# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00180s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0396.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0396, 627 aa vs ./tmplib.23147 library 1986878 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.4612+/-0.00479; mu= 21.5943+/- 0.327 mean_var=93.0897+/-23.134, 0's: 0 Z-trim: 25 B-trim: 50 in 1/39 Lambda= 0.132930 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1785 ( 617 res) fh12727 ( 617) 1387 277.0 3.3e-75 KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864) 321 73.4 1.9e-13 KIAA0229 ( 1180 res) ha02570 (1180) 318 72.5 2.3e-13 KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644) 306 70.4 1.3e-12 KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 ( 803) 293 67.4 5.3e-12 KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089) 284 65.9 2e-11 KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777) 280 65.5 4.3e-11 KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059) 277 64.5 5.1e-11 KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 273 64.4 1.3e-10 KIAA0957 ( 693 res) hj05670 ( 693) 253 59.6 1e-09 KIAA0172 ( 1366 res) ha02512s1 (1366) 234 56.5 1.7e-08 KIAA1758 ( 1662 res) fh20539(revised) (1662) 234 56.6 1.9e-08 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 219 53.5 1.2e-07 KIAA1146 ( 271 res) hg00368 ( 271) 210 50.6 2e-07 KIAA0946 ( 667 res) hj04787 ( 667) 212 51.7 2.3e-07 KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 185 46.8 1e-05 KIAA1977 ( 606 res) fh18284(revised) ( 606) 180 45.5 1.6e-05 KIAA2015 ( 996 res) fk09763 ( 996) 178 45.5 2.6e-05 KIAA0823 ( 578 res) hh02763s1 ( 578) 169 43.3 6.6e-05 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 169 44.0 0.0001 KIAA1981 ( 862 res) fk03148(revised) ( 862) 156 41.2 0.00045 KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 153 40.5 0.00064 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 149 39.8 0.0011 KIAA1518 ( 876 res) sh00483 ( 876) 149 39.8 0.0011 KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715) 146 39.8 0.0023 >>KIAA1785 ( 617 res) fh12727 (617 aa) initn: 1212 init1: 725 opt: 1387 Z-score: 1442.1 bits: 277.0 E(): 3.3e-75 Smith-Waterman score: 1438; 40.694% identity (69.874% similar) in 634 aa overlap (8-627:7-616) 10 20 30 40 50 60 KIAA03 MEGLAGYVYKAASEGKVLTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAK :..:: .::. :. :: ..:. .. :.. . .: .:::..::: :: KIAA17 MDLKTAVFNAARDGKLRLLTKLLASKSKEEVSSLIS--EKTNG--ATPLLMAARYGHLD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA03 VVRLLLEHYRVQTQQTGTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVT .:..:::. .. . :.: ::: .:.:: :: :..:::..::. :..:::.::.::.: KIAA17 MVEFLLEQCSASIEVGGSVNFDGETIEGAPPLWAASAAGHLKVVQSLLNHGASVNNTTLT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 KIAA03 NSTPLRAACFDGRLDIVKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADP ::::::::::::.:.:::::::..:.. ..:.. .:::::. :::: ....::::. :: KIAA17 NSTPLRAACFDGHLEIVKYLVEHKADLEVSNRHGHTCLMISCYKGHKEIAQYLLEKGADV 