# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00177.fasta.huge -Q ../query/KIAA0369.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0369, 794 aa vs ./tmplib.23147 library 1986711 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4297+/-0.0083; mu= -4.2618+/- 0.564 mean_var=297.3008+/-70.981, 0's: 0 Z-trim: 44 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.074383 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 1063 127.8 3.4e-30 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 735 92.5 1.2e-19 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 595 77.9 7.9e-15 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 559 73.7 6.9e-14 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 562 74.2 7.1e-14 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 558 73.7 8.3e-14 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 536 71.3 3.9e-13 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 536 71.3 4e-13 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 465 63.9 1.2e-10 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 458 62.9 1.3e-10 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 457 63.0 2e-10 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 445 61.7 4.7e-10 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 436 60.4 5.8e-10 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 437 60.7 6.6e-10 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 425 59.2 1.2e-09 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 434 60.9 2e-09 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 407 57.9 1.3e-08 KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 397 56.6 1.9e-08 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 397 56.7 2e-08 KIAA1154 ( 476 res) hh03679s1 ( 476) 367 53.0 8.8e-08 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 369 53.4 1.2e-07 KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626) 331 49.6 3e-06 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 330 49.6 3.4e-06 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 324 48.7 4e-06 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 318 47.8 4.1e-06 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 322 48.5 4.2e-06 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 297 45.4 1.5e-05 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 302 46.4 2.3e-05 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 288 44.8 5.3e-05 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 281 44.1 9.3e-05 KIAA0135 ( 1351 res) ha01203s1 (1351) 272 43.2 0.00021 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 266 42.5 0.0003 KIAA1459 ( 853 res) fh16961 ( 853) 244 40.0 0.0012 KIAA0151 ( 723 res) ha03241 ( 723) 227 38.1 0.0039 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 231 38.8 0.0045 KIAA1790 ( 1369 res) fh24104 (1369) 230 38.7 0.0049 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 233 39.2 0.0054 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 220 37.6 0.01 >>KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) (608 aa) initn: 1031 init1: 1031 opt: 1063 Z-score: 633.9 bits: 127.8 E(): 3.4e-30 Smith-Waterman score: 1063; 52.721% identity (79.592% similar) in 294 aa overlap (447-739:308-601) 420 430 440 450 460 470 KIAA03 SSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERS : :.. ..:..::.:::::::::::: .: KIAA17 PAKLEKEPKTRPEENKPERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVIGDGNFAVVKECRHRE 280 290 300 310 320 330 480 490 500 510 520 530 KIAA03 TAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGG : . ::.::: ::. .::: :...:. :.. ..::::: : : ... :.::..: :.:: KIAA17 