# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01304mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0339.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0339, 1709 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7790215 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5463+/-0.00023; mu= 6.3971+/- 0.013 mean_var=274.4000+/-52.311, 0's: 39 Z-trim: 151 B-trim: 115 in 1/66 Lambda= 0.077425 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|68052990|sp|O15047.3|SET1A_HUMAN RecName: Full= (1707) 11558 1306.4 0 gi|114662085|ref|XP_523492.2| PREDICTED: SET domai (1707) 11495 1299.3 0 gi|194219010|ref|XP_001915080.1| PREDICTED: SET do (1707) 10819 1223.8 0 gi|119917047|ref|XP_001251265.1| PREDICTED: simila (1708) 10683 1208.6 0 gi|126334524|ref|XP_001364653.1| PREDICTED: simila (1706) 8473 961.8 0 gi|119572565|gb|EAW52180.1| hCG1998636, isoform CR (1189) 8122 922.3 0 gi|29437232|gb|AAH49883.1| Setd1a protein [Mus mus ( 849) 4871 559.0 6e-156 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