# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01274.fasta.huge -Q ../query/KIAA0405.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0405, 706 aa vs ./tmplib.23147 library 1986799 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6025+/-0.00694; mu= 22.4547+/- 0.473 mean_var=233.5074+/-55.416, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.083931 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 1684 217.2 3.8e-57 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 406 62.5 1.5e-10 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 355 56.4 1.1e-08 KIAA1465 ( 785 res) fh13187 ( 785) 325 52.8 1.4e-07 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 305 50.6 8.2e-07 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 307 51.3 8.4e-07 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 304 50.5 8.9e-07 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 306 51.1 8.9e-07 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 284 47.6 3.9e-06 KIAA1916 ( 542 res) hg01117 ( 542) 263 45.0 2.2e-05 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 259 45.1 4e-05 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 252 43.7 5.8e-05 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 250 44.4 0.0001 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 225 41.3 0.00081 KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206) 216 40.0 0.0016 KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 214 39.4 0.0016 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 211 38.7 0.0017 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 211 39.1 0.0021 KIAA0231 ( 823 res) fk16230 ( 823) 207 38.6 0.0029 KIAA1851 ( 523 res) hg04492 ( 523) 204 37.8 0.0031 KIAA1904 ( 821 res) af00058 ( 821) 203 38.1 0.004 >>KIAA1469 ( 662 res) fj01881 (662 aa) initn: 1873 init1: 1395 opt: 1684 Z-score: 1117.8 bits: 217.2 E(): 3.8e-57 Smith-Waterman score: 1989; 47.149% identity (75.193% similar) in 649 aa overlap (70-706:28-662) 40 50 60 70 80 90 KIAA04 FYFRTSEMGLQTTKWPSHGAFFLKSWLIISLGLYSQVSKLL----ACPSVCRCDRNFVYC .::. ::. : .:::::::: .:.:: KIAA14 RKLPCIKTSTLLTMISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYC 10 20 30 40 50 100 110 120 130 140 150 KIAA04 NERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPK :.: :::.: :::: .:.:::.::::::::.:..:.:. .:. .::: :.::::: :::: KIAA14 NDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPK 60 70 80 90 100 110 160 170 180 190 200 210 KIAA04 NVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKN :. ::::::::.::. .:... ::::::::::.:.:..:.::::.. :.:::::.: KIAA14 YVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRN 120 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 270 KIAA04 HLSSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHL :::..: ::: ..:::.:.:::..::. ..:.::::.::..:::::.:.:... .: .: KIAA14 HLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNL 180 190 200 210 220 230 280 290 300 310 320 330 KIAA04 TKLKEFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLR ..: :.:.:::::. : .::::.: .::::::.::..: .::: ::.: :::.:::.: KIAA14 VNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLS 240 250 260 270 280 290 340 350 360 370 380 390 KIAA04 MLTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMA : ::.::.:.:. :: :::::.: :..::: .::. .: ..::::.:::.::.::::: KIAA14 NLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMA 300 310 320 330 340 350 400 410 420 430 440 450 KIAA04 VRELNMNLLSCPTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTI- ...:: .:..: . :. :: . :: :. : .. :.:.: : : : KIAA14 IKDLNAELFDCKDS--GIV------STIQITTAIPNTVYPAQGQW---PAPVT-KQPDIK 360 370 380 390 400 460 470 480 490 500 510 KIAA04 -PDWDGRERVT-PPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIV : ...: : . : .... :.. .:..:: . . : .:.:.:.::: . : . KIAA14 NPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSI 