# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01335s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0406.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0406, 1095 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827261 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2421+/-0.000184; mu= 13.8067+/- 0.010 mean_var=71.8585+/-14.065, 0's: 31 Z-trim: 32 B-trim: 469 in 1/66 Lambda= 0.151299 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|55726421|emb|CAH89980.1| hypothetical protein [ (1088) 6944 1525.7 0 gi|109092083|ref|XP_001090176.1| PREDICTED: hypoth (1089) 6897 1515.5 0 gi|110331853|gb|ABG67032.1| hypothetical protein L (1092) 6182 1359.4 0 gi|117306196|gb|AAI26509.1| Hypothetical protein L (1092) 6168 1356.3 0 gi|31418696|gb|AAH53067.1| RIKEN cDNA 2610036D13 g (1085) 6119 1345.6 0 gi|118100773|ref|XP_001234099.1| PREDICTED: hypoth (1094) 4359 961.5 0 gi|60098895|emb|CAH65278.1| hypothetical protein [ ( 541) 2253 501.6 4.8e-139 gi|210098747|gb|EEA46852.1| hypothetical protein B (1098) 1954 436.5 3.7e-119 gi|156211222|gb|EDO32342.1| predicted protein [Nem (1078) 1313 296.6 4.8e-77 gi|123232801|emb|CAM20390.1| novel protein contain ( 183) 1109 251.5 3e-64 gi|47212223|emb|CAF91941.1| unnamed protein produc (1149) 1074 244.4 2.6e-61 gi|210098745|gb|EEA46850.1| hypothetical protein B ( 795) 891 204.4 2e-49 gi|134026067|gb|AAI35682.1| LOC100124746 protein [ ( 978) 753 174.3 2.8e-40 gi|210098744|gb|EEA46849.1| hypothetical protein B ( 192) 608 142.2 2.6e-31 gi|12847979|dbj|BAB27782.1| unnamed protein produc ( 89) 492 116.6 5.9e-24 gi|108879261|gb|EAT43486.1| conserved hypothetical (1007) 504 120.0 6.5e-24 gi|190589413|gb|EDV29435.1| hypothetical protein T ( 835) 492 117.3 3.5e-23 gi|156205222|gb|EDO28280.1| predicted protein [Nem ( 213) 427 102.7 2.2e-19 gi|154698968|gb|EDN98706.1| hypothetical protein S (1015) 426 103.0 8.8e-19 gi|76155232|gb|AAX26487.2| SJCHGC02325 protein [Sc ( 360) 419 101.1 1.1e-18 gi|212512940|gb|EEB15606.1| conserved hypothetical (1013) 423 102.3 1.4e-18 gi|215503313|gb|EEC12807.1| conserved hypothetical ( 184) 403 97.4 7.3e-18 gi|221130453|ref|XP_002156352.1| PREDICTED: simila ( 918) 399 97.0 4.8e-17 gi|50259632|gb|EAL22302.1| hypothetical protein CN (1181) 398 96.9 6.8e-17 gi|194183105|gb|EDW96716.1| GE24736 [Drosophila ya (1082) 383 93.6 6.2e-16 gi|190652464|gb|EDV49719.1| GG17331 [Drosophila er (1082) 380 92.9 9.7e-16 gi|157017591|gb|EAA08549.3| AGAP004152-PA [Anophel ( 949) 374 91.6 2.2e-15 gi|116509910|gb|EAU92805.1| hypothetical protein C (1134) 368 90.3 6.2e-15 gi|46122391|ref|XP_385749.1| hypothetical protein (1064) 362 89.0 1.5e-14 gi|160703773|gb|EAT79603.2| hypothetical protein S ( 964) 353 87.0 5.3e-14 gi|198131755|gb|EAL27735.2| GA14211 [Drosophila ps (1079) 347 85.7 1.4e-13 gi|220726492|gb|EED80440.1| predicted protein [Pos ( 424) 341 84.2 1.7e-13 gi|194102680|gb|EDW24723.1| GL23236 [Drosophila pe (1079) 342 84.7 3e-13 gi|158598327|gb|EDP36241.1| conserved hypothetical ( 807) 330 81.9 1.5e-12 gi|7299243|gb|AAF54439.1| CG16908 [Drosophila mela (1080) 328 81.6 2.5e-12 gi|194120780|gb|EDW42823.1| GM26217 [Drosophila se (1082) 321 80.1 7.3e-12 gi|194199995|gb|EDX13571.1| GD20763 [Drosophila si (1082) 320 79.8 8.5e-12 gi|164650946|gb|EDR15186.1| predicted protein [Lac (1116) 307 77.0 6.2e-11 gi|194166346|gb|EDW81247.1| GK11128 [Drosophila wi (1032) 306 76.8 6.8e-11 gi|115926031|ref|XP_001177642.1| PREDICTED: hypoth ( 122) 291 72.9 1.2e-10 gi|49646974|emb|CAG83361.1| YALI0B19734p [Yarrowia ( 901) 301 75.6 1.3e-10 gi|40738853|gb|EAA58043.1| hypothetical protein AN (1191) 297 74.9 3e-10 gi|167869432|gb|EDS32815.1| conserved hypothetical (1002) 290 73.3 7.5e-10 gi|162681443|gb|EDQ67870.1| predicted protein [Phy (1318) 284 72.1 2.3e-09 gi|114188368|gb|EAU30068.1| conserved hypothetical (1188) 280 71.1 3.9e-09 gi|211583415|emb|CAP91427.1| Pc13g03580 [Penicilli (1145) 272 69.4 1.3e-08 gi|150856172|gb|EDN31364.1| hypothetical protein B ( 729) 268 68.4 1.6e-08 gi|193916645|gb|EDW15512.1| GI24874 [Drosophila mo (1088) 268 68.5 2.2e-08 gi|88183566|gb|EAQ91034.1| hypothetical protein CH ( 856) 264 67.6 3.4e-08 gi|28918911|gb|EAA28580.1| predicted protein [Neur (1125) 264 67.6 4.2e-08 >>gi|55726421|emb|CAH89980.1| hypothetical protein [Pong (1088 aa) initn: 5089 init1: 5089 opt: 6944 Z-score: 8182.1 bits: 1525.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 6944; 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