRALKG---LS- 10 20 30 160 170 180 190 200 210 KIAA05 DEVPLGIGGQF-LKHQAEAQPEDLS-----LEEEARF--SSQQPPAQLSHRPQRGPLLWP :::. . : : . .: : . . .: :. . . : : : . .:: KIAA03 ---PLGLDSAFRLFPDPRAGPWNTAVLSSGMEPETALWGPDLQGPEQSPNDAHRGA--ES 40 50 60 70 80 220 230 240 250 260 KIAA05 ERGPPAPRHQEMASASPFLSAWSQVPVNLEDVAVYL--SGEEPRCMDPAQRDAPLENEGP : .:: :: .. ... .: : . ... . : :...: : . .:: . .: KIAA03 ENEEESPR-QESSGEEIIMGDPAQSPESKDSTEMSLERSSQDPSV--PQNPPTPLGHSNP 90 100 110 120 130 140 270 280 290 300 310 320 KIAA05 -GIQLEDGGDGREDAPLRMEWYRVLSARCQGPGHPLPGQRPAPVRGLVRPDQPRGGP-PP :. . : .: .: .. : : : . : :: : ..: KIAA03 LDHQIPLDPPAPEVVPTPSDWTKACEASWQW-GALTTWNSP-PV---VPANEPSLRELVQ 150 160 170 180 190 330 340 350 360 370 380 KIAA05 GRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQRTHTGERPYKCLVCGKGFSDRSNFSTHQR :: : ::.::: : ::::.::. :.: .::: :::::: : :::.:.. :.. ::: KIAA03 GRPA--GAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQR 200 210 220 230 240 250 390 400 410 420 430 440 KIAA05 VHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSGERPYACTQCGKRFNNSSHFSAHRRTHTG .::::::: ::.::: :: ::.:: :.:::.::.:: ::.: : :..:... :.:.::: KIAA03 THTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTG 260 270 280 290 300 310 450 460 470 480 490 KIAA05 EKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGSLPTLQPVAPGGPGAKA :::: : : :.: :..:: .:: :: : KIAA03 EKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPY 320 330 340 350 360 370 >>KIAA1962 ( 746 res) hm00158 (746 aa) initn: 4866 init1: 651 opt: 663 Z-score: 435.4 bits: 90.6 E(): 3.9e-19 Smith-Waterman score: 841; 32.446% identity (52.579% similar) in 601 aa overlap (14-474:9-605) 10 20 30 40 50 60 KIAA05 TLRPEKEQGPPEAMATVPGLQPLPTLEQDLEQEEILIVKVEEDFCLEEEPSVETEDPSPE . . ...: : . ::.:. : . :.: .. . . : KIAA19 DTMQAVVPLNKMTAISPEPQTLASTEQNEVPRVVTSG----EQEAILRGNAADAE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA05 TFRQLFRLFCYQEVAGPREALSRLWELCCRWLRPELRTKEQILELLVLEQFLTVLPGEIQ .::: :: :::.::::::.:::.::::: .::::...::::::::::.:::::.:::::. KIAA19 SFRQRFRWFCYSEVAGPRKALSQLWELCNQWLRPDIHTKEQILELLVFEQFLTILPGEIR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 KIAA05 ARVREQQPESGEEAVVLVEGL-----QRKPRKHRQRGSE--------------------- :. :.:::.::.:.:.: : .. : .. . :. KIAA19 IWVKSQHPESSEEVVTLIEDLTQMLEEKDPVSQDSTVSQEENSKEDKMVTVCPNTESCES 120 130 140 150 160 170 160 170 180 KIAA05 -LLSDDEVPLGIG--GQFLKHQAEAQPEDL-----SLE---------------------- :.: : .. : .. : : : : .:: KIAA19 ITLKDVAVNFSRGEWKKLEPFQKELYKEVLLENLRNLEFLDFPVSKLELISQLKWVELPW 180 190 200 210 220 230 190 200 210 220 KIAA05 --EEARFSSQQPPAQLSHRPQR-------GPLLWPER--GPPAPRHQEMASA-------- ::. ::. . :.. .: : . .. : : ..... KIAA19 LLEEVSKSSRLDESALDKIIERCLRDDDHGLMEESQQYCGSSEEDHGNQGNSKGRVAQNK 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 KIAA05 ---------------SPFLSAWSQVPVNLEDVAVYLSGEEPRCMD---PAQRDAPL---- ::: .... .. . ::: . : . : . . : KIAA19 TLGSGSRGKKFDPDKSPFGHNFKETSDLIKHLRVYLRKKSRRYNESKKPFSFHSDLVLNR 