# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00894s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0330.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0330, 2224 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7809656 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3166+/-0.000203; mu= 12.2409+/- 0.011 mean_var=129.8840+/-25.030, 0's: 28 Z-trim: 72 B-trim: 411 in 1/66 Lambda= 0.112537 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|6685261|sp|Q9Y6J0.1|CABIN_HUMAN RecName: Full=C (2220) 14867 2426.9 0 gi|114685420|ref|XP_515030.2| PREDICTED: calcineur (2222) 14754 2408.6 0 gi|73995857|ref|XP_543529.2| PREDICTED: similar to (2187) 12902 2107.9 0 gi|148699944|gb|EDL31891.1| calcineurin binding pr (2187) 12535 2048.3 0 gi|6685232|sp|O88480.1|CABIN_RAT RecName: Full=Cal (2182) 12113 1979.8 0 gi|149043741|gb|EDL97192.1| calcineurin binding pr (2182) 12112 1979.6 0 gi|194043342|ref|XP_001926759.1| PREDICTED: simila (1688) 9740 1594.4 0 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(2218) 2953 492.6 2e-135 gi|52545656|emb|CAB99097.2| hypothetical protein [ ( 589) 2881 480.4 2.5e-132 gi|27370681|gb|AAH41659.1| Similar to calcineurin ( 407) 2653 443.2 2.7e-121 gi|116283781|gb|AAH28969.1| CABIN1 protein [Homo s ( 407) 2645 441.9 6.7e-121 gi|74199620|dbj|BAE41484.1| unnamed protein produc ( 606) 2556 427.6 2e-116 gi|148699945|gb|EDL31892.1| calcineurin binding pr ( 612) 2556 427.6 2e-116 gi|27370722|gb|AAH39933.1| Similar to cain [Mus mu ( 409) 2526 422.6 4.4e-115 gi|74222989|dbj|BAE40638.1| unnamed protein produc ( 402) 2506 419.3 4.1e-114 gi|149043744|gb|EDL97195.1| calcineurin binding pr ( 601) 2221 373.2 4.6e-100 gi|149043743|gb|EDL97194.1| calcineurin binding pr ( 607) 2221 373.2 4.7e-100 gi|194674695|ref|XP_001787567.1| PREDICTED: simila ( 680) 2149 361.6 1.7e-96 gi|91079222|ref|XP_970170.1| PREDICTED: similar to (2215) 1863 315.6 3.7e-82 gi|210130909|gb|EEA78579.1| hypothetical protein B (2765) 1852 314.0 1.5e-81 gi|26347301|dbj|BAC37299.1| unnamed protein produc ( 504) 1838 311.0 2.1e-81 gi|210126318|gb|EEA74006.1| hypothetical protein B (2767) 1816 308.1 8.6e-80 gi|220673121|emb|CAX14390.1| novel protein similar (1279) 1477 252.7 1.8e-63 gi|34784809|gb|AAH56651.1| Cabin1 protein [Mus mus ( 414) 1440 246.3 5.3e-62 gi|156226602|gb|EDO47410.1| predicted protein [Nem ( 374) 811 144.1 2.7e-31 gi|30388239|gb|AAH51668.1| Cabin1 protein [Mus mus ( 218) 704 126.5 3.1e-26 gi|198412453|ref|XP_002120891.1| PREDICTED: simila ( 605) 705 127.1 5.8e-26 gi|74221255|dbj|BAE42114.1| unnamed protein produc ( 107) 664 119.7 1.7e-24 gi|221130451|ref|XP_002156327.1| PREDICTED: simila ( 811) 670 121.5 3.7e-24 gi|198426435|ref|XP_002121008.1| PREDICTED: simila (1777) 601 110.7 1.5e-20 gi|156226603|gb|EDO47411.1| predicted protein [Nem ( 150) 573 105.1 6.1e-20 gi|47199066|emb|CAF89127.1| unnamed protein produc ( 303) 577 106.0 6.4e-20 gi|212515933|gb|EEB17998.1| conserved hypothetical (2138) 588 108.6 7.4e-20 gi|215505746|gb|EEC15240.1| conserved hypothetical ( 148) 556 102.3 4.1e-19 gi|110758961|ref|XP_396199.3| PREDICTED: similar t (2318) 523 98.1 1.2e-16 gi|215505747|gb|EEC15241.1| conserved hypothetical ( 158) 418 79.9 2.4e-12 gi|157017487|gb|EDO64159.1| AGAP003617-PA [Anophel ( 162) 379 73.6 1.9e-10 >>gi|6685261|sp|Q9Y6J0.1|CABIN_HUMAN RecName: Full=Calci (2220 aa) initn: 14867 init1: 14867 opt: 14867 Z-score: 13041.6 bits: 2426.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 14867; 100.000% identity (100.000% similar) in 2220 aa overlap (5-2224:1-2220) 10 20 30 40 50 60 KIAA03 ISLNMIRIAALNASSTIEDDHEGSFKSHKTQTKEAQEAEAFALYHKALDLQKHDRFEESA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|668 MIRIAALNASSTIEDDHEGSFKSHKTQTKEAQEAEAFALYHKALDLQKHDRFEESA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA03 KAYHELLEASLLREAVSSGDEKEGLKHPGLILKYSTYKNLAQLAAQREDLETAMEFYLEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|668 KAYHELLEASLLREAVSSGDEKEGLKHPGLILKYSTYKNLAQLAAQREDLETAMEFYLEA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 KIAA03 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