Nr search
BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= KCC000947A_C02 KCC000947A_c02
(1228 letters)
Database: nr
1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major] 66 1e-09
pir||T46707 proteophosphoglycan, membrane-associated [imported] ... 66 1e-09
emb|CAB46679.1| proteophosphoglycan [Leishmania major] 59 2e-07
ref|NP_896691.1| possible N-terminal part of IF-2 [Synechococcus... 58 3e-07
gb|AAK49004.1| USC3-5p [Myxococcus xanthus] 55 3e-06
>gb|AAK31375.1|AC084329_1 ppg3 [Leishmania major]
Length = 1325
Score = 66.2 bits (160), Expect = 1e-09
Identities = 88/328 (26%), Positives = 133/328 (39%), Gaps = 7/328 (2%)
Frame = -3
Query: 1205 PDGASSPGGLRSHTAAVAGGSHANTTSSLSLPGDGRGSDSQPASSARSSDTT*RSCSSGR 1026
P +SS S +A + S A + SS S P + S +SSA SS ++ S SS
Sbjct: 785 PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 844
Query: 1025 -PSAQLTAPLATVYSGPALVSMRKRWPSSE--TSNSSMMGTYCSLPPPKKPPPLVTSVCH 855
PS+ +AP A+ S P+ S SS +S+SS S P ++
Sbjct: 845 APSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 904
Query: 854 CRPRKLRRLSVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDAASAR*RIRWRRSA 675
P + + S PSS S+SA ++SS APS+SS S+ ++SA S+
Sbjct: 905 SAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP-----SSSS 959
Query: 674 GSPSTMHESTPKCAESRHFV--TEAISSGKSSFP-RQLRRLPTSRRLCITASQLS-PKRL 507
+PS S P + S + A SS SS P P+S +AS S P
Sbjct: 960 SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSS 1019
Query: 506 PAAGAEGGAMARSSCVSPLRRRWACLTPALRPEHDAWLSAPVLRGPSAAASNDDGQRTVE 327
+A + + A SS S + + P + SAP SA +S+ +
Sbjct: 1020 SSAPSASSSSAPSSSSSA-----PSASSSSAPSSSS--SAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 1072
Query: 326 TSPRVADEAGNSRAGPETIRIIKLSFVS 243
+S + + A + SF+S
Sbjct: 1073 SSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSFLS 1100
Score = 64.7 bits (156), Expect = 3e-09
Identities = 82/317 (25%), Positives = 125/317 (38%), Gaps = 7/317 (2%)
Frame = -3
Query: 1205 PDGASSPGGLRSHTAAVAGGSHANTTSSLSLPGDGRGSDSQPASSARSSDTT*RSCSSGR 1026
P +SS S ++A + S A + SS S P + S +SSA SS ++ S SS
Sbjct: 800 PSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 859
Query: 1025 -PSAQLTAPLATVYSGPALVSMRKRWPSS---ETSNSSMMGTYCSLPPPKKPPPLVTSVC 858
PS+ +AP A+ S P+ S SS +S+SS S P ++
Sbjct: 860 APSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASS 919
Query: 857 HCRPRKLRRLSVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDAASAR*RIRWRRS 678
P + + S PSS S+SA ++SS APS+SS A SA S
Sbjct: 920 SSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSS------SAPSASSSSAPSSS 973
Query: 677 AGSPSTMHESTPKCAESRHFVTEAISSGKSSFPRQLRRLPTSRRLCITASQLSPKRLPAA 498
+ +PS S P + S A S+ SS P P++ +S S ++
Sbjct: 974 SSAPSASSSSAPSSSSS-----SAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 1028
Query: 497 GA---EGGAMARSSCVSPLRRRWACLTPALRPEHDAWLSAPVLRGPSAAASNDDGQRTVE 327
A A + SS +P A + + SAP SA +S+
Sbjct: 1029 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS 1088
Query: 326 TSPRVADEAGNSRAGPE 276
+S + + S +G +
Sbjct: 1089 SSAPSSSSSFLSGSGSD 1105
Score = 61.2 bits (147), Expect = 4e-08
Identities = 87/336 (25%), Positives = 131/336 (38%), Gaps = 2/336 (0%)
Frame = -3
Query: 1196 ASSPGGLRSHTAAVAGGSHANTTSSLSLPGDGRGSDSQPASSARSSDTT*RSCSSGR-PS 1020
+SS S ++A + S A + SS S P + S +SSA SS ++ S SS PS
Sbjct: 666 SSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPS 725
Query: 1019 AQLTAPLATVYSGPALVSMRKRWPSSET-SNSSMMGTYCSLPPPKKPPPLVTSVCHCRPR 843
+ +AP A+ S P+ S SS S+SS + S P S
Sbjct: 726 SSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP 785
Query: 842 KLRRLSVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDAASAR*RIRWRRSAGSPS 663