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 KIAA03 NAKAHCGATALHFAAEAGHIDIVKELIKWRAAIVVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLLS : :. : :::: ::.: .::.: :. . : . .:.::::: :. . ....:..: KIAA17 NRKSVKGNTALHDCAESGSLDIMKMLLMYCAKMEKDGYGMTPLLSASVTGHTNIVDFLTH 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 KIAA03 HADCDRRSRIEALELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPP-- ::. .. ::.:::::::.:.. .. :.. . .: :: :..: ::. : : : KIAA17 HAQTSKTERINALELLGATFVDKKR--DLLGALKYWKKAMNMRYSDRTNIISKPV-PQTL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 KIAA03 IHAYGNRTECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAVYADNM : :: : . .:::.. : : ..:..:..:::::: .. :.:. : ::::::::. 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KIAA16 EVVKFLIQCDWTMAGQQQGVFKKSHAIQQALIAAASMGYTEIVSYLLDLPEKDEEEVERA 840 850 860 870 880 890 80 90 100 110 120 130 KIAA03 RFDGY-VIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRLDIVK ..... . : ::: ::: :..:: .::. .:: : . . ...:: .. .:. .:: KIAA16 QINSFDSLWGETALTAAAGRGKLEVCRLLLEQGAAVAQPNRRGAVPLFSTVRQGHWQIVD 900 910 920 930 940 950 140 150 160 170 180 190 KIAA03 YLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFAAEAG :. ..:....:.: : ::.:: .:: .: .:: : :. . : ::: .: : KIAA16 LLLTHGADVNMADKQGRTPLMMAASEGHLGTVDFLLAQGASIALMDKEGLTALSWACLKG 960 970 980 990 1000 1010 200 210 220 230 240 250 KIAA03 HIDIVKELIKWRAAIV-VNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLLSHADCDRRSRIEALELLG :...:. :. :: .. .: ::: .:: :.::..:..: KIAA16 HLSVVRSLVDNGAATDHADKNGRTPLDLAAFYGDAEVVQFLVDHGAMIEHVDYSGMRPLD 1020 1030 1040 1050 1060 1070 260 270 280 290 300 310 KIAA03 ASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPPIHAYGNRTECRNPQELESI KIAA16 RAVGCRNTSVVVTLLKKGAKIGPATWAMATSKPDIMIILLSKLMEEGDMFYKKGKVKEAA 1080 1090 1100 1110 1120 1130 >>KIAA0229 ( 1180 res) ha02570 (1180 aa) initn: 434 init1: 201 opt: 318 Z-score: 331.8 bits: 72.5 E(): 2.3e-13 Smith-Waterman score: 318; 31.228% identity (55.439% similar) in 285 aa overlap (49-327:162-436) 20 30 40 50 60 70 KIAA03 TLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAKVVRLLLEHYRVQTQQTGT :: .:: .: :..::::.. : . KIAA02 HAALNGHKDVVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIH------QGPSH 140 150 160 170 180 80 90 100 110 120 130 KIAA03 VRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRLDIVK .: . :. ::: ::: :: ::::.:. . .. . . ::: : . :::..:: KIAA02 TRVNEQNNDNETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVK 190 200 210 220 230 240 140 150 160 170 180 190 KIAA03 YLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFAAEAG .:.. . :. : .: : .:: .:: ::. ::. : : ... : .::: :: : KIAA02 MLLNAHPNLLSCNTKKHTPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG-SALHEAALFG 250 260 270 280 290 300 200 210 220 230 240 250 KIAA03 HIDIVKELIKWRAAIVV-NGHGMTPLKVAAE--SCKADVVELLLSHADCDRRSRIEALEL . :.:. :. . . . ..::.: : .. : : :.. . :. .:: : .. KIAA02 KTDVVQILLAAGTDVNIKDNHGLTALDTVRELPSQKSQQIAALIEDHMTGKRSTKE-VDK 310 320 330 340 350 360 260 270 280 