# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00651s2.fasta.nr -Q ../query/KIAA0399.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0399, 2982 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824775 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6239+/-0.00019; mu= 15.9499+/- 0.011 mean_var=92.9107+/-17.916, 0's: 26 Z-trim: 32 B-trim: 23 in 1/65 Lambda= 0.133058 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 45, opt: 33, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114665781|ref|XP_511813.2| PREDICTED: zinc fing (3016) 19854 3823.4 0 gi|148887332|sp|O43149.5|ZZEF1_HUMAN RecName: Full (2961) 19794 3811.9 0 gi|73747881|ref|NP_055928.3| zinc finger, ZZ type (2961) 19769 3807.1 0 gi|109112827|ref|XP_001117691.1| PREDICTED: simila (3069) 19555 3766.1 0 gi|194675936|ref|XP_869342.3| PREDICTED: similar t (2962) 18235 3512.6 0 gi|194217506|ref|XP_001502762.2| PREDICTED: simila (2968) 18189 3503.8 0 gi|109488501|ref|XP_237787.4| PREDICTED: similar t (2964) 18136 3493.6 0 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