Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
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(778 letters)
Database: nr
1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
emb|CAB46679.1| proteophosphoglycan [Leishmania major] 61 2e-08
gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major] 61 2e-08
pir||T46707 proteophosphoglycan, membrane-associated [imported] ... 60 5e-08
ref|NP_346206.1| cell wall surface anchor family protein [Strept... 59 1e-07
dbj|BAC92388.1| hypothetical protein [Oryza sativa (japonica cul... 55 1e-06
>emb|CAB46679.1| proteophosphoglycan [Leishmania major]
Length = 873
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++S++ P+AS+ + SS P SS S+ S + ++S +SS
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SA P + S +S ++ + S+P+ +++A +AS+ + PS++S+
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S S S+A + S++ S+ +++AP +SSS+A S P A
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A+ S PS S + P+ S SAS + AS + P+
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S
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Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-06
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Frame = -2
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P ++S+A ++S+ PS SS P SS SS A P ++S
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+SSSA P + S +S A S + SS P+ +++A +AS+ + PS++S+
Sbjct: 766 SSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA 825
Query: 399 DRHGSDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAA 262
S S S++ S S++ A S ++++ P+SSS+A
Sbjct: 826 PSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA 871
Score = 50.8 bits (120), Expect = 2e-05
Identities = 64/253 (25%), Positives = 102/253 (40%)
Frame = -2
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+P LA+ A E A E + SS PS+ SS + + P ++S
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+SSSA S S +S +S + S+P+ +++A ++S+ + PS +S+
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S + S S+A S S+A S+ +++AP +SSS+A S P
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A A+ S P + S S A + S PS+S SA +S
Sbjct: 745 SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSA--SSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP 802
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+ S S S S
Sbjct: 803 SSSSSSAPSASSS 815
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.21
Identities = 41/205 (20%), Positives = 80/205 (39%)
Frame = +2
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PE S + S S+ + +A +AS+SS+P S+A +A + S
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Query: 317 RRMRALAAEYDRCAVLTQSLRESLPWRSTGADAVDGSAGVLAAAAAAASGAGLEPVPEAA 496
+ +A + + S P S+ A + S+ ++++A ++ + P ++
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S AP + A + + S SA+ S + +A S +S S
Sbjct: 729 SSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSS 788
Query: 677 SFGCRLEGVLGSAEAAGSTAAEAAN 751
S SA ++ S++A +A+
Sbjct: 789 SSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 813
>gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major]
Length = 1325
Score = 61.2 bits (147), Expect = 2e-08
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Frame = -2
Query: 747 AASAAVEPAASAEPSTPSSRQPKDLRDRFLPGPSSCSSRSLACHDVRPLLAASVGDVTSS 568
A+S++ ++S+ PS SS P SS SS A P ++S +SS
Sbjct: 779 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPS----------SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 828
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SA P + S +S ++ + S+P+ ++A +A+S+ A S++SAP
Sbjct: 829 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 888
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
S S S S S+A + S+ +++AP +SSS+A S P A
Sbjct: 889 SAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPS 948
Query: 207 AAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHA---RGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGP 37
A+ S P + S S A P+ S SA SA +S + P
Sbjct: 949 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP 1008
Query: 36 ALGSVLSTSLS 4
+ S + S S
Sbjct: 1009 SASSSSAPSSS 1019
Score = 60.5 bits (145), Expect = 3e-08
