# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ah04695.fasta.huge -Q ../query/KIAA0381.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0381, 1114 aa vs ./tmplib.23147 library 1986391 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3891+/-0.0105; mu= 3.6737+/- 0.706 mean_var=586.3616+/-140.821, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 8 in 1/39 Lambda= 0.052965 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0666 ( 1085 res) hk02075 (1085) 3284 266.7 1.3e-71 KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112) 883 83.2 2.2e-16 KIAA2014 ( 1032 res) ff00951s1 (1032) 868 82.0 4.7e-16 KIAA1695 ( 1199 res) fj11471 (1199) 506 54.5 1.1e-07 >>KIAA0666 ( 1085 res) hk02075 (1085 aa) initn: 4058 init1: 2175 opt: 3284 Z-score: 1377.6 bits: 266.7 E(): 1.3e-71 Smith-Waterman score: 4857; 67.736% identity (85.793% similar) in 1091 aa overlap (47-1114:8-1085) 20 30 40 50 60 70 KIAA03 AAGARAPWGPRNHNEDLGHLSADAPWPAVTMAPRKRSHHGLGFL-CCFGGSDIPEINLR- ::::::. .:..:. ::: ..: :::. : KIAA06 EIEQNSAMAPRKRGGRGISFIFCCFRNNDHPEITYRL 10 20 30 80 90 100 110 120 130 KIAA03 ---DNHPLQFMEFSSPIPNAEELNIRFAELVDELDLTDKNREAMFALPPEKKWQIYCSKK .: :: :: . :.: .:::.. :.:::::::::::.:::::::: ::::::::::: KIAA06 RNDSNFALQTMEPALPMPPVEELDVMFSELVDELDLTDKHREAMFALPAEKKWQIYCSKK 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 KIAA03 KEQEDPNKLATSWPDYYIDRINSMAAMQSLYAFDEEETEMRNQVVEDLKTALRTQPMRFV :.::. :: :::::..:::..::::: .:: :...:: : :....:.:::::::.::::: KIAA06 KDQEE-NKGATSWPEFYIDQLNSMAARKSLLALEKEEEEERSKTIESLKTALRTKPMRFV 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 KIAA03 TRFIELEGLTCLLNFLRSMDHATCESRIHTSLIGCIKALMNNSQGRAHVLAQPEAISTIA ::::.:.::.:.::::..::. : :::::::::::::::::::::::::::. :.:..:: KIAA06 TRFIDLDGLSCILNFLKTMDYETSESRIHTSLIGCIKALMNNSQGRAHVLAHSESINVIA 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 KIAA03 QSLRTENSKTKVAVLEILGAVCLVPGGHKKVLQAMLHYQVYAAERTRFQTLLNELDRSLG ::: ::: ::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::.:.::.: : KIAA06 QSLSTENIKTKVAVLEILGAVCLVPGGHKKVLQAMLHYQKYASERTRFQTLINDLDKSTG 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 KIAA03 RYRDEVNLKTAIMSFINAVLNAGAGEDNLEFRLHLRYEFLMLGIQPVIDKLRQHENAILD ::::::.:::::::::::::. ::: ..:.::::::::::::::::::::::.:::. :: KIAA06 RYRDEVSLKTAIMSFINAVLSQGAGVESLDFRLHLRYEFLMLGIQPVIDKLREHENSTLD 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 KIAA03 KHLDFFEMVRNEDDLELARRFDMVHIDTKSASQMFELIHKKLKYTEAYPCLLSVLHHCLQ .:::::::.::::.::.:.::..::::::::.::::: .:.: ..:::: ..:.:::::: KIAA06 RHLDFFEMLRNEDELEFAKRFELVHIDTKSATQMFELTRKRLTHSEAYPHFMSILHHCLQ 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 490 KIAA03 MPYKRNGGYFQQWQLLDRILQQIVLQDERGVDPDLAPLENFNVKNIVNMLINENEVKQWR :::::.:. : : :::::.::::.:...: ::: .::::::.::.: ::.::::::::. 