# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha00941.fasta.huge -Q ../query/KIAA0045.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0045, 2005 aa vs ./tmplib.23147 library 1985500 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6068+/-0.0091; mu= -3.9975+/- 0.614 mean_var=334.0819+/-84.015, 0's: 0 Z-trim: 17 B-trim: 78 in 1/39 Lambda= 0.070169 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1131 ( 2168 res) pf08614 (2168) 573 73.8 5.3e-13 KIAA1320 ( 567 res) fh13757 ( 567) 372 52.8 2.9e-07 KIAA1625 ( 859 res) hh15184 ( 859) 358 51.6 1e-06 KIAA0439 ( 995 res) hj00462 ( 995) 355 51.4 1.4e-06 KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 352 51.1 1.6e-06 KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086) 348 50.7 2.4e-06 KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192) 348 51.2 4.9e-06 KIAA1301 ( 1581 res) fg06833 (1581) 318 47.9 2.5e-05 KIAA0317 ( 826 res) hg00276 ( 826) 291 44.8 0.00011 KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614) 290 45.0 0.00018 >>KIAA1131 ( 2168 res) pf08614 (2168 aa) initn: 1055 init1: 394 opt: 573 Z-score: 325.3 bits: 73.8 E(): 5.3e-13 Smith-Waterman score: 1012; 30.504% identity (57.958% similar) in 754 aa overlap (1379-2005:1430-2168) 1350 1360 1370 1380 1390 1400 KIAA00 NSGNVRHRLQFYIGEHLLPYNMTVYQAVRQFSIQAEDERESTDDESNPLGRAGIWTKTHT ..:. .. ..: .. : :. : :. :. 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KIAA11 DNFPDDESRHVDLGG--GLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSD--ELERITKLFHFLGIFL 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1720 1730 1740 KIAA00 AKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWML--------------------------RQETS------ :: :.: ::::::.. ::.: : ..:.: KIAA11 AKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMCMGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHD 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1750 1760 1770 KIAA00 -------------------------------LTSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKR :: .:. ..: :: . ...:.. .... KIAA11 SLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWFNGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQ 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1780 1790 1800 1810 1820 KIAA00 LEQDKSQTKESLQYALETLTM---NGC----SVEDLGLDFTL-P-----GFPNIELKKGG . ..:. ... . :. :.. .: :.:::::.: . : :: ..:: .: KIAA11 ILSNKGLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSGPPLSIEDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSG 1940 1950 1960 1970 1980 1990 1830 1840 1850 1860 1870 1880 KIAA00 KDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLCG .: .:. : :::. :.. . .. :...:...:::::..:::. .:. : ::....::: KIAA11 EDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQKQMEAFRDGFNKVFPMEKLSSFSHEEVQMILCG 2000 2010 2020 2030 2040 2050 1890 1900 1910 1920 1930 1940 KIAA00 SKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGG ... .: :. ... .: :::.:: . . ..: ........ ::::.:: :: :: KIAA11 NQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFVRVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGG 2060 2070 2080 2090 2100 2110 1950 1960 1970 1980 1990 2000 KIAA00 FRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQS . .:.: ::.:::. . : ::: :::.:::::.::: :::::.:: :. : .. KIAA11 LANLHPRLTVVRKV----DATDASYPSVNTCVHYLKLPEYSSEEIMRERLLAATME--KG 2120 2130 2140 2150 2160 KIAA00 FHLS :::. KIAA11 FHLN >>KIAA1320 ( 567 res) fh13757 (567 aa) initn: 402 init1: 231 opt: 372 Z-score: 222.4 bits: 52.8 E(): 2.9e-07 Smith-Waterman score: 424; 25.373% identity (57.463% similar) in 402 aa overlap (1606-2005:215-567) 1580 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA00 QRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAM--LEIQY :.:. ..... :.. . .. . ... KIAA13 RCEWFYEHLHSGQPDSDMVHRPVNENDILLVHRDSIFRSSCEVVSKANCAKLKQGIAVRF 190 200 210 220 230 240 1640 1650 1660 1670 1680 1690 KIAA00 ENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALP ..: : : : . :.. ..:.:. : .:. : .:: . : .. KIAA13 HGEEGMGQGVVREWFDILSNEIVNPDYALFTQ----------SADGTTFQPNSNSY---- 250 260 270 280 290 1700 1710 1720 1730 1740 1750 KIAA00 FGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFD ..: :. ::: :.... :. .::.. . ::: .: .. .:. . KIAA13 ----VNPDHLNY----FRFAGQILGLALNHRQLVNIYFTRSFYKHILG--IPVNYQDVAS 300 310 320 330 340 1760 1770 1780 1790 1800 1810 KIAA00 IDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFP ::: :... . :..: :. : ...:: :. . .. KIAA13 IDPEYAKNLQWI---------LDNDISDLGLELTFSVET---------DV-----FGAME 350 360 370 1820 1830 1840 1850 1860 1870 KIAA00 NIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPE .. :: :: .: :: .: ::..:: ...... :...: .::. .: : .: : KIAA13 EVPLKPGGGSILVTQNNKAEYVQLVTELRMTRAIQPQINAFLQGFHMFIPPSLIQLFDEY 380 390 400 410 420 430 1880 1890 1900 1910 1920 1930 KIAA00 ELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTG ::. :: : :.. .. . :: ... ......:.. .. .:.. :.:::::: KIAA13 ELELLLSG--MPEIDVSDWIKNTEYTSGYEREDPVIQWFWEVVEDITQEERVLLLQFVTG 440 450 460 470 480 490 1940 1950 1960 1970 1980 1990 KIAA00 SPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLI : :.: ::: .. . :. .. ..::. ::.:.::::.: : ::....::. KIAA13 SSRVPHGGFANIMGGSGLQNFTIAAVPYTPNLLPTSSTCINMLKLPEYPSKEILKDRLLV 500 510 520 530 540 550 2000 KIAA00 AAREGQQSFHLS : . :. .. .. KIAA13 ALHCGSYGYTMA 560 >>KIAA1625 ( 859 res) hh15184 (859 aa) initn: 367 init1: 188 opt: 358 Z-score: 212.5 bits: 51.6 E(): 1e-06 Smith-Waterman score: 435; 25.408% identity (52.995% similar) in 551 aa overlap (1468-1997:369-852) 1440 1450 1460 1470 1480 1490 KIAA00 KTSPRNAKKHDELWHDGVCPSVSNPLEVYLIPTPPENITFEDPSLDVILLLRVLHAISRY ::.: .: :. :. .: . : KIAA16 PEGYEQRTTVQGQVYFLHTQTGVSTWHDPRIPSPSGTI----PGGDAAFLYEFLLQGHTS 340 350 360 370 380 390 1500 1510 1520 1530 1540 KIAA00 WYYLYDNAMCKEI--IPTSEFINSKLTAKA------NR--QLQDPLVIMTGNIPTWLTEL ... : :. .: . . : .... :: :. :: . : : : KIAA16 EPRDLNSVNCDELGPLPPGWEVRSTVSGRIYFVDHNNRTTQFTDPRLHHIMNHQCQLKEP 400 410 420 430 440 450 1550 1560 1570 1580 1590 1600 KIAA00 GKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVN .. :. . .. . . ..:: .:.: :.. .. : .. :.. :. KIAA16 SQPLPLPSEGSLEDEELPAQRYERD-LVQKLKVLRHELSLQQPQAGHC--RIE-----VS 460 470 480 490 500 1610 1620 1630 1640 1650 1660 KIAA00 REELLKQA-ESVMQ----DLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGL :::..... ...:. :: ..: :.... :. . : : . :. :. .:. :: KIAA16 REEIFEESYRQIMKMRPKDL-KKRLMVKFRGEEGLDYG-GVAREWLYLLCHEMLNPYYGL 510 520 530 540 550 560 1670 1680 1690 1700 1710 1720 