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Frame = -2
Query: 747 AASAAVEPAASAEPSTPSSRQPKDLRDR----FLPGPSSCSSRSLACHDVRPLLAASVGD 580
A+S++ ++S+ PS SS P PSS SS A P ++S
Sbjct: 810 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPS 869
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+SSSA P + S +S A S + SS P+ +++A +AS+ + PS++S+
Sbjct: 870 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSS 929
Query: 402 VDRHGSDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLL 223
S S S++ S S++ A S ++++ P+SSS+A S P
Sbjct: 930 APSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS 989
Query: 222 LLAAEAAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWP----RSAGA 55
A A+ S P + S S A + S PS+S P SA +
Sbjct: 990 SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSA--SSSSAPSSSSSAPSASSSSAPS 1047
Query: 54 SGTEGPALGSVLSTSLS 4
S + P+ S + S S
Sbjct: 1048 SSSSAPSASSSSAPSSS 1064
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-07
Identities = 63/248 (25%), Positives = 105/248 (41%)
Frame = -2
Query: 747 AASAAVEPAASAEPSTPSSRQPKDLRDRFLPGPSSCSSRSLACHDVRPLLAASVGDVTSS 568
A+S++ ++S+ PS SS P PS+ SS + + P ++S +SS
Sbjct: 748 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSS---APSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS 804
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
S+A + + S +S +A + SS ++++A +S+ + PS +S+
Sbjct: 805 SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 864
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
S + S S+A S S+A + SS +++AP SSS+A S P A
Sbjct: 865 SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPS 924
Query: 207 AAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALG 28
++ S PS S A + S PSAS SA +S + P+
Sbjct: 925 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS-SSSAPSSSSSAPSAS---SSSAPSSSSSAPSAS 980
Query: 27 SVLSTSLS 4
S + S S
Sbjct: 981 SSSAPSSS 988
Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-07
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Frame = -2
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A+S++ ++S+ PS SS P PSS SS A P ++S
Sbjct: 673 ASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPS 732
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+SSSA P + S +S ++ + S+P+ +++A +AS+ + PS++S+
Sbjct: 733 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP 792
Query: 399 DRHGSDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLL 220
S + S S+A + S++ S+ +++AP +SSSA S
Sbjct: 793 SASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSS-------- 844
Query: 219 LAAEAAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEG 40
A ++ S PS S S A + S PSAS S+ +S
Sbjct: 845 --APSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS--SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPS 900
Query: 39 PALGSVLSTSLS 4
+ S S+S S
Sbjct: 901 ASSSSAPSSSSS 912
Score = 54.7 bits (130), Expect = 2e-06
Identities = 44/174 (25%), Positives = 83/174 (47%)
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P ++S+A ++S+ PS+ SS P P SS S+ S + ++S
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+SSSA P + S +S ++ + S+P+ +++A +AS+ + PS++S+
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Query: 396 RHGSDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLP 235
S + S S++ S S++ A S ++++ P+SSS+A S P
Sbjct: 1010 ASSSSAPSS--SSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP 1061
Score = 53.9 bits (128), Expect = 3e-06
Identities = 62/248 (25%), Positives = 104/248 (41%)
Frame = -2
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A+S++ ++S+ PS SS P P SS S+ S + ++S +SS
Sbjct: 733 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA--PSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 790
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
+ + P + + +S A S + S+P+ +++A ++S+ A PS +S+
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Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
S + S S+A S S+A + SS +++AP SSS+A S P A
Sbjct: 850 SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSS-SSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPS 908
Query: 207 AAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALG 28