410 420 430 440 450 460 520 530 540 550 560 570 KIAA04 QERIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDT-ICSEATTHASYLNNGSNT : ::.::... .. ::: : :..:.::... : ..: .: :. : . : ..: KIAA14 TETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTT 470 480 490 500 510 520 580 590 600 610 620 630 KIAA04 ASSHEQTTSHSMGSPFL-LAGLIGGAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRR . ... .. .: : ::..::::: .: ..::.. ::..:..: :.. :..::: KIAA14 LNREQEKEPYK--NPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRR 530 540 550 560 570 580 640 650 660 670 680 KIAA04 -KDDYCEAGTKKDNSILEMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPIYTPNGGINYTDCHIPN :::: ::::::::::::. :::::.. ..:. . : .: .. :. ::: : . : . KIAA14 RKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSES 590 600 610 620 630 640 690 700 KIAA04 --NMRYCNSSVPDLEHCHT : : .:..:: .: :. KIAA14 SSNRSYRDSGIPDSDHSHS 650 660 >>KIAA1580 ( 640 res) fj04979 (640 aa) initn: 559 init1: 249 opt: 406 Z-score: 281.5 bits: 62.5 E(): 1.5e-10 Smith-Waterman score: 475; 30.000% identity (62.000% similar) in 350 aa overlap (66-406:31-351) 40 50 60 70 80 90 KIAA04 HHIVFYFRTSEMGLQTTKWPSHGAFFLKSWLIISLGLYSQVSKLLACPSVCRCDRNF--V : ..: . . . . .::::: :. .: : KIAA15 MLNKMTLHPQQIMIGPRFNRALFDPLLVVLLALQLLVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQFSKV 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 KIAA04 YCNERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNL : ...: :: :: .. .: ::.::: .. .:.: . . KIAA15 ICVRKNLREVPDGISTNTRLLNLHENQI-------QIIKVNSFKHL-------------- 70 80 90 160 170 180 190 200 210 KIAA04 PKNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLS .....:.:..:.:.:: .:. : .:. :.: :: ..: . .::: .:: :.: KIAA15 -RHLEILQLSRNHIRTIEIGAFNGLANLNTLELFDNRLTT--IPNGAFVYLSKLKELWLR 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 KIAA04 KNHLSSVPVG----LPVDLQELRVDE-NRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIA .: . :.: .: .:..: . : .:.. ::. ::..:..:. : :: . KIAA15 NNPIESIPSYAFNRIP-SLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYL----NLAMCNLRE 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 KIAA04 EGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHP-PPDLPGT-HLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLER ... : :: :... : :: : .. : :: .:.. ..::. : .::.::..: . KIAA15 IPNLTPLIKLDELDLSGNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNLQSLVE 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 KIAA04 LDISNNQLRMLTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQ .....:.: .: . .: : .:... ..::: :.:.: :.. :.: . : .. :. KIAA15 INLAHNNLTLLPHDLFTPLHHLERIHLHHNPWNCNCDILWLSWWIKDMAPSNTACCARCN 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 KIAA04 GPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTP : ...: . ::..: ..: KIAA15 TPPNLKGRYIGELDQNYFTCYAPVIVEPPADLNVTEGMAAELKCRASTSLTSVSWITPNG 340 350 360 370 380 390 >>KIAA1497 ( 730 res) hg01608 (730 aa) initn: 176 init1: 140 opt: 355 Z-score: 247.8 bits: 56.4 E(): 1.1e-08 Smith-Waterman score: 386; 24.026% identity (52.922% similar) in 616 aa overlap (49-599:75-666) 20 30 40 50 60 70 KIAA04 SSHFDFAVYFFFSFSFSHHIVFYFRTSEMGLQTTKWPSHGAFFLKSWLIISLGLYSQVSK :. :. ::. . . :. : .. . :.. KIAA14 ECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDLRLTRIPSNLSSDTQVLLLQSNNIAKTVDE 50 60 70 80 90 100 80 90 100 110 120 130 KIAA04 LLACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHT : .. . : : : .. : :. .:.:.:..:::.. :....... KIAA14 LQQLFNLTELD--FSQNNFTNIKEVGLANLTQLTTLHLEENQITEMT-DYCLQDLSNLQE 110 120 130 140 150 160 140 150 160 170 180 190 KIAA04 VYLYGNQLDEFPMNLP---KNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVG .:. ::.. . . ::. :::. :....:. . . .:: : . .: . .: KIAA14 LYINHNQISTISAHAFAGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDSTPNLEILMIGENPV--IG 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 