# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/he00818.fasta.huge -Q ../query/KIAA0511.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0511, 933 aa vs ./tmplib.23663 library 1986572 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9399+/-0.0056; mu= 10.3188+/- 0.380 mean_var=118.5621+/-28.289, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.117788 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0037 ( 1088 res) ha00929 (1088) 1442 257.0 8.8e-69 KIAA1060 ( 887 res) hh13580 ( 887) 1405 250.6 6e-67 KIAA0422 ( 1160 res) hh01205s1 (1160) 1049 190.3 1.2e-48 KIAA0520 ( 1364 res) hg02989s1 (1364) 639 120.7 1.2e-27 >>KIAA0037 ( 1088 res) ha00929 (1088 aa) initn: 1632 init1: 737 opt: 1442 Z-score: 1326.7 bits: 257.0 E(): 8.8e-69 Smith-Waterman score: 1850; 37.351% identity (64.604% similar) in 921 aa overlap (8-908:185-1075) 10 20 30 KIAA05 QQQEELKGMQLLREILANVFLYLCAIAVGIMSYYMAD :.::: ::. ..::. .: . .. . 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KIAA00 DASRDLFTYTVKCIQIRRKLRIEKRQQENLLLSVLPAHISMGMKLAIIERLKEHGDRRCM 220 230 240 250 260 270 100 110 120 130 140 150 KIAA05 DQQQFNTMYMYRHENVSILFADIVGFTQLSSACSAQELVKLLNELFARFDKLAAKYHQLR ...:...:. ::.:::::.:::::::::.: :: .::: .:::::..::..: . .: KIAA00 PDNNFHSLYVKRHQNVSILYADIVGFTQLASDCSPKELVVVLNELFGKFDQIAKANECMR 280 290 300 310 320 330 160 170 180 190 200 210 KIAA05 IKILGDCYYCICGLPDYREDHAVCSILMGLAMVEAISYVREKTKTGVDMRVGVHTGTVLG ::::::::::. ::: :: . ::: : .::. ::: : . ..::::.:.:.:: KIAA00 IKILGDCYYCVSGLPVSLPTHARNCVKMGLDMCQAIKQVREATGVDINMRVGIHSGNVLC 340 350 360 370 380 390 220 230 240 250 260 270 KIAA05 GVLGQKRWQYDVWSTDVTVANKMEAGGIPGRVHISQSTMDCLKGEFDVEPGDGGSRCDYL ::.: ..::::::: ::..::.:::.:.::::::...:. : ..:: : : .: :: KIAA00 GVIGLRKWQYDVWSHDVSLANRMEAAGVPGRVHITEATLKHLDKAYEVEDGHGQQRDPYL 400 410 420 430 440 450 280 290 300 310 320 330 KIAA05 EEKGIETYLIIASKPEVKKTATQNGLNGSALPNGAPASSKSSSPALIETKEPNGSAHSSG .: .:.:::.: . . .:. :.: : . .: . . : :.:. . KIAA00 KEMNIRTYLVIDPRSQQPPPPSQH----LPRPKGDAALKMRASVRMTRYLESWGAARPFA 460 470 480 490 500 340 350 360 370 380 KIAA05 STSEKPEEQDAQADNPS--FPN--PRRRLRLQDLADRVVDASEDEHELNQLLNEALLERE ... ..... :. :. :.:. : : . :::. ...:. KIAA00 HLNHRESVSSGETHVPNGRRPKSVPQRHRRTPDRSMSPKGRSEDDSYDDEMLSAIEGLSS 510 520 530 540 550 560 390 400 410 420 430 440 KIAA05 SAQVVKKRNTFL-LSMRFMDPEMETRYSVEKEKQSGAAFSCSCVVLLCTALVEILIDPWL . .: . : .. :.. .: .: . .. :.:. ....: ::..:. : KIAA00 TRPCCSKSDDFYTFGSIFLEKGFEREYRLAPIPRARHDFACASLIFVCILLVHVLLMPRT 570 580 590 600 610 620 450 460 470 480 490 500 KIAA05 MTNYVTF-MVGEILLLILTICSLAAIFPRAFPKK--LVAFSTWIDRTRWARNTWAMLAIF . :.: .:. .: :.: .: .:. : : : . : ..: .. : : :.:.: KIAA00 AALGVSFGLVACVLGLVLGLC-FATKFSRCCPARGTLCTISERVETQPLLRLTLAVLTIG 630 640 650 660 670 680 510 520 530 540 550 KIAA05 ILVMANVVDM-LSCLQYYTGPSNATAGM-----ETEGSCLENPKYYNYVAVLSLIATIML :. . .... : .: : . .:. .:.. : : ::. ::..:: .. KIAA00 SLLTVAIINLPLMPFQVPELPVGNETGLLAASSKTRALCEPLP-YYTCSCVLGFIACSVF 690 700 710 720 730 740 560 570 580 590 600 610 KIAA05 VQVSHMVKLTLMLLVAGAVATINLYAWRPVFDEYDHKRFREHDLPMVALEQMQGFNPGLN ...: : ..::... :: . :. : . . : .: .. : . KIAA00 LRMSLEPK--VVLLTVALVAYLVLFNLSPCW---------QWDCCGQGLGNLTKPNGTTS 750 760 770 780 790 620 630 640 650 660 670 KIAA05 GTDRLPLVPSKYSMTVMVFLMMLSFYYFSRHVEKLARTLFLWKIEVHDQKERVYEMRRWN :: : . .. :..... .::... : ::: . . ..:. :. : KIAA00 GTPSCSWKDLKTMTNFYLVLFYITLLTLSRQIDYYCRLDCLWKKKFKKEHEEFETMENVN 800 810 820 830 840 850 680 690 700 710 720 730 KIAA05 EALVTNMLPEHVARHFLGSKKRDEELYSQTYDEIGVMFASLPNFADFYTEESINNGGIEC . :. :.:: ::: ::.:.: .:. : :.:: . :::::.:.: :::: ..:. :.:: KIAA00 RLLLENVLPAHVAAHFIGDKL-NEDWYHQSYDCVCVMFASVPDFKVFYTECDVNKEGLEC 860 870 880 890 900 910 740 750 760 770 780 790 KIAA05 LRFLNEIISDFDSLLDNPKFRVITKIKTIGSTYMAASGVTPDVNTNGFASSNKEDKSERE ::.:::::.::: :: .::: . ::::::::::::.:.. ::...... ::. KIAA00 LRLLNEIIADFDELLLKPKFSGVEKIKTIGSTYMAAAGLS-------VASGHENQELERQ 920 930 940 950 960 800 810 820 830 840 850 KIAA05 RWQHLADLADFALAMKDTLTNINNQSFNNFMLRIGMNKGGVLAGVIGARKPHYDIWGNTV . :.. ...:..:. . : .:: .:::.: ::.:.:.: :.:::::::::.:::::::: KIAA00 H-AHIGVMVEFSIALMSKLDGINRHSFNSFRLRVGINHGPVIAGVIGARKPQYDIWGNTV 970 980 990 1000 1010 1020 860 870 880 890 900 910 KIAA05 NVASRMESTGVMGNIQVVEETQVILREYGFRFVRRGPIFVKGKGELLTFFLKGRDKLATF :::::::::: .:.:::.::: .::. :. :: : ::::::: :.:. KIAA00 NVASRMESTGELGKIQVTEETCTILQGLGYSCECRGLINVKGKGELRTYFVCTDTAKFQG 1030 1040 1050 1060 1070 1080 920 930 KIAA05 PNGPSVTLPHQVVDNS KIAA00 LGLN >>KIAA1060 ( 887 res) hh13580 (887 aa) initn: 1676 init1: 751 opt: 1405 Z-score: 1293.8 bits: 250.6 E(): 6e-67 Smith-Waterman score: 1842; 36.761% identity (64.661% similar) in 914 aa overlap (29-908:1-872) 10 20 30 40 50 60 KIAA05 QQQEELKGMQLLREILANVFLYLCAIAVGIMSYYMADRKHRKAFLEARQSLEVKMNLEEQ : . .. . .... .. . .. ...:: . KIAA10 GAYHKHLMELALQQTYQDTCNCIKSRIKLEFE 10 20 30 70 80 90 100 110 KIAA05 SQQQENLMLSILPKHVADEMLKDM------KKDESQKDQQQFNTMYMYRHENVSILFADI ..::: :.::.:: :.: :: .. : .... ..:...:. :: :::::.::: KIAA10 KRQQERLLLSLLPAHIAMEMKAEIIQRLQGPKAGQMENTNNFHNLYVKRHTNVSILYADI 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 KIAA05 VGFTQLSSACSAQELVKLLNELFARFDKLAAKYHQLRIKILGDCYYCICGLPDYREDHAV ::::.:.: :: :::..:::::..::..: . . .:::::::::::. ::: .:: KIAA10 VGFTRLASDCSPGELVHMLNELFGKFDQIAKENECMRIKILGDCYYCVSGLPISLPNHAK 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 KIAA05 CSILMGLAMVEAISYVREKTKTGVDMRVGVHTGTVLGGVLGQKRWQYDVWSTDVTVANKM . ::: : :::. ::. : . ..::::::.:.:: ::.: ..::::::: :::.::.: KIAA10 NCVKMGLDMCEAIKKVRDATGVDINMRVGVHSGNVLCGVIGLQKWQYDVWSHDVTLANHM 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 KIAA05 EAGGIPGRVHISQSTMDCLKGEFDVEPGDGGSRCDYLEEKGIETYLIIASKPEVKKTATQ ::::.:::::::. :.. :.: . :: ::: : ::... ..::..: .:. .. . : KIAA10 EAGGVPGRVHISSVTLEHLNGAYKVEEGDGDIRDPYLKQHLVKTYFVI--NPKGERRSPQ 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 KIAA05 NGLNGSALPNGAPASSKSSSPALIET---KEPNGSAHSSGS-TSE--KPEEQDAQADNPS . . .:: .. .:. .: . : : :.: : :. . . KIAA10 HLFRPRHTLDGAKMRASVRMTRYLESWGAAKPFAHLHHRDSMTTENGKISTTDVPMGQHN 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 KIAA05 FPNPRRRLRLQDLADRVVDASEDEHELNQLLNEALLE-RESAQVVKKRNTFLLSMRFMDP : : : :: .. : :.:::. . .:. . : .:... .:. :.. KIAA10 FQN--RTLRTKSQKKRF------EEELNERMIQAIDGINAQKQWLKSEDIQRISLLFYNK 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 KIAA05 EMETRYSVEKEKQSGAAFSCSCVVLLCTALVEILIDPWLMTNYVTFMVGEILL-LILTIC .: .: . .:.:....: .:.::. : . ..: .. .:: .:: .: KIAA10 VLEKEYRATALPAFKYYVTCACLIFFCIFIVQILVLPKTSVLGISFGAAFLLLAFILFVC 390 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 KIAA05 SLAAIFPRAFPKKLVAFSTWIDRTR-------WARNTWAMLAIFILVMANVVDM--LSCL . .. :: . :. .. : : . .... :..: : .: :: KIAA10 FAGQLL--QCSKKASPLLMWLLKSSGIIANRPWPRISLTIITTAIILMMAVFNMFFLSDS 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 KIAA05 QYYTGPSNATAGMETEGSCLENP----------KYYNYVAVLSLIATIMLVQVSHMVKLT . :. :.. .: . :. : .:.::. ....:.. .:. KIAA10 EETIPPTANTTNTSFSASNNQVAILRAQNLFFLPYFIYSCILGLISCSVFLRVNYELKML 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 KIAA05 LMLLVAGAVATINLYAWRPVFDEYDHKRFREHDLPMVALEQMQGFNPGLNGTDRLPLVPS .:... . :: :.. :. .:.. :.. ::. : . . KIAA10 