# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha01242.fasta.nr -Q ../query/KIAA0061.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0061, 903 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826878 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0301+/-0.000185; mu= 14.9948+/- 0.010 mean_var=75.1270+/-14.498, 0's: 53 Z-trim: 56 B-trim: 13 in 1/67 Lambda= 0.147971 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|13124451|sp|Q99575.2|POP1_HUMAN RecName: Full=R (1024) 6254 1345.1 0 gi|15079366|gb|AAH11529.1| Processing of precursor (1024) 6244 1343.0 0 gi|114621071|ref|XP_001149384.1| PREDICTED: proces (1024) 6188 1331.0 0 gi|194214998|ref|XP_001915387.1| PREDICTED: simila (1017) 5224 1125.2 0 gi|119906731|ref|XP_878948.2| PREDICTED: similar t (1015) 5007 1078.9 0 gi|126322136|ref|XP_001369084.1| PREDICTED: simila (1025) 4341 936.7 0 gi|149066545|gb|EDM16418.1| processing of precurso (1014) 3939 850.9 0 gi|148676900|gb|EDL08847.1| processing of precurso (1015) 3859 833.8 0 gi|12855337|dbj|BAB30296.1| unnamed protein produc (1015) 3856 833.2 0 gi|194037013|ref|XP_001926485.1| PREDICTED: simila ( 757) 3663 791.9 0 gi|149596158|ref|XP_001521814.1| PREDICTED: simila ( 736) 3008 652.0 2.7e-184 gi|73974069|ref|XP_539099.2| PREDICTED: similar to (1046) 2538 551.8 5.7e-154 gi|149066544|gb|EDM16417.1| processing of precurso (1044) 2354 512.5 3.8e-142 gi|21961363|gb|AAH34742.1| Processing of precursor (1045) 2321 505.5 5e-140 gi|148676901|gb|EDL08848.1| processing of precurso (1045) 2321 505.5 5e-140 gi|126322134|ref|XP_001369053.1| PREDICTED: simila (1055) 2179 475.2 6.7e-131 gi|149529282|ref|XP_001517582.1| PREDICTED: simila ( 306) 1185 262.5 2e-67 gi|156554198|ref|XP_001600242.1| PREDICTED: simila ( 886) 1122 249.5 5e-63 gi|189530452|ref|XP_001339421.2| PREDICTED: simila ( 733) 947 212.0 7.6e-52 gi|118112274|ref|XP_001236103.1| PREDICTED: simila ( 298) 819 184.4 6.6e-44 gi|156218398|gb|EDO39296.1| predicted protein [Nem ( 824) 799 180.5 2.7e-42 gi|190618857|gb|EDV34381.1| GF20996 [Drosophila an ( 860) 744 168.8 9.5e-39 gi|194149621|gb|EDW65312.1| GJ18978 [Drosophila vi ( 839) 730 165.8 7.4e-38 gi|189182198|gb|ACD81875.1| RE46306p [Drosophila m ( 491) 720 163.4 2.2e-37 gi|45446816|gb|AAF46049.3| lethal (1) G0045 [Droso ( 857) 720 163.6 3.3e-37 gi|194187520|gb|EDX01104.1| GE16413 [Drosophila ya ( 855) 717 163.0 5.2e-37 gi|190648630|gb|EDV45908.1| GG18770 [Drosophila er ( 851) 715 162.6 6.9e-37 gi|194160254|gb|EDW75155.1| GK19851 [Drosophila wi ( 849) 681 155.3 1.1e-34 gi|193908422|gb|EDW07289.1| GI14948 [Drosophila mo ( 836) 659 150.6 2.7e-33 gi|198146020|gb|EDY72425.1| GA23082 [Drosophila ps ( 832) 658 150.4 3.1e-33 gi|193901553|gb|EDW00420.1| GH12857 [Drosophila gr ( 817) 656 150.0 4.1e-33 gi|4972738|gb|AAD34764.1| unknown [Drosophila mela ( 797) 650 148.7 9.9e-33 gi|167867051|gb|EDS30434.1| ribonucleaseP/MRP prot ( 810) 647 148.0 1.6e-32 gi|194104969|gb|EDW27012.1| GL16532 [Drosophila pe ( 822) 644 147.4 2.5e-32 gi|189233586|ref|XP_969301.2| PREDICTED: similar t ( 738) 618 141.8 1.1e-30 gi|212506204|gb|EEB10487.1| ribonuclease p/mrp sub ( 863) 584 134.6 1.8e-28 gi|158599352|gb|EDP36994.1| Ribonucleases P/MRP pr ( 883) 571 131.8 1.3e-27 gi|193591991|ref|XP_001948427.1| PREDICTED: simila ( 613) 568 131.1 1.5e-27 gi|210082930|gb|EEA31578.1| hypothetical protein B ( 854) 562 129.9 4.7e-27 gi|47217885|emb|CAG05007.1| unnamed protein produc ( 847) 558 129.1 8.5e-27 gi|57229084|gb|AAW45518.1| ribonucleases P/MRP pro ( 787) 537 124.5 1.8e-25 gi|50256685|gb|EAL19408.1| hypothetical protein CN ( 787) 536 124.3 2.1e-25 gi|190583316|gb|EDV23387.1| hypothetical protein T ( 666) 529 122.8 5.2e-25 gi|149420171|ref|XP_001520809.1| PREDICTED: simila ( 290) 524 121.4 5.8e-25 gi|156218486|gb|EDO39382.1| predicted protein [Nem ( 321) 513 119.1 3.2e-24 gi|194131017|gb|EDW53060.1| GM12420 [Drosophila se ( 209) 491 114.2 6e-23 gi|210091602|gb|EEA39849.1| hypothetical protein B ( 817) 497 116.0 6.8e-23 gi|194131015|gb|EDW53058.1| GM12422 [Drosophila se ( 544) 459 107.8 1.4e-20 gi|221112571|ref|XP_002168404.1| PREDICTED: simila ( 656) 455 107.0 2.9e-20 gi|164649146|gb|EDR13388.1| predicted protein [Lac ( 708) 441 104.0 2.4e-19 >>gi|13124451|sp|Q99575.2|POP1_HUMAN RecName: Full=Ribon (1024 aa) initn: 6254 init1: 6254 opt: 6254 Z-score: 7207.9 bits: 1345.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 6254; 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