# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ha00929.fasta.huge -Q ../query/KIAA0037.ptfa ./tmplib.23147 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0037, 1088 aa vs ./tmplib.23147 library 1986417 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4782+/-0.00449; mu= 14.3811+/- 0.304 mean_var=115.2833+/-27.280, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.119451 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1060 ( 887 res) hh13580 ( 887) 3335 586.6 5.3e-168 KIAA0511 ( 933 res) he00818 ( 933) 1442 260.4 8.7e-70 KIAA0422 ( 1160 res) hh01205s1 (1160) 867 161.4 6.8e-40 KIAA0520 ( 1364 res) hg02989s1 (1364) 624 119.6 3.1e-27 >>KIAA1060 ( 887 res) hh13580 (887 aa) initn: 3038 init1: 1328 opt: 3335 Z-score: 3108.1 bits: 586.6 E(): 5.3e-168 Smith-Waterman score: 3335; 58.705% identity (80.022% similar) in 896 aa overlap (202-1081:1-878) 180 190 200 210 220 230 KIAA00 SLMGGFTTPSVRVGLQLLANAVIFLCGNLTGAFHKHQMQDASRDLFTYTVKCIQIRRKLR ::.::: :. : .. . : .::. : ::. KIAA10 GAYHKHLMELALQQTYQDTCNCIKSRIKLE 10 20 30 240 250 260 270 280 290 KIAA00 IEKRQQENLLLSVLPAHISMGMKLAIIERLKEHGDRRCMPDNNFHSLYVKRHQNVSILYA .:::::: ::::.:::::.: :: ::.::. . ::::.:::::: ::::::: KIAA10 FEKRQQERLLLSLLPAHIAMEMKAEIIQRLQGPKAGQMENTNNFHNLYVKRHTNVSILYA 40 50 60 70 80 90 300 310 320 330 340 350 KIAA00 DIVGFTQLASDCSPKELVVVLNELFGKFDQIAKANECMRIKILGDCYYCVSGLPVSLPTH ::::::.::::::: ::: .::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::.: KIAA10 DIVGFTRLASDCSPGELVHMLNELFGKFDQIAKENECMRIKILGDCYYCVSGLPISLPNH 100 110 120 130 140 150 360 370 380 390 400 410 KIAA00 ARNCVKMGLDMCQAIKQVREATGVDINMRVGIHSGNVLCGVIGLRKWQYDVWSHDVSLAN :.::::::::::.:::.::.:::::::::::.::::::::::::.:::::::::::.::: KIAA10 AKNCVKMGLDMCEAIKKVRDATGVDINMRVGVHSGNVLCGVIGLQKWQYDVWSHDVTLAN 160 170 180 190 200 210 420 430 440 450 460 470 KIAA00 RMEAAGVPGRVHITEATLKHLDKAYEVEDGHGQQRDPYLKEMNIRTYLVIDPRSQQPPPP .:::.::::::::. .::.::. ::.::.: :. ::::::. ..::.::.:.... : KIAA10 HMEAGGVPGRVHISSVTLEHLNGAYKVEEGDGDIRDPYLKQHLVKTYFVINPKGERRSP- 220 230 240 250 260 480 490 500 510 520 KIAA00 SQHLPRPKG--DAALKMRASVRMTRYLESWGAARPFAHLNHRESVSSGETHVPNGRRPKS ::: ::. :.: ::::::::::::::::::.:::::.::.:... . .. . : . KIAA10 -QHLFRPRHTLDGA-KMRASVRMTRYLESWGAAKPFAHLHHRDSMTTENGKISTTDVPMG 270 280 290 300 310 320 530 540 550 560 570 580 KIAA00 VPQRHRRTPDRSMSPKGRSEDDSYDDEMLSAIEGLSSTRPCCSKSDDFYTFGSIFLEKGF . . :: :. : : : :.. ...:..::.:... . ::.:. .. .: .: . KIAA10 QHNFQNRTL-RTKSQKKRFEEE-LNERMIQAIDGINAQKQWL-KSEDIQRISLLFYNKVL 330 340 350 360 370 380 590 600 610 620 630 640 KIAA00 EREYRLAPIPRARHDFACASLIFVCILLVHVLLMPRTAALGVSFGLVACVLGLVLGLCFA :.::: . .: .. .:: ::: ::..:..:..:.:..::.::: . .:...: .::: KIAA10 