+ + S PSS S+SA ++SS APS+SS A SA S+ +PS
Sbjct: 786 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSS------SAPSASSSSAPSSSSSAPS 839
Query: 662 TMHESTPKCAESRHFVTEAISSGKSSFPRQLRRLPTSRRLCITASQLSPKRLPAAGAEGG 483
S P + S A S+ SS P P++ +++ S P+A +
Sbjct: 840 ASSSSAPSSSSS------APSASSSSAPSSSSSAPSASS---SSAPSSSSSAPSASSSSA 890
Query: 482 AMARSSCVSPLRRRWACLTPALRPEHDAWLSAPVLRGPSAAASNDDGQRTVETSPRVADE 303
+ SS A + + + SAP S++A + +S A
Sbjct: 891 PSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP--SSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPS 948
Query: 302 AGNSRAGPETIRIIKLSFVSP*RTHKHAPAACPSRA 195
A +S A + S S + AP+A S A
Sbjct: 949 ASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA 984
Score = 56.6 bits (135), Expect = 9e-07
Identities = 93/347 (26%), Positives = 137/347 (38%), Gaps = 13/347 (3%)
Frame = -3
Query: 1196 ASSPGGLRSHTAAVAGGSHANTTSSLSLPGDGRGSDSQPASSARSSDTT*R--SCSSGRP 1023
+SS S ++A + S A + SS S P + S +SSA SS ++ + SS P
Sbjct: 726 SSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP 785
Query: 1022 SAQLTAPLATVYSGPALVSMRKRWPSSE---TSNSSMMGTYCSLPP--PKKPPPLVTSVC 858
S+ +AP A+ S P+ S SS +S+SS S P P +S
Sbjct: 786 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA 845
Query: 857 HCRPRKLRRLSVALFLLSLPSSPSASASC--STSSMAPSTSSRSSV*LDAASAR*RIRWR 684
S + S S+PSAS+S S+SS APS SS S+ ++SA
Sbjct: 846 PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA----PSA 901
Query: 683 RSAGSPSTMHESTPKCAESRHFVTEAISSGKSSFPRQLRRLPTSRRLCITASQLSPKRLP 504
S+ +PS+ S P + S A SS SS P +S ++S S
Sbjct: 902 SSSSAPSSSSSSAPSASSS-----SAPSSSSSSAP---SASSSSAPSSSSSSAPSASSSS 953
Query: 503 AAGAEGGAMARSSCVSPLRRRWACLTPALRPEHDAWLSAPVLRGPSAAASNDD----GQR 336
A + A + SS +P A + + SAP SA +S+
Sbjct: 954 APSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 1013
Query: 335 TVETSPRVADEAGNSRAGPETIRIIKLSFVSP*RTHKHAPAACPSRA 195
+ +S A A +S A + S S + AP+A S A
Sbjct: 1014 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA 1060
Score = 52.8 bits (125), Expect = 1e-05
Identities = 74/250 (29%), Positives = 103/250 (40%), Gaps = 9/250 (3%)
Frame = -3
Query: 1205 PDGASSPGGLRSHTAAVAGGSHANTTSSLSLPGDGRGS-DSQPASSARSSDTT*RSCSSG 1029
P +SS S +A + S A + SS S P S S +SSA SS S SS
Sbjct: 876 PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSS-----SSSSA 930
Query: 1028 RPSAQLTAPLATVYSGPALVSMRKRWPSSETSNSSMMGTYCSLPPPKKPPPLVTSVCHCR 849
++ +AP ++ S P+ S SS S+SS + S P ++
Sbjct: 931 PSASSSSAPSSSSSSAPSASS------SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA 984
Query: 848 PRKLRRLSVALFLLSLPSS----PSASASC--STSSMAPSTSSRS--SV*LDAASAR*RI 693
P + + S PSS PSAS+S S+SS APS SS S S A SA
Sbjct: 985 PSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 1044
Query: 692 RWRRSAGSPSTMHESTPKCAESRHFVTEAISSGKSSFPRQLRRLPTSRRLCITASQLSPK 513
S+ +PS S P + S A S+ SS P P++ +A S
Sbjct: 1045 APSSSSSAPSASSSSAPSSSSS-----SAPSASSSSAPSSSSSAPSAS--SSSAPSSSSS 1097
Query: 512 RLPAAGAEGG 483
L +G++GG
Sbjct: 1098 FLSGSGSDGG 1107
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.24
Identities = 61/241 (25%), Positives = 88/241 (36%), Gaps = 12/241 (4%)
Frame = -3
Query: 881 PPLVTSVCH----CRPRKLRRLSVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDA 714
P L+ S C C+P S S SS S+SA ++SS APS+SS A
Sbjct: 647 PELLASDCATENACKPETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSS------SA 700
Query: 713 ASAR*RIRWRRSAGSPSTMHESTPKCAESRHFVTEAISSGKSSFPRQLRRLPTSRRLCIT 534
SA S+ +PS S P + S A S+ SS P P++
Sbjct: 701 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSS------APSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAP 754
Query: 533 ASQLSPKRLPAAGA----EGGAMARSSCVSPLRRRWACLTPALRPEHDAWLSAPVLRGPS 366
