Comparison between the cloned and the revised DNA sequences

Cloned DNA sequence, length = 5377 bp
Revised DNA sequence, length = 5100 bp

<< Positions of primers used in RT-PCR experiment(s) >>

 1 : f NN05418  1468 -  1488     ACA TAC AGC AAC GAC ACA TAG
     r NN05419  2319 -  2299     CAA AAA TGT CTG ATG AGT GAG
<< Positions of inserion/deletion/mutation(s) in the aligned sequence >>
 1 :  1664 -  1940      277-bp deletion  (in the revised sequence)
Predicted coding region: colored in green ( 3 - 2192 in the revised sequence).


*- Clone Name -*      1          .         .         .         .         . 50
hh02687               1 GTATAGGTATGAAATCACCAGAAGAACAACTGGTGTGTGTGCCACCACAG 50
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)      1 GTATAGGTATGAAATCACCAGAAGAACAACTGGTGTGTGTGCCACCACAG 50

                     51          .         .         .         .         . 100
hh02687              51 GAGGCCTTTCCTAACGACCCCCGGGTAATAAATAGACAGAGAAGTTCTGA 100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)     51 GAGGCCTTTCCTAACGACCCCCGGGTAATAAATAGACAGAGAAGTTCTGA 100

                    101          .         .         .         .         . 150
hh02687             101 TTACCAGTTTCCATCCTCTCCATTTACAGACACACTAAAGGGCACCACTG 150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    101 TTACCAGTTTCCATCCTCTCCATTTACAGACACACTAAAGGGCACCACTG 150

                    151          .         .         .         .         . 200
hh02687             151 AGGATGACGTGTTGACAGGTCAGGTGGAGGAGCAGTGTGTGCCAGCAGCA 200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    151 AGGATGACGTGTTGACAGGTCAGGTGGAGGAGCAGTGTGTGCCAGCAGCA 200

                    201          .         .         .         .         . 250
hh02687             201 GAGGCAGAGCCGCCTGCAGTGAGCGAAACCACAGAGAGGACAGTGTTAGG 250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    201 GAGGCAGAGCCGCCTGCAGTGAGCGAAACCACAGAGAGGACAGTGTTAGG 250

                    251          .         .         .         .         . 300
hh02687             251 AGAGTACAATCTCTTTTCTAGGAAGATAGAAGAGATTTTGAAGCAAAAGA 300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    251 AGAGTACAATCTCTTTTCTAGGAAGATAGAAGAGATTTTGAAGCAAAAGA 300

                    301          .         .         .         .         . 350
hh02687             301 ATGTTTCATATGTCAGTAGAGTTTCCACACCTATCTTTTCAACACAAGAG 350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    301 ATGTTTCATATGTCAGTAGAGTTTCCACACCTATCTTTTCAACACAAGAG 350

                    351          .         .         .         .         . 400
hh02687             351 AAGATGAAACGGCTTTCCGAGTTCATATATTCTAAGACTTCCAAAGCTGG 400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    351 AAGATGAAACGGCTTTCCGAGTTCATATATTCTAAGACTTCCAAAGCTGG 400

                    401          .         .         .         .         . 450
hh02687             401 TGTGCAGGAGTTTGTAGATGGTTTGCATGAGAAGCTAAATACTATTATTA 450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    401 TGTGCAGGAGTTTGTAGATGGTTTGCATGAGAAGCTAAATACTATTATTA 450

                    451          .         .         .         .         . 500
hh02687             451 TTAAAGCATCAGCCAAGGGTGGGAATTTGCCACCAGTCAGTCCTAACGAT 500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    451 TTAAAGCATCAGCCAAGGGTGGGAATTTGCCACCAGTCAGTCCTAACGAT 500

                    501          .         .         .         .         . 550
hh02687             501 TCTGGTGCTAAGATAGCATCGAATCCTCTGGAAAGGCATGTCATACCAGT 550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    501 TCTGGTGCTAAGATAGCATCGAATCCTCTGGAAAGGCATGTCATACCAGT 550