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KIAA06 P-LPPGGPPPPPGPPP-LGAIMPPPGAPM---GLALKKKSIPQPTNALKSFNWSKLPENK 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 KIAA03 VPGTVWNEIDDMQVFRILDLEDFEKMFSAYQRHQ----------KELGSTEDIYLASRKV . ::::.:::: .::.::::::.:. ::::::.: :: . .: .. :: KIAA06 LEGTVWTEIDDTKVFKILDLEDLERTFSAYQRQQDFFVNSNSKQKEADAIDDTLSSKLKV 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 KIAA03 KELSVIDGRRAQNCIILLSKLKLSNEEIRQAILKMDEQEDLAKDMLEQLLKFIPEKSDID :::::::::::::: ::::.:::::.::..::: ::::::: ::::::::::.::::::: KIAA06 KELSVIDGRRAQNCNILLSRLKLSNDEIKRAILTMDEQEDLPKDMLEQLLKFVPEKSDID 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 KIAA03 LLEEHKHEIERMARADRFLYEMSRIDHYQQRLQALFFKKKFQERLAEAKPKVEAILLASR ::::::::..:::.:::::.:::::.:::::::.:.::::: ::.::.::::::: .:. KIAA06 LLEEHKHELDRMAKADRFLFEMSRINHYQQRLQSLYFKKKFAERVAEVKPKVEAIRSGSE 750 760 770 780 790 800 840 850 860 870 880 890 KIAA03 ELVRSKRLRQMLEVILAIGNFMNKGQRGGAYGFRVASLNKIADTKSSIDRNISLLHYLIM :. :: :.:.:::.::.::.:::::::.::::...:::::::::::::.::.:::::: KIAA06 EVFRSGALKQLLEVVLAFGNYMNKGQRGNAYGFKISSLNKIADTKSSIDKNITLLHYLIT 810 820 830 840 850 860 900 910 920 930 940 950 KIAA03 ILEKHFPDILNMPSELQHLPEAAKVNLAELEKEVGNLRRGLRAVEVELEYQRRQVREPSD :.:...:..::. ::. .:.:::::..::.::...:: ::.:::.:::::. : .:.: KIAA06 IVENKYPSVLNLNEELRDIPQAAKVNMTELDKEISTLRSGLKAVETELEYQKSQPPQPGD 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 KIAA03 KFVPVMSDFITVSSFSFSELEDQLNEARDKFAKALMHFGEHDSKMQPDEFFGIFDTFLQA ::: :.:.::::.:::::..:: : ::.: :.::. ::::. .:.:::::::::: :::: KIAA06 KFVSVVSQFITVASFSFSDVEDLLAEAKDLFTKAVKHFGEEAGKIQPDEFFGIFDQFLQA 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA03 FSEARQDLEAMRRRKEEEERRARMEAMLKEQRERERWQRQRKVLAAGSSLEEGGEFDDLV :::.:. : ::..::::::::::::.::::::::: .:. : . ::.::::::: KIAA06 VSEAKQENENMRKKKEEEERRARMEAQLKEQRERERKMRKAK-----ENSEESGEFDDLV 990 1000 1010 1020 1030 1040 1080 1090 1100 1110 KIAA03 SALRSGEVFDKDLCKLKRSRKRSGSQALEVTRERAINRLNY ::::::::::::: ::::.::: .: . .::: :..::. KIAA06 SALRSGEVFDKDLSKLKRNRKRITNQMTDSSRERPITKLNF 1050 1060 1070 1080 >>KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112 aa) initn: 510 init1: 248 opt: 883 Z-score: 385.9 bits: 83.2 E(): 2.2e-16 Smith-Waterman score: 1241; 26.706% identity (57.423% similar) in 1172 aa overlap (48-1101:11-1102) 20 30 40 50 60 70 KIAA03 AGARAPWGPRNHNEDLGHLSADAPWPAVTMAPRKRSHHGLGFLCCFGGSDIPEINLR-DN .:: : .: :. : . ..: : KIAA19 FPTRTLGARSSPRPRRAADMG---NAGSMDSQQTDFRAHN 10 20 30 80 90 100 110 120 130 KIAA03 HPLQFMEFSSPIPNAEELNIRFAELVDELDLT-DKNREAMFALPPEKKWQIYCSKKKEQ- ::.. :.:. ::. ::: ... ..: :: : . ::::.. :.... : KIAA19 VPLKL-----PMPEPGELEERFAIVLNAMNLPPDKAR-LLRQYDNEKKWELICDQERFQV 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 KIAA03 EDPNKLATSWPDYYIDRINSMAAMQSLYAFDEEETEMRNQVVEDLKTALRTQPMRFVTRF ..: : ::...... ..... .::...:. .:::. . .: .: KIAA19 KNP-------PHTYIQKLKGYLDPAVTRKKFRRRVQESTQVLRELEISLRTNHIGWVREF 