KIAA04 VEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVP----VGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTS . : :. .:. : :. .:...: ::: .:. : .:... . ..:.:.. . KIAA14 ILDMNFKPLANLRSLVLAGMYLTDIPGNALVGLD-SLESLSFYDNKLVKVPQLALQKVPN 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 KIAA04 LERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLS-------HPPPDLPGTHLIRLY :. : .. : . . : :: :... .:::..: :... . .:: .: .: KIAA14 LKFLDLNKNPIHK--IQEGDFKNMLRLKELGI--NNMGELVSVDRYALDNLP--ELTKLE 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 KIAA04 LQDN-QINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCS .: ....: :: .. :: : ..:: : . : . ..: ::.... ..:: ::: KIAA14 ATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAIYQKTVESLPNLREISIHSNPLRCDCV 340 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 KIAA04 IKWVTEWLKYIPSSLNVRGFM------CQGPEQVRGMAVRELNMNLLS--C-PTTT---- :.:.. .. :.: :: : : . .: :.:. .. : : : . KIAA14 IHWIN------SNKTNIR-FMEPLSMFCAMPPEYKGHQVKEVLIQDSSEQCLPMISHDSF 400 410 420 430 440 420 430 440 450 KIAA04 P-------GLPLFTPAPSTASPTTQ----PPT---LSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPD : : .: . : : . : ... . : .: . : .. .: KIAA14 PNRLNVDIGTTVFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLSDKYKLSSEGTLEISNIQI 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 KIAA04 WD-GRE-----------------RVTPPISERIQLSIHFVNDT---SIQVSWLSLFTVMA : :: .:. . . :. .:..: :: ::: .::. KIAA14 EDSGRYTCVAQNVQGADTRVATIKVNGTLLDGTQVLKIYVKQTESHSILVSWKVNSNVMT 510 520 530 540 550 560 500 510 520 530 540 550 KIAA04 YKLTWVKMGHSLVGG-IVQERIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDTI .: : . .. . :. : . .. .:..:.: . :..::. . : . . KIAA14 SNLKWSSATMKIDNPHITYTARVPVDVHEYNLTHLQPSTDYEVCLT---VSNIHQQTQKS 570 580 590 600 610 620 560 570 580 590 600 610 KIAA04 CSEATT-HASYLNNGSNTASSHEQTTSHSMGSPFLLAGLIGGAVIFVLVVLLSVFCWHMH : ..:: .:.. . :. .: . . ::: : . .: . :: : KIAA14 CVNVTTKNAAFAVDISDQETS--TALAAVMGSMFAVISLASIAVYFAKRFKRKNYHHSLK 630 640 650 660 670 680 620 630 640 650 660 670 KIAA04 KKGRYTSQKWKYNRGRRKDDYCEAGTKKDNSILEMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPI KIAA14 KYMQKTSSIPLNELYPPLINLWEGDSEKDKDGSADTKPTQVDTSRSYYMW 690 700 710 720 730 >>KIAA1465 ( 785 res) fh13187 (785 aa) initn: 277 init1: 181 opt: 325 Z-score: 227.9 bits: 52.8 E(): 1.4e-07 Smith-Waterman score: 325; 26.235% identity (53.395% similar) in 324 aa overlap (149-467:13-327) 120 130 140 150 160 170 KIAA04 NQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHLQENNIQTISRAALAQL :: ::. : .. .. : : . KIAA14 GHNTCVYLAWAIFPA-LPRRVWRRGFSPRTFTESRRILGAAM 10 20 30 40 180 190 200 210 220 230 KIAA04 LKLEELHLDDNSISTVGV--EDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELRVDEN . :. : : ....: : : . . .. . ..: :: :::... : .. : KIAA14 FPLRALWLVWALLGVAGSCPEPCACVDKYAHQFADCAYKELREVPEGLPANVTTLSLSAN 50 60 70 80 90 100 240 250 260 270 280 290 KIAA04 RIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPP-PDL .:.:. :: ..:.. : . : . . . :... :..::.... .: .: : :: KIAA14 KITVLRRGAFADVTQVTSLWLAHNEV--RTVEPGALAVLSQLKNLDLSHNFISSFPWSDL 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 KIAA04 PGTHLIRLY-LQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDNLSNLKQLTAR . ..: .. :... .: :.. : :. : :.::.:: :. :.:: :: :..: KIAA14 RNLSALQLLKMNHNRLGSLPRDALGALPDLRSLRINNNRLRTLAPGTFDALSALSHLQLY 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 410 KIAA04 NNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSL-NVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGL .::. : :.. :. : :: . .. : .: ..:. : .: . : . :.. KIAA14 HNPFHCGCGLVWLQAWAASTRVSLPEPDSIACASPPALQGVPVYRLP----ALPCAPPSV 220 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 470 KIAA04 PLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQL : . : : : :.. . ::: . :: : . ::. KIAA14 HLSAEPPLEAPGTPLRAGLAFVLHCIADGHPTPRLQWQLQIP--GGTVVLEPPVLSGEDD 