290 300 310 KIAA03 LGASFANDRENYDII--KTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPPIHAYGNRTECRNPQE ..: : :. . :. : . : : :.: : .: : :.. . KIAA02 TPPPQPPLISSMDSISQKSQGDVEKAVTELIIDFDANAEEE--GPYEALYNAISCHSLDS 370 380 390 400 410 420 320 330 340 350 360 370 KIAA03 LESIRQ-DRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAVYADNMEFEQCIKLWLHALH . : :. :.:. . : KIAA02 MASGRSSDQDSTNKEAEAAGVKPAGVRPRERPPPPAKPPPDEEEEDHIDKKYFPLTASEV 430 440 450 460 470 480 >>KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644 aa) initn: 391 init1: 256 opt: 306 Z-score: 318.2 bits: 70.4 E(): 1.3e-12 Smith-Waterman score: 314; 30.337% identity (58.052% similar) in 267 aa overlap (50-294:828-1085) 20 30 40 50 60 70 KIAA03 LAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAKVVRLLL---EHYRVQTQQT : :: ::..::. :: ....:... : KIAA17 DILQYLLTCEWSPGPPQPGTLRKSHALQQALTAAASMGHSSVVQCLLGMEKEHEVEVNGT 800 810 820 830 840 850 80 90 100 110 120 130 KIAA03 GTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRLDI :. : ::: ::: :..:: .::..::: :..:. . :: : .:. .: KIAA17 DTLW-------GETALTAAAGRGKLEVCELLLGHGAAVSRTNRRGVPPLFCAARQGHWQI 860 870 880 890 900 910 140 150 160 170 180 190 KIAA03 VKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFAAE :. :.: . ......: : ::.:: .:: ..:..:: . : .. . : .:: .: KIAA17 VRLLLERGCDVNLSDKQGRTPLMVAACEGHLSTVEFLLSKGAALSSLDKEGLSALSWACL 920 930 940 950 960 970 200 210 220 230 240 KIAA03 AGHIDIVKELIKWRAAI-VVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELL------LSHAD------ :: .:. :.. ::: .. .: ::: .:: :..: : . :.: KIAA17 KGHRAVVQYLVEEGAAIDQTDKNGRTPLDLAAFYGDAETVLYLVEKGAVIEHVDHSGMRP 980 990 1000 1010 1020 1030 250 260 270 280 290 KIAA03 ------CDRRSRIEALELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLP : : . :: ::...: . . . . . .:..... :.. :. KIAA17 LDRAIGCRNTSVVVALLRKGAKLGN--AAWAMATSKPDILIILLQKLMEEGNVMYKKGKM 1040 1050 1060 1070 1080 300 310 320 330 340 350 KIAA03 PIHAYGNRTECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAVYADN KIAA17 KEAAQRYQYALRKFPREGFGEDMRPFNELRVSLYLNLSRCRRKTNDFGMAEEFASKALEL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 >>KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 (803 aa) initn: 342 init1: 206 opt: 293 Z-score: 307.3 bits: 67.4 E(): 5.3e-12 Smith-Waterman score: 298; 31.646% identity (59.072% similar) in 237 aa overlap (90-320:394-616) 60 70 80 90 100 110 KIAA03 KVVRLLLEHYRVQTQQTGTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTV . : :: ::: .. ..::. :::.. . KIAA18 SARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKMEHQNKRSPLHAAAEAGHVDICHMLVQAGANIDTCSE 370 380 390 400 410 420 120 130 140 150 160 170 KIAA03 TNSTPLRAACFDGRLDIVKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQ-RA . ::: : ...:. ::::.. .: .. . .::: .:: ::: .::.::: . . KIAA18 DQRTPLMEAAENNHLEAVKYLIKAGALVDPKDAEGSTCLHLAAKKGHYEVVQYLLSNGQM 430 440 450 460 470 480 180 190 200 210 220 230 KIAA03 DPNAKAHCGATALHFAAEAGHIDIVKELIKWRAAIVV-NGHGMTPLKVAAESCKADVVEL : : . : : . .:.: :.:.:: :.. . : . ... :. :: : .:..:. KIAA18 DVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLVKLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAFSGCVDIAEI 490 500 510 520 530 540 240 250 260 270 280 290 KIAA03 LLSHADCDRRSRIEALELLGAS--FANDREN-YDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILE-K ::. : :: ..:... : : ::: :: . :.:. .:.: :. : KIAA18 LLA-AKCD----LHAVNIHGDSPLHIAARENRYDCV----VLFLS-----RDSDVTLKNK 550 560 570 580 300 310 320 330 340 350 KIAA03 EVLPPIHAYGNRTECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAV : :.. . .. . .. . :: KIAA18 EGETPLQCASLNSQVWSALQMSKALQDSAPDRPSPVERIVSRDIARGYERIPIPCVNAVD 590 600 610 620 630 640 >>KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089 aa) initn: 957 init1: 267 opt: 284 Z-score: 296.9 bits: 65.9 E(): 2e-11 Smith-Waterman score: 370; 27.953% identity (54.243% similar) in 601 aa overlap (48-591:240-795) 20 30 40 50 60 70 KIAA03 LTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAKVVRLLLEHYRVQTQQTG ::: .:::.::.::: :. : KIAA12 ANAAYSGSLDVVNLLVSRGADLEIEDAHGHTPLTLAARQGHTKVVNCLI--------GCG 210 220 230 240 250 260 80 90 100 110 120 130 KIAA03 TVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRLDIV . .. :: ::: :: .:: :::. :. :..:. . . . : :::: . :. ::: KIAA12 A-NINHTDQDGWTALRSAAWGGHTEVVSALLYAGVKVDCADADSRTVLRAAAWGGHEDIV 270 280 290 300 310 320 140 150 160 170 180 190 KIAA03 KYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFAA-- :....:... :.. : :. ::: :: ..:..::.. :. : . : ::: :: KIAA12 LNLLQHGAEVNKADNEGRTALIAAAYMGHREIVEHLLDHGAEVNHEDVDGRTALSVAALC 330 340 350 360 370 380 200 210 220 230 240 KIAA03 ---EAGHIDIVKELIKWRAAIV--VNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLL-SHADCDRRSR :: ..:. :: :.: : . ::::: ::: ..:::.::: . :: :. . KIAA12 VPASKGHASVVSLLID-RGAEVDHCDKDGMTPLLVAAYEGHVDVVDLLLEGGADVDHTDN 390 400 410 420 430 250 260 270 280 290 300 KIAA03 IEALELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPPIHAYGNRTECR ::.:. . . ....: . :. :. . . :: : :: : KIAA12 NGRTPLLAAASMG---HASVVNTLLFWGAAV-----DSIDSEGRTVLSIASAQGNVEVVR 440 450 460 470 480 490 310 320 330 340 350 KIAA03 N--PQELESIRQDRDA----LHM---EG--LIVRERI-LGA--DNIDVSHPIIYRGAVYA . . :. ..: :: ::: :: :: . : :: ..:: . : . . : KIAA12 TLLDRGLDENHRD-DAGWTPLHMAAFEGHRLICEALIEQGARTNEIDNDGRIPF---ILA 500 510 520 530 540 360 370 380 390 400 KIAA03 DNMEFEQCIKLWL-HALHLRQKG--NRNT--------HKDLLRFAQVFSQMIHLNETVKA .. .:... : . .. :.: .::. :.:.... .::. .: : KIAA12 SQEGHYDCVQILLENKSNIDQRGYDGRNALRVAALEGHRDIVEL--LFSHGADVN--CKD 550 560 570 580 590 600 410 420 430 440 450 KIAA03 PDIECVLRCSVLEIEQSMNRV-----KNI--SDADVHNAMDNYEC-NLYTFLYLVCISTK : . .: .:: . .: . :. :::. ..:. . : . . . : :. . KIAA12 ADGRPTLYILALENQLTMAEYFLENGANVEASDAEGRTAL-HVSCWQGHMEMVQVLIAYH 610 620 630 640 650 660 460 470 480 490 500 KIAA03 TQCSEEDQCKINKQIYNLIHLDPRTREGFT-LLHLAVNSNTPVDDFHTND-----VC--- .. . :. : . :. . .: . ...: .. .. :: :: . .: KIAA12 ADVNAADNEKRSA-------LQSAAWQGHVKVVQLLIEHGAVVD--HTCNQGATALCIAA 670 680 690 700 710 510 520 530 540 550 560 KIAA03 SFPNALVTKLLLDCGAEVNAVDNEGNSALHIIVQYNRPISDFLTLHSIIISLVEA----- . . :...::. ::. : .:. : .:... .. . :: ::.:.: KIAA12 QEGHIDVVQVLLEHGADPNHADQFGRTAMRVAAKNG---------HSQIIKLLEKYGASS 720 730 740 750 760 570 580 590 600 610 620 KIAA03 --GAHTDMTNKQNKTPLDKSTTGVSEILLKTQMKMSLKCLAARAVRANDINYQDQIPRTL : . .. ... ::.. .. :. . .:. KIAA12 LNGCSPSPVHTMEQKPLQSLSSKVQSLTIKSNSSGSTGGGDMQPSLRGLPNGPTHAFSSP 770 780 790 800 810 820 KIAA03 EEFVGFH KIAA12 SESPDSTVDRQKSSLSNNSLKSSKNSSLRTTSSTATAQTVPIDSFHNLSFTEQIQQHSLP 830 840 850 860 870 880 >>KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777 aa) initn: 1201 init1: 253 opt: 280 Z-score: 291.0 bits: 65.5 E(): 4.3e-11 Smith-Waterman score: 313; 30.606% identity (57.879% similar) in 330 aa overlap (27-345:120-420) 10 20 30 40 50 KIAA03 MEGLAGYVYKAASEGKVLTLAALLLNRSESDIRYLL---GYVSQQGGQRST-PLII ....:. :: : . : :. :.: KIAA12 VHIVEELLKCGVNLEHRDMGGWTALMWACYKGRTDVVELLLSHGANPSVTGLYSVYPIIW 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 110 KIAA03 AARNGHAKVVRLLLEH-YRVQTQQTGTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHG :: ::: .:.:::.. .:. . : : :.: : :: ::.: :: :.. : KIAA12 AAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCS-------DKY---GTTPLVWAARKGHLECVKHLLAMG 150 160 170 180 190 120 130 140 150 160 170 KIAA03 ANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRLDIVKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVR :.:.. ... : : .: : . :: ... : :.....: :: ::::. .:::..:. KIAA12 ADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTDKDGNTALMIASKEGHTEIVQ 200 210 220 230 240 250 180 190 200 210 220 230 KIAA03 YLLEQRADPNAKAHCGATALHFAAEAGHIDIVKELIKWRAAIVVNGH-GMTPLKVAAESC ::. . : . : :.: :...::..::. :.. : : . :. . : : :.:. KIAA12 DLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYADIDIRGQDNKTALYWAVEKG 260 270 280 290 300 310 240 250 260 270 280 KIAA03 KADVVELLLSHADCDRRSRIEALELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQD-GDN .: .:. .:. :. ..: ..: :. .::. .. . ..: . : : . KIAA12 NATMVRDILQ---CNPDTEI---------CTKDGET-PLIKATKMRNIEVVELLLDKGAK 320 330 340 350 360 290 300 310 320 330 340 KIAA03 I--LEKEVLPPIHAYGNRTECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGAD--NIDVSH . ..:. :.: . : . :. :: .:. .:. :. : : ::: :: KIAA12 VSAVDKKGDTPLHI-AIRGRSRKLAELL-LRNPKDGR----LLYRPNKAGETPYNIDCSH 370 380 390 400 410 420 350 360 370 380 390 400 KIAA03 PIIYRGAVYADNMEFEQCIKLWLHALHLRQKGNRNTHKDLLRFAQVFSQMIHLNETVKAP KIAA12 QKSILTQIFGARHLSPTETDGDMLGYDLYSSALADILSEPTMQPPICVGLYAQWGSGKSF 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059 aa) initn: 368 init1: 261 opt: 277 Z-score: 289.7 bits: 64.5 E(): 5.1e-11 Smith-Waterman score: 317; 24.386% identity (51.882% similar) in 611 aa overlap (39-600:141-719) 10 20 30 40 50 60 KIAA03 YKAASEGKVLTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAKVVRLLLEH ::...:. : : :: .::...:.::: KIAA03 KNWQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSNVNVSDRAGR--TALHHAAFSGHGEMVKLLL-- 120 130 140 150 160 70 80 90 100 110 120 KIAA03 YRVQTQQTGTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAA .. .. :: : . : :: ::.:::::::::::.:. . :::.:: KIAA03 ----SRGANINAFDKK--DRRAIHW-AAYMGHIEVVKLLVSHGAEVTCKDKKSYTPLHAA 170 180 190 200 210 130 140 150 160 170 180 KIAA03 CFDGRLDIVKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGA .: ...::::.. ..... : : :: : .: :.:. :: :.. : : : . : KIAA03 ASSGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGAIVNQKNEKGF 220 230 240 250 260 270 190 200 210 220 230 240 KIAA03 TALHFAAEAGHIDIVKELIKWRAAIVV--NGHGMTPLKVAAESCKADVVELLLSHA---D : ::::: . : . ::. .: : . : :::...: . . . ... . : KIAA03 TPLHFAAASTHGALCLELLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSRSQTIIQSGAVID 280 290 300 310 320 330 250 260 270 280 290 KIAA03 CDRRSRIEAL--------ELLGASFANDRENYDI--IKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEK :. .. : ::: .. .. . :. . :.:: : :.: : . KIAA03 CEDKNGNTPLHIAARYGHELLINTLITSGADTAKRGIHGMFPLHLAALSGFSDCCRKLLS 340 350 360 370 380 390 300 310 320 330 KIAA03 ---EVLPP-------IHAY--GNRTECRN---PQELESIRQD---RDALHMEGLIVRERI .. : .:: :. :: : . ..: :. ::. . . KIAA03 SGFDIDTPDDFGRTCLHAAAAGGNLECLNLLLNTGADFNKKDKFGRSPLHYAAANCNYQC 400 410 420 430 440 450 340 350 360 370 380 KIAA03 L------GADNIDVSH----PIIYRGAVYADNMEFEQCIKLWLHALHLRQKGNRNTHK-D : ::. :... :. : .. .:. .:.. :. . . : :. . . KIAA03 LFALVGSGASVNDLDERGCTPLHYAATSDTDG----KCLEYLLR--NDANPGIRDKQGYN 460 470 480 490 500 510 390 400 410 420 430 440 KIAA03 LLRFAQVFSQMIHLNETVKAPDIECVLRCSVLEI-EQSMNR--VKNISDADVHNAMDNYE .... .... . :. .. .. ... : .. .: :: .. . : :. . : KIAA03 AVHYSAAYGHRLCLQLIASETPLDVLMETSGTDMLSDSDNRATISPLHLAAYHGHHQALE 520 530 540 550 560 570 450 460 470 480 490 500 KIAA03 CNLYTFLYLVCISTKTQCSEEDQCKINKQIYNLIHLDPRTREGFTLL-HLAVNSNTPVDD . ..: : . ... . : .. .. .: .: ..: . . . ::. KIAA03 VLVQSLLDLD-VRNSSGRTPLDLAAFKGHVEC---VDVLINQGASILVKDYILKRTPIHA 580 590 600 610 620 510 520 530 540 550 KIAA03 FHTNDVCSFPNALVTKLLLDCGAEVNAVD-NEGNSALHIIVQYNRPISDFLTLHSIIISL :: .. .::. . :::: ..::. .... .: . :: KIAA03 AATNG-----HSECLRLLIGNAEPQNAVDIQDGNGQTPLMLSVLNGHTDC------VYSL 630 640 650 660 670 560 570 580 590 600 610 KIAA03 VEAGAHTDMTNKQNKTPLDKSTTGVSEILLKTQMKMSLKCLAARAVRANDINYQDQIPRT .. ::..: .: ..: : .... : . . .. . ::: KIAA03 LNKGANVDAKDKWGRTALHRGAVTGHEECVDALLQHGAKCLLRDSRGRTPIHLSAACGHI 680 690 700 710 720 730 620 KIAA03 LEEFVGFH KIAA03 GVLGALLQSAASMDANPATADNHGYTALHWACYNGHETCVELLLEQEVFQKTEGNAFSPL 740 750 760 770 780 790 >>KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486 aa) initn: 413 init1: 223 opt: 273 Z-score: 282.5 bits: 64.4 E(): 1.3e-10 Smith-Waterman score: 332; 33.566% identity (58.392% similar) in 286 aa overlap (48-322:1068-1329) 20 30 40 50 60 70 KIAA03 LTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAKVVRLLLEHYRVQTQQTG ::: .:: .:.......::. ...:: KIAA06 SLACSGGRQEVVELLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNAGAEINSRTG 1040 1050 1060 1070 1080 1090 80 90 100 110 120 130 KIAA03 TVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTN-STPLRAACFDGRLDI . .. : . : :: :: .::::.. :...: :: .: : :::.:: .. 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