100 110 120 130 140 200 210 220 KIAA03 IELE--GLTCLLNFLR------SMDHATCESRIHTSL----------------------I .. : :: :...: ..: . :: ...:. . KIAA19 LNEENKGLDVLVEYLSFAQYAVTFDFESVESTVESSVDKSKPWSRSIEDLHRGSNLPSPV 150 160 170 180 190 200 230 240 KIAA03 G----------------------------------------CIKALMNNSQGRAHVLAQP : :..:.:: . : :...: KIAA19 GNSVSRSGRHSALRYNTLPSRRTLKNSRLVSKKDDVHVCIMCLRAIMNYQYGFNMVMSHP 210 220 230 240 250 260 250 260 270 280 290 300 KIAA03 EAISTIAQSLRTENSKTKVAVLEILGAVCLVPGGHKKVLQAMLHYQVYAAERTRFQTLLN .:.. :: :: ..: .::. :::.:.::::: :::. .:.:. ... .:. ::. :.. KIAA19 HAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILSAFDNFKEVCGEKQRFEKLME 270 280 290 300 310 320 310 320 330 340 350 360 KIAA03 ELDRSLGRYRDE-VNLKTAIMSFINAVLNAGAGEDNLEFRLHLRYEFLMLGIQPVIDKLR .. : .:. ... .: :.::: :... ....::.::.::: ::.. .:::. KIAA19 HF-----RNEDNNIDFMVASMQFINIVVHS---VEDMNFRVHLQYEFTKLGLDEYLDKLK 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 420 KIAA03 QHENAILDKHLD-FFEMVRNEDDLELARRFDMVHIDTKSASQMFELIHKKLKYTEAYPCL . :. :. ... ... : . : . .::.:. :. .: KIAA19 HTESDKLQVQIQAYLDNVFDVGAL-------LEDAETKNAA---------LERVEELEEN 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 KIAA03 LSVLHHCLQMPYKRNGGYFQQWQLLDRILQQIVLQDERGVDPDLAPLENFNVKNIVNMLI .: : . :: .: .. . .: ...:. . : : .. : .:... .:. KIAA19 ISHLSEKLQ--DTENEAMSKIVELEKQLMQR---NKELDVVREIYKDANTQVHTLRKMV- 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 KIAA03 NENEVKQWRDQAEKFRKEHMELVSRLERKERECETKTLEKEEMMRTLNKMKDKLARESQE : ..: .. : ::.: .: :::. .. .: .: KIAA19 -------------KEKEEAIQRQSTLEKKIHE-----LEKQGTIKIQKKGDGDIAILPVV 480 490 500 510 550 560 570 580 590 KIAA03 LRQARGQVAELVA------QLSELSTGPVSSPPPP-----GGPLTLSSSMTTNDLPPPPP . .. .:.:: .. :.::. :::: : :.... .: .::::: KIAA19 ASGTLSMGSEVVAGNSVGPTMGAASSGPLPPPPPPLPPSSDTPETVQNGPVTPPMPPPPP 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 KIAA03 PLPFACCPPPPPPPLPP-GGP-----PTPPGAPPCLGMGLPLPQDPYPSS--DVPLRKKR : : ::::::: :: :: :.:: ::: : . ::: :. . : . KIAA19 PPPPPPPPPPPPPPPPPLPGPASETVPAPPLAPP-LPSAPPLPGTSSPTVVFNSGLAAVK 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 KIAA03 VPQPSHP---LKSFNWVKLNEERVPGTVWNEIDDMQVFRILDLEDFEKMF-SAYQRHQKE . .: . . :::: :. ... :::.::::: .... :....::..: . : . KIAA19 IKKPIKTKFRMPVFNWVALKPNQINGTVFNEIDDERILEDLNVDEFEEIFKTKAQGPAID 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 KIAA03 LGSTEDIYLASRKVKELSVIDGRRAQNCIILLSKLKLSNEEIRQAILKMDEQEDLAKDML :.:... . .. ........ ::.: : : : . .:: .:: .: . : :.. KIAA19 LSSSKQ-KIPQKGSNKVTLLEANRAKNLAITLRKAGKTADEICKAIHVFD-LKTLPVDFV 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 KIAA03 EQLLKFIPEKSDIDLL---EEHKHEIERMARADRFLYEMSRIDHYQQRLQALFFKKKFQE : :..:.: .... .: :.... .: .. :::....:.:.. .:.. . : .: : KIAA19 ECLMRFLPTENEVKVLRLYERERKPLENLSDEDRFMMQFSKIERLMQKMTIMAFIGNFAE 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 KIAA03 RLAEAKPKVEAILLASRELVRSKRLRQMLEVILAIGNFMNKGQRGGAYGFRVASLNKIAD . :...::. :: . :..:...::.:::.::.::...::..:::.. ::. . : KIAA19 SIQMLTPQLHAIIAASVSIKSSQKLKKILEIILALGNYMNSSKRGAVYGFKLQSLDLLLD 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 KIAA03 TKSSIDRNISLLHYLIMILEKHFPDILNMPSELQHLPEAAKVNLAELEKEVGNLRRGLRA :::. ::. .::::. ...... .. . .::... .:: :.: .. .: .:.::. KIAA19 TKST-DRKQTLLHYISNVVKEKYHQVSLFYNELHYVEKAAAVSLENVLLDVKELQRGMDL 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 KIAA03 VEVELEYQRRQVREPSDKFVPVMSDFITVSSFSFSELEDQLNEARDKFAKALMHFGEHDS .. : .. ... ....:: . ....:.:. . :.: : .. .:::. . KIAA19 TKREYTMHDHNT---------LLKEFILNNEGKLKKLQDDAKIAQDAFDDVVKYFGENPK 940 950 960 970 980 1000 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA03 KMQPDEFFGIFDTFLQAFSEARQDLEAMRRRKEEE--ERRARMEAMLKEQRER---ERWQ :. :: .: :..:...:... : .:...:. :. ..::....: . .. . KIAA19 TTPPSVFFPVFVRFVKAYKQAEEENE-LRKKQEQALMEKLLEQEALMEQQDPKSPSHKSK 990 1000 1010 1020 1030 1040 1060 1070 1080 1090 KIAA03 RQRKVLAA---------GSSLEEG--GEFDDLVSALRSGEVFDKDLCKLKRS-RKRSGSQ ::.. : : . . :: : ..:... ::. : ..:: :.: .: KIAA19 RQQQELIAELRRRQVKDNRHVYEGKDGAIEDIITDLRNQPYRRAD--AVRRSVRRRFDDQ 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1100 1110 KIAA03 ALEVTRERAINRLNY : KIAA19 NLRSVNGAEITM 1110 >>KIAA2014 ( 1032 res) ff00951s1 (1032 aa) initn: 987 init1: 303 opt: 868 Z-score: 380.0 bits: 82.0 E(): 4.7e-16 Smith-Waterman score: 1150; 26.776% identity (54.736% similar) in 1098 aa overlap (78-1076:23-1005) 50 60 70 80 90 100 KIAA03 APRKRSHHGLGFLCCFGGSDIPEINLRDNHPLQFMEFSSPIPNAEELNIRFAELVDELDL :: . . :.:. ::. ::: ... ..: KIAA20 GGPAAMGNLESAEGVPGEPPSVPLLLPPGKMPMPEPCELEERFALVLSSMNL 10 20 30 40 50 110 120 130 140 150 160 KIAA03 TDKNREAMFALPPEKKWQIYCSKKKEQ-EDPNKLATSWPDYYIDRINSMAAMQSLYAFDE . . . ::::.. :.... : ..: : ::....:. . . KIAA20 PPDKARLLRQYDNEKKWDLICDQERFQVKNP-------PHTYIQKLQSFLDPSVTRKKFR 60 70 80 90 100 170 180 190 200 KIAA03 EETEMRNQVVEDLKTALRTQPMRFVTRFI--ELEGLTCLLNFL----------------- .... ..:...:. .:::. . .: .:. : .:: :...: KIAA20 RRVQESTKVLRELEISLRTNHIGWVREFLNDENKGLDVLVDYLSFAQCSVMFDFEGLESG 110 120 130 140 150 160 210 KIAA03 ------------RSMD---------------------------------HATCESR---- ::.. .: .:: KIAA20 DDGAFDKLRSWSRSIEDLQPPSALSAPFTNSLARSARQSVLRYSTLPGRRALKNSRLVSQ 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 KIAA03 ---IHTSLIGCIKALMNNSQGRAHVLAQPEAISTIAQSLRTENSKTKVAVLEILGAVCLV .:. .. :..:.:: . : :...:.:.. :: :: ..: .::. :::.:.::::: KIAA20 KDDVHVCIL-CLRAIMNYQYGFNLVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLV 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 KIAA03 PGGHKKVLQAMLHYQVYAAERTRFQTLLNELDRSLGRYRD-EVNLKTAIMSFINAVLNAG :::. .: :. ... : ::. :.. . : .: .... .: :.::: :... 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