EKEYRATALPAFKYYVTCACLIFFCIFIVQILVLPKTSVLGISFGAAFLLLAFILFVCFA 390 400 410 420 430 440 650 660 670 680 690 700 KIAA00 TKFSRCC----PARGTLCTISERVETQPLLRLTLAVLTIGSLLTVAIINLPLMPFQVPEL .. .: : : : . ..: :..:...: . .: .:..:. .. . . KIAA10 GQLLQCSKKASPLLMWLLKSSGIIANRPWPRISLTIITTAIILMMAVFNMFFLSDSEETI 450 460 470 480 490 500 710 720 730 740 750 KIAA00 P-VGNETGL-LAASSKTRALCEP-----LPYYTCSCVLGFIACSVFLRMSLEPKVVLLTV : ..: :. ..::.. :. . :::. ::.::.:.::::::.. : :.... : KIAA10 PPTANTTNTSFSASNNQVAILRAQNLFFLPYFIYSCILGLISCSVFLRVNYELKMLIMMV 510 520 530 540 550 560 760 770 780 790 800 810 KIAA00 ALVAY-LVLFNLSPCWQWDCCGQGLGNLTKPNGTTSGTPSCSWKDLKTMTNFYLVLFYIT :::.: .:.. .. ::. .. : ::::::: . : .:.:: KIAA10 ALVGYNTILLHTH--------AHVLGDYSQVLFERPGI----WKDLKTMGSVSLSIFFIT 570 580 590 600 610 820 830 840 850 860 870 KIAA00 LLTLSRQIDYYCRLDCLWKKKFKKEHEEFETMENVNRLLLENVLPAHVAAHFIGDKL-NE ::.:.:: .:::::: :::.:::::.::.:::::.::.::::::::::: ::.. .: :: KIAA10 LLVLGRQNEYYCRLDFLWKNKFKKEREEIETMENLNRVLLENVLPAHVAEHFLARSLKNE 620 630 640 650 660 670 880 890 900 910 920 930 KIAA00 DWYHQSYDCVCVMFASVPDFKVFYTECDVNKEGLECLRLLNEIIADFDELLLKPKFSGVE . ::::::::::::::.:::: :::: :::::::::::::::::::::.:: :::::::: KIAA10 ELYHQSYDCVCVMFASIPDFKEFYTESDVNKEGLECLRLLNEIIADFDDLLSKPKFSGVE 680 690 700 710 720 730 940 950 960 970 980 990 KIAA00 KIKTIGSTYMAAAGLS-VASGHENQELERQHAHIGVMVEFSIALMSKLDGINRHSFNSFR ::::::::::::.::: : : ...:: :::. :::.::::..::..:::.::.::::.:. 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KIAA05 QQQEELKGMQLLREILANVFLYLCAIAVGIMSYYMAD 10 20 30 220 230 240 250 260 270 KIAA00 DASRDLFTYTVKCIQIRRKLRIEKRQQENLLLSVLPAHISMGMKLAIIERLKEHGDRRCM : : . . .... .:. ...:::::.::.:: :.. : .. .:. :. KIAA05 RKHRKAFLEARQSLEVKMNLEEQSQQQENLMLSILPKHVADEM----LKDMKK--DESQK 40 50 60 70 80 90 280 290 300 310 320 330 KIAA00 PDNNFHSLYVKRHQNVSILYADIVGFTQLASDCSPKELVVVLNELFGKFDQIAKANECMR ...:...:. ::.:::::.:::::::::.: :: .::: .:::::..::..: . .: KIAA05 DQQQFNTMYMYRHENVSILFADIVGFTQLSSACSAQELVKLLNELFARFDKLAAKYHQLR 100 110 120 130 140 150 340 350 360 370 380 390 KIAA00 IKILGDCYYCVSGLPVSLPTHARNCVKMGLDMCQAIKQVREATGVDINMRVGIHSGNVLC ::::::::::. ::: :: . ::: : .::. ::: : . ..::::.:.:.:: KIAA05 IKILGDCYYCICGLPDYREDHAVCSILMGLAMVEAISYVREKTKTGVDMRVGVHTGTVLG 160 170 180 190 200 210 400 410 420 430 440 450 KIAA00 GVIGLRKWQYDVWSHDVSLANRMEAAGVPGRVHITEATLKHLDKAYEVEDGHGQQRDPYL ::.: ..::::::: ::..::.:::.:.::::::...:. : ..:: : : .: :: KIAA05 GVLGQKRWQYDVWSTDVTVANKMEAGGIPGRVHISQSTMDCLKGEFDVEPGDGGSRCDYL 220 230 240 250 260 270 460 470 480 490 500 KIAA00 KEMNIRTYLVIDPRSQQPPPPSQH----LPRPKGDAALKMRASVRMTRYLESWGAARPFA .: .:.:::.: . . .:. :.: : . .: . . : :.:. . KIAA05 EEKGIETYLIIASKPEVKKTATQNGLNGSALPNGAPASSKSSSPALIETKEPNGSAHSSG 