# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk16230.fasta.huge -Q ../query/KIAA0231.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0231, 823 aa vs ./tmplib.23147 library 1986682 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3397+/-0.00505; mu= 19.3346+/- 0.344 mean_var=100.6292+/-25.045, 0's: 0 Z-trim: 28 B-trim: 92 in 1/39 Lambda= 0.127853 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1437 ( 811 res) hk07206 ( 811) 3188 599.3 5.4e-172 KIAA0862 ( 584 res) hk06532 ( 584) 414 87.4 4.8e-18 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 273 61.9 5.2e-10 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 260 59.7 3e-09 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 217 51.1 4.4e-07 KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 ( 793) 217 51.3 4.9e-07 KIAA0405 ( 706 res) hg01274 ( 706) 207 49.3 1.7e-06 KIAA1163 ( 437 res) hj05329 ( 437) 197 47.2 4.6e-06 KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559) 196 47.8 1e-05 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 188 46.2 2.6e-05 KIAA1469 ( 662 res) fj01881 ( 662) 181 44.5 4.4e-05 KIAA1674 ( 538 res) fg03838 ( 538) 178 43.8 5.8e-05 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 175 43.7 0.00012 KIAA1497 ( 730 res) hg01608 ( 730) 169 42.4 0.00022 KIAA0416 ( 529 res) hh00236 ( 529) 167 41.8 0.00023 KIAA0606 ( 1369 res) ph00195 (1369) 164 41.8 0.00058 KIAA1898 ( 1013 res) fk06427 (1013) 162 41.3 0.00064 KIAA0813 ( 1618 res) pf00581 (1618) 162 41.6 0.00083 KIAA1854 ( 572 res) fg02232 ( 572) 156 39.8 0.001 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 149 38.7 0.0029 KIAA1246 ( 832 res) hh00149a ( 832) 149 38.8 0.003 KIAA1194 ( 575 res) fg00908 ( 575) 146 38.0 0.0036 KIAA0012 ( 789 res) ha00413 ( 789) 147 38.3 0.0038 KIAA0918 ( 966 res) hk09360(revised) ( 966) 142 37.6 0.008 >>KIAA1437 ( 811 res) hk07206 (811 aa) initn: 3161 init1: 2464 opt: 3188 Z-score: 3179.8 bits: 599.3 E(): 5.4e-172 Smith-Waterman score: 3188; 59.029% identity (82.814% similar) in 803 aa overlap (21-816:2-803) 10 20 30 40 50 60 KIAA02 SILDLFNFFHCISVLLQGKVMITLTELKCLADAQSSYHILKPWWDVFWYYITLIMLLVAV :: .:::. .::.: .:.::::::::: ::...::..:: KIAA14 TMIPVTELRYFADTQPAYRILKPWWDVFTDYISIVMLMIAV 10 20 30 40 70 80 90 100 110 KIAA02 LAGALQLTQSRVLCCLPCKVEFDNHCAVPWDILKASMNTSSNPGT---PLPL--PLRIQN ..:.::.::....: :::: . : . : . :.. : : : :. KIAA14 FGGTLQVTQDKMIC-LPCKWVTKDSCNDSFRGWAAPGPEPTYPNSTILPTPDTGPTGIKY 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA02 DLHRQQYSYIDAVCYEKQLHWFAKFFPYLVLLHTLIFAACSNFWLHYPSTSSRLEHFVAI :: :.::.:.::::::..::::::.:::::::::::: ::::::...: :::.:::::.: KIAA14 DLDRHQYNYVDAVCYENRLHWFAKYFPYLVLLHTLIFLACSNFWFKFPRTSSKLEHFVSI 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 KIAA02 LHKCFDSPWTTRALSETVAEQSVRPLKLSK--SKILLSSSGCSADIDSGKQSLPYPQPGL : ::::::::::::::::.:.: .:: ... .:: : :... : . . KIAA14 LLKCFDSPWTTRALSETVVEESDPKPAFSKMNGSMDKKSSTVSEDVEATVPMLQRTKSRI 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 KIAA02 ESAGIESPTSSVLDKKEGEQAKAIFEKVKRFRMHVEQKDIIYRVYLKQIIVKVILFVLII :.. .. ..::::::::::::.:::::.:: :::. ::.::.:..: :.::: :.::: KIAA14 EQGIVDRSETGVLDKKEGEQAKALFEKVKKFRTHVEEGDIVYRLYMRQTIIKVIKFILII 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 KIAA02 TYVPYFLTHITLEIDCSVDVQAFTGYKRYQCVYSLAEIFKVLASFYVILVILYGLTSSYS :. :.. .: ...::.::....:::. :.:.. :: .::.:::::. :::.::: :. 