280 290 300 310 320 330 480 490 500 510 520 530 KIAA04 SIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSLVNLEPRS KIAA14 GVGAEEGEGEGDGDLLTQTQAQTPTPAPAWPAPPATPRFLALANGSLLVPLLSAKEAGVY 340 350 360 370 380 390 >>KIAA0848 ( 988 res) hk05607 (988 aa) initn: 269 init1: 209 opt: 305 Z-score: 214.1 bits: 50.6 E(): 8.2e-07 Smith-Waterman score: 315; 28.214% identity (58.929% similar) in 280 aa overlap (184-435:392-663) 160 170 180 190 200 KIAA04 PKNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISL------ ::..: .. ::. .. .: . : KIAA08 LYPGPNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGL-TVNCKERGFNNISELLPRPLN 370 380 390 400 410 420 210 220 230 240 250 260 KIAA04 -KLLFLSKNHLSSVPVGLPVD---LQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLT : :.::.: .... . . :. :.. .:::. ..: :: :: .:. :...:: . KIAA08 AKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDI- 430 440 450 460 470 270 280 290 300 310 KIAA04 NKGIAEGTFSHLTKLK----EFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFS . .. : : : .:. ::...:. .:. .: :.:..: . .: ::. KIAA08 -EKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKL--LFLNNNLLRTLPTDAFA 480 490 500 510 520 530 320 330 340 350 360 370 KIAA04 NLRKLERLDISNNQLRML-TQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSL . .: ::.. .: . .: . ::...:. . :. .::: : :.. .:.. : ::. KIAA08 GT-SLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETI-SSV 540 550 560 570 580 590 380 390 400 410 420 KIAA04 NVRG-FMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPT-----------TTPGLPLFTPAPSTASPT .: : .:..::.. :: .....: :: . :: . ::..::: KIAA08 SVVGDVLCRSPENLTHRDVRTIELEVL-CPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPY 600 610 620 630 640 650 430 440 450 460 470 480 KIAA04 T-QPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQLSIHFVNDTSIQV .:: .: KIAA08 EFSPPGGPVPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQ 660 670 680 690 700 710 >>KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618 aa) initn: 734 init1: 189 opt: 307 Z-score: 214.0 bits: 51.3 E(): 8.4e-07 Smith-Waterman score: 334; 27.103% identity (55.452% similar) in 321 aa overlap (87-406:80-347) 60 70 80 90 100 110 KIAA04 HGAFFLKSWLIISLGLYSQVSKLLACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLGIPEGVTVLYL ::. ... . .. :. :: .:. KIAA08 LFGGSAPGLHLEAAPDGDGQRLLPSGSRAGRCEGTMALTPGWGSSAGPVR-PELWLLLWA 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA04 HNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHLQENNIQTISRAALA ... .. :: . . :: .:. :. .: :.:.:.. :.:. ::: : . .: KIAA08 AAWRLGASACPALCTCTGT--TVDCHGTGLQAIPKNIPRNTERLELNGNNITRIHKNDFA 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 KIAA04 QLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELRVDEN : .:. :.: .:.:..: : ::: . .: .:..::...: KIAA08 GLKQLRVLQLMENQIGVV--ERGAFDD---MK------------------ELERLRLNRN 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 KIAA04 RIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPPPDLP .. .. .. ::: .: :: .. : . ..: . .: : ::. KIAA08 QLHMLPELLFQNNQALSRLDLSENAI--QAIPRKAFRGATDLKN---------------- 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 KIAA04 GTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDNLSNLKQLTARNN : :. :::. : :: :: :: : ..::.. . . :... .:. . ..: KIAA08 ------LQLDKNQISCIEEGAFRALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSFNHMPKLRTFRLHSN 250 260 270 280 290 360 370 380 390 400 410 KIAA04 PWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGF-MCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGLPL :::: . :...::. :. . : .:.:: ..::. : :.. . .:: KIAA08 HLFCDCHLAWLSQWLRQRPT---IGLFTQCSGPASLRGLNVAEVQKSEFSCSGQGEAGRV 300 310 320 330 340 350 420 430 440 450 460 470 KIAA04 FTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQLSI KIAA08 PTCTLSSGSCPAMCTCSNGIVDCRGKGLTAIPANLPETMTEIRLELNGIKSIPPGAFSPY 