300 310 320 330 340 350 270 280 290 300 KIAA05 ENEGPGIQLEDGGDG----REDAPLRMEWYRVL------SARCQGPG-----HPLPGQRP ... : . . ..:: ... : . : : .:. : . ..: KIAA19 KEKTAGEKSRKSNDGGKVLSHSSALTEHQKRQKIHLGDRSQKCSKCGIIFIRRSTLSRRK 360 370 380 390 400 410 310 320 330 340 KIAA05 APVRGLVRPD--------QPRG-------------GPPPGRRAS-------HGADKPYTC .:. : : . .: : : :: : ..::: : KIAA19 TPMCEKCRKDSCQEAALNKDEGNESGKKTHKCSKCGKAFGYSASLTKHRRIHTGEKPYMC 420 430 440 450 460 470 350 360 370 380 390 400 KIAA05 PECGKGFSKTSHLTKHQRTHTGERPYKCLVCGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECG ::::.:: .: :: :.:::.::.:.:: :::::. ... :::.::::::: : .:: KIAA19 NECGKAFSDSSSLTPHHRTHSGEKPFKCDDCGKGFTLSAHLIKHQRIHTGEKPYKCKDCG 480 490 500 510 520 530 410 420 430 440 450 460 KIAA05 KRFSQSSSLVIHRRTHSGERPYACTQCGKRFNNSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFR . ::.::::. :.: :.::.::.:..::: :..:: .: :.: ::::::: : ::..:: KIAA19 RPFSDSSSLIQHQRIHTGEKPYTCSNCGKSFSHSSSLSKHQRIHTGEKPYKCGECGKAFR 540 550 560 570 580 590 470 480 490 KIAA05 RGTDLHKHQRTHMGAGSLPTLQPVAPGGPGAKA ... : .::: : : KIAA19 QNSCLTRHQRIHTGEKPYLCNDCGMTFSHFTSVIYHQRLHSGEKPYKCNQCEKAFPTHSL 600 610 620 630 640 650 >>KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 (579 aa) initn: 2744 init1: 649 opt: 653 Z-score: 430.2 bits: 89.3 E(): 7.6e-19 Smith-Waterman score: 653; 59.441% identity (77.622% similar) in 143 aa overlap (332-474:406-548) 310 320 330 340 350 360 KIAA05 PLPGQRPAPVRGLVRPDQPRGGPPPGRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQRTHT : . ::: : :: :.: ..: : ::::::: KIAA18 RIHVGERPYECNECGKGFNRSTHLVQHQLIHTGVKPYECNECDKAFIHSSALIKHQRTHT 380 390 400 410 420 430 370 380 390 400 410 420 KIAA05 GERPYKCLVCGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSGERP ::.:::: :::.:: :... ::::::::::: : :::: ::::. :: :.: :.::.: KIAA18 GEKPYKCQECGKAFSHCSSLTKHQRVHTGEKPYECSECGKTFSQSTHLVQHQRIHTGEKP 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 480 KIAA05 YACTQCGKRFNNSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGSLPTL : :..::: :. ::.:. :.: : :.::: : ::..: ... : .::::: : KIAA18 YECNECGKTFSRSSNFAKHQRIHIGKKPYKCSECGKAFIHSSALIQHQRTHTGEKPFRCN 500 510 520 530 540 550 490 KIAA05 QPVAPGGPGAKA KIAA18 ECGKSFKCSSSLIRHQRVHTEEQP 560 570 >>KIAA1969 ( 595 res) fk06944 (595 aa) initn: 5040 init1: 597 opt: 645 Z-score: 425.0 bits: 88.4 E(): 1.5e-18 Smith-Waterman score: 645; 55.479% identity (78.082% similar) in 146 aa overlap (332-477:385-530) 310 320 330 340 350 360 KIAA05 PLPGQRPAPVRGLVRPDQPRGGPPPGRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQRTHT : ..: : : ::::::. .: ::::.: :: KIAA19 FIHAGEKPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHT 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 KIAA05 GERPYKCLVCGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSGERP ::.:::: ::::.:.. ::..::. .::::::: : :::: :..: .:. :. :.::.: KIAA19 GEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKP 