# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha01417.fasta.huge -Q ../query/KIAA0053.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0053, 666 aa vs ./tmplib.23147 library 1986839 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1039+/-0.00777; mu= 8.1158+/- 0.526 mean_var=246.1330+/-56.642, 0's: 0 Z-trim: 22 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.081750 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095) 328 52.2 2.9e-07 KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061) 316 50.7 7.7e-07 KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770) 319 51.4 8.1e-07 KIAA1501 ( 735 res) hh12863 ( 735) 304 49.1 1.7e-06 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 306 49.6 1.7e-06 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 302 49.0 2.2e-06 KIAA1688 ( 1094 res) fh26207 (1094) 300 48.9 2.9e-06 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 295 48.1 3.7e-06 KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445) 296 48.6 4.7e-06 KIAA1478 ( 570 res) fj05212 ( 570) 281 46.2 9.3e-06 KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499) 279 46.6 1.9e-05 KIAA0621 ( 753 res) hg04539 ( 753) 266 44.6 3.7e-05 KIAA1314 ( 681 res) fh12718 ( 681) 265 44.5 3.8e-05 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 234 41.2 0.0007 KIAA0013 ( 1086 res) ha00450s1 (1086) 229 40.5 0.00095 KIAA1723 ( 1554 res) pf00881 (1554) 211 38.6 0.0051 >>KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095 aa) initn: 169 init1: 144 opt: 328 Z-score: 222.2 bits: 52.2 E(): 2.9e-07 Smith-Waterman score: 346; 23.769% identity (56.531% similar) in 467 aa overlap (152-589:487-942) 130 140 150 160 170 180 KIAA00 ATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQR :... ::. . : : . : :.. : KIAA04 KPSIAKRRANQQETEQFYFTKMKEYLEGRNLITKLQAKHDLLQKTLGESQRTDCSL--AR 460 470 480 490 500 510 190 200 210 220 230 240 KIAA00 LDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERP . :: ... . . .:..::.: .:: .:: ..:::::. :.. :.....::. :: : KIAA04 RSSTV--RKQDSSQAIPLVVESCIRFISRHGLQHEGIFRVSGSQVEVNDIKNAFERGEDP 520 530 540 550 560 570 250 260 270 280 290 KIAA00 -SFDR-DTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLS . :. : :. ..:..::::.: : .:. : . .. .. : . : .: .: . . : : KIAA04 LAGDQNDHDMDSIAGVLKLYFRGLEHPLFPKDIFHDLMACVTMDNLQE-RALH-IRKVLL 580 590 600 610 620 630 300 310 320 330 340 350 KIAA00 ILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQI .::. . .. :. ::.... : :. ::: .: .:. .: . . .. 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KIAA04 INEVIKTIIIHHEAIFPSPRELEGPVYEKCMAGGEEYCDSPHSEPGAIDEVDHDNGTEPH 650 660 670 680 690 700 >>KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770 aa) initn: 296 init1: 98 opt: 319 Z-score: 214.3 bits: 51.4 E(): 8.1e-07 Smith-Waterman score: 319; 26.617% identity (54.975% similar) in 402 aa overlap (192-570:57-446) 170 180 190 200 210 KIAA00 EWVKFLRRVAGTPCGVFGQRLDETVAYEQKFGPHL------VPILVEKCAEFILEHGRNE .: :: :: ....:. :: ..: KIAA07 TFLRTFMKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNSGFEVPQVLQSCTAFIERYG-IV 30 40 50 60 70 80 220 230 240 250 260 270 KIAA00 EGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDT---DVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQ .::.:: : . ...:: ::. . :.. .. :.:.:.:: :::.:.::.:.. .. KIAA07 DGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQL 90 100 110 120 130 140 280 290 300 310 320 330 KIAA00 YEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDN :: : .. : . . .. .. :: .: : .. : : . :....: . : KIAA07 YEKF--SDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKN 150 160 170 180 190 200 340 350 360 370 380 KIAA00 LATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTP-----QIQRVMTMMIRDH-EVLFPKSKDIPLSPPA :: : . ::.::: . : . :: .:: :.. .: .: .::: .. .. : KIAA07 LAIVWAPNLLRSKQIESACF-SGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQEGA 210 220 230 240 250 260 390 400 410 420 430 440 KIAA00 QK-NDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKV . . ::. :. :. . :. . . .: . .:. : : . . .. KIAA07 ASLSRPKSLLVSSPSTKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGP--AALQGKFHT 270 280 290 300 310 320 450 460 470 480 490 500 KIAA00 PREKPGDWKM-QSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANSSKMEIFKNEFWSPSSEAKAGEGHR : : . : :.. . . . . . :.. . .... :: .. .:: : :: :: . KIAA07 IIEFPLERKRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLG-KSSSVSKRKLQRNE--SEPSEMKAMALKG 330 340 