                    551          .         .         .         .         . 600
hh02687             551 TTCCTCAAGTGACTTCAACAATAAACATCTCCTTGAGCCACTGTGTAGTG 600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    551 TTCCTCAAGTGACTTCAACAATAAACATCTCCTTGAGCCACTGTGTAGTG 600

                    601          .         .         .         .         . 650
hh02687             601 ATCCTTTGAAAGATACCAACTCTGATGAGCAGCATTCCACTTCGGCTTTA 650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    601 ATCCTTTGAAAGATACCAACTCTGATGAGCAGCATTCCACTTCGGCTTTA 650

                    651          .         .         .         .         . 700
hh02687             651 ACTGAAGTAGAAATGAACCAGCCTCAACATGCCACAGAGTTAATGGTGAC 700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    651 ACTGAAGTAGAAATGAACCAGCCTCAACATGCCACAGAGTTAATGGTGAC 700

                    701          .         .         .         .         . 750
hh02687             701 TTCTGATCATATTGTACCTGGTGATATGGCCCGGGAACCAGTAGAAGAAA 750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    701 TTCTGATCATATTGTACCTGGTGATATGGCCCGGGAACCAGTAGAAGAAA 750

                    751          .         .         .         .         . 800
hh02687             751 CAACAAAATCCCCCAGTGATGTAAACATTTCTGCTCAACCAGCTCTTTCA 800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    751 CAACAAAATCCCCCAGTGATGTAAACATTTCTGCTCAACCAGCTCTTTCA 800

                    801          .         .         .         .         . 850
hh02687             801 AATTTTATAAGCCAGTTAGAACCTGAAGTATTTAATAGTTTGGTTAAAAT 850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    801 AATTTTATAAGCCAGTTAGAACCTGAAGTATTTAATAGTTTGGTTAAAAT 850

                    851          .         .         .         .         . 900
hh02687             851 CATGAAAGACGTCCAGAAAAATACTGTGAAATTTTATATTCATGAAGAAG 900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    851 CATGAAAGACGTCCAGAAAAATACTGTGAAATTTTATATTCATGAAGAAG 900

                    901          .         .         .         .         . 950
hh02687             901 AAGAGAGTGTGCTCTGTAAAGAAATAAAGGAATATCTTATCAAATTAGGC 950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    901 AAGAGAGTGTGCTCTGTAAAGAAATAAAGGAATATCTTATCAAATTAGGC 950

                    951          .         .         .         .         . 1000
hh02687             951 AATACAGAATGTCATCCTGAACAGTTTTTGGAAAGAAGATCAAAATTAGA 1000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)    951 AATACAGAATGTCATCCTGAACAGTTTTTGGAAAGAAGATCAAAATTAGA 1000

                   1001          .         .         .         .         . 1050
hh02687            1001 TAAACTATTGATTATTATTCAAAATGAAGACATTGCAGGTTTCATTCACA 1050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1001 TAAACTATTGATTATTATTCAAAATGAAGACATTGCAGGTTTCATTCACA 1050

                   1051          .         .         .         .         . 1100
hh02687            1051 AGATACCTGGCTTGGTGACTTTAAAGAAGCTCCCCTGTGTTAGTTTTGCT 1100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1051 AGATACCTGGCTTGGTGACTTTAAAGAAGCTCCCCTGTGTTAGTTTTGCT 1100

                   1101          .         .         .         .         . 1150
hh02687            1101 GGTGTTGATAGCCTGGATGATGTTAAAAATCATACATACAATGAATTATT 1150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1101 GGTGTTGATAGCCTGGATGATGTTAAAAATCATACATACAATGAATTATT 1150

                   1151          .         .         .         .         . 1200
hh02687            1151 TGTATCTGGAGGTTTTATCGTATCTGATGAATCAATTCTAAACCCAGAGG 1200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1151 TGTATCTGGAGGTTTTATCGTATCTGATGAATCAATTCTAAACCCAGAGG 1200

                   1201          .         .         .         .         . 1250
hh02687            1201 TTGTCACAGTTGAGAACCTTAAAAATTTTTTGACATTCCTTGAGGAACTT 1250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1201 TTGTCACAGTTGAGAACCTTAAAAATTTTTTGACATTCCTTGAGGAACTT 1250

