KMC012135A_c01
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Fasta Sequence
>KMC012135A_C01 KMC012135A_c01
gtgaggtagaaatatttcttacttctataaatgagcttattacacgtaatacttgtcaag
gaccaattggacgatggagtCGATAATAAAGTAAAGAAAAAGAAAAAAACGGAGAAGGAT
GCGGCTTTTTCTGCTACGCACGCGCCTGTCTCTATCTGGCCGTGAATGTAACCCTATCTA
TCCTTCTTTTCCCACCCTATATATACCCTCAACCCTTTCTTTCTCCCTCCACCATTACCT
TCTCATTTTCTCTCTCTACACTCAAACAACATCATCAACAACTCCACCCACCACTCTGTT
TGTTTCATCAACACCCTCTTTGCTTTTTCCTTCTTCTGTTTTTCCATCTCATTTCGGATG
GGTGAATCATGCAACAACAACAACAACAACAATGATACGAGGAAGCGAGTTCGGGAGGAC
AACTCGGAGGCTGACTCACCCGAGTCAAAGCTTCCCCGACTCAGCTCCGGTCCTGACGTT
AACTCGCCCGAGTCCGGACTCGCACGGGTTAGCTCAGGAGAGTTTTCTGAGACGGAACGA
GTTGACTCGGGTGACGCGGTCCTTGACTCGGCCGGGGTGAATGAGATCCAGGATGACCTT
TTGAACATGCTTGACGACGCAGATAATGCGGCGGAGCGTGAACCAGCCACCACCGTGCAG
GGCCTCGATTCCGTCATCAGGAGCTTCGAGGAGGAGATACTTGCTCCGGATCAGAGCCAC
GCGCCGGAGTCTGGTGATTTCAACCCGAACCTAGGATACCTCTTGGAGGCTTCAGACGAC
GAGCTGGGGTTGCCGCCGACGGTGGAGCCGAGCCAGGAGGCGGAGAAACCAGAAACCGAG
TTTTCGGGTCGGGTTGGTCCGGATGGGTTTGACTGGACCGGGTTTCTGGGTTTCGAAGAC
GATTTGCGTGGCTATGAAG


Nr search

BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]

Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= KMC012135A_C01 KMC012135A_c01
         (919 letters)

Database: nr 
           1,393,205 sequences; 448,689,247 total letters

Searching..................................................done

                                                                   Score     E
Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value

ref|NP_683304.1| unknown protein; protein id: At1g13360.1 [Arabi...    81  2e-14
dbj|BAA99375.1| unnamed protein product [Oryza sativa (japonica ...    72  1e-11
ref|NP_566782.1| expressed protein; protein id: At3g25870.1, sup...    67  5e-10
dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens]                 59  1e-07
ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens]         57  3e-07

>ref|NP_683304.1| unknown protein; protein id: At1g13360.1 [Arabidopsis thaliana]
           gi|9958057|gb|AAG09546.1|AC011810_5 Unknown Protein
           [Arabidopsis thaliana] gi|27754364|gb|AAO22631.1|
           unknown protein [Arabidopsis thaliana]
           gi|28393909|gb|AAO42362.1| unknown protein [Arabidopsis
           thaliana]
          Length = 194

 Score = 81.3 bits (199), Expect = 2e-14
 Identities = 56/148 (37%), Positives = 76/148 (50%), Gaps = 9/148 (6%)
 Frame = +1

Query: 499 LARVSSGEFSETERVDSGDAVLDSAGVNEIQDDLLNMLDDADNAAEREPATTVQGLDSVI 678
           + R  S E          +AVLDS  V  ++DDL ++LDD+D      P    Q LDSV+
Sbjct: 8   ITRTDSAEKKRVRDESFDEAVLDSPEVKRLRDDLFDVLDDSD------PEPVSQDLDSVM 61

Query: 679 RSFEEEILAPDQSHAPES---GDFNPNLGYLLEASDDELGL--PPTVEPSQEAEKPETEF 843
           +SFE+E+     + A  S   G+  P+LGYLLEASDDELGL  PP++ P   A++  T  
Sbjct: 62  KSFEDELSTVTTTTAQGSSTAGETQPDLGYLLEASDDELGLPPPPSISPVPVAKEEVTTE 121