280 290 300 310 320 330 510 520 530 540 550 560 KIAA00 HLNHRESVSSGETHVPNGRRPKSVPQRHRRTPDRSMSPKGRSEDDSYDDEMLSAIEGLSS ... ..... :. :. :.:. : : . :::. ...:. : KIAA05 STSEKPEEQDAQADNPS--FPN--PRRRLRLQDLADRVVDASEDEHELNQLLNEAL-LER 340 350 360 370 380 570 580 590 600 610 620 KIAA00 TRPCCSKSDDFYTFGSIFLEKGFEREYRLAPIPRARHDFACASLIFVCILLVHVLLMPRT :. . . .. :.. .: .: . .. :.:. ....: ::..:. : KIAA05 ESAQVVKKRNTFLLSMRFMDPEMETRYSVEKEKQSGAAFSCSCVVLLCTALVEILIDPWL 390 400 410 420 430 440 630 640 650 660 670 680 KIAA00 AALGVSFGLVACVLGLVLGLC-FATKFSRCCPARGTLCTISERVETQPLLRLTLAVLTIG . :.: .:. .: :.: .: .:. : : : . : ..: .. : : :.:.: KIAA05 MTNYVTF-MVGEILLLILTICSLAAIFPRAFPKK--LVAFSTWIDRTRWARNTWAMLAIF 450 460 470 480 490 500 690 700 710 720 730 740 KIAA00 SLLTVAIINLPLMPFQVPELPVGNETGLLAASSKTRALCEPLP-YYTCSCVLGFIACSVF :. . .... : .: : . .:. .:.. : : ::. ::..:: .. KIAA05 ILVMANVVDM-LSCLQYYTGPSNATAGM-----ETEGSCLENPKYYNYVAVLSLIATIML 510 520 530 540 550 750 760 770 780 790 KIAA00 LRMSLEPKV--VLLTVALVAYLVLFNLSPCW---------QWDCCGQGLGNLTKPNGTTS ...: :. .::... :: . :. : . . : .: .. : . KIAA05 VQVSHMVKLTLMLLVAGAVATINLYAWRPVFDEYDHKRFREHDLPMVALEQMQGFNPGLN 560 570 580 590 600 610 800 810 820 830 840 850 KIAA00 GTPSCSWKDLKTMTNFYLVLFYITLLTLSRQIDYYCRLDCLWKKKFKKEHEEFETMENVN :: : . .. :..... .::... : ::: . . ..:. :. : KIAA05 GTDRLPLVPSKYSMTVMVFLMMLSFYYFSRHVEKLARTLFLWKIEVHDQKERVYEMRRWN 620 630 640 650 660 670 860 870 880 890 900 910 KIAA00 RLLLENVLPAHVAAHFIGDKL-NEDWYHQSYDCVCVMFASVPDFKVFYTECDVNKEGLEC . :. :.:: ::: ::.:.: .:. : :.:: . :::::.:.: :::: ..:. :.:: KIAA05 EALVTNMLPEHVARHFLGSKKRDEELYSQTYDEIGVMFASLPNFADFYTEESINNGGIEC 680 690 700 710 720 730 920 930 940 950 960 KIAA00 LRLLNEIIADFDELLLKPKFSGVEKIKTIGSTYMAAAGLS-------VASGHENQELERQ ::.:::::.::: :: .::: . ::::::::::::.:.. ::...... ::. KIAA05 LRFLNEIISDFDSLLDNPKFRVITKIKTIGSTYMAASGVTPDVNTNGFASSNKEDKSERE 740 750 760 770 780 790 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA00 H-AHIGVMVEFSIALMSKLDGINRHSFNSFRLRVGINHGPVIAGVIGARKPQYDIWGNTV . :.. ...:..:. . : .:: .:::.: ::.:.:.: :.:::::::::.:::::::: KIAA05 RWQHLADLADFALAMKDTLTNINNQSFNNFMLRIGMNKGGVLAGVIGARKPHYDIWGNTV 800 810 820 830 840 850 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA00 NVASRMESTGELGKIQVTEETCTILQGLGYSCECRGLINVKGKGELRTYFVCTDTAKFQG :::::::::: .:.:::.::: .::. :. :: : ::::::: :.:. KIAA05 NVASRMESTGVMGNIQVVEETQVILREYGFRFVRRGPIFVKGKGELLTFFLKGRDKLATF 860 870 880 890 900 910 KIAA00 LGLN KIAA05 PNGPSVTLPHQVVDNS 920 930 >>KIAA0422 ( 1160 res) hh01205s1 (1160 aa) initn: 2021 init1: 862 opt: 867 Z-score: 808.1 bits: 161.4 E(): 6.8e-40 Smith-Waterman score: 2181; 39.520% identity (64.635% similar) in 1083 aa overlap (7-1075:164-1154) 10 20 30 KIAA00 