                   1251          .         .         .         .         . 1300
hh02687            1251 AGTACTCCAGAAGGAAAATGGCAATGGAAAGTCCACTGTAAATTTCAGAA 1300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1251 AGTACTCCAGAAGGAAAATGGCAATGGAAAGTCCACTGTAAATTTCAGAA 1300

                   1301          .         .         .         .         . 1350
hh02687            1301 GAAACTAAAGGAACTAGGCAGATTGAATGCTAAAGCTCTAAGTCTGTTGA 1350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1301 GAAACTAAAGGAACTAGGCAGATTGAATGCTAAAGCTCTAAGTCTGTTGA 1350

                   1351          .         .         .         .         . 1400
hh02687            1351 CGCTTCTGAATGTCTATCAGAAGAAACATCTGGTTGAAATTTTGTCATAC 1400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1351 CGCTTCTGAATGTCTATCAGAAGAAACATCTGGTTGAAATTTTGTCATAC 1400

                   1401          .         .         .         .         . 1450
hh02687            1401 CACAATTGTGATTCACAAACTCGAAATGCTCCAGAATTGGATTGCCTTAT 1450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1401 CACAATTGTGATTCACAAACTCGAAATGCTCCAGAATTGGATTGCCTTAT 1450

                   1451          .         .         .         .         . 1500
hh02687            1451 CAGACTTCAGGCTCAGAACATACAGCAACGACACATAGTCTTTTTAACAG 1500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1451 CAGACTTCAGGCTCAGAACATACAGCAACGACACATAGTCTTTTTAACAG 1500

                   1501          .         .         .         .         . 1550
hh02687            1501 AGAAGAACATCAAGATGCTTTCCAGTTATACAGATAATGGAATAGTGGTT 1550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1501 AGAAGAACATCAAGATGCTTTCCAGTTATACAGATAATGGAATAGTGGTT 1550

                   1551          .         .         .         .         . 1600
hh02687            1551 GCAACTGCTGAAGACTTCATGCAAAACTTTAAAAATCTTGTGGGCTATCA 1600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1551 GCAACTGCTGAAGACTTCATGCAAAACTTTAAAAATCTTGTGGGCTATCA 1600

                   1601          .         .         .         .         . 1650
hh02687            1601 CAATTCAATCACAGAAGAAAACCTTCCACAGCTTGGTGCTAATGAGAATC 1650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1601 CAATTCAATCACAGAAGAAAACCTTCCACAGCTTGGTGCTAATGAGAATC 1650

                   1651          .         .         .         .         . 1700
hh02687            1651 TTGAGTCGCAGTCAGATGCTGTTTTGACATTAACCCCTTTGGAGCTGGGA 1700
                        |||||||||||||                                     
hh02687(revised)   1651 TTGAGTCGCAGTC------------------------------------- 1663

                   1701          .         .         .         .         . 1750
hh02687            1701 GTTGGGATTTCCCAACATTAAACGTGAACACATTTCGCAGAAGCTTTTAG 1750
                                                                          
hh02687(revised)   1664 -------------------------------------------------- 1664

                   1751          .         .         .         .         . 1800
hh02687            1751 CATCGGATTATCTGGACATTCACATCTAGTGTGAGTGTTGTGACTAAGTG 1800
                                                                          
hh02687(revised)   1664 -------------------------------------------------- 1664

                   1801          .         .         .         .         . 1850
hh02687            1801 AACTTGTGGCAGAAGACCAAGCTTTAAGGGATTGTGGACTTGCAGACCCT 1850
                                                                          
hh02687(revised)   1664 -------------------------------------------------- 1664

                   1851          .         .         .         .         . 1900
hh02687            1851 GACGCGTTATATTGTGTGAGTAGTGTATAATTTTAAAACTTAAACAAACT 1900
                                                                          
hh02687(revised)   1664 -------------------------------------------------- 1664

                   1901          .         .         .         .         . 1950
hh02687            1901 GTGTATTTCAATAGAGGAGGACTTTTTGTTTTTTAAATGTAGCTCTTTTA 1950
                                                                ||||||||||
hh02687(revised)   1664 ----------------------------------------AGCTCTTTTA 1673

