# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha07045.fasta.huge -Q ../query/KIAA0267.ptfa ./tmplib.23147 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0267, 666 aa
 vs ./tmplib.23147 library

1986839 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.5012+/-0.0045; mu= 22.2872+/- 0.308
 mean_var=72.3569+/-17.361, 0's: 0 Z-trim: 2  B-trim: 8 in 1/39
 Lambda= 0.150777

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA0939  ( 595 res)   hh04825s1                   ( 595)  889 203.1 5.9e-53


>>KIAA0939  ( 595 res)   hh04825s1                        (595 aa)
 initn: 839 init1: 294 opt: 889  Z-score: 1042.6  bits: 203.1 E(): 5.9e-53
Smith-Waterman score: 914;  36.123% identity (69.604% similar) in 454 aa overlap (58-503:63-490)

        30        40        50        60        70        80       
KIAA02 LLAVGVFDWAGASDGGGGEARAMDEEIVSEKQAEESHRQDSANLLIFILLLTLTILTIWL
                                     .::.. ..... .... .:.:.. :. . :
KIAA09 FNVTLHTTLVVTTKLVLPTPGKPILPVQTGEQAQQEEQSSGMTIFFSLLVLAICIILVHL
             40        50        60        70        80        90  

        90       100       110       120       130       140       
KIAA02 FKHRRARFLHETGLAMIYGLLVGLVLRYGIHVPSDVNNVTLSCEVQSSPTTLLVTFDPEV
       . . : .:: :.  ..  :.:.: :..           . ..  .. .   .   : :..
KIAA09 LIRYRLHFLPESVAVVSLGILMGAVIKI----------IEFKKLANWKEEEM---FRPNM
            100       110       120                 130            

       150       160       170       180       190       200       
KIAA02 FFNILLPPIIFYAGYSLKRRHFFRNLGSILAYAFLGTAISCFVIGSIMYGCVTLMKVTGQ
       :: .::::::: .::::.. .::.:.:::  .: .::::: ::.:. .:         ::
KIAA09 FFLLLLPPIIFESGYSLHKGNFFQNIGSITLFAVFGTAISAFVVGGGIY-------FLGQ
     140       150       160       170       180              190  

         210       220       230       240       250       260     
KIAA02 --LAGDFYFTDCLLFGAIVSATDPVTVLAIFHELQVDVELYALLFGESVLNDAVAIVLSS
         . . . .:: . ::...::.:::...:::. :.::  :  :.::::.:::::.:::..
KIAA09 ADVISKLNMTDSFAFGSLISAVDPVATIAIFNALHVDPVLNMLVFGESILNDAVSIVLTN
            200       210       220       230       240       250  

           270         280       290       300       310       320 
KIAA02 SI--VAYQPAGDNS--HTFDVTAMFKSIGIFLGIFSGSFAMGAATGVVTALVTKFTKLRE
       .   .. .  .: :  .::     ....  :: .: :: :.:. ::...::: :   ::.
KIAA09 TAEGLTRKNMSDVSGWQTF-----LQALDYFLKMFFGSAALGTLTGLISALVLKHIDLRK
            260       270            280       290       300       

             330       340       350       360       370       380 
KIAA02 FQLLETGLFFLMSWSTFLLAEAWGFTGVVAVLFCGITQAHYTYNNLSTESQHRTKQLFEL
          :: :.......  . :::. ...:..:.:: ::...:::..:::  .:   .: .. 
KIAA09 TPSLEFGMMIIFAYLPYGLAEGISLSGIMAILFSGIVMSHYTHHNLSPVTQILMQQTLRT
       310       320       330       340       350       360       

             390       400       410       420       430       440 
KIAA02 LNFLAENFIFSYMGLTLFTFQNHVFNPTFVVGAFVAIFLGRAANIYPLSLLLNLGRRSKI
       . :: :. .:...::..:.:  : :. .::.  .: ...:::.::.::: :::. :  ::
KIAA09 VAFLCETCVFAFLGLSIFSFP-HKFEISFVIWCIVLVLFGRAVNIFPLSYLLNFFRDHKI
       370       380        390       400       410       420      

             450       460        470        480       490         
KIAA02 GSNFQHMMMFAGLRGAMAFALAIR-DTATYA-RQMMFSTTLLIVFFTVWVFGGGTTAMLS
         ... .: :.:::::. .::... :   .  ::.. .::..::.::. ..::.:  .. 
KIAA09 TPKMMFIMWFSGLRGAIPYALSLHLDLEPMEKRQLIGTTTIVIVLFTILLLGGSTMPLIR
        430       440       450       460       470       480      

     500       510       520       530       540       550         
KIAA02 CLHIRVGVDSDQEHLGVPENERRTTKAESAWLFRMWYNFDHNYLKPLLTHSGPPLTTTLP
        . :                                                        
KIAA09 LMDIEDAKAHRRNKKDVNLSKTEKMGNTVESEHLSELTEEEYEAHYIRRQDLKGFVWLDA
        490       500       510       520       530       540      




666 residues in 1 query   sequences
1986839 residues in 2037 library sequences
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]