Query: 844 S----GRVGPDGFDWTGFLGFEDDLRGY 915
           +     R   D        GFED +  Y
Sbjct: 122 TVTDLVRASSDSSGIDEIWGFEDHVSNY 149

>dbj|BAA99375.1| unnamed protein product [Oryza sativa (japonica cultivar-group)]
          Length = 175

 Score = 72.0 bits (175), Expect = 1e-11
 Identities = 50/109 (45%), Positives = 61/109 (55%), Gaps = 2/109 (1%)
 Frame = +1

Query: 592 DDLLNMLDDADNAAEREPATTVQGLDSVIRSFEEEILAPDQSH--APESGDFNPNLGYLL 765
           +DLL+MLDD  +A           L SV+RSFEEEI+A D +   AP +    P LG+LL
Sbjct: 29  EDLLDMLDDDTDAGG-----AAGDLASVMRSFEEEIVAGDVAGDVAPTT---QPELGFLL 80

Query: 766 EASDDELGLPPTVEPSQEAEKPETEFSGRVGPDGFDWTGFLGFEDDLRG 912
           EASDDELGLPP    S E E    E    +G  G  W    GFED++ G
Sbjct: 81  EASDDELGLPPATASSSEEEAGAGEPEDAIGFGGQIW----GFEDEIGG 125

>ref|NP_566782.1| expressed protein; protein id: At3g25870.1, supported by cDNA:
           141813. [Arabidopsis thaliana]
           gi|9279590|dbj|BAB01048.1| gene_id:MPE11.2~unknown
           protein [Arabidopsis thaliana]
          Length = 170

 Score = 66.6 bits (161), Expect = 5e-10
 Identities = 48/117 (41%), Positives = 62/117 (52%), Gaps = 4/117 (3%)
 Frame = +1

Query: 562 LDSAGVNEIQDDLLNMLDDADNAAEREPATTVQGLDSVIRSFEEEILAPDQSHAPESGDF 741
           LDS  V  ++DDL    DD+      +P +  Q LDSV++SFE E+     + A  SG+ 
Sbjct: 26  LDSPDVKRLRDDLF---DDSG----LDPVS--QDLDSVMKSFENELSTT--TAALSSGET 74

Query: 742 NPNLGYLLEASDDELGLPPTVEPSQEAEKPETEFS----GRVGPDGFDWTGFLGFED 900
            P+LGYL EASDDELGLPP + P Q    P  E +     R   D  +     GFED
Sbjct: 75  QPDLGYLFEASDDELGLPPPLTPPQTLLPPSCEETVTELVRASSDSSEVGELCGFED 131

>dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens]
          Length = 258

 Score = 58.5 bits (140), Expect = 1e-07
 Identities = 55/164 (33%), Positives = 77/164 (46%), Gaps = 1/164 (0%)
 Frame = -3

Query: 902 SSSKPRNPVQSNPSGPTRPENSVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPDSG 723
           SSS   +   S+PS  +   +S S  S++   S+   +PSSSS +S   P     SP   
Sbjct: 80  SSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPS-- 137

Query: 722 AWL*SGASISSSKLLMTESRPCTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTASPES 543
               S +S SSS    + S P +  + S S++ S SSS    SS  S + + S  +S  S
Sbjct: 138 ----SSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSS-PSSSGSSPSSSNSSPSSSSS 192

Query: 542 TRSVSENSPELTRASP-DSGELTSGPELSRGSFDSGESASELSS 414
           + S S +SP    +SP  S   TS P  S  S  S  S+S  SS
Sbjct: 193 SPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSSSSPSSS 236

 Score = 56.2 bits (134), Expect = 7e-07
 Identities = 53/166 (31%), Positives = 77/166 (45%), Gaps = 3/166 (1%)
 Frame = -3

Query: 902 SSSKPRNPVQSNPSGPTRPENSVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPDSG 723
           SSS   +P  S+ S  + P +S S  S S   ST   + SSSS +S         S  S 
Sbjct: 58  SSSSSSSPSSSHSS--SSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSS 115