                   1951          .         .         .         .         . 2000
hh02687            1951 GAAAACGATGAAAAGGATGAAGAGGATATGTCTCTGGATTCAGGGGATGA 2000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1674 GAAAACGATGAAAAGGATGAAGAGGATATGTCTCTGGATTCAGGGGATGA 1723

                   2001          .         .         .         .         . 2050
hh02687            2001 AATCTCACATATAGAAGTATGCAGCAATTTTCATTCAGAAATATGGGAGA 2050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1724 AATCTCACATATAGAAGTATGCAGCAATTTTCATTCAGAAATATGGGAGA 1773

                   2051          .         .         .         .         . 2100
hh02687            2051 AAGAGACCAAAGGATCACGTGGAACAGATCAAAAAAAGAATACTCAAATT 2100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1774 AAGAGACCAAAGGATCACGTGGAACAGATCAAAAAAAGAATACTCAAATT 1823

                   2101          .         .         .         .         . 2150
hh02687            2101 GAGTTGCAATCGTCTCCTGATGTGCAAAACAGTTTATTAGAAGATAAGAC 2150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1824 GAGTTGCAATCGTCTCCTGATGTGCAAAACAGTTTATTAGAAGATAAGAC 1873

                   2151          .         .         .         .         . 2200
hh02687            2151 TTACCTTGATTCTGAAGAGAGAACTTCTATTGATATAGTATGCTCTGAAG 2200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1874 TTACCTTGATTCTGAAGAGAGAACTTCTATTGATATAGTATGCTCTGAAG 1923

                   2201          .         .         .         .         . 2250
hh02687            2201 GAGAGAACAGCAATTCAACAGAACAAGATTCATATAGTAACTTTCAGGTT 2250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1924 GAGAGAACAGCAATTCAACAGAACAAGATTCATATAGTAACTTTCAGGTT 1973

                   2251          .         .         .         .         . 2300
hh02687            2251 TATCATAGTCAATTAAATATGTCCCATCAGTTTAGTCATTTTAATGTTCT 2300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   1974 TATCATAGTCAATTAAATATGTCCCATCAGTTTAGTCATTTTAATGTTCT 2023

                   2301          .         .         .         .         . 2350
hh02687            2301 CACTCATCAGACATTTTTGGGGACACCATATGCCCTTTCATCAAGTCAGT 2350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2024 CACTCATCAGACATTTTTGGGGACACCATATGCCCTTTCATCAAGTCAGT 2073

                   2351          .         .         .         .         . 2400
hh02687            2351 CTCAAGAAAATGAGAATTACTTCTTATCTGCTTATACTGAAAGCTTGGAT 2400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2074 CTCAAGAAAATGAGAATTACTTCTTATCTGCTTATACTGAAAGCTTGGAT 2123

                   2401          .         .         .         .         . 2450
hh02687            2401 AGAGATAAATCTCCACCTCCCTTAAGTTGGGGGAAAAGTGATTCTTCCAG 2450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2124 AGAGATAAATCTCCACCTCCCTTAAGTTGGGGGAAAAGTGATTCTTCCAG 2173

                   2451          .         .         .         .         . 2500
hh02687            2451 GCCATATTCACAAGAGAAATAACTGTAGTAACTTTTTTTTTAAGAGATTG 2500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2174 GCCATATTCACAAGAGAAATAACTGTAGTAACTTTTTTTTTAAGAGATTG 2223

                   2501          .         .         .         .         . 2550
hh02687            2501 TTGTGGACTTTGTTTATTAACAATTTATATTTCATTCTCTAAACAAAAGG 2550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2224 TTGTGGACTTTGTTTATTAACAATTTATATTTCATTCTCTAAACAAAAGG 2273

                   2551          .         .         .         .         . 2600
hh02687            2551 TTCTTGTTCTTTCTCAAATGTTTTTTCTTTTATTTAAATCATGATGGCCT 2600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2274 TTCTTGTTCTTTCTCAAATGTTTTTTCTTTTATTTAAATCATGATGGCCT 2323

