# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01609.fasta.huge -Q ../query/KIAA0351.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0351, 590 aa vs ./tmplib.23147 library 1986915 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8050+/-0.00597; mu= 11.8385+/- 0.405 mean_var=127.7326+/-29.878, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 154 in 1/39 Lambda= 0.113481 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0277 ( 583 res) ha06833 ( 583) 310 62.0 1.5e-10 KIAA0959 ( 820 res) hj05718 ( 820) 301 60.7 5.3e-10 KIAA1308 ( 745 res) fh08652 ( 745) 299 60.3 6.3e-10 KIAA0846 ( 691 res) hk05386 ( 691) 292 59.1 1.3e-09 KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508) 289 59.0 3.1e-09 KIAA1516 ( 2304 res) fh10631s2 (2304) 221 48.1 9.2e-06 >>KIAA0277 ( 583 res) ha06833 (583 aa) initn: 214 init1: 162 opt: 310 Z-score: 281.1 bits: 62.0 E(): 1.5e-10 Smith-Waterman score: 310; 27.126% identity (62.753% similar) in 247 aa overlap (79-321:344-581) 50 60 70 80 90 100 KIAA03 ATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVFDVLKVTPEEFASQITLMDIPVFKAIQPEELA .: .. ..: .. .: .:..:. .:: KIAA02 SGRIYVYRKDLADTLNPFAENEESQQRSMRILGMNTWDLALELMNFDWSLFNSIHEQELI 320 330 340 350 360 370 110 120 130 140 150 160 KIAA03 SCGWSKKEKHSLAPNVVAFTRRFNQVSFWVVREILTAQTLKIRAEILSHFVKIAKKLLEL .:.. . . :. . .: :.:..::. ::: . : :......:.::: . 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