Query: 722 AWL*SGASISSSKLLMTESRPCTVVAGSRSAALSASSS---MFKRSSWISFTPAESRTAS 552
           +   S +S SSS    + S P +  + S S+  S+SSS       SS  S +P+ S  +S
Sbjct: 116 SSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSS 175

Query: 551 PESTRSVSENSPELTRASPDSGELTSGPELSRGSFDSGESASELSS 414
             S+ S S +SP  + +SP S   +  P  S  S  S  ++S  +S
Sbjct: 176 SGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTS 221

 Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-06
 Identities = 53/167 (31%), Positives = 76/167 (44%), Gaps = 2/167 (1%)
 Frame = -3

Query: 908 RKSSSKPRNPVQSNPSGPTRPENSVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPD 729
           R SSS  R+ + S+    + P +S S  S S   S    +PSSS  +S         SP 
Sbjct: 36  RSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPS--SSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPS 93

Query: 728 SGAWL*SGASISSSKLLMTESR--PCTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTA 555
           S +   S +S SSS    + S   P +  + S S+  S+SSS    SS  S +P+ S ++
Sbjct: 94  SSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSS 153

Query: 554 SPESTRSVSENSPELTRASPDSGELTSGPELSRGSFDSGESASELSS 414
              S+ S S +S   + +SP S    S P  S  S  S  S+   SS
Sbjct: 154 PSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSS--GSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSS 198

 Score = 47.4 bits (111), Expect = 3e-04
 Identities = 52/157 (33%), Positives = 74/157 (47%), Gaps = 9/157 (5%)
 Frame = -3

Query: 902 SSSKPRNPVQSNPSGPTRPENSVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPDSG 723
           SSS P +   S+ S  + P +S S  S+S   S+   +PSSSS +S   P     SP S 
Sbjct: 100 SSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSS--PSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS 157

Query: 722 AWL*SGASIS--SSKLLMTESRPCTV---VAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRT 558
           +   S +S S  SS    + S P +     + S S+  S+SSS   RSS  S + + S T
Sbjct: 158 SSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSS--SPSSSSSST 215

Query: 557 ASPE----STRSVSENSPELTRASPDSGELTSGPELS 459
           +SP     S+ S S +SP  +  S   G     P+ S
Sbjct: 216 SSPSTSSPSSSSPSSSSPSSSCPSAALGRRPQSPQSS 252

 Score = 47.0 bits (110), Expect = 4e-04
 Identities = 49/152 (32%), Positives = 73/152 (47%), Gaps = 2/152 (1%)
 Frame = -3

Query: 863 SGPTRPENSVSG--FSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPDSGAWL*SGASISS 690
           SG +R  +S S    S+S L S++   PSSSS +S         SP S     S +S SS
Sbjct: 32  SGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSI---PSSSSSSSSPSSSHSSSSPSSSH---SSSSPSS 85

Query: 689 SKLLMTESRPCTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTASPESTRSVSENSPEL 510
           S    + S P +  + S S++ S+S+S    SS    + + S ++SP S+ S   +S   
Sbjct: 86  SS---STSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSS 142

Query: 509 TRASPDSGELTSGPELSRGSFDSGESASELSS 414
           + +SP S   +S P  S  S  S  S+   SS
Sbjct: 143 SSSSPSSS--SSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSS 172

 Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.049
 Identities = 40/139 (28%), Positives = 58/139 (40%)
 Frame = -3

Query: 911 PRKSSSKPRNPVQSNPSGPTRPENSVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSP 732
           P  SSS P +   S+ S P+   +S S  S+S        + SSSS  S   P     SP
Sbjct: 129 PSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSS--------SSSSSSSPSSSSPSSSGSSP 180

Query: 731 DSGAWL*SGASISSSKLLMTESRPCTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTAS 552
            S     S +S S S    + S   +  + S S+  S S+S    SS  S +P+ S    
Sbjct: 181 SSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSSSSPSSS---C 237

