Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KMC003701A_C01 KMC003701A_c01
(444 letters)
Database: nr
1,393,205 sequences; 448,689,247 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
ref|NP_193728.1| putative protein; protein id: At4g19950.1 [Arab... 86 1e-16
ref|NP_199299.1| putative protein; protein id: At5g44860.1, supp... 83 9e-16
ref|NP_564374.1| expressed protein; protein id: At1g31130.1, sup... 80 7e-15
dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens] 67 5e-11
ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens] 65 1e-10
>ref|NP_193728.1| putative protein; protein id: At4g19950.1 [Arabidopsis thaliana]
gi|7485737|pir||T04879 hypothetical protein F18F4.50 -
Arabidopsis thaliana gi|2827649|emb|CAA16603.1| putative
protein [Arabidopsis thaliana]
gi|7268790|emb|CAB78995.1| putative protein [Arabidopsis
thaliana]
Length = 306
Score = 85.5 bits (210), Expect = 1e-16
Identities = 52/132 (39%), Positives = 71/132 (53%)
Frame = +2
Query: 47 MDTEQEEMQFLGLFGVYRESYKIILSWRKIFSQITLTLILPLTFILLIHMEVSNILFSKI 226
MD EE+QFL G+ RES I K F ITLTLI PL+F +L H + + ++I
Sbjct: 1 MDLAPEELQFLNKRGILRESTSIPQYSLKTFYLITLTLIFPLSFAILAHSLFTQPILAQI 60
Query: 227 NNNTQEMLYTPQDTPQHKKLSDMISSEWATYWLFELAYITFLLIFSLLTTSAVVYTVASI 406
+ Q Q QH EW +F+ YI FL FSLL+T+AVV+TVAS+
Sbjct: 61 DTYPQ----ADQSQLQH---------EWTVLLVFQFCYIIFLFAFSLLSTAAVVFTVASL 107
Query: 407 YTARDITFRGVL 442
YT + ++F +
Sbjct: 108 YTGKPVSFSSTM 119
>ref|NP_199299.1| putative protein; protein id: At5g44860.1, supported by cDNA:
31042. [Arabidopsis thaliana] gi|2660664|gb|AAC79135.1|
unknown protein [Arabidopsis thaliana]
gi|10177476|dbj|BAB10867.1|
gb|AAC79135.1~gene_id:K21C13.3~strong similarity to
unknown protein [Arabidopsis thaliana]
gi|21592663|gb|AAM64612.1| unknown [Arabidopsis
thaliana] gi|28392933|gb|AAO41902.1| unknown protein
[Arabidopsis thaliana] gi|28973591|gb|AAO64120.1|
unknown protein [Arabidopsis thaliana]
Length = 321
Score = 82.8 bits (203), Expect = 9e-16
Identities = 52/132 (39%), Positives = 72/132 (54%)
Frame = +2
Query: 47 MDTEQEEMQFLGLFGVYRESYKIILSWRKIFSQITLTLILPLTFILLIHMEVSNILFSKI 226
MD EE+QFL + G+ RES I K F ITLTLI PL+F +L H LF
Sbjct: 1 MDLAAEELQFLNIQGILRESTTIPKFSPKTFYLITLTLIFPLSFAILAHS-----LF--- 52
Query: 227 NNNTQEMLYTPQDTPQHKKLSDMISSEWATYWLFELAYITFLLIFSLLTTSAVVYTVASI 406
TQ +L TP + + EW +++ Y+ FL FSLL+T+AVV+TVAS+
Sbjct: 53 ---TQPILAQLDATPPSDQ--SKTNHEWTLLLIYQFIYVIFLFAFSLLSTAAVVFTVASL 107
Query: 407 YTARDITFRGVL 442
YT + ++F +
Sbjct: 108 YTGKPVSFSSTM 119
>ref|NP_564374.1| expressed protein; protein id: At1g31130.1, supported by cDNA:
151489., supported by cDNA: gi_13272450, supported by
cDNA: gi_19698822 [Arabidopsis thaliana]
gi|25513746|pir||H86436 F28K20.6 protein - Arabidopsis
thaliana gi|4512625|gb|AAD21694.1| ESTs gb|T20423,
gb|AA712864, gb|H76323 and gb|Z25560 come from this
gene. [Arabidopsis thaliana]
gi|13272451|gb|AAK17164.1|AF325096_1 unknown protein
[Arabidopsis thaliana] gi|19698823|gb|AAL91147.1|
unknown protein [Arabidopsis thaliana]