KIAA00 WRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIM . : .: : :: . . .: :.. :.:.:..:. :.. KIAA16 F-------------QYSTDNIYMLQ----INPDSSINPDHLSY----FHFVGRIMGLAVF 570 580 590 600 1730 1740 1750 1760 1770 1780 KIAA00 DFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQT . .. . .:::: .: . .:. :: ..:: . .:. . ::.: . . KIAA16 HGHYINGGFTVPFYKQLLGKPIQLS--DLESVDPELHKSLVWI---------LENDITPV 610 620 630 640 650 1790 1800 1810 1820 1830 1840 KIAA00 KESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWA : . : :: .. : ::: .:...::: .: .::.:: . : KIAA16 ----------LDHTFC-VEHNAFGRILQH----ELKPNGRNVPVTEENKKEYVRLYVNWR 660 670 680 690 1850 1860 1870 1880 1890 KIAA00 LNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLCG-SKADT--WDAKTLMECCRPD . .:. :: ... ::. ..: :. : .::. .. : .: : : ..: .. : KIAA16 FMRGIEAQFLALQKGFNELIPQHLLKPFDQKELELIIGGLDKIDLNDWKSNTRLKHC--- 700 710 720 730 740 750 1900 1910 1920 1930 1940 1950 KIAA00 HGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFEST . :: :..... . .::.:.. .::::::: :.:. ::..:. . . . KIAA16 ---VADSNIVRWFWQAVETFDEERRARLLQFVTGSTRVPLQGFKALQGSTGAAGPRLFTI 760 770 780 790 800 810 1960 1970 1980 1990 2000 KIAA00 ENPD---DFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS . : : ::.. :: : . .: : : : . :::: :..: KIAA16 HLIDANTDNLPKAHTCFNRIDIPPYESYEKLYEKLLTAVEETCGFAVE 820 830 840 850 >>KIAA0439 ( 995 res) hj00462 (995 aa) initn: 493 init1: 169 opt: 355 Z-score: 210.1 bits: 51.4 E(): 1.4e-06 Smith-Waterman score: 403; 24.138% identity (52.038% similar) in 638 aa overlap (1408-2002:431-991) 1380 1390 1400 1410 1420 KIAA00 QFSIQAEDERESTDDESNPLGRAGIWTKTHTIWYKPVREDEE---------SNKDCVGG- : : .:. . : ::. . KIAA04 VHTTPGLPSGWEERKDAKGRTYYVNHNNRTTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSNNHLIEPQ 410 420 430 440 450 460 1430 1440 1450 1460 1470 KIAA00 -KRGRAQTAPTKT--SPRNAKKHDELWHDGVCPSVSNPLEV----YLIPTPPENIT--FE .: :. ..:: : .: .. : : . .: ..::: : : : ...: : KIAA04 IRRPRSLSSPTVTLSAPLEGAK-DSPVRRAVKDTLSNPQSPQPSPYNSPKPQHKVTQSFL 470 480 490 500 510 1480 1490 1500 1510 1520 1530 KIAA00 DPSLDVILLLRVLHAISRYWYYLYDNAMCKEIIPTSEF-INSKLTAKANRQLQDPLVIMT :. . .:. .: .. ... : .: .. . .. : . :: KIAA04 PPGWE----MRIAPN-GRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNPNDLGPLP--- 520 530 540 550 560 570 1540 1550 1560 1570 1580 1590 KIAA00 GNIPTWLTEL---GKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLDTNPEINQS---DSQ : : .. :.: :.. ... .: .. : .: :.: . : .. KIAA04 ---PGWEERIHLDGRT--FYIDHNSK-----ITQWEDPR-LQNPAITGPAVPYSREFKQK 580 590 600 610 620 1600 1610 1620 1630 1640 KIAA00 DSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQD-----LGSSR-----AMLEIQYENEVGTGL . .: . :: :. . ...... .. .: : : :..:.: : KIAA04 YDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDY 630 640 650 660 670 680 1650 1660 1670 1680 1690 1700 KIAA00 GPTL-EFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKP : . :.. :.:.:. ::. : . .... : :. .:: . KIAA04 GGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLF---EYS-----ATDNYTLQINPNSGL--------CNE 690 700 710 720 1710 1720 1730 1740 1750 1760 KIAA00 AHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFDIDPVVAR :.. : :.:.. . :.. .:.: . :::: :: .. .: .:. ..: KIAA04 