++ S PS S + S PSAS SA +S + P+
Sbjct: 909 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS---SSSAPSSSSSAPSAS 965
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S + S S
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Score = 52.8 bits (125), Expect = 6e-06
Identities = 66/255 (25%), Positives = 100/255 (38%), Gaps = 2/255 (0%)
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+P LA+ A E A E + SS SS SS A P ++S
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Query: 582 DVTSSSAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAP 403
+SSSA P + S +S ++ + S+P+ ++A +A+S+ A S++SAP
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Query: 402 VDRHGSDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLL 223
S S S S S+A S +++AP SSS+A S P
Sbjct: 762 SASSSSAPSSSSSSAPSASSSSA---------PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPS--- 809
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A+ ++ S P S S + P + S PSAS SA +S
Sbjct: 810 --ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSAS---SSSAPSSS 864
Query: 48 TEGPALGSVLSTSLS 4
+ P+ S + S S
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Score = 51.2 bits (121), Expect = 2e-05
Identities = 45/175 (25%), Positives = 80/175 (45%)
Frame = -2
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P ++S+A ++S+ PS SS P PS+ SS + + P ++S
Sbjct: 931 PSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS----APSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPS 986
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+SSS+A + + S +S +A + SS ++++A +S+ + PS +S+
Sbjct: 987 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP 1046
Query: 396 RHGSDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPG 232
S + S S+A S S++ S +++AP SSS+A S L G
Sbjct: 1047 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSFLSG 1101
Score = 50.8 bits (120), Expect = 2e-05
Identities = 48/174 (27%), Positives = 75/174 (42%)
Frame = -2
Query: 756 PWLAASAAVEPAASAEPSTPSSRQPKDLRDRFLPGPSSCSSRSLACHDVRPLLAASVGDV 577
P ++S+A ++S+ PS SS P SS SS A P ++S
Sbjct: 915 PSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPS----------SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSA 964
Query: 576 TSSSAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVD 397
+SSSA P + S +S A S + SS +++A +AS+ + PS++S+
Sbjct: 965 SSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPS 1024
Query: 396 RHGSDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLP 235
S + S S S S+A S +++AP SSS+A S P
Sbjct: 1025 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSA---------PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAP 1069
Score = 48.1 bits (113), Expect = 2e-04
Identities = 37/129 (28%), Positives = 59/129 (45%), Gaps = 4/129 (3%)
Frame = -2
Query: 756 PWLAASAAVEPAASAEPSTPSSRQPKDLRDR----FLPGPSSCSSRSLACHDVRPLLAAS 589
P ++S+A ++S+ PS SS P PSS SS A P ++S
Sbjct: 977 PSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 1036
Query: 588 VGDVTSSSAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTAS 409
+SSSA P + S +S A S + SS +++A +AS+ + PS++S
Sbjct: 1037 APSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS 1096
Query: 408 APVDRHGSD 382
+ + GSD
Sbjct: 1097 SFLSGSGSD 1105
Score = 35.4 bits (80), Expect = 1.0
Identities = 38/211 (18%), Positives = 84/211 (39%)
Frame = +2
Query: 137 PERSFSLTEGGGSGPSSCRDTQAASAASNSSSPGKQLQRQHSAAELEFGGAAVVTLDSLR 316
PE S + S S+ + +A +AS+SS+P +++ ++ S
Sbjct: 662 PETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 721
Query: 317 RRMRALAAEYDRCAVLTQSLRESLPWRSTGADAVDGSAGVLAAAAAAASGAGLEPVPEAA 496
+ ++ + S S P S+ + S+ A++++A S + ++
Sbjct: 722 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS 781
Query: 497 SEAPDSERCRANINGTGSQRSAALEDVTSPTLAASSGRTSWQASDREEQEDGPGRKRSRK 676
S AP S + + + + S++ ++P+ ++SS +S ++ P S
Sbjct: 782 SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS---SSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP 838
Query: 677 SFGCRLEGVLGSAEAAGSTAAEAANQGGRSN 769
S SA ++ S+A A++ S+
Sbjct: 839 SASS------SSAPSSSSSAPSASSSSAPSS 863
>pir||T46707 proteophosphoglycan, membrane-associated [imported] - Leishmania