Query: 551 PESTRSVSENSPELTRASP 495
           P +       SP+ +  +P
Sbjct: 238 PSAALGRRPQSPQSSHCAP 256

 Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.19
 Identities = 43/154 (27%), Positives = 63/154 (39%), Gaps = 12/154 (7%)
 Frame = -3

Query: 839 SVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPDSGAWL*SGASISSSKLLMTESRP 660
           S+SG +    GS + G P++      R      +S  S + L S    SSS      S  
Sbjct: 11  SISGSTKCRCGSRIAG-PNALGSGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSH 69

Query: 659 CTVVAGSRSAALSASSS------MFKRSSWISFTPAESR------TASPESTRSVSENSP 516
            +    S  ++ S SSS          SS  S +P+ S       ++SP S+ S S +SP
Sbjct: 70  SSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSP 129

Query: 515 ELTRASPDSGELTSGPELSRGSFDSGESASELSS 414
             + +SP S   +S    S  S     S+S  SS
Sbjct: 130 SSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSS 163

>ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens]
          Length = 252

 Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-07
 Identities = 52/166 (31%), Positives = 78/166 (46%), Gaps = 3/166 (1%)
 Frame = -3

Query: 902 SSSKPRNPVQSNPSGP---TRPENSVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSP 732
           SSS   +P  S+PS     + P +S S  S S   S+   +PSSS+ +S         SP
Sbjct: 62  SSSPSSSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSS----SSSSP 117

Query: 731 DSGAWL*SGASISSSKLLMTESRPCTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTAS 552
            S +   S +S S S    + S   +  + S S++ S+ SS    SS  S +P+ S  +S
Sbjct: 118 SSSS---SSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSS 174

Query: 551 PESTRSVSENSPELTRASPDSGELTSGPELSRGSFDSGESASELSS 414
             S+ S S +SP  + +SP S   +  P  S  S  S  ++S  SS
Sbjct: 175 SGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSSS 220

 Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-06
 Identities = 53/159 (33%), Positives = 73/159 (45%), Gaps = 1/159 (0%)
 Frame = -3

Query: 902 SSSKPRNPVQSNPSGPTRPENSVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPDSG 723
           SSS   +P  S+ S  + P +S S  S+S        +PSSSS +S   P     SP S 
Sbjct: 85  SSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSS------SSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS 138

Query: 722 AWL*SGASISSSKLLMTESRPCTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTASPES 543
           +      S SSS    + S P +  + S S++ S SSS    SS  S + + S  +S  S
Sbjct: 139 S------SSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSS-PSSSGSSPSSSNSSPSSSSS 191

Query: 542 TRSVSENSPELTRASP-DSGELTSGPELSRGSFDSGESA 429
           + S S +SP    +SP  S   TS P  S  S  S  S+
Sbjct: 192 SPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSSSSPSSSSPSSS 230

 Score = 53.1 bits (126), Expect = 6e-06
 Identities = 52/166 (31%), Positives = 76/166 (45%), Gaps = 1/166 (0%)
 Frame = -3

Query: 908 RKSSSKPRNPVQSNPSGPTRPENSVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPD 729
           R SSS  R+ + S+    + P +S S  S S   S    +PSSS  +S         SP 
Sbjct: 36  RSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPS--SSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPS 93

Query: 728 SGAWL*SGA-SISSSKLLMTESRPCTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTAS 552
           S +   S + S S+S    + S P +  + S S+  S+SSS    SS  S +P+ S ++ 
Sbjct: 94  SSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSP 153

Query: 551 PESTRSVSENSPELTRASPDSGELTSGPELSRGSFDSGESASELSS 414
             S+ S S +S   + +SP S    S P  S  S  S  S+   SS
Sbjct: 154 SSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSS--GSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSS 197

 Score = 52.0 bits (123), Expect = 1e-05
 Identities = 53/158 (33%), Positives = 75/158 (46%)
 Frame = -3

Query: 902 SSSKPRNPVQSNPSGPTRPENSVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPDSG 723
           SSS   +   S+PS  + P +S S  S S   ST   +PSSSS +S   P     S  S 
Sbjct: 57  SSSSSSSSPSSSPSSSS-PSSSHSSSSPSSSSST--SSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSS 113