DHLS----YFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITL--NDMESVDSEYYN 730 740 750 760 770 1770 1780 1790 1800 1810 1820 KIAA00 SVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFPNIELKKG :. : ::.: .. .:.. .. :..: . ...:: . KIAA04 SL---------KWILENDPTEL--DLMFCIDE--------ENFGQTY------QVDLKPN 780 790 800 810 1830 1840 1850 1860 1870 1880 KIAA00 GKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLC :..: :: .: .::. ::: : . . :..:...: .:: ..:.. .. : .::. :.: KIAA04 GSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMC 820 830 840 850 860 870 1890 1900 1910 1920 1930 KIAA00 G---SKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRL : .. : ..... .:: . ....... . .: :.. .::::::. :. KIAA04 GLGDVDVNDWRQHSIYK-----NGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRV 880 890 900 910 920 1940 1950 1960 1970 1980 1990 KIAA00 PVGGFRSL---NPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIA :..:: : : : . :.:. .:. :: . :: : : :: : ..: .:::::.: KIAA04 PMNGFAELYGSNGPQLF---TIEQWGSPEK-LPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMA 930 940 950 960 970 980 2000 KIAA00 AREGQQSFHLS . :. :.: KIAA04 V-ENAQGFEGVD 990 >>KIAA0093 ( 927 res) ha00935 (927 aa) initn: 443 init1: 174 opt: 352 Z-score: 208.9 bits: 51.1 E(): 1.6e-06 Smith-Waterman score: 406; 27.446% identity (55.847% similar) in 419 aa overlap (1598-2002:559-923) 1570 1580 1590 1600 1610 1620 KIAA00 AFDRDRAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQD-----L .: ... :. :. . .:..: . KIAA00 EDPRLENVAITGPAVPYSRDYKRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKLRRATVLEDSYRRIM 530 540 550 560 570 580 1630 1640 1650 1660 1670 KIAA00 GSSRA-----MLEIQYENEVGTGLGPTL-EFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGS : .:: : :....: : : . :.. :.:.:. ::. : . .. KIAA00 GVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLF---EYSATD---- 590 600 610 620 630 640 1680 1690 1700 1710 1720 1730 KIAA00 QEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFY . : :. .:: . :.. :.:.:.. . :.. .:.: . ::: KIAA00 -NYTLQINPNSGL--------CNEDHLSY----FKFIGRVAGMAVYHGKLLDGFFIRPFY 650 660 670 680 1740 1750 1760 1770 1780 1790 KIAA00 KWMLRQETSLTSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMN : ::.. .: ::. ..: :. . ::.: :. .:.. .. KIAA00 KMMLHKPITL--HDMESVDSEYYNSLRWI---------LEND--PTELDLRFIIDE---- 690 700 710 720 730 1800 1810 1820 1830 1840 1850 KIAA00 GCSVEDLGLDFTLPGFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRD : .: :::.::..: :: .: .::. ::: : . . ...:. .:.. KIAA00 ----ELFGQTHQH------ELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKE 740 750 760 770 780 1860 1870 1880 1890 1900 1910 KIAA00 GFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEIL :: ..: . .. : .::. :.:: .:. :.. : . .::. . ........ . KIAA00 GFFELIPQDLIKIFDENELELLMCGL-GDV-DVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAV 790 800 810 820 830 1920 1930 1940 1950 1960 1970 KIAA00 SSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSL---NPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCV .:.:.. .::::::. :.:..:: : : : .. : :. .:. :: . :: KIAA00 LMMDSEKRIRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQSF---TVEQWGTPEK-LPRAHTCF 840 850 860 870 880 890 1980 1990 2000 KIAA00 NYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS : : :: : :.: . .:: .: :. :.: KIAA00 NRLDLPPYESFEELWDKLQMAI-ENTQGFDGVD 900 910 920 >>KIAA0010 ( 1086 res) ha00408 (1086 aa) initn: 344 init1: 148 opt: 348 Z-score: 205.8 bits: 50.7 E(): 2.4e-06 Smith-Waterman score: 396; 27.331% identity (52.754% similar) in 472 aa overlap (1544-2005:689-1086) 1520 1530 1540 1550 1560 1570 KIAA00 SEFINSKLTAKANRQLQDPLVIMTGNIPTWLTELGKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDR :::: :: ::. : .: KIAA00 MGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTEL----PFVVPFEERVKIF--------- 660 670 680 690 700 1580 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA00 AMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQY :::. .. . :.:. : :: . :. :. . ..: . ... 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KIAA00 LYPNPAAQMLVGDSFAR---HYYFLARMLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADVDI 810 820 830 840 850 1750 1760 1770 1780 1790 1800 KIAA00 HDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFT : : ..:: : ... : : :.: ::.:::.:: KIAA00 HHLASLDPEVYKNLLFL-------KSYEDD---------------------VEELGLNFT 860 870 880 890 1810 1820 1830 1840 1850 1860 KIAA00 -----LPGFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFP : .::: :::::::: : :..:: . ::. . .. .::.:. .: KIAA00 VVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVS 900 910 920 930 940 950 1870 1880 1890 1900 1910 1920 KIAA00 LSHLQYFYPEELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQ : :..: .:.. :. :... . . : . ::. : ..: ..... .: .:. KIAA00 LEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPI-SLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEE 960 970 980 990 1000 1010 1930 1940 1950 1960 1970 1980 KIAA00 QRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSS .: .:.:::. : :. ::. : : . : .. . . ::.. ::.: ::::.. . KIAA00 KRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAFCI-----HNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYD 1020 1030 1040 1050 1060 1990 2000 KIAA00 IEIMREKLLIAAREGQQSFHLS ..: ::: : : .:.:: KIAA00 ETLLRSKLLYAI-ECAAGFELS 1070 1080 >>KIAA0312 ( 3192 res) ff01724 (3192 aa) initn: 413 init1: 203 opt: 348 Z-score: 200.2 bits: 51.2 E(): 4.9e-06 Smith-Waterman score: 419; 27.293% identity (52.838% similar) in 458 aa overlap (1556-2005:2799-3192) 1530 1540 1550 1560 1570 1580 KIAA00 NRQLQDPLVIMTGNIPTWLTELGKTCPFFFPFDTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLDTNPEI :: . .. :. ..: : . . . .. KIAA03 DTQKFLRFAETHRTVLNQILRQSTTHLADGPFAV--LVDYIRVLDFDVKRKYFRQELERL 2770 2780 2790 2800 2810 2820 1590 1600 1610 1620 1630 1640 KIAA00 NQS-DSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPT ... ..: : : :. . :: : ... :.. : : .:.: : : KIAA03 DEGLRKEDMAVHVRRDHVFEDSYRE-LHRKSPEEMKN------RLYIVFEGEEGQDAGGL 2830 2840 2850 2860 2870 1650 1660 1670 1680 1690 KIAA00 L-EFYALVSQELQRADLGLWR---GEEVTLS-NPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAK : :.: ..:.:. .:.: :..:: . ::.. . KIAA03 LREWYMIISREMFNPMYALFRTSPGDRVTYTINPSSH---------------------CN 2880 2890 2900 2910 1700 1710 1720 1730 1740 1750 KIAA00 PAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSLTSHDLFDIDPVVA : :.. :.:.:...:::..: ::.. . ::: .: . . :. . : KIAA03 PNHLSY----FKFVGRIVAKAVYDNRLLECYFTRSFYKHILGKSVRYTDMESED------ 