# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00236.fasta.huge -Q ../query/KIAA0416.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0416, 529 aa vs ./tmplib.23147 library 1986976 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.3856+/-0.00493; mu= 22.8101+/- 0.337 mean_var=82.3264+/-20.151, 0's: 0 Z-trim: 34 B-trim: 131 in 1/39 Lambda= 0.141353 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0644 ( 887 res) hj03618 ( 887) 442 100.5 5.4e-22 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 387 89.7 1.7e-18 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 384 88.8 2.2e-18 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 351 81.7 1.8e-16 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 339 79.9 1.5e-15 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 325 76.5 7.5e-15 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 307 72.9 1e-13 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 279 67.3 5.7e-12 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 273 65.7 1e-11 KIAA1851 ( 523 res) hg04492 ( 523) 272 65.4 1.2e-11 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 271 65.5 1.6e-11 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 265 64.3 3.7e-11 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 254 62.5 2.4e-10 KIAA1904 ( 821 res) af00058 ( 821) 249 61.1 3.7e-10 KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 240 59.6 1.7e-09 KIAA1484 ( 700 res) fj06928 ( 700) 232 57.5 3.8e-09 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 230 56.9 4.6e-09 KIAA1916 ( 542 res) hg01117 ( 542) 223 55.4 1.2e-08 KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 219 54.9 2.6e-08 KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206) 214 54.2 6.3e-08 KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 211 53.2 7.4e-08 KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 209 52.4 7.8e-08 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 211 53.4 8.7e-08 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 203 51.5 2.2e-07 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 203 52.0 3e-07 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 187 48.8 3e-06 KIAA1194 ( 575 res) fg00908 ( 575) 166 43.9 3.9e-05 KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 167 44.3 4e-05 KIAA0975 ( 1528 res) hj06890 (1528) 165 44.4 7.1e-05 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 161 43.6 0.00013 KIAA0012 ( 789 res) ha00413 ( 789) 157 42.3 0.00016 KIAA1801 ( 1227 res) fj21373 (1227) 140 39.1 0.0022 KIAA0563 ( 1652 res) fh23589 (1652) 134 38.1 0.0059 KIAA1674 ( 538 res) fg03838 ( 538) 130 36.5 0.0061 >>KIAA0644 ( 887 res) hj03618 (887 aa) initn: 709 init1: 269 opt: 442 Z-score: 486.7 bits: 100.5 E(): 5.4e-22 Smith-Waterman score: 467; 28.571% identity (52.314% similar) in 497 aa overlap (1-427:50-530) 10 20 KIAA04 QPRLNAASNVLRRMGLHFKWPL--GAPMLA : . :: . :: .. :: : . 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KIAA08 RNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVNKGWL 240 250 260 270 280 290 170 180 190 200 210 220 KIAA04 YGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWD-CRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHL :::: :: :.. .:... : :. :. : :::: :.: : ...:.:: :..:.: KIAA08 YGLRMLQQLYVSQNAIERISPDA-WEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNL 300 310 320 330 340 350 230 240 250 260 270 280 KIAA04 EHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKIS-NLTCGMEWTWG--TLEKLDLTGNEIKAID :..:.: . : ::.:.:: :. :.:: . . : : .: :: : ::.::.: KIAA08 GDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSIT 360 370 380 390 400 410 290 300 310 320 330 340 KIAA04 LTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSLRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSF .: . .:. : ..:: . :.. . . : : . :. . :. .. : .:: KIAA08 KKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAF-SQTHLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWL--V 