                   2601          .         .         .         .         . 2650
hh02687            2601 GTAACAGTTGAAGCATCTAAAAATTGAAATAAATATATATTTTTAACATA 2650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2324 GTAACAGTTGAAGCATCTAAAAATTGAAATAAATATATATTTTTAACATA 2373

                   2651          .         .         .         .         . 2700
hh02687            2651 TATTGTACTTGAATTATCTCATGTTGGCACTTCTAAGTTTTACTTTTTGT 2700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2374 TATTGTACTTGAATTATCTCATGTTGGCACTTCTAAGTTTTACTTTTTGT 2423

                   2701          .         .         .         .         . 2750
hh02687            2701 ATGTTACCTGTACTTAGGCTTCAAATTGAAGCCTGTTTTATGTGTAAAAT 2750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2424 ATGTTACCTGTACTTAGGCTTCAAATTGAAGCCTGTTTTATGTGTAAAAT 2473

                   2751          .         .         .         .         . 2800
hh02687            2751 CAGATGCTTGCAGGAGGACGGTAAACAGCAAAGGCTTTACTTCTTTTTCT 2800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2474 CAGATGCTTGCAGGAGGACGGTAAACAGCAAAGGCTTTACTTCTTTTTCT 2523

                   2801          .         .         .         .         . 2850
hh02687            2801 CTAATGTCACCTGATATAAAGTACTTTTGTTGAAGTGAATTATTTTGATG 2850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2524 CTAATGTCACCTGATATAAAGTACTTTTGTTGAAGTGAATTATTTTGATG 2573

                   2851          .         .         .         .         . 2900
hh02687            2851 TAGGCTTTTGTATACTGTGTTTACACAGGTATAAGTCAGTAATAGCAGTG 2900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2574 TAGGCTTTTGTATACTGTGTTTACACAGGTATAAGTCAGTAATAGCAGTG 2623

                   2901          .         .         .         .         . 2950
hh02687            2901 TTAATATTTACAGGATTTTGGCTCGATACCTCAAGATTTATCTAACAGTG 2950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2624 TTAATATTTACAGGATTTTGGCTCGATACCTCAAGATTTATCTAACAGTG 2673

                   2951          .         .         .         .         . 3000
hh02687            2951 CAGTTTCATTTAGATAATAAACTATGTACATAGGACACATTTTTTATCTC 3000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2674 CAGTTTCATTTAGATAATAAACTATGTACATAGGACACATTTTTTATCTC 2723

                   3001          .         .         .         .         . 3050
hh02687            3001 TAGGCTTAGTCATGTAAAAACTGCCTATTGCTAAAATTCTGGTAACTTTT 3050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2724 TAGGCTTAGTCATGTAAAAACTGCCTATTGCTAAAATTCTGGTAACTTTT 2773

                   3051          .         .         .         .         . 3100
hh02687            3051 TGAGAGTATTGGATAATTTTCAGTACCTGCGCAATCCTTGATTTAATGAA 3100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2774 TGAGAGTATTGGATAATTTTCAGTACCTGCGCAATCCTTGATTTAATGAA 2823

                   3101          .         .         .         .         . 3150
hh02687            3101 ATTAAATTTTTTATTTCAAAAGATAGGCTTCTGTTTATCAAAGGCGTTGA 3150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2824 ATTAAATTTTTTATTTCAAAAGATAGGCTTCTGTTTATCAAAGGCGTTGA 2873

                   3151          .         .         .         .         . 3200
hh02687            3151 ACAATTTGATTTTTAAATTAGTTTTAGCAAAATGGAAGTATAATGGGAAT 3200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2874 ACAATTTGATTTTTAAATTAGTTTTAGCAAAATGGAAGTATAATGGGAAT 2923

                   3201          .         .         .         .         . 3250
hh02687            3201 ATATTTTTGAGGTGGTCTTAGTAGTAATTACCATTTGTTGAACACATTAA 3250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2924 ATATTTTTGAGGTGGTCTTAGTAGTAATTACCATTTGTTGAACACATTAA 2973

                   3251          .         .         .         .         . 3300
hh02687            3251 TGCTATACTAGACAGATACAGTGGAGATAGCTTTCAAACCCGTATCTATT 3300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   2974 TGCTATACTAGACAGATACAGTGGAGATAGCTTTCAAACCCGTATCTATT 3023