IMMVALVGYNTILLHTHAHVLGDYSQVLFER---------------PGI-WKD----LKT 570 580 590 600 630 640 650 660 670 680 KIAA05 KYSMTVMVFLMMLSFYYFSRHVEKLARTLFLWKIEVHDQKERVYEMRRWNEALVTNMLPE :... .:.. : ..:. : : :::: . . ..:.. :. :..:. :.:: KIAA10 MGSVSLSIFFITL--LVLGRQNEYYCRLDFLWKNKFKKEREEIETMENLNRVLLENVLPA 610 620 630 640 650 690 700 710 720 730 740 KIAA05 HVARHFLGSKKRDEELYSQTYDEIGVMFASLPNFADFYTEESINNGGIECLRFLNEIISD :::.:::. . ..:::: :.:: . :::::.:.: .:::: ..:. :.::::.:::::.: KIAA10 HVAEHFLARSLKNEELYHQSYDCVCVMFASIPDFKEFYTESDVNKEGLECLRLLNEIIAD 660 670 680 690 700 710 750 760 770 780 790 800 KIAA05 FDSLLDNPKFRVITKIKTIGSTYMAASGVTPDVNTNGFASSNKEDKSERER-WQHLADLA ::.::..::: . ::::::::::::.:.. : ..: ..: :: ..:.. .. KIAA10 FDDLLSKPKFSGVEKIKTIGSTYMAATGLS--------AVPSQEHSQEPERQYMHIGTMV 720 730 740 750 760 770 810 820 830 840 850 860 KIAA05 DFALAMKDTLTNINNQSFNNFMLRIGMNKGGVLAGVIGARKPHYDIWGNTVNVASRMEST .::.:. : ::..:::.: ::.:.:.: :.::::::.::.::::::::::::::.:: KIAA10 EFAFALVGKLDAINKHSFNDFKLRVGINHGPVIAGVIGAQKPQYDIWGNTVNVASRMDST 780 790 800 810 820 830 870 880 890 900 910 920 KIAA05 GVMGNIQVVEETQVILREYGFRFVRRGPIFVKGKGELLTFFLKGRDKLATFPNGPSVTLP ::. .:::.:::...:. :. . :: : :::::.: :.:. KIAA10 GVLDKIQVTEETSLVLQTLGYTCTCRGIINVKGKGDLKTYFVNTEMSRSLSQSNVAS 840 850 860 870 880 930 KIAA05 HQVVDNS >>KIAA0422 ( 1160 res) hh01205s1 (1160 aa) initn: 1970 init1: 842 opt: 1049 Z-score: 965.4 bits: 190.3 E(): 1.2e-48 Smith-Waterman score: 2014; 40.505% identity (67.289% similar) in 911 aa overlap (11-910:330-1156) 10 20 30 40 KIAA05 QQQEELKGMQLLREILANVFLYLCAIAVGIMSYYMADRKH : ... :::.:.::. ..:: ..: :. .. 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KIAA04 ILG--------ASQKRKEEKAMLAKLQRTRANSMEGLMPRWVPD-RAFS--RTKDSKAFR 600 610 620 630 640 350 360 370 380 390 KIAA05 DAQADNPSFPNPRRRLRLQDLADRVVDASEDEHELNQLLNEALLERESAQVVKKR-NTFL . :. : : : . :: . : :....:..:. : :. : . :: KIAA04 QMGIDDSSKDN--RGTQ---------DALNPEDEVDEFLSRAIDARSIDQLRKDHVRRFL 650 660 670 680 690 400 410 420 430 440 450 KIAA05 LSMRFMDPEMETRYSVEKEKQSGAAFSCSCVVLLCTALVEILIDPWLMTNYVTFMVG--- :. :. ..: .:: . . . :: .:. .:. ....:: : . :.:.: KIAA04 LT--FQREDLEKKYSRKVDPRFGAYVACALLVFCFICFIQLLIFP-----HSTLMLGIYA 700 710 720 730 740 460 470 480 490 500 510 KIAA05 EILLLILTICSLAAIFP--RAFPKKLVAFSTWIDRTRWARNTWAMLAIFILVMANVVDML :.::.: . :.. ::: : .: : :.: :..: .: .. 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