2920 2930 2940 2950 2960 1760 1770 1780 1790 1800 1810 KIAA00 RSVYHL-EDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVEDLGLDFTLPGFPNIELK ::. . .: ::.: : .: .. :. .. : :.:: :: KIAA03 ---YHFYQGLVYL---LENDVSTLGYDLTFSTEVQEFGVCEVRDLK--------PN---- 2970 2980 2990 3000 3010 1820 1830 1840 1850 1860 1870 KIAA00 KGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQL : .: :: .: .::..:: .. .. .:. .: .:: ..: .. : .::. : KIAA03 --GANILVTEENKKEYVHLVCQMRMTGAIRKQLAAFLEGFYEIIPKRLISIFTEQELELL 3020 3030 3040 3050 3060 1880 1890 1900 1910 1920 1930 KIAA00 LCG-SKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRL . : : : :. : : : .: ...... : :::. .. :::::::. .. KIAA03 ISGLPTIDIDDLKSNTEY----HKYQSNSIQIQWFWRALRSFDQADRAKFLQFVTGTSKV 3070 3080 3090 3100 3110 3120 1940 1950 1960 1970 1980 1990 KIAA00 PVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAARE :. :: .:. : . .. . : :::. :: : : :: : :.: .:. ::.: .: KIAA03 PLQGFAALEGMNGIQKFQIHRDDRSTDRLPSAHTCFNQLDLPAYESFEKLRHMLLLAIQE 3130 3140 3150 3160 3170 3180 2000 KIAA00 GQQSFHLS ...: :. KIAA03 CSEGFGLA 3190 >>KIAA1301 ( 1581 res) fg06833 (1581 aa) initn: 500 init1: 145 opt: 318 Z-score: 187.5 bits: 47.9 E(): 2.5e-05 Smith-Waterman score: 368; 29.854% identity (51.699% similar) in 412 aa overlap (1603-1997:1226-1574) 1580 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA00 RAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQ : . :..::..: . : .: :: :. . KIAA13 APYKRDFEAKLRNFYRKLETKGYGQGPGKLKLIIRRDHLLEDAFN--QIMGYSRKDLQRN 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1640 1650 1660 1670 1680 KIAA00 --YENEVGT-GL---GPTLEFYALVSQELQRADLGLWRGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNL : . :: :: ::. ::. :::.:: ::. . : . : .: KIAA13 KLYVTFVGEEGLDYSGPSREFFFLVSRELFNPYYGLF----------EYSANDTYTVQ-- 1260 1270 1280 1290 1300 1690 1700 1710 1720 1730 1740 KIAA00 QGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLMAKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWMLRQETSL :.. : . . . ::: :.... :.. :.: . :::: .:: .: KIAA13 ----ISPMS-----AFVDNHHEWFRFSGRILGLALIHQYLLDAFFTRPFYKALLRILCDL 1310 1320 1330 1340 1350 1750 1760 1770 1780 1790 1800 KIAA00 TSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKRLEQDKSQTKESLQYALETLTMNGCSVED-LGL .. . .: . .: .:::. :. ...: : : KIAA13 SDLEYLDEE-------FH-------------------QSLQW------MKDNDIHDILDL 1360 1370 1380 1810 1820 1830 1840 1850 1860 KIAA00 DFTLPG--FPNI---ELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFES ::. : .: ::: :: .:::: .: .::.. .. : ...:: .: .:. :: KIAA13 TFTVNEEVFGQITERELKPGGANIPVTEKNKKEYIERMVKWRIERGVVQQTESLVRGFYE 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1870 1880 1890 1900 1910 KIAA00 VFPLSHLQYFYPEELDQLLCGS-KADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAV-KFLFEILSS : .. : .::. .. :. . : : .. : .: ::.. : .... . KIAA13 VVDARLVSVFDARELELVIAGTAEIDLSDWRNNTE----YRGGYHDNHIVIRWFWAAVER 1450 1460 1470 1480 1490 1920 1930 1940 1950 1960 1970 KIAA00 FDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSL---NPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNY :.:::. .::::::. .: :: :: : : :. . :: . :: : KIAA13 FNNEQRLRLLQFVTGTSSIPYEGFASLRGSNGP----RRFCVEKWGKITALPRAHTCFNR 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1980 