major (fragment) gi|5420389|emb|CAB46680.1|
proteophosphoglycan [Leishmania major]
Length = 383
Score = 59.7 bits (143), Expect = 5e-08
Identities = 60/247 (24%), Positives = 101/247 (40%)
Frame = -2
Query: 744 ASAAVEPAASAEPSTPSSRQPKDLRDRFLPGPSSCSSRSLACHDVRPLLAASVGDVTSSS 565
+S++ P+AS+ + SS P SS S+ S + ++S +SSS
Sbjct: 20 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSS 79
Query: 564 AADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHGS 385
A P + S +S ++ + S+P+ ++A +A+S+ A S++SAP S
Sbjct: 80 APSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 139
Query: 384 DSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAEA 205
S S S S+A + S+ +++AP +SSS+A S P ++ +
Sbjct: 140 APSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPS-----SSSS 194
Query: 204 AWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALGS 25
A PS S + S PS+S P S+ + T P
Sbjct: 195 A------------PSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSSSSTTTTMDPTPDP 242
Query: 24 VLSTSLS 4
VL +S S
Sbjct: 243 VLPSSSS 249
Score = 48.1 bits (113), Expect = 2e-04
Identities = 56/219 (25%), Positives = 89/219 (40%), Gaps = 3/219 (1%)
Frame = -2
Query: 651 PSSCSSRSLACHDVRPLLAASVGDVTSSSAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSS 472
PSS SS A P ++S +SSSA P S S +S +S + S+
Sbjct: 4 PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP-------SASSSSAPSSSSSSA 56
Query: 471 PAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHGSDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTT 292
P+ +++A ++S+ + PS +S+ S + S S+A S S+A S+ ++
Sbjct: 57 PSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP--------SASSS 108
Query: 291 AAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAEAAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHA- 115
+AP +SSSA S +A ++ P S S S A
Sbjct: 109 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 168
Query: 114 --RGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALGSVLSTSLS 4
P+ S SA SA +S + P+ S + S S
Sbjct: 169 SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 207
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.011
Identities = 43/162 (26%), Positives = 70/162 (42%), Gaps = 6/162 (3%)
Frame = -2
Query: 747 AASAAVEPAASAEPSTPSSRQPKDLRDR----FLPGPSSCSSRSLACHDVRPLLAASVGD 580
A+S++ ++S+ PS SS P PSS SS A P ++S
Sbjct: 90 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAP 149
Query: 579 VTSSSAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPV 400
SSS+A S S +S ++ + S+P+ +++A +AS+ + PS++S+
Sbjct: 150 SASSSSAP-------------SSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP 196
Query: 399 DRHGSDSRSDWVSTA--QRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPP 280
S + S S+A S SA + SS TT P
Sbjct: 197 SASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSSSSTTTTMDP 238
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.79
Identities = 41/162 (25%), Positives = 68/162 (41%), Gaps = 4/162 (2%)
Frame = -2
Query: 477 SSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHGSDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSV 298
S+P+ ++A +A+S+ A S++SAP S + S S S S+A + S+
Sbjct: 2 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP-SASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 60
Query: 297 TTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAEAAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSV--- 127
+++AP +SSS+A S P + ++ + P S S S
Sbjct: 61 SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSA 120
Query: 126 -KGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALGSVLSTSLS 4
A + S PSAS S+ +S + S S+S S
Sbjct: 121 SSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSS 162
Score = 34.3 bits (77), Expect = 2.3
Identities = 40/152 (26%), Positives = 64/152 (41%), Gaps = 2/152 (1%)
Frame = -2
Query: 453 AAAAASTPALPSTASAPVDRHGSDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNS 274
++A +S+ + PS +S+ S + S S+A S S+A + SS +++AP S
Sbjct: 1 SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 60
Query: 273 SSAALCCRCSCLPGLLLLLAAEAAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGP--AD 100
SS+A S P A+ ++ S P S S + P +