                   3301          .         .         .         .         . 3350
hh02687            3301 CCTAACTACTGCCTCTAATACTAATTACTAACTTGTTACTAATGCTAACT 3350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3024 CCTAACTACTGCCTCTAATACTAATTACTAACTTGTTACTAATGCTAACT 3073

                   3351          .         .         .         .         . 3400
hh02687            3351 TTTAAAAATGTTTTTGAAAATTGCAATTTCTACAAATAAATGTCATAGTG 3400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3074 TTTAAAAATGTTTTTGAAAATTGCAATTTCTACAAATAAATGTCATAGTG 3123

                   3401          .         .         .         .         . 3450
hh02687            3401 CAAATAAATGTCAGGATTTAGAGAAGGAGCCTAAACTGAATTTGTGTTAT 3450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3124 CAAATAAATGTCAGGATTTAGAGAAGGAGCCTAAACTGAATTTGTGTTAT 3173

                   3451          .         .         .         .         . 3500
hh02687            3451 TTCAGTAAAAGTTATGGAGTTATGGGTCTAGACGTGTTAATAAGTTAGAC 3500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3174 TTCAGTAAAAGTTATGGAGTTATGGGTCTAGACGTGTTAATAAGTTAGAC 3223

                   3501          .         .         .         .         . 3550
hh02687            3501 AGAACTTTGGCACTTTAGAACAAATGCATGAGTGGTATTTCAGTTCCTAA 3550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3224 AGAACTTTGGCACTTTAGAACAAATGCATGAGTGGTATTTCAGTTCCTAA 3273

                   3551          .         .         .         .         . 3600
hh02687            3551 GTTACATAAAAAGTGTGAAAGAACACTGTGAGGTCCCAGCAACGCCAGAC 3600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3274 GTTACATAAAAAGTGTGAAAGAACACTGTGAGGTCCCAGCAACGCCAGAC 3323

                   3601          .         .         .         .         . 3650
hh02687            3601 TATATTAAGGTAAGTAGAAAGTGTTTTTATAGGGCTTCAATACCCAGGTG 3650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3324 TATATTAAGGTAAGTAGAAAGTGTTTTTATAGGGCTTCAATACCCAGGTG 3373

                   3651          .         .         .         .         . 3700
hh02687            3651 GTGACAGAGCAGAAGAACCGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTACTAAG 3700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3374 GTGACAGAGCAGAAGAACCGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTACTAAG 3423

                   3701          .         .         .         .         . 3750
hh02687            3701 CTTTTACAAAAGAAGTATCTGTTTTATTGTATAGAACAAGTACAGCATTT 3750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3424 CTTTTACAAAAGAAGTATCTGTTTTATTGTATAGAACAAGTACAGCATTT 3473

                   3751          .         .         .         .         . 3800
hh02687            3751 TACTACATAGTATACAAGTTTTTAATGAGCATTTAAAAAAATAAGTAAAT 3800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3474 TACTACATAGTATACAAGTTTTTAATGAGCATTTAAAAAAATAAGTAAAT 3523

                   3801          .         .         .         .         . 3850
hh02687            3801 CTAGGCTATTTGAAAAATACAGTTGAGCCAGTGAGCACATTTTATAATTT 3850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3524 CTAGGCTATTTGAAAAATACAGTTGAGCCAGTGAGCACATTTTATAATTT 3573

                   3851          .         .         .         .         . 3900
hh02687            3851 GGAAGACACAAATCAAATGTGAAGGATTTGATTTTCTACATTTAAAATGA 3900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3574 GGAAGACACAAATCAAATGTGAAGGATTTGATTTTCTACATTTAAAATGA 3623

                   3901          .         .         .         .         . 3950
hh02687            3901 AGAACCAAAACTCTCTTCTTGATTTTCAGCTAAAGGCAGGAGACTACTTT 3950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3624 AGAACCAAAACTCTCTTCTTGATTTTCAGCTAAAGGCAGGAGACTACTTT 3673

