# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00246.fasta.nr -Q ../query/KIAA0315.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0315, 1841 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826009 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1547+/-0.000185; mu= 16.5505+/- 0.010 mean_var=76.4039+/-14.761, 0's: 36 Z-trim: 47 B-trim: 19 in 2/64 Lambda= 0.146729 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|126302585|sp|O15031.3|PLXB2_HUMAN RecName: Full (1838) 12379 2631.3 0 gi|55728934|emb|CAH91205.1| hypothetical protein [ (1839) 12178 2588.7 0 gi|149017545|gb|EDL76549.1| plexin B2 [Rattus norv (1841) 11027 2345.1 0 gi|148672420|gb|EDL04367.1| mCG140951 [Mus musculu (1842) 10924 2323.3 0 gi|74184763|dbj|BAE27981.1| unnamed protein produc (1842) 10915 2321.4 0 gi|194681262|ref|XP_584919.4| PREDICTED: similar t (1843) 10891 2316.3 0 gi|194227009|ref|XP_001914939.1| PREDICTED: simila (1720) 9992 2126.0 0 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protein [Homo sa ( 475) 3123 671.4 5.2e-190 gi|30582613|gb|AAP35533.1| plexin B2 [Homo sapiens ( 470) 3089 664.2 7.5e-188 gi|30584027|gb|AAP36262.1| Homo sapiens plexin B2 ( 471) 3089 664.2 7.5e-188 gi|169146265|emb|CAQ14724.1| novel protein similar (1094) 3079 662.4 6.2e-187 gi|13097006|gb|AAH03293.1| Plxnb2 protein [Mus mus ( 470) 3052 656.4 1.7e-185 gi|149591934|ref|XP_001517911.1| PREDICTED: simila ( 892) 2709 584.0 2e-163 gi|54035167|gb|AAH84085.1| LOC494999 protein [Xeno ( 473) 2702 582.3 3.5e-163 gi|189520689|ref|XP_698766.3| PREDICTED: similar t (2143) 2681 578.4 2.4e-161 gi|51243714|gb|AAT99561.1| plexin D1 [Mus musculus (1925) 2010 436.3 1.3e-118 gi|74184721|dbj|BAE27964.1| unnamed protein produc (1925) 2010 436.3 1.3e-118 gi|194677387|ref|XP_001789224.1| PREDICTED: simila (1717) 2008 435.9 1.5e-118 gi|119599646|gb|EAW79240.1| plexin D1, isoform CRA (1747) 1979 429.7 1.1e-116 gi|157694524|ref|NP_055918.2| plexin D1 [Homo sapi (1925) 1979 429.8 1.2e-116 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