350 360 370 510 520 530 540 550 KIAA00 RTMSQDLRQL-SDSQRTSTY--DNVPSL--PGSPGEEASALSSQACDSKGDTLASP-NSE ::. :. . :: . :. .: : : ..:::.. .:. :.. :: KIAA07 GRAEGTLRSAKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSAS---FNGEMLGNRCNSY 380 390 400 410 420 430 560 570 580 590 600 610 KIAA00 TGPGKKNSGEEEIDSLQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELE . . : .::: KIAA07 DNLPHDNESEEEGGLLHIPALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESEC 440 450 460 470 480 490 >>KIAA1501 ( 735 res) hh12863 (735 aa) initn: 216 init1: 103 opt: 304 Z-score: 208.7 bits: 49.1 E(): 1.7e-06 Smith-Waterman score: 304; 24.898% identity (57.959% similar) in 245 aa overlap (155-395:470-709) 130 140 150 160 170 180 KIAA00 PEEAGKFVFEIIPASWDQNRMGQDSYVLMASSQAEMEEW-VKFLRRVAGTPCGVFGQRLD :. : : ...... . .:: ::. KIAA15 GLGGLKSEFLKQSAARGLRTQDLPAGSKDDSAAAPKTPWGINIIKKNKKAAPRAFGVRLE 440 450 460 470 480 490 190 200 210 220 230 240 KIAA00 ETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERP-- : .. . ::..: : ... .: . ::.:.::.. .:..:.. .. : KIAA15 ECQPATEN---QRVPLIVAACCRIVEARGLESTGIYRVPGNNAVVSSLQEQLNRGPGDIN 500 510 520 530 540 550 250 260 270 280 290 300 KIAA00 -SFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSI . .: :.....:::: ..: ::::. ..:. :. ... .: : .. : : . KIAA15 LQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRIEDARE--RMRTLRKLIRD 560 570 580 590 600 610 310 320 330 340 350 360 KIAA00 LPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQ :: : :... :. : . ::: ::: :.: .:.:.. .. . .. :. KIAA15 LPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNMTDMVTHMPDRY 620 630 640 650 660 670 370 380 390 400 410 420 KIAA00 RVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSM ... .:. . .: .: :. ..:. .: KIAA15 KIVETLIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVPPGDPGSADLLE 680 690 700 710 720 730 430 440 450 460 470 480 KIAA00 TSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKCFLTSAFQGANS KIAA15 I >>KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051 aa) initn: 238 init1: 136 opt: 306 Z-score: 208.4 bits: 49.6 E(): 1.7e-06 Smith-Waterman score: 306; 29.268% identity (64.878% similar) in 205 aa overlap (179-380:470-666) 150 160 170 180 190 200 KIAA00 SYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFI :.: ..: .: : ...:..::.: .:: KIAA13 NLITKLQAKHDLLQRTLGEGHRAEYMTTSRGRRNSHT--RHQDSG-QVIPLIVESCIRFI 440 450 460 470 480 490 210 220 230 240 250 260 KIAA00 LEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDT--DVHTVASLLKLYLRDLPEP .: ...::::. :.. :......:. :: : : .. :...::..::::.: : .: KIAA13 NLYGLQHQGIFRVSGSQVEVNDIKNSFERGENPLADDQSNHDINSVAGVLKLYFRGLENP 500 510 520 530 540 550 270 280 290 300 310 320 KIAA00 VVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVN . : ... .. : .. : : .: . . : : :::. .. :. ::.... : KIAA13 LFPKERFNDLISCIRIDNLYE-RALH-IRKLLLTLPRSVLIVMRYLFAFLNHLSQYSDEN 560 570 580 590 600 610 330 340 350 360 370 380 KIAA00 KMSVDNLATVIGVNLIR-SKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPP :. ::: .: .:. ...: . ...... .: ::..:: .:.. KIAA13 MMDPYNLAICFGPTLMPVPEIQDQ---VSCQAHVNEIIKTIIIHHETIFPDAKELDGPVY 620 630 640 650 660 670 390 400 410 420 430 440 KIAA00 AQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKV KIAA13 EKCMAGDDYCDSPYSEHGTLEEVDQDAGTEPHTSEDECEPIEAIAKFDYVGRSARELSFK 680 690 700 710 720 730 >>KIAA0131 ( 942 res) ha01235 (942 aa) initn: 201 init1: 146 opt: 302 Z-score: 206.3 bits: 49.0 E(): 2.2e-06 Smith-Waterman score: 302; 31.890% identity (57.874% similar) in 254 aa overlap (165-409:483-722) 140 150 160 170 180 190 KIAA00 IIPASWDQNRMGQDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQRL--DETVAYEQKF :: . : . ..::: . . :. KIAA01 LQAKHEKLQEALQRGDKEEQEVSWTQYTQRKFQKSRQPRPSSQYNQRLFGGDMEKFIQSS 460 470 480 490 500 510 200 210 220 230 240 250 KIAA00 GPHLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDT--DVH : . ::..::.: .:: .: ..:::::. : . :...::::. :: : . : :. KIAA01 G-QPVPLVVESCIRFINLNGLQHEGIFRVSGAQLRVSEIRDAFERGEDPLVEGCTAHDLD 520 530 540 550 560 570 260 270 280 290 300 KIAA00 TVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSIL----PRDNY .::..::::.:.: :. : . : :.: ..: .: : ....: : : KIAA01 SVAGVLKLYFRSLEPPLFPPD------LFGELLASSELEATAERVEHVSRLLWRLPAPVL 580 590 600 610 620 310 320 330 340 350 360 KIAA00 SLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKV-EDPAVIMRGTPQIQRVMTM .: :. ::... : :. :::. .: .:. . .:: : ..: . : :.:. 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