                   3951          .         .         .         .         . 4000
hh02687            3951 CCAACTCCTTTTGCTTCTGGAGAAGGCCCTGAAATCACATTGATATATGT 4000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3674 CCAACTCCTTTTGCTTCTGGAGAAGGCCCTGAAATCACATTGATATATGT 3723

                   4001          .         .         .         .         . 4050
hh02687            4001 TTGTTAGTAAAATGTGCACACCTGACTTGCAATGTTGTGTTAAACTAGAA 4050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3724 TTGTTAGTAAAATGTGCACACCTGACTTGCAATGTTGTGTTAAACTAGAA 3773

                   4051          .         .         .         .         . 4100
hh02687            4051 TTATATTCACTTGGAAAACATATCGCTTAGGATAAAATTTTGTCATTCAA 4100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3774 TTATATTCACTTGGAAAACATATCGCTTAGGATAAAATTTTGTCATTCAA 3823

                   4101          .         .         .         .         . 4150
hh02687            4101 AAATTTTTTCAGAAATGCTTGTACTAGACCACCTCATTTGGATATATAGC 4150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3824 AAATTTTTTCAGAAATGCTTGTACTAGACCACCTCATTTGGATATATAGC 3873

                   4151          .         .         .         .         . 4200
hh02687            4151 TATCACATTTGTAAGATTCTGTTTTTAGCATAAAAATCAATAGGGATGAA 4200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3874 TATCACATTTGTAAGATTCTGTTTTTAGCATAAAAATCAATAGGGATGAA 3923

                   4201          .         .         .         .         . 4250
hh02687            4201 AATTTTCTTAGAACTCAAGACTCCATAACTATGGGGGTAAATGAAGTCAT 4250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3924 AATTTTCTTAGAACTCAAGACTCCATAACTATGGGGGTAAATGAAGTCAT 3973

                   4251          .         .         .         .         . 4300
hh02687            4251 CCCTTCTCCCCCAGTCCACCCCCAAGTGCTCTTAGATACTGAAGGAGTCT 4300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   3974 CCCTTCTCCCCCAGTCCACCCCCAAGTGCTCTTAGATACTGAAGGAGTCT 4023

                   4301          .         .         .         .         . 4350
hh02687            4301 CCCTTAACATACAGTGTTTTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTGTTTTTTTTT 4350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4024 CCCTTAACATACAGTGTTTTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTGTTTTTTTTT 4073

                   4351          .         .         .         .         . 4400
hh02687            4351 GGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAAGCTGGAGTACAGTGGTGCAATC 4400
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4074 GGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAAGCTGGAGTACAGTGGTGCAATC 4123

                   4401          .         .         .         .         . 4450
hh02687            4401 TCACTGCAAGCTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAACCT 4450
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4124 TCACTGCAAGCTCTGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAACCT 4173

                   4451          .         .         .         .         . 4500
hh02687            4451 CCCGAATGGCTGGGACTACAGGCACCCACCACCACGCCTGGCTAACTAAC 4500
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4174 CCCGAATGGCTGGGACTACAGGCACCCACCACCACGCCTGGCTAACTAAC 4223

                   4501          .         .         .         .         . 4550
hh02687            4501 TAACTAACTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTGTGTTAGCC 4550
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4224 TAACTAACTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTGTGTTAGCC 4273

                   4551          .         .         .         .         . 4600
hh02687            4551 AGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCA 4600
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4274 AGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCA 4323

                   4601          .         .         .         .         . 4650
hh02687            4601 AAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACTGCTCCTGGCCAACATCCAGTA 4650
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4324 AAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACTGCTCCTGGCCAACATCCAGTA 4373

                   4651          .         .         .         .         . 4700
hh02687            4651 TTTTATCTTGACTGTCCTAACCTTACCTTAGATGCTAACAGAAGGGTCCT 4700
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4374 TTTTATCTTGACTGTCCTAACCTTACCTTAGATGCTAACAGAAGGGTCCT 4423

                   4701          .         .         .         .         . 4750
hh02687            4701 GCTCAAATAACACTGGGTGCTATATTGATGGGTAAATGTGTACATCCTAT 4750
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4424 GCTCAAATAACACTGGGTGCTATATTGATGGGTAAATGTGTACATCCTAT 4473