Query: 722 AWL*SGASISSSKLLMTESRPCTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTASPES 543
           +   S +S SSS      S P +  +   S++ S+SSS    SS    +P+ S ++S  S
Sbjct: 114 SSSPSSSSSSSS------SSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSS----SPSSSSSSSSSS 163

Query: 542 TRSVSENSPELTRASPDSGELTSGPELSRGSFDSGESA 429
           + S S +SP  + +SP S    S P  S  S  S  S+
Sbjct: 164 SSSPSSSSPSSSGSSPSSS--NSSPSSSSSSPSSSSSS 199

 Score = 50.1 bits (118), Expect = 5e-05
 Identities = 47/150 (31%), Positives = 68/150 (45%), Gaps = 2/150 (1%)
 Frame = -3

Query: 902 SSSKPRNPVQSNPSGPTRPENSVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPDSG 723
           SSS P +   S+ S  + P +S S  S+S   S+   +PSSSS +S   P     SP S 
Sbjct: 99  SSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSS--PSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS 156

Query: 722 AWL*SGASIS--SSKLLMTESRPCTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTASP 549
           +   S +S S  SS    + S P +  +   S++ S SSS    S   S   + S + S 
Sbjct: 157 SSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSS 216

Query: 548 ESTRSVSENSPELTRASPDSGELTSGPELS 459
            S+ S S +SP  +  S   G     P+ S
Sbjct: 217 PSSSSPSSSSPSSSCPSAALGRRPQSPQSS 246

 Score = 45.4 bits (106), Expect = 0.001
 Identities = 49/152 (32%), Positives = 71/152 (46%), Gaps = 2/152 (1%)
 Frame = -3

Query: 863 SGPTRPENSVSG--FSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPDSGAWL*SGASISS 690
           SG +R  +S S    S+S L S++   PSSSS +S         SP S     S +S SS
Sbjct: 32  SGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSI---PSSSSSSS---------SPSSSP---SSSSPSS 76

Query: 689 SKLLMTESRPCTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTASPESTRSVSENSPEL 510
           S    + S   +  + S S++ S+SS     SS      + S ++SP S+ S S +SP  
Sbjct: 77  SHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSS------SSSSSSSPSSSSSSSSSSPSS 130

Query: 509 TRASPDSGELTSGPELSRGSFDSGESASELSS 414
           + +SP S   +S    S  S     S+S  SS
Sbjct: 131 SSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSS 162

 Score = 42.7 bits (99), Expect = 0.008
 Identities = 41/142 (28%), Positives = 59/142 (40%)
 Frame = -3

Query: 839 SVSGFSASWLGSTVGGNPSSSSEASKRYPRFGLKSPDSGAWL*SGASISSSKLLMTESRP 660
           S+SG +    GS + G P++      R      +S  S + L S    SSS      S P
Sbjct: 11  SISGSTKCRCGSRIAG-PNALGSGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSP 69

Query: 659 CTVVAGSRSAALSASSSMFKRSSWISFTPAESRTASPESTRSVSENSPELTRASPDSGEL 480
            +    S  ++ S SSS    S   S + + S  +S  S+ S S +SP  + +S  S   
Sbjct: 70  SSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPS 129

Query: 479 TSGPELSRGSFDSGESASELSS 414
           +S    S  S  S  S S  SS
Sbjct: 130 SSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSS 151

  Database: nr
    Posted date:  Apr 1, 2003  2:05 AM
  Number of letters in database: 448,689,247
  Number of sequences in database:  1,393,205
  
Lambda     K      H
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Gapped
Lambda     K      H
   0.267   0.0410    0.140 

Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
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Number of Sequences: 1393205
Number of extensions: 23300231
Number of successful extensions: 206740
Number of sequences better than 10.0: 769
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frameshift window, decay const: 50,  0.1
T: 12
A: 40
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EST assemble image


clone accession position
1 MPD060g06_f AV774042 1 402
2 SPDL091a12_f BP057684 320 919




Lotus japonicus
Kazusa DNA Research Institute