# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg04390.fasta.nr -Q ../query/KIAA0543.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0543, 1111 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7822268 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0012+/-0.000188; mu= 15.5140+/- 0.010 mean_var=72.1657+/-14.231, 0's: 46 Z-trim: 75 B-trim: 1127 in 1/68 Lambda= 0.150976 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|182639178|sp|O60290.2|ZN862_HUMAN RecName: Full (1169) 7541 1652.6 0 gi|119600432|gb|EAW80026.1| hCG16180 [Homo sapiens (1213) 7541 1652.6 0 gi|109068807|ref|XP_001101093.1| PREDICTED: simila (1274) 7211 1580.7 0 gi|194210096|ref|XP_001494367.2| PREDICTED: simila (1170) 6525 1431.3 0 gi|194666579|ref|XP_001787729.1| PREDICTED: simila (1168) 6010 1319.1 0 gi|126341074|ref|XP_001370079.1| PREDICTED: simila (1192) 5575 1224.4 0 gi|109473452|ref|XP_001054093.1| PREDICTED: simila (1197) 5141 1129.9 0 gi|109472010|ref|XP_001060788.1| PREDICTED: simila (1123) 5133 1128.1 0 gi|73978957|ref|XP_853490.1| PREDICTED: similar to ( 603) 3648 804.4 0 gi|117167979|gb|AAI13088.1| ZNF862 protein [Homo s ( 254) 1669 373.1 1.1e-100 gi|149033466|gb|EDL88267.1| rCG52293 [Rattus norve ( 320) 1206 272.3 3e-70 gi|148666116|gb|EDK98532.1| mCG1036748 [Mus muscul ( 415) 1167 263.9 1.3e-67 gi|119588453|gb|EAW68047.1| hCG1991368 [Homo sapie ( 717) 825 189.6 5.3e-45 gi|189537267|ref|XP_693848.3| PREDICTED: PR domain (1115) 776 179.1 1.2e-41 gi|149409933|ref|XP_001509349.1| PREDICTED: simila (1601) 688 160.0 9.3e-36 gi|109071585|ref|XP_001110391.1| PREDICTED: simila ( 787) 409 99.0 1.1e-17 gi|194380562|dbj|BAG58434.1| unnamed protein produ ( 760) 386 94.0 3.4e-16 gi|158255412|dbj|BAF83677.1| unnamed protein produ ( 744) 385 93.8 3.8e-16 gi|119624875|gb|EAX04470.1| hCG42061 [Homo sapiens ( 749) 385 93.8 3.9e-16 gi|111308110|gb|AAI21494.1| Hypothetical protein M ( 537) 356 87.3 2.4e-14 gi|193709409|ref|XP_001951671.1| PREDICTED: simila ( 684) 349 85.9 8.3e-14 gi|149466112|ref|XP_001519083.1| PREDICTED: simila ( 659) 311 77.6 2.5e-11 gi|221123749|ref|XP_002164564.1| PREDICTED: simila ( 832) 310 77.5 3.5e-11 gi|221132389|ref|XP_002167418.1| PREDICTED: simila (1524) 309 77.5 6.4e-11 gi|193690818|ref|XP_001944219.1| PREDICTED: simila ( 683) 300 75.2 1.3e-10 gi|198413053|ref|XP_002124374.1| PREDICTED: simila ( 820) 295 74.2 3.3e-10 gi|53133426|emb|CAG32042.1| hypothetical protein [ ( 525) 291 73.2 4.3e-10 gi|118085414|ref|XP_001231338.1| PREDICTED: hypoth ( 525) 291 73.2 4.3e-10 gi|194210090|ref|XP_001493115.2| PREDICTED: simila ( 713) 289 72.8 7.3e-10 gi|194666572|ref|XP_616433.4| PREDICTED: similar t ( 546) 286 72.1 9.4e-10 gi|126305296|ref|XP_001378864.1| PREDICTED: hypoth ( 309) 283 71.2 9.6e-10 gi|73978947|ref|XP_853443.1| PREDICTED: similar to ( 617) 286 72.1 1e-09 gi|193716080|ref|XP_001952490.1| PREDICTED: simila (1017) 288 72.7 1.1e-09 gi|119602619|gb|EAW82213.1| zinc finger protein 70 ( 392) 281 70.9 1.6e-09 gi|94534777|gb|AAI16130.1| Zinc finger protein 619 ( 419) 281 70.9 1.6e-09 gi|126335677|ref|XP_001370527.1| PREDICTED: simila (1101) 283 71.7 2.5e-09 gi|193688398|ref|XP_001950436.1| PREDICTED: simila ( 697) 280 70.9 2.8e-09 gi|149034956|gb|EDL89676.1| zinc finger protein 31 (1016) 279 70.8 4.3e-09 gi|194677207|ref|XP_001253952.2| PREDICTED: simila ( 421) 274 69.4 4.7e-09 gi|119909733|ref|XP_586727.3| PREDICTED: similar t ( 631) 276 70.0 4.8e-09 gi|193594173|ref|XP_001945763.1| PREDICTED: simila ( 821) 277 70.3 5e-09 gi|126322993|ref|XP_001369981.1| PREDICTED: simila ( 131) 263 66.6 1e-08 gi|126304610|ref|XP_001368860.1| PREDICTED: simila ( 821) 272 69.2 1.1e-08 gi|148697560|gb|EDL29507.1| mCG142742, isoform CRA ( 417) 268 68.1 1.2e-08 gi|194041487|ref|XP_001927060.1| PREDICTED: simila ( 382) 267 67.8 1.3e-08 gi|109132732|ref|XP_001085420.1| PREDICTED: simila ( 416) 267 67.9 1.4e-08 gi|126341048|ref|XP_001368980.1| PREDICTED: simila ( 779) 270 68.7 1.4e-08 gi|74760749|sp|Q96C28.1|ZN707_HUMAN RecName: Full= ( 369) 266 67.6 1.4e-08 gi|193786210|dbj|BAG51493.1| unnamed protein produ ( 371) 266 67.6 1.4e-08 gi|119602616|gb|EAW82210.1| zinc finger protein 70 ( 371) 266 67.6 1.4e-08 >>gi|182639178|sp|O60290.2|ZN862_HUMAN RecName: Full=Zin (1169 aa) initn: 7541 init1: 7541 opt: 7541 Z-score: 8867.1 bits: 1652.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 7541; 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