360 370 380 390 400 410 >>KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) (966 aa) initn: 274 init1: 213 opt: 304 Z-score: 213.5 bits: 50.5 E(): 8.9e-07 Smith-Waterman score: 306; 26.510% identity (57.718% similar) in 298 aa overlap (208-497:420-700) 180 190 200 210 220 230 KIAA04 LLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSV---PVGLPVDLQELRVD : ..:..:... : . :. :.. KIAA09 LQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLG 390 400 410 420 430 440 240 250 260 270 280 290 KIAA04 ENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLK----EFSIVRNSLSH .:::..:.: :: .::.:.:: ..:: . . .. : : .:. .....:. : KIAA09 NNRISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNRI--ERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSG 450 460 470 480 490 500 300 310 320 330 340 KIAA04 PPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRML-TQGVFDNLSNLK .:. .: :.:..: .. .: .::.: : ::.. .:.. : ..::.:.:..: KIAA09 TFDPVPNLQL--LFLNNNLLQAMPSGVFSGLTLL-RLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLI 510 520 530 540 550 560 350 360 370 380 390 400 KIAA04 QLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTT :. ..::: : :.: . :.. . .. : .:..:.. .: .. .:: :: KIAA09 QIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELL-CPDY 570 580 590 600 610 620 410 420 430 440 450 460 KIAA04 TPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPPISE . . . ::.::. ...: . . :: . .: : . :.: KIAA09 SD-VVVSTPTPSS---------IQVPARTSAVTPAVRLNSTGAPASLGAGGGASSVPLSV 630 640 650 660 670 470 480 490 500 510 520 KIAA04 RIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSGEKQHLSLVNL : ::. .: :. :. . :: . KIAA09 LI-LSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSVYGGGGGTG 680 690 700 710 720 730 >>KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496 aa) initn: 189 init1: 189 opt: 306 Z-score: 213.5 bits: 51.1 E(): 8.9e-07 Smith-Waterman score: 306; 32.093% identity (60.930% similar) in 215 aa overlap (217-427:71-276) 190 200 210 220 230 240 KIAA04 DDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLP-VDLQELRVDENRIAVISDMA : .::. : ... .:: ::: :. : KIAA02 TLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAVAPQTSILDLRF--NRIREIQPGA 50 60 70 80 90 250 260 270 280 290 300 KIAA04 FQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSL-SHPPPDLPG-THLIRL :. : .:. :....: . : : :.: : .:: . . .: . : . : . : .: KIAA02 FRRLRNLNTLLLNNNQI--KRIPSGAFEDLENLKYLYLYKNEIQSIDRQAFKGLASLEQL 100 110 120 130 140 150 310 320 330 340 350 360 KIAA04 YLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCS ::. :::. . .:..: ::::: . ::.. :. :.:..: ..:.: .: ::: KIAA02 YLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGTFNHLESMKRLRLDSNTLHCDCE 160 170 180 190 200 210 370 380 390 400 410 420 KIAA04 IKWVTEWLKYIPSSLNVRGF-MCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTTTPGLPLFTPAPST : :... :: : :... .:. :....: .: .. . :.: : .: :. KIAA02 ILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCER-----PRITSEPQD 220 230 240 250 260 270 430 440 450 460 470 480 KIAA04 ASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTIPDWDGRERVTPPISERIQLSIHFVNDTS :. :. KIAA02 ADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQETDQGI 280 290 300 310 320 330 >>KIAA1854 ( 572 res) fg02232 (572 aa) initn: 255 init1: 132 opt: 284 Z-score: 202.0 bits: 47.6 E(): 3.9e-06 Smith-Waterman score: 284; 31.795% identity (61.538% similar) in 195 aa overlap (206-393:382-572) 180 190 200 210 220 230 KIAA04 AQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVD---LQELR : : :.:. :.:..: . .. :. :. KIAA18 CTSQSSDNGLNVNCQERKFTNISDLQPKPTSPKKLYLTGNYLQTVYKNDLLEYSSLDLLH 360 370 380 390 400 410 240 250 260 270 280 290 KIAA04 VDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPP . .::::::.. :: :::::.:: ..:: : . . . :. : .:. . . : ... 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