Sbjct: 61 SSSAPSSSSSSAPS-----ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSS 115
Query: 99 SLPSASVGWPRSAGASGTEGPALGSVLSTSLS 4
S PSAS SA +S + P+ S + S S
Sbjct: 116 SAPSAS---SSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 144
>ref|NP_346206.1| cell wall surface anchor family protein [Streptococcus pneumoniae
TIGR4] gi|25389341|pir||E95206 cell wall surface anchor
family protein [imported] - Streptococcus pneumoniae
(strain TIGR4) gi|14973269|gb|AAK75846.1| cell wall
surface anchor family protein [Streptococcus pneumoniae
TIGR4]
Length = 4776
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Identities = 59/248 (23%), Positives = 98/248 (38%)
Frame = -2
Query: 747 AASAAVEPAASAEPSTPSSRQPKDLRDRFLPGPSSCSSRSLACHDVRPLLAASVGDVTSS 568
+ASA+ +ASA ST +S +S S+ + A +AS S
Sbjct: 826 SASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASE 885
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
SA+ A + + AS +AS + S+ A +A+A+A+++ + ++ SA
Sbjct: 886 SASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASTSA 945
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
S+S S S A S SA+ + S+ T+A+ S+SA+ S +A
Sbjct: 946 SESASTSAS-ASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASAS 1004
Query: 207 AAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALG 28
A+ + S + S A + SAS SA S +E +
Sbjct: 1005 ASTSASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASESASTS 1064
Query: 27 SVLSTSLS 4
+ S S S
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Frame = -2
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+ASA+ +ASA ST +S +S S+ + A +AS S
Sbjct: 3312 SASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASE 3371
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
SA+ A + + AS +AS + S+ A +A+A+A+++ + ++ SA
Sbjct: 3372 SASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASTSA 3431
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
S+S S S A S SA+ + S+ T+A+ S+SA+ S +A
Sbjct: 3432 SESASTSAS-ASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASAS 3490
Query: 207 AAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALG 28
A+ + S + S A + SAS SA S +E +
Sbjct: 3491 ASTSASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASESASTS 3550
Query: 27 SVLSTSLS 4
+ S S S
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+ASA+ +ASA ST +S +S S+ + A +AS S
Sbjct: 2070 SASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASE 2129
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
SA+ A + + AS +AS + S+ A +A+A+A+++ + ++ SA
Sbjct: 2130 SASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASTSA 2189
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
S+S S S A S SA+ + S+ T+A+ S+SA+ S +A
Sbjct: 2190 SESASTSAS-ASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASAS 2248
Query: 207 AAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALG 28
A+ + S + S A + SAS SA S +E +
Sbjct: 2249 ASTSASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASESASTS 2308
Query: 27 SVLSTSLS 4
+ S S S
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Score = 56.6 bits (135), Expect = 4e-07
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+ASA+ +ASA ST +S G +S S+ + A + S S
Sbjct: 2994 SASASASTSASASASTSAS------------GSASTSTSASASTSASASASTSASASASI 3041
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
SA++ A + + AS +AS + S+ A +A+ +A+++ + ++ASA
Sbjct: 3042 SASESASTSASESASTSTSASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 3101
Query: 387 SDSRSDWVST---AQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLL 217
S S S+ ST A S SA+ + S+ T+A+ S+SA++ S
Sbjct: 3102 STSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSA 3161
Query: 216 AAEAAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGP 37
+A A+ + + S + S A + SAS SA S +E
Sbjct: 3162 SASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESA 3221
Query: 36 ALGSVLSTSLS 4
+ + S S S
Sbjct: 3222 STSASASASTS 3232
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+ASA+ +ASA ST +S +S S+ + A +AS S+
Sbjct: 2450 SASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 2509
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
SA+ A + + AS +AS + S+ A +A+A+A+++ + ++ SA V