                   4751          .         .         .         .         . 4800
hh02687            4751 TCCTTCCTCTTTATCTCACAATTTTTGTCTCCACTAAGCAAGAAGTAAAC 4800
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4474 TCCTTCCTCTTTATCTCACAATTTTTGTCTCCACTAAGCAAGAAGTAAAC 4523

                   4801          .         .         .         .         . 4850
hh02687            4801 TAACACTTCGTCACTCTAAAGAAATAACTTATGTAAAACTCTTAGTAACC 4850
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4524 TAACACTTCGTCACTCTAAAGAAATAACTTATGTAAAACTCTTAGTAACC 4573

                   4851          .         .         .         .         . 4900
hh02687            4851 CTGTTTGTCTTCAAATGAGTAAATAGACCAAAGTGGGGGGACAATTTTCT 4900
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4574 CTGTTTGTCTTCAAATGAGTAAATAGACCAAAGTGGGGGGACAATTTTCT 4623

                   4901          .         .         .         .         . 4950
hh02687            4901 AGTTCTGTAGAGGGAAAAACATCTGAGTCAACATTTTCAAATGCAGAGGG 4950
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4624 AGTTCTGTAGAGGGAAAAACATCTGAGTCAACATTTTCAAATGCAGAGGG 4673

                   4951          .         .         .         .         . 5000
hh02687            4951 TATTGGTACATGACGACATGGAAAAGGGCACTTTTAAACACAGCTTACTC 5000
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4674 TATTGGTACATGACGACATGGAAAAGGGCACTTTTAAACACAGCTTACTC 4723

                   5001          .         .         .         .         . 5050
hh02687            5001 TTCCTCAAGTACAGAGAGTATATAGTGAATCAAAACTAACTACAGCCATT 5050
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4724 TTCCTCAAGTACAGAGAGTATATAGTGAATCAAAACTAACTACAGCCATT 4773

                   5051          .         .         .         .         . 5100
hh02687            5051 CTTTTTAAAGCCCAAGGGATGGAGCAAAGGTGTAAGGATGTTACCTGTTT 5100
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4774 CTTTTTAAAGCCCAAGGGATGGAGCAAAGGTGTAAGGATGTTACCTGTTT 4823

                   5101          .         .         .         .         . 5150
hh02687            5101 GTTTTAATCAGAGAGCAAAAAGAAGTCACAATAGTTTGGGAGAAAAAGTA 5150
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4824 GTTTTAATCAGAGAGCAAAAAGAAGTCACAATAGTTTGGGAGAAAAAGTA 4873

                   5151          .         .         .         .         . 5200
hh02687            5151 GTATGGTGAGTAAGGTTATGCGTATAATTTCATACTGAATTTATTACTAT 5200
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4874 GTATGGTGAGTAAGGTTATGCGTATAATTTCATACTGAATTTATTACTAT 4923

                   5201          .         .         .         .         . 5250
hh02687            5201 TTGGGATGTACGTCAATGTTCTAACAAACACTGCCAACACGTCAATTTTT 5250
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4924 TTGGGATGTACGTCAATGTTCTAACAAACACTGCCAACACGTCAATTTTT 4973

                   5251          .         .         .         .         . 5300
hh02687            5251 TAAAAAGCGTGGGCCACATTGCTAAGAATTTGTTAAAGCATAACTGTATT 5300
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   4974 TAAAAAGCGTGGGCCACATTGCTAAGAATTTGTTAAAGCATAACTGTATT 5023

                   5301          .         .         .         .         . 5350
hh02687            5301 TTTTGTTTTAGGGCCTTATTGATGTTTTGCCGTTCCAATGTATGCATTTT 5350
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   5024 TTTTGTTTTAGGGCCTTATTGATGTTTTGCCGTTCCAATGTATGCATTTT 5073

                   5351          .         .        5377
hh02687            5351 TTTACTCAATAAACTTGTCTTAATTTT 5377
                        |||||||||||||||||||||||||||
hh02687(revised)   5074 TTTACTCAATAAACTTGTCTTAATTTT 5100