# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01642.fasta.nr -Q ../query/KIAA0352.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0352, 721 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7799458 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7674+/-0.000194; mu= 10.3234+/- 0.011 mean_var=98.6085+/-18.981, 0's: 30 Z-trim: 202 B-trim: 181 in 1/64 Lambda= 0.129157 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|18201965|sp|O15060.1|ZBT39_HUMAN RecName: Full= ( 712) 4915 926.7 0 gi|114644194|ref|XP_522441.2| PREDICTED: zinc fing ( 712) 4875 919.2 0 gi|109097346|ref|XP_001115523.1| PREDICTED: zinc f ( 712) 4808 906.7 0 gi|149715154|ref|XP_001488157.1| PREDICTED: simila ( 711) 4621 871.9 0 gi|148692574|gb|EDL24521.1| zinc finger and BTB do ( 712) 4407 832.0 0 gi|35193043|gb|AAH58661.1| Zinc finger and BTB dom ( 712) 4397 830.1 0 gi|149066578|gb|EDM16451.1| zinc finger and BTB do ( 711) 4388 828.5 0 gi|38511416|gb|AAH60725.1| Zbtb39 protein [Mus mus ( 638) 3911 739.5 8.6e-211 gi|73968438|ref|XP_848992.1| PREDICTED: similar to ( 673) 3271 620.3 7.1e-175 gi|47212739|emb|CAF90053.1| unnamed protein produc ( 725) 613 125.0 9.3e-26 gi|68402885|ref|XP_693418.1| PREDICTED: similar to ( 812) 564 116.0 5.7e-23 gi|210108711|gb|EEA56601.1| hypothetical protein B ( 619) 487 101.5 9.7e-19 gi|210128786|gb|EEA76462.1| hypothetical protein B ( 682) 481 100.4 2.3e-18 gi|32493355|gb|AAH54704.1| Zgc:66441 [Danio rerio] ( 700) 474 99.1 5.7e-18 gi|194213084|ref|XP_001495428.2| PREDICTED: simila ( 930) 464 97.4 2.5e-17 gi|73951205|ref|XP_859927.1| PREDICTED: hypothetic ( 440) 454 95.2 5.3e-17 gi|125847909|ref|XP_688258.2| PREDICTED: similar t ( 757) 456 95.8 6.1e-17 gi|189534705|ref|XP_001919840.1| PREDICTED: simila ( 940) 453 95.3 1.1e-16 gi|210100601|gb|EEA48678.1| hypothetical protein B ( 694) 447 94.1 1.8e-16 gi|157016813|gb|EAL40335.2| AGAP010500-PA [Anophel ( 634) 446 93.9 2e-16 gi|210114271|gb|EEA62032.1| hypothetical protein B ( 513) 444 93.4 2.2e-16 gi|73971468|ref|XP_867298.1| PREDICTED: similar to ( 536) 441 92.9 3.3e-16 gi|189521462|ref|XP_001922719.1| PREDICTED: simila ( 707) 441 93.0 4.1e-16 gi|70571551|dbj|BAE06771.1| zinc finger protein [C ( 540) 431 91.0 1.2e-15 gi|189534684|ref|XP_001919656.1| PREDICTED: simila ( 301) 425 89.7 1.7e-15 gi|30584443|gb|AAP36474.1| Homo sapiens zinc finge ( 735) 421 89.3 5.5e-15 gi|149639318|ref|XP_001510484.1| PREDICTED: simila ( 898) 420 89.2 7.3e-15 gi|59862073|gb|AAH90307.1| Zgc:110821 [Danio rerio ( 279) 413 87.4 7.5e-15 gi|157423025|gb|AAI53425.1| Zgc:110821 [Danio reri ( 279) 413 87.4 7.5e-15 gi|109126318|ref|XP_001099728.1| PREDICTED: simila ( 734) 418 88.7 8.1e-15 gi|210129927|gb|EEA77600.1| hypothetical protein B ( 348) 412 87.3 1e-14 gi|210109822|gb|EEA57685.1| hypothetical protein B ( 912) 416 88.4 1.2e-14 gi|149016550|gb|EDL75751.1| rCG27468, isoform CRA_ ( 472) 410 87.1 1.6e-14 gi|149016551|gb|EDL75752.1| rCG27468, isoform CRA_ ( 542) 410 87.1 1.8e-14 gi|149016552|gb|EDL75753.1| rCG27468, isoform CRA_ ( 735) 410 87.2 2.3e-14 gi|210120457|gb|EEA68176.1| hypothetical protein B ( 509) 407 86.5 2.6e-14 gi|72151892|ref|XP_784771.1| PREDICTED: hypothetic ( 783) 409 87.1 2.7e-14 gi|211827263|gb|AAH33165.2| ZFP90 protein [Homo sa ( 299) 402 85.4 3.3e-14 gi|119603641|gb|EAW83235.1| zinc finger protein 90 ( 584) 402 85.7 5.4e-14 gi|94730444|sp|Q8TF47.2|ZFP90_HUMAN RecName: Full= ( 636) 402 85.7 5.8e-14 gi|210129755|gb|EEA77428.1| hypothetical protein B ( 945) 402 85.8 7.8e-14 gi|114663259|ref|XP_511056.2| PREDICTED: zinc fing (1278) 403 86.1 8.5e-14 gi|189528539|ref|XP_686402.3| PREDICTED: similar t ( 505) 397 84.7 9.3e-14 gi|210091334|gb|EEA39589.1| hypothetical protein B (1729) 404 86.4 9.4e-14 gi|210096772|gb|EEA44911.1| hypothetical protein B (1784) 404 86.4 9.6e-14 gi|210091827|gb|EEA40069.1| hypothetical protein B ( 322) 393 83.8 1.1e-13 gi|210129752|gb|EEA77425.1| hypothetical protein B ( 383) 394 84.0 1.1e-13 gi|194227844|ref|XP_001492622.2| PREDICTED: simila ( 511) 395 84.3 1.2e-13 gi|126344053|ref|XP_001372640.1| PREDICTED: simila ( 849) 397 84.9 1.4e-13 gi|109129035|ref|XP_001092619.1| PREDICTED: simila ( 648) 395 84.4 1.4e-13 >>gi|18201965|sp|O15060.1|ZBT39_HUMAN RecName: Full=Zinc (712 aa) initn: 4915 init1: 4915 opt: 4915 Z-score: 4951.0 bits: 926.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 4915; 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