Sbjct: 2510 SASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSAST 2569
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
S S S S + + ++A A +S +T+A ++S++A + A+E
Sbjct: 2570 SASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASE 2629
Query: 207 AAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALG 28
+A S S + S A A + SAS SA AS + +
Sbjct: 2630 SASTSASASAS-TSASASASTSASASASTSASASASASTSASASASTSASASASTSASAS 2688
Query: 27 SVLSTSLS 4
+ +S S S
Sbjct: 2689 ASISASES 2696
Score = 55.1 bits (131), Expect = 1e-06
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+ASA+ +ASA ST +S +S S+ + A +AS S+
Sbjct: 2038 SASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 2097
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
SA+ A + + AS +AS + S A +A+A+A+++ + ++ SA
Sbjct: 2098 SASTSASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASAST 2157
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
S S S S A S S + + S+ T+A+ S+SA+ S +A
Sbjct: 2158 SASASASTS-ASASASTSASASASTSASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASAS 2216
Query: 207 AAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALG 28
A+ + + S + S A + SAS SA S +E +
Sbjct: 2217 ASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASISASESASTS 2276
Query: 27 SVLSTSLS 4
+ S S S
Sbjct: 2277 ASASASTS 2284
Score = 55.1 bits (131), Expect = 1e-06
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+ASA+ +ASA ST +S +S S+ + A +AS S+
Sbjct: 794 SASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 853
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
SA+ A + + AS +AS + S A +A+A+A+++ + ++ SA
Sbjct: 854 SASTSASASASTSASESASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASAST 913
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
S S S S A S S + + S+ T+A+ S+SA+ S +A
Sbjct: 914 SASASASTS-ASASASTSASASASTSASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASAS 972
Query: 207 AAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALG 28
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Sbjct: 973 ASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASISASESASTS 1032
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+ASA+ +ASA ST +S +S S+ + A +AS S+
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Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
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Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
S S S +S ++ + ++A A +S +T+A ++S++A + A+E
Sbjct: 4132 SASASASISASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSTSASASTSASE 4191
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+A S S + S A A + SAS SA S +E +
Sbjct: 4192 SASTS---------ASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASTSASESASTS 4242
Query: 27 SVLSTSLS 4
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+ASA+ +ASA ST +S +S S+ A + S TS+
Sbjct: 1752 SASASTSASASASASTSASASASTSASASASTSASASASISASESASTSASESASTSTSA 1811
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
SA+ S S ++ A++ T +S + +A+A+AST A ST+++
Sbjct: 1812 SASTSASE---------SASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASTSASESASTS 1862
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCLPGLLLLLAAE 208
+ + + ++A S SA+ + S+ T+A+ S+SA++ S +A
Sbjct: 1863 ASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASVSASTSASASASTSASAS 1922
Query: 207 AAWVSRQDEGPLPPPSVRLKLRSGLSVKGHARGPADSLPSASVGWPRSAGASGTEGPALG 28
A+ + + S + S A + SAS SA S +E +
Sbjct: 1923 ASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASESASTS 1982
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+ASA+ +ASA ST +S +S S+ + A +AS S+
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Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPS---TASAPVD 397
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S+S S S +A S SA+ + S+ T+A+ S+SA+ S
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+A A+ + E S + S A A + SAS SA
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S +E + + S S S
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Query: 396 RHGSDSRSDWVS-------TAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAALCCRCSCL 238