gi|21386969|gb|AAM47888.1| unknown protein [Arabidopsis
thaliana] gi|21553567|gb|AAM62660.1| unknown
[Arabidopsis thaliana]
Length = 321
Score = 79.7 bits (195), Expect = 7e-15
Identities = 46/132 (34%), Positives = 73/132 (54%)
Frame = +2
Query: 47 MDTEQEEMQFLGLFGVYRESYKIILSWRKIFSQITLTLILPLTFILLIHMEVSNILFSKI 226
MD + EE+QFL + + +ES I + F ITL+ I PL+F +L H + + +K+
Sbjct: 1 MDLQPEELQFLTIPQLLQESISIKKRSPRTFYLITLSFIFPLSFAILAHSLFTQPILAKL 60
Query: 227 NNNTQEMLYTPQDTPQHKKLSDMISSEWATYWLFELAYITFLLIFSLLTTSAVVYTVASI 406
+ + D P SD +W +F+ +Y+ FL FSLL+T+AVV+TVAS+
Sbjct: 61 DKS---------DPPN----SDRSRHDWTVLLIFQFSYLIFLFAFSLLSTAAVVFTVASL 107
Query: 407 YTARDITFRGVL 442
YT + ++F L
Sbjct: 108 YTGKPVSFSSTL 119
>dbj|BAC03887.1| unnamed protein product [Homo sapiens]
Length = 258
Score = 67.0 bits (162), Expect = 5e-11
Identities = 51/149 (34%), Positives = 75/149 (50%), Gaps = 2/149 (1%)
Frame = +3
Query: 3 HLHPTERKDQKQSHPWIQSKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLS 182
H + S P S S +SS S+ + SS+ SS+ SP SS S S
Sbjct: 69 HSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSS 128
Query: 183 SSSTWKSPTSSSARSTTTHRKCSTHHRTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SS 362
SS+ SP+SSS+ S+++ S+ + ++ +S + SP S P S S P+S +S S
Sbjct: 129 PSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPS 188
Query: 363 PSSQPP--PSSTPSPRSTPRET*RSAESS 443
SS P SS+PSPRS+ + S+ SS
Sbjct: 189 SSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSS 217
Score = 59.7 bits (143), Expect = 8e-09
Identities = 46/129 (35%), Positives = 70/129 (53%)
Frame = +3
Query: 57 SKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTT 236
S +S +SS S+ +P+ SSS SS+ S SS SP SS+S+ S +SS + S+++
Sbjct: 67 SSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSS--SSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSS 124
Query: 237 HRKCSTHHRTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPPSSTPSPRSTPR 416
+ + P++ +S + S P SSS P+S SS SS SS P SS+PS +
Sbjct: 125 SSSSPSSSSSSPSSSSSSS----SSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSP 180
Query: 417 ET*RSAESS 443
+ S+ SS
Sbjct: 181 SSSNSSPSS 189
Score = 59.7 bits (143), Expect = 8e-09
Identities = 44/106 (41%), Positives = 58/106 (54%)
Frame = +3
Query: 81 ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTTHRKCSTHH 260
+SS S + + SSS SS+ SP SS S SSSS S SSS S ++ +
Sbjct: 131 SSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSS 190
Query: 261 RTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPPSSTPS 398
+ P++ +S SP S P SSS +SPS+ SSPSS P SS+PS
Sbjct: 191 SSSPSSSSSSP-SPRSSSPSSSSSSTSSPST-SSPSSSSPSSSSPS 234
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-08
Identities = 49/120 (40%), Positives = 66/120 (54%)
Frame = +3
Query: 81 ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTTHRKCSTHH 260
+SS S+ +P SSSH S + S SS SP SSSST SP+SSS+ S+++ S
Sbjct: 57 SSSSSSSSP--SSSHSSSSPSSSH---SSSSPSSSSST-SSPSSSSSSSSSSSPSSSNSS 110
Query: 261 RTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPPSSTPSPRSTPRET*RSAES 440
+ ++ S + S S P SSS SPSS SS SS P SS+ SP S+ + S+ S
