# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00201.fasta.nr -Q ../query/KIAA0494.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0494, 536 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824716 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7679+/-0.000189; mu= 9.5758+/- 0.011 mean_var=94.7247+/-18.083, 0's: 38 Z-trim: 54 B-trim: 64 in 1/68 Lambda= 0.131778 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|148698690|gb|EDL30637.1| RIKEN cDNA 4732418C07, ( 508) 2377 462.1 1.6e-127 gi|149035627|gb|EDL90308.1| similar to RIKEN cDNA ( 484) 2202 428.9 1.6e-117 gi|37748356|gb|AAH59213.1| RIKEN cDNA 4732418C07 g ( 529) 2121 413.5 7.5e-113 gi|123254756|emb|CAM15280.1| novel protein [Mus mu ( 467) 2119 413.1 8.9e-113 gi|26325977|dbj|BAC26732.1| unnamed protein produc ( 484) 2116 412.5 1.4e-112 gi|26347425|dbj|BAC37361.1| unnamed protein produc ( 467) 2109 411.2 3.3e-112 gi|74208951|dbj|BAE21219.1| unnamed protein produc ( 529) 2103 410.1 8e-112 gi|55730394|emb|CAH91919.1| hypothetical protein [ ( 322) 2034 396.8 4.9e-108 gi|193785989|dbj|BAG50924.1| unnamed protein produ ( 273) 1721 337.2 3.5e-90 gi|221041506|dbj|BAH12430.1| unnamed protein produ ( 418) 1723 337.7 3.8e-90 gi|148698691|gb|EDL30638.1| RIKEN cDNA 4732418C07, ( 461) 1669 327.5 5e-87 gi|20271455|gb|AAH28320.1| 4732418C07Rik protein [ ( 315) 1533 301.5 2.3e-79 gi|123254754|emb|CAM15278.1| novel protein [Mus mu ( 420) 1411 278.4 2.7e-72 gi|74201822|dbj|BAE43367.1| unnamed protein produc ( 248) 1282 253.7 4.4e-65 gi|26324676|dbj|BAC26092.1| unnamed protein produc ( 210) 1113 221.5 1.8e-55 gi|221040980|dbj|BAH12167.1| unnamed protein produ ( 287) 1113 221.6 2.3e-55 gi|50925281|gb|AAH79685.1| MGC80252 protein [Xenop ( 461) 1114 222.0 2.9e-55 gi|47220378|emb|CAF98477.1| unnamed protein produc ( 536) 996 199.6 1.8e-48 gi|42542875|gb|AAH66369.1| Zgc:77197 [Danio rerio] ( 255) 735 149.7 9e-34 gi|215499945|gb|EEC09439.1| RNAse H, putative [Ixo (1603) 313 70.1 5.2e-09 gi|212513128|gb|EEB15756.1| conserved hypothetical ( 395) 297 66.6 1.5e-08 gi|198431966|ref|XP_002126623.1| PREDICTED: simila ( 441) 232 54.3 8.4e-05 gi|157015717|gb|EAU76500.2| AGAP005780-PA [Anophel ( 531) 214 50.9 0.001 gi|121905960|gb|EAY10879.1| viral A-type inclusion (4057) 221 53.0 0.0019 gi|210109748|gb|EEA57611.1| hypothetical protein B ( 770) 204 49.2 0.0051 gi|89298903|gb|EAR96891.1| hypothetical protein TT (1325) 206 49.7 0.006 gi|48124377|ref|XP_393262.1| PREDICTED: similar to ( 426) 198 47.8 0.0072 >>gi|148698690|gb|EDL30637.1| RIKEN cDNA 4732418C07, iso (508 aa) initn: 1484 init1: 1059 opt: 2377 Z-score: 2445.5 bits: 462.1 E(): 1.6e-127 Smith-Waterman score: 2427; 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