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KIAA14 LPADIGLLQNLQNLAITANRIETLPPELFQCRKLRALHLGNNVLQSLPSRVGELTNLTQI 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 KIAA02 ELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC :: :: :: :: :: : :::. :.:::.:.:::: : ::: KIAA14 ELRGNRLECLPVELGECPLLKRSGLVVEEDLFNTLPPEVKERLWRADKEQA 770 780 790 800 810 >>KIAA0862 ( 584 res) hk06532 (584 aa) initn: 674 init1: 230 opt: 414 Z-score: 415.9 bits: 87.4 E(): 4.8e-18 Smith-Waterman score: 414; 27.363% identity (62.935% similar) in 402 aa overlap (415-809:172-559) 390 400 410 420 430 440 KIAA02 DFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVEKLKSKLVK-NAQDKIE ::....: .. .... : . . .. . KIAA08 AEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHN-KLREIPSVVYRLDSLTTLY 150 160 170 180 190 200 450 460 470 480 490 500 KIAA02 LHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDH-PAL :.. .. . .. .:... .::.. .::. ...: :: : : :..: .: : KIAA08 LRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIGELCNLITLDVAHNQL--EHLPKE 210 220 230 240 250 510 520 530 540 550 KIAA02 AFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKEL---YLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKN .. : :. .:. .: . .:..:..: : ..:..:. . ....: : KIAA08 IGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLA--KCSALEEL-N 260 270 280 290 300 310 560 570 580 590 600 610 KIAA02 LRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLER :.. ...: .:. . . : .:..:.: . .: ... ... .. ::.. ... KIAA08 LEN----NNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINK 320 330 340 350 360 370 620 630 640 650 660 670 KIAA02 IPHSIFSLNN-LHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNL :: .::: . : .:....:.: .. ..: .. :.: :... :: ....: .: KIAA08 IPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLP--LDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSL 380 390 400 410 420 680 690 700 710 720 730 KIAA02 EQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLP : : :..: ...:: : ::. ::: :.: .:.:: ::..:: ...:::.. :: KIAA08 EVLILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLP 430 440 450 460 470 480 740 750 760 770 780 790 KIAA02 DGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGN-YLETLPPELEGCQSLKRNC :. . .: : ::.: : .: ..: : :: .: : : :..:: :: :..: . KIAA08 RGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPLELALCSKL--SI 490 500 510 520 530 540 800 810 820 KIAA02 LIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC . .:. :. :: KIAA08 MSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV 550 560 570 580 >>KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371 aa) initn: 780 init1: 242 opt: 273 Z-score: 271.6 bits: 61.9 E(): 5.2e-10 Smith-Waterman score: 422; 29.219% identity (61.713% similar) in 397 aa overlap (399-793:17-393) 370 380 390 400 410 420 KIAA02 ALREKSNYSDIPDVKNDFAFILHLADQYDPLYSKRFSIFLSEVSENKLKQINLNNEWTVE : ... .. . :. .:.:. .. .: : KIAA12 MTTKRSLFVRLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVP-KEIFTFE 10 20 30 40 430 440 450 460 470 480 KIAA02 KLKSKLVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKEL : .: .: ..:: :: ..:. .. ::: . ::.....:.::.:: KIAA12 KTLEELYLDA-NQIEE-------LPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLREL 50 60 70 80 90 490 500 510 520 530 540 KIAA02 RVYHSSLVVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLST : ... . . : . : :.. . . ..:.: .: :: .:::. : : : . KIAA12 DVSKNG-IQEFPENIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFL-EFLPA 100 110 120 130 140 150 550 560 570 580 590 600 KIAA02 MQLEGFQDLKNLRTLYLK-SSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSL-DNEGSKLVVLNNLKKMVN .: : .:. : :. ..:. .:... . : .:..:.: .:: .. : . :... . KIAA12 ----NFGRLTKLQILELRENQLKMLPKTM-NRLTQLERLDLGSNEFTE--VPEVLEQLSG 160 170 180 190 200 610 620 630 640 650 660 KIAA02 LKSLELISCDLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIA :: . . . : :: : ::..: ::. .::.. ::: :: .::. : : :.. KIAA12 LKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSKNNIEMVEEGIST--CENLQDLLLSSNSLQ 210 220 230 240 250 260 670 680 690 700 710 720 KIAA02 YIPAQIGALSNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQY .: ::.:.:. :..:.:.. :: .. ... :: :.:.. .: : :.::. KIAA12 QLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIGGLISVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRT 270 280 290 300 310 320 730 740 750 760 770 780 KIAA02 FAVTNNNIEMLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPE ::. .: ...:: . . :.. :.: .:.: .: ..:....: ..: : :..:: KIAA12 FAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFS 330 340 350 360 370 380 790 800 810 820 KIAA02 LEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC . :.: KIAA12 FTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQKMVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFN 390 400 410 420 430 440 >>KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630 aa) initn: 518 init1: 220 opt: 260 Z-score: 257.9 bits: 59.7 E(): 3e-09 Smith-Waterman score: 398; 30.814% identity (61.628% similar) in 344 aa overlap (466-809:23-351) 440 450 460 470 480 490 KIAA02 KNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVSQLVNLKELRVYHSSL ::. .:: . : :.:: . .. KIAA01 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRS----LEEL-LLDANQ 10 20 30 40 500 510 520 530 540 550 KIAA02 VVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQ . . : : ::. : :. .:. ..: : .. .: :: .: .:: .... KIAA01 LRELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKAL 50 60 70 80 90 100 560 570 580 590 600 610 KIAA02 DLKNLRTLYLKSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISC .. . . . :::.:. :.: :: .:.: :. : .. ... ...:: .::: KIAA01 EIAD----FSGNPLSRLPDGFTQLR-SLAHLAL-NDVSLQALPGDVGNLANLVTLELREN 110 120 130 140 150 160 620 630 640 650 660 670 KIAA02 DLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGAL :. .: :. : .:..::: :.:... . .. : :: : : .:... .: ..: : KIAA01 LLKSLPASLSFLVKLEQLDLGGNDLEVLPD--TLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNL 170 180 190 200 210 680 690 700 710 720 730 KIAA02 SNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIE : :....: .:.:: .: . : : :: : : .:. : :..:. . : .: . KIAA01 RRLVCLDVSENRLEELPAELGGLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLC 220 230 240 250 260 270 740 750 760 770 780 790 KIAA02 MLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKR . ... .:..:. :.: .: :: : .:.:..::.:.. :.::.::::. :: .: KIAA01 EVTEAIGDCENLSELILTENLLMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVAL-- 280 290 300 310 320 330 800 810 820 KIAA02 NCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC . : ...: : .:: KIAA01 SVLSLRDNRLAVLPPELAHTTELHVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLR 340 350 360 370 380 390 >>KIAA1580 ( 640 res) fj04979 (640 aa) initn: 134 init1: 62 opt: 217 Z-score: 219.1 bits: 51.1 E(): 4.4e-07 Smith-Waterman score: 249; 29.796% identity (65.306% similar) in 245 aa overlap (474-710:69-299) 450 460 470 480 490 500 KIAA02 LHLFMLNGLPDNVFELTEMEVLSLELIPEVKLPSAVS---QLVNLKELRVYHSSLVVDHP ..:...: .:.::.: .. .. KIAA15 AGLVRAQTCPSVCSCSNQFSKVICVRKNLREVPDGISTNTRLLNLHENQIQ----IIKVN 40 50 60 70 80 90 510 520 530 540 550 KIAA02 ALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFH-LKNLKELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKN .. :. .:.::.:. ... : .:. : ::. : : . ..:.:. .: :.. KIAA15 SFKHLR-HLEILQLSRNHIRTIEIGAFNGLANLNTLEL----FDNRLTTIPNGAFVYLSK 100 110 120 130 140 560 570 580 590 600 610 KIAA02 LRTLYLKSS-LSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNN--LKKMVNLKSLELISCD :. :.:... . ::. . . .:::..:.: .: ..: ... .. . ::. :.: :. KIAA15 LKELWLRNNPIESIPSYAFNRIPSLRRLDL-GELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNLAMCN 150 160 170 180 190 200 620 630 640 650 660 670 KIAA02 LERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQ-IGAL :..::. . : .: :::: :.:.... ::: :..:. : . ...: : . . : KIAA15 LREIPN-LTPLIKLDELDLSGNHLSAIRPG-SFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNL 210 220 230 240 250 260 680 690 700 710 720 730 KIAA02 SNLEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIE ..: ...: :::. :: .:: : ::.:. . : KIAA15 QSLVEINLAHNNLTLLPHDLF--TPLHHLERIHLHHNPWNCNCDILWLSWWIKDMAPSNT 270 280 290 300 310 320 740 750 760 770 780 790 KIAA02 MLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKR KIAA15 ACCARCNTPPNLKGRYIGELDQNYFTCYAPVIVEPPADLNVTEGMAAELKCRASTSLTSV 330 340 350 360 370 380 >>KIAA1016 ( 793 res) hk03719s1 (793 aa) initn: 253 init1: 124 opt: 217 Z-score: 218.2 bits: 51.3 E(): 4.9e-07 Smith-Waterman score: 227; 29.680% identity (59.817% similar) in 219 aa overlap (601-815:132-343) 580 590 600 610 620 KIAA02 RIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERIPHSI---FSL :.. .: .:.: . :...:.. .: KIAA10 GGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLNRGLERALEEAANSGGLNLSARKLKEFPRTAAPGHDL 110 120 130 140 150 160 630 640 650 660 670 680 KIAA02 NNLHELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQLSLDHNN .. . :: .: : :: . . :. .: :.:.:: : :: : :. : :.:..:. KIAA10 SDTVQADLSKNRL--VEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYLNLSRNQ 170 180 190 200 210 690 700 710 720 730 740 KIAA02 IENLPLQLFLC-TKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQCKK . :: :: :. : : :.: .:::: :..:. . :. :.: ::. . : :. KIAA10 LSALPA--CLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKS 220 230 240 250 260 270 750 760 770 780 790 800 KIAA02 LQCLLLGKNSLMNLSPHVGELSNLTHLELIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIVEENLLN :. : . .: : : .. .: :..... : . ..: .. ..:. :..:.: :. KIAA10 LRELNVRRNYLKVLPQELVDLP-LVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQ--VLLLENNPLQ 280 290 300 310 320 330 810 820 KIAA02 TLPLPVTERLQTCLDKC . : . . KIAA10 SPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKTADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDN 340 350 360 370 380 390 >>KIAA0405 ( 706 res) hg01274 (706 aa) initn: 43 init1: 43 opt: 207 Z-score: 208.7 bits: 49.3 E(): 1.7e-06 Smith-Waterman score: 207; 29.268% identity (57.073% similar) in 205 aa overlap (621-817:127-322) 600 610 620 630 640 650 KIAA02 EGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERIPHSIFSLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQ : . .....: . : :.: : ... KIAA04 ERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLD--EFPMNLP 100 110 120 130 140 150 660 670 680 690 700 KIAA02 HLQNLSCLKLWHNNIAYIP-AQIGALSNLEQLSLDHNNIENLPLQ---LFLCTKLHYLDL .:. :.: .::: : : .. : .::.: :: :.: .. .. . .:. : : KIAA04 --KNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFL 160 170 180 190 200 210 710 720 730 740 750 760 KIAA02 SYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQC-KKLQCLLLGKNSLMNLSPHVG : :::. .: . .:: . : .: : .. : :: .:. :.. : : : . : KIAA04 SKNHLSSVP--VGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEG 220 230 240 250 260 270 770 780 790 800 810 820 KIAA02 ELSNLTHLE---LIGNYLETLPPELEGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDK .:.::.:. .. : : ::.: : . .. : ...: .: .:: . :. KIAA04 TFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIR---LYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERL 280 290 300 310 320 KIAA02 C KIAA04 DISNNQLRMLTQGVFDNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQG 330 340 350 360 370 380 >>KIAA1163 ( 437 res) hj05329 (437 aa) initn: 106 init1: 72 opt: 197 Z-score: 200.8 bits: 47.2 E(): 4.6e-06 Smith-Waterman score: 197; 34.932% identity (63.014% similar) in 146 aa overlap (681-816:10-152) 660 670 680 690 700 KIAA02 HLQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSNLEQLSLDHNNIENL-----PLQLFLCTKLHYLD :.:.:::. : : .: :.:: : KIAA11 HSLPSYTALLDLSHNNLSRLRAEWTPTRL---TQLHSLL 10 20 30 710 720 730 740 750 760 KIAA02 LSYNHLTFIPEE-IQYLSNLQYFAVTNNNIEMLPDGLFQ-CKKLQCLLLGKNSLMNLSPH ::.:::.:: : .. . ::.:. ...:... : . ::. . :. ::: .: .: .. KIAA11 LSHNHLNFISSEAFSPVPNLRYLDLSSNQLRTLDEFLFSDLQVLEVLLLYNNHIMAVDRC 40 50 60 70 80 90 770 780 790 800 810 820 KIAA02 V-GELSNLTHLELIGNYLETLPPEL--EGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCL . ....: .: : : . .: :: :: . : . : . : :..:::: ..: KIAA11 AFDDMAQLQKLYLSQNQISRFPLELVKEGAKLPKLTLLDLSSNKLKNLPLPDLQKLPAWI 100 110 120 130 140 150 KIAA02 DKC KIAA11 KNGLYLHNNPLNCDCELYQLFSHWQYRQLSSVMDFQEDLYCMNSKKLHNVFNLSFLNCGE 160 170 180 190 200 210 >>KIAA0814 ( 1559 res) fh16048 (1559 aa) initn: 199 init1: 89 opt: 196 Z-score: 194.3 bits: 47.8 E(): 1e-05 Smith-Waterman score: 240; 24.789% identity (55.211% similar) in 355 aa overlap (505-817:95-439) 480 490 500 510 520 530 KIAA02 LPSAVSQLVNLKELRVYHSSLVVDHPALAFLEENLKILRLKFTEMGKIPRWVFH-LKNLK . .: . : : ... .: . : ::::. KIAA08 PPAVACPTKCTCSAASVDCHGLGLRAVPRGIPRNAERLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLR 70 80 90 100 110 120 540 550 560 570 580 590 KIAA02 ELYLSGCVLPEQLSTMQLEGFQDLKNLRTLYL-KSSLSRIPQVVTDLLPSLQKLSLDNEG :.: .:.:... .:::::.:. : : :..:. .:... . :.: .:.:... KIAA08 VLHLED----NQVSVIERGAFQDLKQLERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQ 130 140 150 160 170 180 600 610 620 630 640 650 KIAA02 SKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLERIPHSIF-SLNNLHELDLRENNLKTVEEIISFQH . . . .. ....:.:.: . . : . : .: .:. : : .::.. . . ::.: KIAA08 IQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHISCIEDGAFRALRDLEILTLNNNNISRIL-VTSFNH 190 200 210 220 230 660 670 680 690 KIAA02 LQNLSCLKLWHNNIAYIPAQIGALSN-LEQ-------------LSLDHNNIENLPLQLFL . .. :.: :.: : ... ::. :.: . : :. .. . .. KIAA08 MPKIRTLRL-HSNHLYCDCHLAWLSDWLRQRRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYV 240 250 