420 430 440 450 460 350 360 370 380 390 400 KIAA04 QGRWEHSI--LCHSPDHTQGEDILDAVHGFQLCWNLSTTVTVMATTYRDPTTEYTKRISS .. ..::. : :. :..::. KIAA08 DNNFQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVCDDFLKPQIRTHPETIIALRGMNVTLTC 470 480 490 500 510 520 >>KIAA1580 ( 640 res) fj04979 (640 aa) initn: 220 init1: 179 opt: 351 Z-score: 387.6 bits: 81.7 E(): 1.8e-16 Smith-Waterman score: 373; 25.137% identity (57.650% similar) in 366 aa overlap (14-374:14-352) 10 20 30 40 50 KIAA04 QPRLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLL--F .: .:. : :.:... :..... . ...:: : : . . KIAA15 MLNKMTLHPQQIMIGPRFNRALFDPLLVVLLALQLLVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQFSKV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 KIAA04 YCDSQGFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAF : .... ::.. . .. :.:..:.: .. ..: . .: :.:..:.: :.. :: KIAA15 ICVRKNLREVPDGISTNTRLLNLHENQIQIIKVNSFKHLRHLEILQLSRNHIRTIEIGAF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 KIAA04 QGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLR .:: .:. : : .:.. .:: .:. : ::. : :: KIAA15 NGLANLNTLELFDNRLTTIPNGAFVYL------------------------SKLKELWLR 130 140 150 180 190 200 210 220 230 KIAA04 SNSLRTIPVRLFWDCRSLEFLDLST-NRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKI-NFA .: ...:: : ::. :::. .:: .....: :: .:: :.: .: .: :.. KIAA15 NNPIESIPSYAFNRIPSLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNLAMCNLREIPNLT 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 KIAA04 HFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILL ...:. : :. :..: . : :.:: . ..:..:. ..:... .: . 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KIAA14 ARMSFVIAACQLVLGLLMTSLTESSIQNSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDL 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 KIAA04 GFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYK . .:. .. . : :. :.:.. :.. .. .:: : ...:.....:: .. .: . KIAA14 RLTRIPSNLSSDTQVLLLQSNNIAKTV-DELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQ 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 KIAA04 LKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLR : : : :.: . . . .: :::.: .. ::.:.. . : ::..: ::: ::.:. KIAA14 LTTLHLEENQITEMTDYCLQDLSNLQELYINHNQISTISAHAFAGLKNLLRLHLNSNKLK 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 KIAA04 TIPVRLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSS .: : : . .::.: .. : . .. .: : .:: : : :: : .. :.: KIAA14 VIDSRWFDSTPNLEILMIGENPVIGILDMNFKPLANLRSLVLAGMYLTDIPGNALVGLDS 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 KIAA04 LHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDN-NKL :..: . ::. .. .:. :::. : :. :. :..: :: : ..: ..: KIAA14 LESLSFYDNKLVKVPQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGEL 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 KIAA04 NSLDSKILNSLRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGED :.: :..: :: . ..: KIAA14 VSVDRYALDNLPELTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAIYQKTVESL 320 330 340 350 360 370 >>KIAA1246 ( 832 res) hh00149a (832 aa) initn: 384 init1: 172 opt: 307 Z-score: 338.1 bits: 72.9 E(): 1e-13 Smith-Waterman score: 309; 35.185% identity (57.870% similar) in 216 aa overlap (33-233:44-255) 10 20 30 40 50 KIAA04 RLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMA------CPPKCRC--- : .: : :.::: :: : : KIAA12 PGSPGAPRSRPRCHPAGGRCCLAQALSDQTMETLLGGLLAFGMAFAVVDACPKYCVCQNL 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 KIAA04 -EKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQIST :.: : :.:. :: :. .. : : : : .. :..::... :. : :..: :: KIAA12 SESLGTLCPSKGLLFVPPDIDRRTVELRLGGNFIIHISRQDFANMTGLVDLTLSRNTISH 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 KIAA04 VKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYG-LRK .. .: : .:. : :.::.. : . :. :.:::.: .. :::... : : : KIAA12 IQPFSFLDLESLRSLHLDSNRLPSLGEDTLRGLVNLQHLIVNNNQLGGIADEAFEDFLLT 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 KIAA04 LQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCR----SLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEH :. : : :.:. .: :: .:. :.:. : : .:.. :: : :: .: : KIAA12 LEDLDLSYNNLHGLP----WDSVRRMVNLHQLSLDHNLLDHIAEGTFADLQKLARLDLTS 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 KIAA04 NQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFE :.: :. KIAA12 NRLQKLPPDPIFARSQASALTATPFAPPLSFSFGGNPLHCNCELLWLRRLERDDDLETCG 250 260 270 280 290 300 >>KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) (966 aa) initn: 488 init1: 212 opt: 279 Z-score: 306.7 bits: 67.3 E(): 5.7e-12 Smith-Waterman score: 296; 30.342% identity (56.410% similar) in 234 aa overlap (2-228:14-243) 10 20 30 40 KIAA04 QPRLNAASNVLRRMGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACP : .. ... :.: : .: : . .:. . . . : : KIAA09 RRGAQGGKMHTCCPPVTLEQDLHRKM--H-SWMLQTLAFAVTSLVLSCAETIDYYGEICD 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 KIAA04 PKCRCEK----LLFYCDSQGFHSVPNATDK--GSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTW : ::. : :...:. :. . . : : : ...: ..:.... . KIAA09 NACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASI 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 KIAA04 LHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLH ::: : :. .. ::.:: :..: :..::. : . :: : ::. :....: .: .. KIAA09 LHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 KIAA04 PELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGF-AGLIKLR :. : :. ::.: : .: : ..: :: : ::: :::. : :. . :. KIAA09 PNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNLF-RFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDKVV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 KIAA04 ELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAI ::.::.: KIAA09 ELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCPRRL 240 250 260 270 280 290 >>KIAA1854 ( 572 res) fg02232 (572 aa) initn: 408 init1: 171 opt: 273 Z-score: 302.0 bits: 65.7 E(): 1e-11 Smith-Waterman score: 273; 32.292% identity (59.896% similar) in 192 aa overlap (47-228:35-222) 20 30 40 50 60 70 KIAA04 HFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEK----LLFYCDSQGFHSVP--N : .: ::. : . :...:: .: . 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KIAA18 PPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLGNNGLQEIRTGAFSGLKTLKRLHLN 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 KIAA04 SNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLF .::. : . :: : .:. :. ..: .:... : : ::..: : .: : ..: .: KIAA18 NNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAFSKLNKLKVLILNDNLLLSLPSNVF 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 KIAA04 WDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIK----LRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHT : ::: :::. . :::... . :..::.: KIAA18 -RFVLLTHLDLRGNRLKVMP---FAGVLEHIGGIMEIQLEENPWNCTCDLLPLKAWLDTI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 KIAA04 LFLQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLD KIAA18 TVFVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSASDSSQRGSHADTHVQRLSPTMNPALN 250 260 270 280 290 300 >>KIAA1851 ( 523 res) hg04492 (523 aa) initn: 386 init1: 246 opt: 272 Z-score: 301.3 bits: 65.4 E(): 1.2e-11 Smith-Waterman score: 272; 32.979% identity (56.915% similar) in 188 aa overlap (47-230:53-240) 20 30 40 50 60 70 KIAA04 HFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSVPNATDKGS :: :: : :. : . :...:: .. KIAA18 LVLLGTLLCMLRVGLGTPDSEGFPPRALHNCPYKCICAADLLSCTGLGLQDVPAELPAAT 30 40 50 60 70 80 80 90 100 110 120 130 KIAA04 LGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELILSSNKIFY :.: :: . .:. .: . :: ::::::..... . .: . :. : :::: . KIAA18 ADLDLSHNALQRLRPGWLAPLFQLRALHLDHNELDALGRGVFVNASGLRLLDLSSNTLRA 90 100 110 120 130 140 140 150 160 170 180 190 KIAA04 LPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVRLF--WDCR : . : :..: : :.: : . :.::: :. :.: : : .. . . 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