S+S S S +A S SA+ + S+ T+A+ S+SA+ S
Sbjct: 2315 TSASESASTSASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSAS 2374
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+A A+ + E S + S A A + SAS SA
Sbjct: 2375 ESASTSTSASAS--TSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASAS 2432
Query: 57 ASGTEGPALGSVLSTSLS 4
S +E + + S S S
Sbjct: 2433 TSASESASTSASASASTS 2450
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Sbjct: 952 SASASASTSASASASTSASASASTSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 1011
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPS---TASAPVD 397
SA+ + A + + AS +AS T +S + +A+A+AST A S +ASA
Sbjct: 1012 SASTSASASASISASESASTSASASAS-TSASVSASTSASASASTSASESASTSASASAS 1070
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S+S S S +A S SA+ + S+ T+A+ S+SA+ S
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+A A+ + E S + S A A + SAS SA
Sbjct: 1131 ESASTSTSASAS--TSASESASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASAS 1188
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S +E + + S S S
Sbjct: 1189 TSASESASTSASASASTS 1206
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S S S S +A S SA+ + S+ T+A+ S+SA+ S +A
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A+ + S + S A + SAS SA S + +
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+ASA+ +ASA ST +S +S S+ + A +AS S+
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A+ + S + S A + SAS SA S + +
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+A A+ + + S + S A + SAS SA S
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A+ + + S + S A + SAS SA S + +
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S S S S + + ++A S +T+A ++S++A + A+E
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S S S VS S SA+ + S+ T+A+ S+SA+ S +A
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A+ + + S + S A + SAS SA S +E +
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S S S S + + ++A A +S +T+A ++S++A + + A+E
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+A S S + SV A + SAS SA S + +
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Query: 747 AASAAVEPAASAEPSTPSSRQPKDLRDRFLPGPSSCSSRSLACHDVRPLLAASVGDVTSS 568
+ASA+ +ASA ST +S +S S+ + A +AS S+
Sbjct: 4602 SASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 4661
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
SA+ A + + AS +AS + S+ A +A+A+A+++ + ++AS V
Sbjct: 4662 SASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSAS--ASASTSVSNSA 4719
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSV 298
+ S S +T+ + + + L SS+
Sbjct: 4720 NHSNSQVGNTSGSTGKSQKELPNTGTESSI 4749
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.16
Identities = 41/162 (25%), Positives = 74/162 (45%)
Frame = -2
Query: 747 AASAAVEPAASAEPSTPSSRQPKDLRDRFLPGPSSCSSRSLACHDVRPLLAASVGDVTSS 568
+ASA+ +ASA S +S +S S+ + A +AS TS+
Sbjct: 4572 SASASTSASASASTSASASASISASESASTSASASASTSASASAST----SASASASTSA 4627
Query: 567 SAADRCDPVPFMLARHLSESGASLAASGTGSSPAPLAAAAAAASTPALPSTASAPVDRHG 388
SA+ A + + AS +AS + S+ A +A+ +A+++ + ++ASA
Sbjct: 4628 SAS----------ASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSASA 4677
Query: 387 SDSRSDWVSTAQRSYSAARALMRRRRLSSVTTAAPPNSSSAA 262
S S S ++A S SA+ + S+ T+A+ S+S +
Sbjct: 4678 SASTS---ASASASTSASASASTSASASASTSASASASTSVS 4716
>dbj|BAC92388.1| hypothetical protein [Oryza sativa (japonica cultivar-group)]
gi|35215203|dbj|BAC92555.1| hypothetical protein [Oryza
sativa (japonica cultivar-group)]
Length = 384
Score = 55.1 bits (131), Expect = 1e-06
Identities = 57/173 (32%), Positives = 65/173 (36%), Gaps = 17/173 (9%)
Frame = -3
Query: 698 PPAGSRRTCAT---VSCPARPPAPPGH*PAMTCARYWPPAWATSRPQAPPTAATRC---- 540
PP S+R A + P PP PP H A PP A SRP PP C
Sbjct: 158 PPIASQRLAAPRHPLHLPPPPPEPPSHREAEPL----PPHTAFSRP-LPPLRPVLCRRPP 212
Query: 539 ----HLCW---RDTFPNRGPHLQPQAPAPAPRRSLLP---RPPPARRHCRPQRLLQWTAT 390
H W F R P P P+ R +P PP RR C P+ +
Sbjct: 213 RYRSHHPWLSNPSVFAGRRRTHLPVPPGPSDHRPPVPPHGTPPNRRRRCLPEERRRLFPP 272
Query: 389 EATRAATGSARRSGRTQPPEPSCAAAGCPA*LPPRRRTRARRRCAAAAAACRG 231
AT + SAR G P P A C A RRR A RR +A AA G
Sbjct: 273 PATSRSASSARTLGEPLLPLPFPFA--CIATARERRRLPAARRRSAPPAAASG 323