260 270 280 290 700 710 720 730 KIAA02 CTKLH----------------------YLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIE : : .: . : :: .. .. . . .:.:. KIAA08 CPAPHSEPPSCNANSISCPSPCTCSNNIVDCRGKGLMEIPANLP--EGIVEIRLEQNSIK 300 310 320 330 340 350 740 750 760 770 780 790 KIAA02 MLPDGLF-QCKKLQCLLLGKNSLMNLSPHVGE-LSNLTHLELIGNYLETLPPEL-EGCQS .: : : : :::. . ..::.. ...: . . :..:: : : :: . . : .: : KIAA08 AIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQGLKSLTSLVLYGNKITEIAKGLFDGLVS 360 370 380 390 400 410 800 810 820 KIAA02 LKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC :. :... : .: : . . . :: KIAA08 LQ--LLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDNKLQTISKGLFAPLQSIQTLHLAQNP 420 430 440 450 460 470 >>KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258 aa) initn: 259 init1: 149 opt: 188 Z-score: 187.3 bits: 46.2 E(): 2.6e-05 Smith-Waterman score: 292; 23.729% identity (56.992% similar) in 472 aa overlap (377-809:186-642) 350 360 370 380 390 400 KIAA02 GLTSSYSLWWMLRSSLKQYSFEALREKSNYSDIPDVKNDFAFILHLAD-QYDPLYSKRFS :.. : .. :: :. . . . ...: KIAA09 SGIYNVRKGKTQLHKWAERLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYS 160 170 180 190 200 210 410 420 430 440 450 KIAA02 I-FLSEVSENKLKQINLNN-----EWTVEKLKSKLVKNAQDKIELHLFMLNGLPDNVFEL . : : .. . ...... .: .. ::.:.. . ..: . :. .:...: KIAA09 LAFSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRW--QRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYS 220 230 240 250 260 270 460 470 480 490 500 510 KIAA02 TEMEVLSLEL-IPEVKLPSAVSQLVN---LKELRVYHSSLVVDHPALAFLEENLKILRLK .. :.:. . ... :.... : . :: : . :..: . : : .: : :. KIAA09 QDITYLNLRHNFMQLERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGL-FPILLCEISTLTELNLS 280 290 300 310 320 330 520 530 540 550 560 570 KIAA02 FTEMGKIPRWVFHLKNLKELYLSG---CVLPEQLSTMQLEGFQDLKNLRTLYLKSSLSRI . . .: . .: ::. : :.: .:::.:...: .:..: . ...:.: KIAA09 CNGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQ-----QLSSLGISF--NNFSQI 340 350 360 370 380 580 590 600 610 620 630 KIAA02 PQVVTDLLPSLQKLSLDNEGSKLVVLNNLKKMVNLKSLELISCDLER-IPHSIFSLNNLH :.: . : :... . .. ... :. :..: ..: ..: :. . ... . ... KIAA09 PEVY-EKLTMLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHIT 390 400 410 420 430 440 640 650 660 670 KIAA02 ELDLRENNLKTVEEIISFQHLQNLSC-------LKLWHNNIAYIPAQIGALSN------- ..:::.: : .. . :. :..: : : : .. . :. . :. KIAA09 HVDLRDNRLTDLD-LSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVP 450 460 470 480 490 500 680 690 700 710 720 730 KIAA02 --LEQLSLDHNNIENLPLQLFLCTKLHYLDLSYNHLTFIPEEIQYLSNLQYFAVTNNNIE : :.:..: .: .: :.. ::.::: :: .: .: .:. . . .:... KIAA09 SLLTFLDLSRNLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQ 510 520 530 540 550 560 740 750 760 770 780 KIAA02 MLPDGLFQCKKLQCLLLGKNSLMNL-----SPHVGELSNLTHLE---LIGNYLETLPPEL :: : . :. : : .:.: : : ...:..: .:: : :: :.:.: . KIAA09 NLPT-LVEHIPLEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTI 570 580 590 600 610 620 790 800 810 820 KIAA02 EGCQSLKRNCLIVEENLLNTLPLPVTERLQTCLDKC .:. : . :... : .. .: KIAA09 ANCKRL--HTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTG 630 640 650 660 670 680 823 residues in 1 query sequences 1986682 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:12:36 2008 done: Thu Dec 18 15:12:37 2008 Total Scan time: 0.600 Total Display time: 0.230 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]