TRQAYAMKIIDKSRLKGKEDMVDSEILIIQSLSHPNIVKLHEVYETDMEIYLILEYVQGG 340 350 360 370 380 390 540 550 560 570 580 590 KIAA03 DLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKL :::::: . :. : ::. :...: .:. ..:. .:::::.::::::: ...: : .::: KIAA17 DLFDAIIESVKFPEPDAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKPENLLVQRNEDKSTTLKL 400 410 420 430 440 450 600 610 620 630 640 650 KIAA03 GDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSG .::::: : :..:::::::::::::..: ::::.::.:::::: :::::::::::. KIAA17 ADFGLAKHVVRPIFTVCGTPTYVAPEILSEKGYGLEVDMWAAGVILYILLCGFPPFRSPE 460 470 480 490 500 510 660 670 680 690 700 710 KIAA03 DDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVNDDG ::. ::. : .:. .: :::::.::.::.:.. .:.:: .:..: :::.:::.. : KIAA17 RDQDELFNIIQLGHFEFLPPYWDNISDAAKDLVSRLLVVDPKKRYTAHQVLQHPWIETAG 520 530 540 550 560 570 720 730 740 750 760 770 KIAA03 LPEN-EHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIALDHGFTIKRSGSLDYYQQPGMYWI .. ..: .:. . . :: . : KIAA17 KTNTVKRQKQVSPSSEGHFRSQHKRVVEQVS 580 590 600 >>KIAA0968 ( 527 res) hj06483 (527 aa) initn: 426 init1: 321 opt: 735 Z-score: 444.5 bits: 92.5 E(): 1.2e-19 Smith-Waterman score: 735; 38.924% identity (69.620% similar) in 316 aa overlap (452-762:59-368) 430 440 450 460 470 480 KIAA03 ASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREY ::.:.. . .: : :.::..::. ...:: KIAA09 EQQRLSPGPPVPSLTCLPSARMATITCTRFTEEYQLFEELGKGAFSVVRRCVKVLAGQEY 30 40 50 60 70 80 490 500 510 520 530 540 KIAA03 ALKIIKKSKCRGKEHM-IQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFD : :::. .: ...:. .. :. : : .:::::: : . .. . ::...:: ::.::. KIAA09 AAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFE 90 100 110 120 130 140 550 560 570 580 590 600 KIAA03 AITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFG :.. . :.: ::: . .. :. . :....::::.::::::. . :. ..::.::: KIAA09 DIVAREYYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGA-AVKLADFG 150 160 170 180 190 200 610 620 630 640 650 KIAA03 LATIVDGPL---YTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSGD :: :.: . ::: :..::.. . :: ::.:: ::: :::: :.::: . KIAA09 LAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWD--E 210 220 230 240 250 260 660 670 680 690 700 710 KIAA03 DQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVNDDG- ::. :..:: : ::::: ::.:. ::.::. :: .. ..:..:...:.:::.. . KIAA09 DQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRST 270 280 290 300 310 320 720 730 740 750 760 770 KIAA03 LPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIALDHGFTIKRSGSLDYYQQPGMYWIR . :. .. .:: ::. : .. : .... ..:. .:: KIAA09 VASCMHRQETVDCLKK-FNARRKLKG--AILTTMLATRNFSGGKSGGNKKSDGVKESSES 330 340 350 360 370 380 780 790 KIAA03 PPLLIRRGRFSDEDATRM KIAA09 TNTTIEDEDTKVRKQEIIKVTEQLIEAISNGDFESYTKMCDPGMTAFEPEALGNLVEGLD 390 400 410 420 430 440 >>KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371 aa) initn: 385 init1: 216 opt: 595 Z-score: 358.0 bits: 77.9 E(): 7.9e-15 Smith-Waterman score: 603; 31.463% identity (61.220% similar) in 410 aa overlap (366-767:51-425) 340 350 360 370 380 390 KIAA03 LDESECRVVKSTSYTKIASSSRRSTTKSPGPSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKS : :. . :. .. :: :. : . KIAA09 SVSLLSGASSSSLAWCGLATGALGAGARGIPELRGAAGAGGAAGAGTGGAG---PAGRLL 30 40 50 60 70 400 410 420 430 440 450 KIAA03 PSPSPTSPGSLRKQRSSQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERY : :.: ::.. ...: :. . . :: .:: : : KIAA09 PPPAPGSPAA----------PAAVSPAAGQPRPPAPASRGP----------MPARIG-YY 80 90 100 110 460 470 480 490 500 510 KIAA03 KVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHM--IQNEVSILRRVKHPNI .. :::: :::::::. .. : . :.::: :.. .:.. : ::.:.. . ::.: KIAA09 EIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQL-DEENLKKIFREVQIMKMLCHPHI 120 130 140 150 160 170 520 530 540 550 560 570 KIAA03 VLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIV . : . :.. .::: : ..::..:: ... ....:..: . ....:. . : ::: KIAA09 IRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIV 180 190 200 210 220 230 580 590 600 610 620 630 KIAA03 HRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATI-VDGPLY-TVCGTPTYVAPEIIAETGY-G :::.: ::::. :.. ..:..:::.... . : : : ::.: :.:::.. : : KIAA09 HRDLKAENLLL----DANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDG 240 250 260 270 280 290 640 650 660 670 680 690 KIAA03 LKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELIT :::::. ::. :.:.:: :: :: . : ..: :. : :.. .: ..:: KIAA09 PKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGS--TLQNLRARVLSGK--FRIPFF--MSTECEHLIR 300 310 320 330 340 700 710 720 730 740 KIAA03 MMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVN-DDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSV ::..: ..:.: :. .: :.. :. :. .. .. ..:.. .. : ... .. KIAA09 HMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMED 350 360 370 380 390 400 750 760 770 780 790 KIAA03 IALDHGFTIK--RSGSLDYYQQPGMYWIRPPLLIRRGRFSDEDATRM ..::. :.. :: . :.: KIAA09 MGLDKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAE 410 420 430 440 450 460 >>KIAA0175 ( 656 res) ha02337 (656 aa) initn: 486 init1: 291 opt: 559 Z-score: 341.2 bits: 73.7 E(): 6.9e-14 Smith-Waterman score: 559; 35.185% identity (65.926% similar) in 270 aa overlap (451-715:12-271) 430 440 450 460 470 480 KIAA03 LASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTARE . . :.. .::: :.:: :: . :.. KIAA01 TCKRTMKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEM 10 20 30 40 490 500 510 520 530 540 KIAA03 YALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFD :.::. :. . :..:. :. ..: .: : . ... .....:.: ::.::: KIAA01 VAIKIMDKNTLGSDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFD 50 60 70 80 90 100 550 560 570 580 590 600 KIAA03 AITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFG : : .. .:... .. ...::. :.:: . .:::.:::::: :.. .::: ::: KIAA01 YIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYH----KLKLIDFG 110 120 130 140 150 610 620 630 640 650 KIAA03 LATIVDGP----LYTVCGTPTYVAPEIIAETGY-GLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGS : . : : : ::. .:.:::.: .: : ..:.:. :.. :.:.::: :: . KIAA01 LCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPF--D 160 170 180 190 200 210 660 670 680 690 700 710 KIAA03 GDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVNDD :. .:. .:. :. : :. : .: :. :. .:: :: .:.: ..:.:::. .: KIAA01 DDNVMALYKKIMRGKYDVPK--W--LSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQD 220 230 240 250 260 270 720 730 740 750 760 770 KIAA03 GLPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIALDHGFTIKRSGSLDYYQQPGMYWI KIAA01 YNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKAR 280 290 300 310 320 330 >>KIAA0781 ( 950 res) hk09678 (950 aa) initn: 431 init1: 221 opt: 562 Z-score: 340.9 bits: 74.2 E(): 7.1e-14 Smith-Waterman score: 562; 36.806% identity (66.319% similar) in 288 aa overlap (429-712:24-295) 400 410 420 430 440 450 KIAA03 SPTSPGSLRKQRSSQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVG :: ::: . ..: :. . : . KIAA07 KPSRAANPPARPRSCPPCLAAGPSMVMADGPRH--LQRG---PVRVGF-YDIE 10 20 30 40 460 470 480 490 500 510 KIAA03 RTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKE-HMIQNEVSILRRVKHPNIVLLI :.: ::::::: .: : : :.::: ::. . . . : ::.:.. . ::.:. : KIAA07 GTLGKGNFAVVKLGRHRITKTEVAIKIIDKSQLDAVNLEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLY 50 60 70 80 90 100 520 530 540 550 560 570 KIAA03 EEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDI . :.. . :::: : .:.:..:: ... .. .: .: .... ::. : :. .:::::. KIAA07 QVMETKSMLYLVTEYAKNGEIFDYLANHGRLNESEARRKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDL 110 120 130 140 150 160 580 590 600 610 620 630 KIAA03 KPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIV-DGPLY-TVCGTPTYVAPEIIAETGY-GLKVD : ::::. :.. ..:..:::.... .: : : ::.: :.:::.. : : ..: KIAA07 KAENLLL----DNNMNIKIADFGFGNFFKSGELLATWCGSPPYAAPEVFEGQQYEGPQLD 170 180 190 200 210 220 640 650 660 670 680 690 KIAA03 IWAAGVITYILLCGFPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLL ::. ::. :.:.:: :: .: .: ...: :. : ::. .:.. ..:: ::. KIAA07 IWSMGVVLYVLVCGALPF--DGPTLPILRQRVLEGR--FRIPYF--MSEDCEHLIRRMLV 230 240 250 260 270 700 710 720 730 740 750 KIAA03 VDVDQRFSAVQVLEHPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIALDH .: ..:.. .:. :: :. KIAA07 LDPSKRLTIAQIKEHKWMLIEVPVQRPVLYPQEQENEPSIGEFNEQVLRLMHSLGIDQQK 280 290 300 310 320 330 >>KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 (766 aa) initn: 359 init1: 181 opt: 558 Z-score: 339.8 bits: 73.7 E(): 8.3e-14 Smith-Waterman score: 558; 38.225% identity (65.188% similar) in 293 aa overlap (441-724:1-283) 420 430 440 450 460 KIAA03 SSQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQ--IPATITERYKVGRTIGDGNFAV : ::. . :. : . .:.: :.::: KIAA00 SMAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAV 10 20 30 470 480 490 500 510 520 KIAA03 VKECVERSTAREYALKIIKKSKCR--GKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTEL :: . :... :.:.: :.: . :..: :: .. :.::::: : : .:. :.: KIAA00 VKLARHVFTGEKVAVKVIDKTKLDTLATGHLFQ-EVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKL 40 50 60 70 80 530 540 550 560 570 580 KIAA03 YLVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERD-ASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVY ::..:: :::.:: : . .. ..: :. .. ... ::.: :.:..::::.::::.. . KIAA00 YLILELGDGGDMFDYIMKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFF 90 100 110 120 130 140 590 600 610 620 630 640 KIAA03 EHQDGSKSLKLGDFGLATIVD-GP-LYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLK-VDIWAAGVIT :.: .:: :::... . : : : ::. .: ::::. : ::::. ::: KIAA00 EKQG---LVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVIL 150 160 170 180 190 200 650 660 670 680 690 700 KIAA03 YILLCGFPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFS ..:.:: :::. ..:.:.: .:. . :: .:: :.::: :: : .: : KIAA00 FMLVCGQPPFQ-EANDSETL-TMIMDCKYTVPS----HVSKECKDLITRMLQRDPKRRAS 210 220 230 240 250 260 710 720 730 740 750 760 KIAA03 AVQVLEHPWVND-DGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTGPKPNSTAAGVSVIALDHGFTIKRS .. .:::.. : : ..... KIAA00 LEEIENHPWLQGVDPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALET 270 280 290 300 310 320 >>KIAA1860 ( 689 res) fh18358 (689 aa) initn: 382 init1: 244 opt: 536 Z-score: 327.6 bits: 71.3 E(): 3.9e-13 Smith-Waterman score: 536; 33.333% identity (63.272% similar) in 324 aa overlap (394-713:1-312) 370 380 390 400 410 420 KIAA03 PGPSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQRSSQHGGSSTSLAS : : . .::. :. :. :: ... .: KIAA18 KMSSRTVLAPGNDRN--SDTHGTLGSGRSS 10 20 430 440 450 460 470 480 KIAA03 TKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYAL : : ... : . : . . :.. :::: :::: :: . :.:: :. KIAA18 DKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAI 30 40 50 60 70 80 490 500 510 520 530 540 KIAA03 KIIKKSKCRGKE-HMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAI ::: :.. . . . :: :.. ..::::: :.: ... :::::: ...:..:: . 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