# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01226.fasta.nr -Q ../query/KIAA0337.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0337, 1609 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7818056 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3028+/-0.000201; mu= 11.6446+/- 0.011 mean_var=124.5211+/-23.694, 0's: 41 Z-trim: 74 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.114935 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|74724250|sp|Q96PE2.1|ARHGH_HUMAN RecName: Full= (2063) 10871 1815.2 0 gi|109107878|ref|XP_001115376.1| PREDICTED: simila (2068) 10451 1745.5 0 gi|194213465|ref|XP_001917491.1| PREDICTED: Rho gu (2014) 10123 1691.1 0 gi|73988183|ref|XP_851853.1| PREDICTED: similar to (1977) 10112 1689.3 0 gi|148684535|gb|EDL16482.1| mCG116432, isoform CRA (2057) 9679 1617.5 0 gi|147742931|sp|Q80U35.2|ARHGH_MOUSE RecName: Full (2057) 9675 1616.9 0 gi|148684536|gb|EDL16483.1| mCG116432, isoform CRA (1048) 6350 1065.3 0 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