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 KIAA05 YACTQCGKRFNNSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGSLPTL : : .::: :..:: ...:.: ::::::: : ::..: :...: ::. : : : KIAA19 YKCEECGKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCE 480 490 500 510 520 530 490 KIAA05 QPVAPGGPGAKA KIAA19 ECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEECDNTFNQSSNLIKQNNSYWRETLQMSRMWES 540 550 560 570 580 590 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 4717 init1: 630 opt: 646 Z-score: 424.2 bits: 88.7 E(): 1.6e-18 Smith-Waterman score: 646; 55.479% identity (79.452% similar) in 146 aa overlap (329-474:551-696) 300 310 320 330 340 350 KIAA05 PGHPLPGQRPAPVRGLVRPDQPRGGPPPGRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQR :. :...::: : :::: :..::.:..: : KIAA16 THQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWR 530 540 550 560 570 580 360 370 380 390 400 410 KIAA05 THTGERPYKCLVCGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSG .::::.:::: ::..:::::... :: .::::::: : :::: : ..: :. ::: :.: KIAA16 VHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTG 590 600 610 620 630 640 420 430 440 450 460 470 KIAA05 ERPYACTQCGKRFNNSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGSL :.:: :..::: :. :....:. ::::::: : ::. : ... : .::::: : KIAA16 EKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPY 650 660 670 680 690 700 480 490 KIAA05 PTLQPVAPGGPGAKA KIAA16 RCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTE 710 720 730 740 750 760 >>KIAA1396 ( 551 res) hj08221 (551 aa) initn: 4426 init1: 631 opt: 641 Z-score: 422.9 bits: 87.9 E(): 1.9e-18 Smith-Waterman score: 641; 55.245% identity (79.720% similar) in 143 aa overlap (332-474:406-548) 310 320 330 340 350 360 KIAA05 PLPGQRPAPVRGLVRPDQPRGGPPPGRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQRTHT : ..::: : ::::.: .:.:. ::: :: KIAA13 RVHSGEKPYECKECGKAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHT 380 390 400 410 420 430 370 380 390 400 410 420 KIAA05 GERPYKCLVCGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSGERP ::.::.:. ::..:..::... ::..::::::: : :::: :::. .:. :.: :.::.: KIAA13 GEKPYECIECGNAFKQRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTGEKP 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 480 KIAA05 YACTQCGKRFNNSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGSLPTL : ::.::: :..:: . :.: :::..:: : ::..::: .: :::.: : KIAA13 YKCTECGKAFSDSSSCAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP 500 510 520 530 540 550 490 KIAA05 QPVAPGGPGAKA >>KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) (599 aa) initn: 5154 init1: 632 opt: 639 Z-score: 421.2 bits: 87.7 E(): 2.4e-18 Smith-Waterman score: 639; 53.147% identity (80.420% similar) in 143 aa overlap (332-474:451-593) 310 320 330 340 350 360 KIAA05 PLPGQRPAPVRGLVRPDQPRGGPPPGRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQRTHT : . ::: : :::: ....: ..::.: :: KIAA19 