Sbjct: 111 SSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSS---SPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSS 167
Score = 57.4 bits (137), Expect = 4e-08
Identities = 48/133 (36%), Positives = 68/133 (51%), Gaps = 4/133 (3%)
Frame = +3
Query: 57 SKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTT 236
S +S +SS S+ +P+ S S SS+ S SS S SSSS+ S SSS+ S+++
Sbjct: 58 SSSSSSSPSSSHSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSS 117
Query: 237 HRKCSTHHRTHPNTKNSP----T*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPPSSTPSPR 404
S+ + P++ +S + S S P SSS +S SS SS SS P SS S
Sbjct: 118 PSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSG 177
Query: 405 STPRET*RSAESS 443
S+P + S SS
Sbjct: 178 SSPSSSNSSPSSS 190
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-08
Identities = 46/128 (35%), Positives = 65/128 (49%), Gaps = 11/128 (8%)
Frame = +3
Query: 57 SKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTT 236
S +S +SS S + + SSS SS+ SP SS S S SS+ SP+SSS+ S+++
Sbjct: 105 SSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSS 164
Query: 237 HRKCSTHH-----------RTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPP 383
S+ + P++ +S S S P SSS +S SS SSPS+ P
Sbjct: 165 SSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPS 224
Query: 384 SSTPSPRS 407
SS+PS S
Sbjct: 225 SSSPSSSS 232
Score = 56.6 bits (135), Expect = 7e-08
Identities = 47/129 (36%), Positives = 62/129 (47%)
Frame = +3
Query: 57 SKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTT 236
+K RC S P S G +SS+ S S S LSSS S +SSS S+ +
Sbjct: 16 TKCRCGS-----RIAGPNALGSGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSHS 70
Query: 237 HRKCSTHHRTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPPSSTPSPRSTPR 416
S+ H + + +S T SP S SSS P+S +S SS SS P SS+ S S+P
Sbjct: 71 SSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPS 130
Query: 417 ET*RSAESS 443
+ S SS
Sbjct: 131 SSSSSPSSS 139
Score = 53.5 bits (127), Expect = 6e-07
Identities = 45/117 (38%), Positives = 62/117 (52%)
Frame = +3
Query: 93 STENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTTHRKCSTHHRTHP 272
S+ P+ SSS SS+ S S SP SS S+ SP+SSS+ S+ + S+ + P
Sbjct: 52 SSSIPSSSSSSSSPSSSHS-----SSSPSSSHSS-SSPSSSSSTSSPS-SSSSSSSSSSP 104
Query: 273 NTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPPSSTPSPRSTPRET*RSAESS 443
++ NS + S S P SSS +SPSS SS S SS+ SP S+ S+ SS
Sbjct: 105 SSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSS 161
Score = 50.1 bits (118), Expect = 6e-06
Identities = 47/142 (33%), Positives = 67/142 (47%), Gaps = 12/142 (8%)
Frame = +3
Query: 12 PTERKDQKQSHPWIQSKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSS 191
P+ S P S +S SS S+ +P+ SSS SS+ S SS S S SS
Sbjct: 118 PSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS--SSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSS 175
Query: 192 TWKSPTSS------SARSTTTHRKCSTHHRTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS 353
+ SP+SS S+ S ++ + + P++ +S T SP + P SS +SPSS