RHACQGWRMPAKGRYFLNEGEEGPDQDALYEKYQLT :: .. : .. .. . ::..: . KIAA04 LGFEDTEVTTTAGGTAEVAPDAVPRSGRSCWRRLVQ--VFQSKQFRSAKLERLYQRYFF- 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 KIAA00 SQHGPLLLTLLLVAATACVALIIIAFSQGDPSRHQAILGMAFL-VLAVFAALSVLMYVEC : . ::::. :. . .. ...:: .. :.: : :.. .:: ::: : ..: : KIAA04 -QMNQSSLTLLM-AVLVLLTAVLLAF-HAAPARPQP----AYVALLACAAALFVGLMVVC 200 210 220 230 240 100 110 120 130 140 KIAA00 ---LLRR---WLRALALLTWACLVALGYVLVFDAWTKAACAWEQVPFFLFIVFVVYTLLP .:. :. . ..: : .: .:. : . .: : : :.:...::::: KIAA04 NRHSFRQDSMWVVSYVVLGILAAVQVGGALAADPRSPSAGLWCPV----FFVYIAYTLLP 250 260 270 280 290 150 160 170 180 190 200 KIAA00 FSMRGAVAVGAVSTASHLLVLGSLMGGFTTPSVRVGLQLLANAVIFLCGNLTGAFHKHQM . ::.:: : .. ::.. .: : .. . :: ::...::: :. : .. KIAA04 IRMRAAVLSGLGLSTLHLILAWQLNRG----DAFLWKQLGANVLLFLCTNVIGICTHYPA 300 310 320 330 340 350 210 220 230 240 250 260 KIAA00 QDASRDLFTYTVKCIQIRRKLRIEKRQQENLLLSVLPAHISMGMKLAIIERLKEHGDRRC . ..:. : : :: : .:. :.:::: ::::::: :..: :: : . :: KIAA04 EVSQRQAFQETRGYIQARLHLQHENRQQERLLLSVLPQHVAMEMKEDINTK-KE------ 360 370 380 390 400 270 280 290 300 310 320 KIAA00 MPDNNFHSLYVKRHQNVSILYADIVGFTQLASDCSPKELVVVLNELFGKFDQIAKANECM : ::..:...:.:::::.::: :::.:::.:. .:::..:::::..::..: :.:. KIAA04 --DMMFHKIYIQKHDNVSILFADIEGFTSLASQCTAQELVMTLNELFARFDKLAAENHCL 410 420 430 440 450 460 330 340 350 360 370 380 KIAA00 RIKILGDCYYCVSGLPVSLPTHARNCVKMGLDMCQAIKQVREATGVDINMRVGIHSGNVL :::::::::::::::: . ::. ::.::.:: .::. :::.:::..::::::::: : KIAA04 RIKILGDCYYCVSGLPEARADHAHCCVEMGVDMIEAISLVREVTGVNVNMRVGIHSGRVH 470 480 490 500 510 520 390 400 410 420 430 440 KIAA00 CGVIGLRKWQYDVWSHDVSLANRMEAAGVPGRVHITEATLKHLDKAYEVEDGHGQQRDPY :::.::::::.::::.::.:::.:::.: ::.:::.:::..:. :::: :.: .:. : KIAA04 CGVLGLRKWQFDVWSNDVTLANHMEAGGRAGRIHITRATLQYLNGDYEVEPGRGGERNAY 530 540 550 560 570 580 450 460 470 480 490 500 KIAA00 LKEMNIRTYLVIDPRSQQPPPPSQHLPRPKGDAALKMRASVRMTRYLESWGAARPFAHLN :::..:.:.:.. ::. . : . . . ::. : . : : :.. KIAA04 LKEQHIETFLILGA-SQKRKEEKAMLAKLQ-----RTRAN-SMEGLMPRWVPDRAFSRT- 590 600 610 620 630 510 520 530 540 550 560 KIAA00 HRESVSSGETHVPNGRRPKSVPQRHRRTPDRSMSPKGRSEDDSYDDEMLS-AIEGLSSTR ..: . . . .. . .: : : ...: ::. ::.:: ::.. : . KIAA04 -KDSKAFRQMGIDDSSKD------NRGTQD-ALNP----EDEV--DEFLSRAIDARSIDQ 640 650 660 670 680 570 580 590 600 610 620 KIAA00 PCCSKSDDFYTFGSIFLEKGFEREYRLAPIPRARHDFACASLIFVCILLVHVLLMPRTAA ..: : : .. .:..: :: ::: :.: : ....:..:... KIAA04 ---LRKDHVRRFLLTFQREDLEKKYSRKVDPRFGAYVACALLVFCFICFIQLLIFPHSTL 690 700 710 720 730 740 630 640 650 660 670 680 KIAA00 LGVSFGLVACVLGLVLGLCFATKFSRCCPARGTLCTISERVETQPLLRLTLAVLTIGSLL . .:. : .. :.: . : :.: . : ::. ... . 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