# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha02362.fasta.nr -Q ../query/KIAA0166.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0166, 2228 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827273 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2855+/-0.000182; mu= 15.4033+/- 0.010 mean_var=74.0018+/-14.670, 0's: 46 Z-trim: 47 B-trim: 2358 in 2/64 Lambda= 0.149092 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|1723117|sp|P50748.1|KNTC1_HUMAN RecName: Full=K (2209) 14318 3090.7 0 gi|119618739|gb|EAW98333.1| kinetochore associated (2209) 14313 3089.6 0 gi|114647569|ref|XP_001168340.1| PREDICTED: Rough (2209) 14261 3078.4 0 gi|194214360|ref|XP_001492639.2| PREDICTED: simila (2208) 13282 2867.9 0 gi|81175181|sp|Q8C3Y4.2|KNTC1_MOUSE RecName: Full= (2207) 11822 2553.8 0 gi|126324288|ref|XP_001374157.1| PREDICTED: simila (2411) 10442 2257.0 0 gi|118098509|ref|XP_415157.2| PREDICTED: similar t (2226) 8931 1932.0 0 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