# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00872.fasta.nr -Q ../query/KIAA0329.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0329, 1417 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825692 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5460+/-0.000188; mu= 13.7676+/- 0.010 mean_var=84.4299+/-16.345, 0's: 39 Z-trim: 51 B-trim: 37 in 1/66 Lambda= 0.139581 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|73964504|ref|XP_547986.2| PREDICTED: similar to (1421) 8158 1653.7 0 gi|74188509|dbj|BAE28012.1| unnamed protein produc (1423) 4719 961.2 0 gi|34534753|dbj|BAC87100.1| unnamed protein produc ( 733) 4022 820.6 0 gi|194389156|dbj|BAG61595.1| unnamed protein produ ( 594) 3942 804.4 0 gi|94732185|emb|CAK11071.1| novel protein [Danio r ( 977) 3193 653.8 1.7e-184 gi|94732184|emb|CAK11070.1| novel protein [Danio r (1308) 3193 653.9 2.2e-184 gi|109085247|ref|XP_001116456.1| PREDICTED: hypoth ( 570) 2890 592.6 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6.9e-33 gi|210118009|gb|EEA65743.1| hypothetical protein B ( 456) 590 129.3 5.9e-27 gi|108869351|gb|EAT33576.1| conserved hypothetical ( 495) 568 124.9 1.4e-25 gi|190620918|gb|EDV36442.1| GF11949 [Drosophila an ( 707) 496 110.5 4.1e-21 gi|210118003|gb|EEA65737.1| hypothetical protein B ( 268) 469 104.8 8.4e-20 gi|42415435|gb|AAS15687.1| GH02593p [Drosophila me ( 710) 467 104.7 2.4e-19 gi|122129531|sp|Q6NLL1.1|Y1411_DROME RecName: Full ( 710) 463 103.9 4.2e-19 gi|194159701|gb|EDW74602.1| GK22008 [Drosophila wi ( 692) 455 102.3 1.2e-18 gi|194110255|gb|EDW32298.1| GL11559 [Drosophila pe ( 703) 454 102.1 1.4e-18 gi|54635947|gb|EAL25350.1| GA10789 [Drosophila pse ( 703) 453 101.9 1.7e-18 gi|194175572|gb|EDW89183.1| GE23992 [Drosophila ya ( 708) 452 101.7 1.9e-18 gi|194192440|gb|EDX06016.1| GD10254 [Drosophila si ( 710) 452 101.7 1.9e-18 gi|167877890|gb|EDS41273.1| conserved hypothetical ( 421) 446 100.3 3e-18 gi|156537984|ref|XP_001608189.1| PREDICTED: simila ( 616) 448 100.8 3e-18 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NGAREDVGGSDVTGLGDEPCPADDGPNSTQLPFQEQDSSPGAHDGEDIQPIGPQSTFCEV . :: . ::::: : .: ::.::::.: : : :::::: :.. :..: :::: :. gi|739 E-LREAMEGSDVTELREESCPTDDGPSSGQSPCQEQDSSAEAREVGDMEPDDSQSTFSEA 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 KIAA03 PLLNSLTVPSSLSWAPSAEQWLPGTRADEGSPVEPSQEQDILTSMEASGHLSTNLWHAVT :.::: :::::::: ::: : .: ::::: :::.:: .: : . :::... ::::: gi|739 PFLNSPPVPSSLSWASHAEQRLLATSADEGSAEEPSKEQGFLMHMGGPGHLGSTPWHAVT 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 KIAA03 DDDTGQKEIPISERVLGSVGGQLTP-VSALAASTHKPWLEQPPRDQTLTSSDEEDIYAHG :.::: ::. : ::.:::.::: :::::. :..: ::: :::.::::::::::::: gi|739 DSDTGLKEVIAPECDLGTVGGRLTPPVSALAVCTREPRHEQPSRDQVLTSSDEEDIYAHG 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 KIAA03 LPSSSSETSVTELGPSCSQQDLSRLGAEDAGLLKPDQFAESWMGYSGPGYGILSLVVSEK :::::::::::::: ::: ::::. :..:.:::: ::::::::::::::::::::.:::: gi|739 LPSSSSETSVTELGGSCSLQDLSQPGTDDTGLLKSDQFAESWMGYSGPGYGILSLAVSEK 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 KIAA03 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::::.:::::: :..:..::..:::::.:::...::::..:.: :::.:: : ::: :.: gi|947 PCARSVKVDCPCPMAQMAARGGVVWALSEQRGVFYREGLNSYCAEGEHWKYDTVSESQGL 500 510 520 530 540 550 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA03 EPVCITLGDQQTLWALDIHGNLWFRTGIISKKPQGDDDHWWQVSITDYVVFDQCSLFQTI ::.::.::...:.:::: ::::::::. .:::::.::::::::::::::::: :::::. gi|947 EPICIALGENNTVWALDTSGNLWFRTGVTAKKPQGEDDHWWQVSITDYVVFDQGSLFQTL 560 570 580 590 600 610 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA03 IHATHSVATAAQAPVEKVADKLRMAFWSQQLQCQPSLLGVNNSGVWISSGKNEFHVAKGS :.::..:::...::::.::..::.:: ::. ::::::..:: :::::.::.::::::::: gi|947 IQATQTVATVTRAPVERVAERLRVAFLSQHSQCQPSLISVNISGVWIASGRNEFHVAKGS 620 630 640 650 660 670 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA03 LIGTYWNHVVPRGTASATKWAFVLASAAPTKEGSFLWLCQSSKDLCSVSAQSAQSRPSTV :::::: .::::::::::::::..::.:.:::::::: :: ::: . :. : :: :. gi|947 LIGTYWRSTVPRGTASATKWAFVFSSAVPAKEGSFLWLGQSRKDLFCIWDQDLQMRPFTI 680 690 700 710 720 730 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA03 QLPPEAEMRAYAACQDALWALDSLGQVFIRTLSKSCPTGMHWTRLDLSQLGAVKLTSLAC 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