KIHTGDKLYKCKECGKVFKQSSHLNRHEKIHTGKKPYKCKECGKVITSSSSFAKHKRIHT 430 440 450 460 470 480 370 380 390 400 410 420 KIAA05 GERPYKCLVCGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSGERP ::.:.::: :::.:.. .... :.:.::::::: : :::: : ::. : .::: :.::.: KIAA19 GEKPFKCLECGKAFTSSTTLTKHRRIHTGEKPYTCEECGKAFRQSAILYVHRRIHTGEKP 490 500 510 520 530 540 430 440 450 460 470 480 KIAA05 YACTQCGKRFNNSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGSLPTL :.: .::: : .:... ::.. ::::::::: ::. ::....:. :.. : : KIAA19 YTCGECGKTFRQSANLYAHKKIHTGEKPYTCGDCGKTFRQSANLYAHKKIHTGDKTIQV 550 560 570 580 590 490 KIAA05 QPVAPGGPGAKA >>KIAA0972 ( 702 res) hj06859 (702 aa) initn: 3658 init1: 640 opt: 640 Z-score: 421.1 bits: 87.9 E(): 2.4e-18 Smith-Waterman score: 640; 55.782% identity (76.871% similar) in 147 aa overlap (328-474:413-559) 300 310 320 330 340 350 KIAA05 GPGHPLPGQRPAPVRGLVRPDQPRGGPPPGRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQ :: ::. ::: : ::::.: . .:: .:: KIAA09 LVSNDRTQTWVKSSEYHENKKSYQTSVHRVRRRSHSMMKPYKCNECGKSFCQKGHLIQHQ 390 400 410 420 430 440 360 370 380 390 400 410 KIAA05 RTHTGERPYKCLVCGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHS ::::::.:..: ::: ::..:..:::::.::.:::: : :::: : :.:.: :.: :. KIAA09 RTHTGEKPFECSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKCNECGKTFVQKSTLRGHQRIHT 450 460 470 480 490 500 420 430 440 450 460 470 KIAA05 GERPYACTQCGKRFNNSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGS ::.:: :..::: : ..: . :.: ::::: . : ::. : . ..:. ::::: : KIAA09 GEKPYECSECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQCGKTFGQKSNLRIHQRTHTGEKT 510 520 530 540 550 560 480 490 KIAA05 LPTLQPVAPGGPGAKA KIAA09 YQCNECEKSFWRKDHLIQHQKTHTGEKPFKCNECGKTFARTSTLRVHQRIHTGEKPFKCN 570 580 590 600 610 620 >>KIAA1954 ( 468 res) fk02322 (468 aa) initn: 2490 init1: 635 opt: 635 Z-score: 419.9 bits: 87.1 E(): 2.9e-18 Smith-Waterman score: 635; 54.225% identity (80.986% similar) in 142 aa overlap (331-472:322-463) 310 320 330 340 350 360 KIAA05 HPLPGQRPAPVRGLVRPDQPRGGPPPGRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQRTH :: ..::: : :::.:.... . .:.: : KIAA19 SHITDFTDHQRIHTAENPYDCEQAFSQQAISHPGEKPYQCNVCGKAFKRSTSFIEHHRIH 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 KIAA05 TGERPYKCLVCGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSGER :::.::.: ::..:: ::... :.:.::::::: : .::: :::::::. :.:::.::. KIAA19 TGEKPYECNECGEAFSRRSSLTQHERTHTGEKPYECIDCGKAFSQSSSLIQHERTHTGEK 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 KIAA05 PYACTQCGKRFNNSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGSLPT :: :..::. : ..... :.: :::::::.: ::..: :.. : :::: : KIAA19 PYECNECGRAFRKKTNLHDHQRIHTGEKPYSCKECGKNFSRSSALTKHQRIHTRNKL 420 430 440 450 460 490 KIAA05 LQPVAPGGPGAKA 493 residues in 1 query sequences 1987012 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:06:54 2008 done: Thu Dec 18 15:06:55 2008 Total Scan time: 0.450 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]