Sbjct: 176 SGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSTSSPSSSSPSSSSPSS 235
Query: 354 *SSPSS------QPPPSSTPSP 401
S PS+ Q P SS +P
Sbjct: 236 -SCPSAALGRRPQSPQSSHCAP 256
>ref|XP_209582.1| hypothetical protein XP_209582 [Homo sapiens]
Length = 252
Score = 65.5 bits (158), Expect = 1e-10
Identities = 51/137 (37%), Positives = 75/137 (54%), Gaps = 2/137 (1%)
Frame = +3
Query: 39 SHPWIQSKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSS 218
S P S S +SS S+ +P+ S+S SS+ SP SS S S SS+ SP+SSS
Sbjct: 81 SSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNS-SSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSS 139
Query: 219 ARSTTTHRKCSTHHRTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPP--PSST 392
+ S+++ S+ + ++ +S + SP S P S S P+S +S S SS P SS+
Sbjct: 140 SSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSS 199
Query: 393 PSPRSTPRET*RSAESS 443
PSPRS+ + S+ SS
Sbjct: 200 PSPRSSSPSSSSSSTSS 216
Score = 60.8 bits (146), Expect = 4e-09
Identities = 46/129 (35%), Positives = 70/129 (53%)
Frame = +3
Query: 57 SKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTT 236
S +S +SS S+ +P+ SSS SS+ S SS SP SS+S+ S +SS + S+++
Sbjct: 67 SSPSSSSPSSSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSS---SSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSS 123
Query: 237 HRKCSTHHRTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPPSSTPSPRSTPR 416
+ + P++ +S + S P SSS P+S SS SS SS P SS+PS +
Sbjct: 124 SSSSPSSSSSSPSSSSSSS----SSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSP 179
Query: 417 ET*RSAESS 443
+ S+ SS
Sbjct: 180 SSSNSSPSS 188
Score = 60.1 bits (144), Expect = 6e-09
Identities = 45/106 (42%), Positives = 57/106 (53%)
Frame = +3
Query: 81 ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTTHRKCSTHH 260
+SS S + + SSS SS+ SP SS S SSSS S SSS S ++ +
Sbjct: 130 SSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSS 189
Query: 261 RTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPPSSTPS 398
+ P++ +S SP S P SSS +SPSS SSPSS P SS PS
Sbjct: 190 SSSPSSSSSSP-SPRSSSPSSSSSSTSSPSS-SSPSSSSPSSSCPS 233
Score = 58.5 bits (140), Expect = 2e-08
Identities = 49/140 (35%), Positives = 68/140 (48%), Gaps = 11/140 (7%)
Frame = +3
Query: 12 PTERKDQKQSHPWIQSKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSS 191
P+ S P S +S +SS S + + SSS SS+ SP SS S S SS
Sbjct: 92 PSSSSSSSSSSP---SSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSS 148
Query: 192 TWKSPTSSSARSTTTHRKCSTHH-----------RTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLP 338
+ SP+SSS+ S+++ S+ + P++ +S S S P SSS
Sbjct: 149 SSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPS 208
Query: 339 TSPSS*SSPSSQPPPSSTPS 398
+S SS SSPSS P SS+PS
Sbjct: 209 SSSSSTSSPSSSSPSSSSPS 228
Score = 57.0 bits (136), Expect = 5e-08
Identities = 47/121 (38%), Positives = 64/121 (52%)
Frame = +3
Query: 81 ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTTHRKCSTHH 260
+SS S+ +P+ S S SS+ SS SP SSSST SP+SSS+ S+++
Sbjct: 57 SSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSH-----SSSSPSSSSST-SSPSSSSSSSSSS-------- 102