1990 2000 KIAA00 LKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS : :: : :. .. :::: :..: KIAA13 LDLPPYPSFSMLYEKLLTAVEETSTFGLE 1560 1570 1580 >>KIAA0317 ( 826 res) hg00276 (826 aa) initn: 356 init1: 125 opt: 291 Z-score: 176.1 bits: 44.8 E(): 0.00011 Smith-Waterman score: 312; 26.238% identity (51.733% similar) in 404 aa overlap (1608-2004:454-825) 1580 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA00 LLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEV :. .:. .: . : .:.:: . . 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KIAA03 IIGLRMHYKYFETDDPEFYKSKVCFILNNDMSEMELVFAEEKYNKSG------QLDKV-- 600 610 620 630 640 1820 1830 1840 1850 1860 1870 KIAA00 GFPNIELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYF .:: :: . ::: : :: :. . : :... . : :.. . : . : : KIAA03 ----VELMTGGAQTPVTNANKIFYLNLLAQYRLASQVKEEVEHFLKGLNELVPENLLAIF 650 660 670 680 690 1880 1890 1900 1910 1920 1930 KIAA00 YPEELDQLLCGSKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQF .::. :.::. .: . . .. ....... ..::. .:. .::: KIAA03 DENELELLMCGT-GDISVSDFKAHAVVVGGSWHFREKVMRWFWTVVSSLTQEELARLLQF 700 710 720 730 740 750 1940 1950 1960 1970 1980 1990 KIAA00 VTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREK .::: .:: ::: .: : . :. .:: ::.. :: : : :: :.: : ... KIAA03 TTGSSQLPPGGFAALCPSFQIIAAPTHST------LPTAHTCFNQLCLPTYDSYEEVHRM 760 770 780 790 800 810 2000 KIAA00 LLIAAREGQQSFHLS : .: :: ..: . KIAA03 LQLAISEGCEGFGML 820 >>KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614 aa) initn: 490 init1: 123 opt: 290 Z-score: 172.0 bits: 45.0 E(): 0.00018 Smith-Waterman score: 336; 27.340% identity (51.478% similar) in 406 aa overlap (1603-1997:1259-1607) 1580 1590 1600 1610 1620 1630 KIAA00 RAMQRLLDTNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVNREELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQ : . :..::. . : .. :: :. . 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KIAA03 SDLEYLDEE-------FH-------------------QSLQWMKDN---NITDILDLTFT 1390 1400 1410 1810 1820 1830 1840 1850 1860 KIAA00 FTLPGFPNI---ELKKGGKDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFP . : .. :::.:: . :: .: .::.. .. : ...:: .: ... :: : KIAA03 VNEEVFGQVTERELKSGGANTQVTEKNKKEYIERMVKWRVERGVVQQTEALVRGFYEVVD 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1870 1880 1890 1900 1910 1920 KIAA00 LSHLQYFYPEELDQLLCGS-KADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSR-AVKFLFEILSSFDN .. : .::. .. :. . : : .. : .: ::.. ...... . :.: KIAA03 SRLVSVFDARELELVIAGTAEIDLNDWRNNTE----YRGGYHDGHLVIRWFWAAVERFNN 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1930 1940 1950 1960 1970 1980 KIAA00 EQQRLFLQFVTGSPRLPVGGFRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDY ::. .::::::. .: :: .: . : .:. . . :: . :: : : :: : KIAA03 EQRLRLLQFVTGTSSVPYEGFAALRGSNGLRRFCIEKWGKITS-LPRAHTCFNRLDLPPY 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1990 2000 KIAA00 SSIEIMREKLLIAAREGQQSFHLS : .. :::: :..: KIAA03 PSYSMLYEKLLTAVEETSTFGLE 1600 1610 2005 residues in 1 query sequences 1985500 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:05:48 2008 done: Thu Dec 18 15:05:49 2008 Total Scan time: 1.000 Total Display time: 0.720 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]