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Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0048, 627 aa vs ./tmplib.23147 library 1986878 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2978+/-0.00971; mu= -22.2987+/- 0.653 mean_var=459.0916+/-114.129, 0's: 0 Z-trim: 53 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.059858 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 317 41.9 0.00022 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 308 41.0 0.00028 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 304 40.8 0.00049 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 298 40.3 0.00066 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 296 40.0 0.00066 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 295 39.9 0.00067 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 294 39.9 0.00076 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 291 39.6 0.00086 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 297 40.3 0.00087 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 292 39.8 0.0011 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 289 39.5 0.0011 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 285 39.1 0.0013 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 287 39.4 0.0014 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 289 39.6 0.0014 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 280 38.6 0.0015 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 286 39.3 0.0015 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 280 38.6 0.0016 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 277 38.3 0.0018 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 277 38.4 0.002 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 275 38.2 0.0022 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 282 39.0 0.0022 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 273 38.0 0.0022 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 276 38.3 0.0023 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 276 38.3 0.0023 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 274 38.1 0.0024 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 271 37.8 0.0025 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 276 38.5 0.0029 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 273 38.2 0.0032 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 273 38.2 0.0036 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 265 37.3 0.0037 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 266 37.4 0.0038 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 268 37.7 0.0041 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 267 37.6 0.0042 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 265 37.5 0.0053 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 257 36.7 0.007 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 254 36.3 0.0071 KIAA1993 ( 532 res) bg00180 ( 532) 254 36.4 0.0076 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 253 36.3 0.0086 >>KIAA0972 ( 702 res) hj06859 (702 aa) initn: 398 init1: 194 opt: 317 Z-score: 170.7 bits: 41.9 E(): 0.00022 Smith-Waterman score: 317; 44.860% identity (68.224% similar) in 107 aa overlap (521-621:481-585) 500 510 520 530 540 KIAA00 LSPTQIQLQMEQALAGETQPGEKRRRMACTCPNC-KDGEKRSGEQGKKK-HVCHIP---- : .: : ..: .:... :. . : KIAA09 FECSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKCNECGKTFVQKSTLRGHQRIHTGEKPYECS 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 KIAA00 DCGKTFRKTSLLRAHVRLHTGERPFVCNWFFCGKRFTRSDELQRHARTHTGDKRFECAQC .::::: . : :: : :.::::. : :: ::: : ....:. : :::::.: ..: .: KIAA09 ECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQ--CGKTFGQKSNLRIHQRTHTGEKTYQCNEC 520 530 540 550 560 610 620 KIAA00 QKRFMRSDHLTKHYKTHLVTKNL .: : :.::: .: ::: KIAA09 EKSFWRKDHLIQHQKTHTGEKPFKCNECGKTFARTSTLRVHQRIHTGEKPFKCNECGKKF 570 580 590 600 610 620 >>KIAA0557 ( 493 res) hh01334 (493 aa) initn: 562 init1: 185 opt: 308 Z-score: 168.6 bits: 41.0 E(): 0.00028 Smith-Waterman score: 308; 24.194% identity (51.613% similar) in 372 aa overlap (270-621:93-444) 240 250 260 270 280 290 KIAA00 GAPTQLLTESPPTPLSKTNKKARKKSLPASQPPVAVAEQVETVLIETTADNIIQAGNNLL .: . . ::. .:. ... . . 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