Query: 261 RTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPPSSTPSPRSTPRET*RSAES 440
P++ NS + S S P SSS +SPSS SS S SS+ SP S+ S+ S
Sbjct: 103 ---PSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSS 159
Query: 441 S 443
S
Sbjct: 160 S 160
Score = 54.3 bits (129), Expect = 3e-07
Identities = 46/134 (34%), Positives = 68/134 (50%), Gaps = 5/134 (3%)
Frame = +3
Query: 57 SKKRCNS*ASSEST--ENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARST 230
+K RC S + + +RSSS +S S L SS+ SSSS+ S + SS+ +
Sbjct: 16 TKCRCGSRIAGPNALGSGGSRSSSSSSRSILSSSILSSSIPSSSSSSSSPSSSPSSSSPS 75
Query: 231 TTHRK---CSTHHRTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS*SSPSSQPPPSSTPSP 401
++H S+ + P++ +S + S S SSS +SPSS SS SS P SS+ SP
Sbjct: 76 SSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSSSSSSSPSSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSP 135
Query: 402 RSTPRET*RSAESS 443
S+ + S SS
Sbjct: 136 SSSSSSSSSSPSSS 149
Score = 53.5 bits (127), Expect = 6e-07
Identities = 49/132 (37%), Positives = 70/132 (52%), Gaps = 3/132 (2%)
Frame = +3
Query: 57 SKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSSTWKSPTSSSARSTTT 236
S +S +SS ST +P+ SSS SS+ SP S S SSSS+ SP+SSS+ S+++
Sbjct: 76 SSHSSSSPSSSSSTSSPSSSSS----SSSSSP----SSSNSSSSSSSSSPSSSSSSSSSS 127
Query: 237 HRKCSTHHRTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLP---TSPSS*SSPSSQPPPSSTPSPRS 407
S+ + ++ +S S S P SSS +SPSS S SS PSS+ S S
Sbjct: 128 PSSSSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSSSGSSPSSSNSSPS 187
Query: 408 TPRET*RSAESS 443
+ + S+ SS
Sbjct: 188 SSSSSPSSSSSS 199
Score = 49.7 bits (117), Expect = 8e-06
Identities = 43/136 (31%), Positives = 62/136 (44%), Gaps = 6/136 (4%)
Frame = +3
Query: 12 PTERKDQKQSHPWIQSKKRCNS*ASSESTENPTRSSSHGEKSSAKSP*L*SSLSPLSSSS 191
P+ S P S +S SS S+ +P+ SSS SS+ S SS S S SS
Sbjct: 117 PSSSSSSSSSSPSSSSSSPSSS--SSSSSSSPSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSPSS 174
Query: 192 TWKSPTSS------SARSTTTHRKCSTHHRTHPNTKNSPT*SPLSGPPIGSSSLPTSPSS 353
+ SP+SS S+ S ++ + + P++ +S T SP S P SS + PS+
Sbjct: 175 SGSSPSSSNSSPSSSSSSPSSSSSSPSPRSSSPSSSSSSTSSPSSSSPSSSSPSSSCPSA 234
Query: 354 *SSPSSQPPPSSTPSP 401
Q P SS +P
Sbjct: 235 ALGRRPQSPQSSHCAP 250
Database: nr
Posted date: Apr 1, 2003 2:05 AM
Number of letters in database: 448,689,247
Number of sequences in database: 1,393,205
Lambda K H
0.318 0.135 0.401
Gapped
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 434,188,008
Number of Sequences: 1393205
Number of extensions: 10949695
Number of successful extensions: 125202
Number of sequences better than 10.0: 3496
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 64766
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
Number of HSP's gapped (non-prelim): 102568
length of database: 448,689,247
effective HSP length: 123
effective length of database: 277,325,032
effective search space used: 6655800768
frameshift window, decay const: 50, 0.1
T: 12
A: 40
X1: 16 ( 7.3 bits)
X2: 38 (14.6 bits)
X3: 64 (24.7 bits)
S1: 41 (21.7 bits)