+S S ++ A A + SS +P A + + SAP S
Sbjct: 755 SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSS 814
Query: 365 AAASNDD----GQRTVETSPRVADEAGNSRAGPETIRIIKLSFVSP*RTHKHAPAACPSR 198
A +S+ + +S A A +S A + S S + AP+A S
Sbjct: 815 APSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSS 874
Query: 197 A 195
A
Sbjct: 875 A 875
>pir||T46707 proteophosphoglycan, membrane-associated [imported] - Leishmania
major (fragment) gi|5420389|emb|CAB46680.1|
proteophosphoglycan [Leishmania major]
Length = 383
Score = 65.9 bits (159), Expect = 1e-09
Identities = 69/239 (28%), Positives = 103/239 (42%), Gaps = 1/239 (0%)
Frame = -3
Query: 1205 PDGASSPGGLRSHTAAVAGGSHANTTSSLSLPGDGRGSDSQPASSARSSDTT*RSCSSGR 1026
P +SS S +A A S A ++SS S P S S P+SS+ S+ + + SS
Sbjct: 26 PSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPS--ASSSSAPSSSSSSAPS---ASSSSA 80
Query: 1025 PSAQLTAPLATVYSGPALVSMRKRWPSSET-SNSSMMGTYCSLPPPKKPPPLVTSVCHCR 849
PS+ +AP A+ S P+ S SS S+SS + S P ++
Sbjct: 81 PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSA 140
Query: 848 PRKLRRLSVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDAASAR*RIRWRRSAGS 669
P + + S PSS S+SA ++SS APS+SS S+ ++SA S+ +
Sbjct: 141 PSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP-----SSSSSA 195
Query: 668 PSTMHESTPKCAESRHFVTEAISSGKSSFPRQLRRLPTSRRLCITASQLSPKRLPAAGA 492
PS S P + S A S+ SS P P+S T LP++ +
Sbjct: 196 PSASSSSAPSSSSS-----SAPSASSSSAPSSSSSAPSSSSTTTTMDPTPDPVLPSSSS 249
Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.022
Identities = 64/260 (24%), Positives = 96/260 (36%), Gaps = 2/260 (0%)
Frame = -3
Query: 1079 ASSARSSDTT*RSCSSGRPSAQLTAPLATVYSGPALVSMRKRWPSSE--TSNSSMMGTYC 906
+S+ SS + + SS PS+ +AP A+ S P+ S SS +S+SS +
Sbjct: 1 SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 60
Query: 905 SLPPPKKPPPLVTSVCHCRPRKLRRLSVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV 726
S P S + + S PSS S++ S S+SS S+SS S
Sbjct: 61 SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSA 120
Query: 725 *LDAASAR*RIRWRRSAGSPSTMHESTPKCAESRHFVTEAISSGKSSFPRQLRRLPTSRR 546
+A + S+ +PS S P + S A S+ SS P S
Sbjct: 121 SSSSAPS-------SSSSAPSASSSSAPSSSSS-----SAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 168
Query: 545 LCITASQLSPKRLPAAGAEGGAMARSSCVSPLRRRWACLTPALRPEHDAWLSAPVLRGPS 366
+A S P+A + + SS S A + A + SA PS
Sbjct: 169 -SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPS------ASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPS 221
Query: 365 AAASNDDGQRTVETSPRVAD 306
+++S T T D
Sbjct: 222 SSSSAPSSSSTTTTMDPTPD 241
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.038
Identities = 66/280 (23%), Positives = 105/280 (36%)
Frame = -3
Query: 1034 SGRPSAQLTAPLATVYSGPALVSMRKRWPSSETSNSSMMGTYCSLPPPKKPPPLVTSVCH 855
S PS+ +AP A+ S P+ +S+S+ + S P P +S
Sbjct: 1 SSAPSSSSSAPSASSSSAPS------------SSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS-- 46
Query: 854 CRPRKLRRLSVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDAASAR*RIRWRRSA 675
S PSS S+SA ++SS APS+SS S+ ++SA S+
Sbjct: 47 ----------------SAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP-----SSSS 85
Query: 674 GSPSTMHESTPKCAESRHFVTEAISSGKSSFPRQLRRLPTSRRLCITASQLSPKRLPAAG 495
+PS S P + S A S+ SS P P++ +S +P +A
Sbjct: 86 SAPSASSSSAPSSSSS------APSASSSSAPSSSSSAPSA------SSSSAPSSSSSAP 133
Query: 494 AEGGAMARSSCVSPLRRRWACLTPALRPEHDAWLSAPVLRGPSAAASNDDGQRTVETSPR 315
+ + A SS S + P+ + SAP SA +S+ + +S
Sbjct: 134 SASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPS-----SSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSA 188
Query: 314 VADEAGNSRAGPETIRIIKLSFVSP*RTHKHAPAACPSRA 195
+ + A S +P + AP+A S A
Sbjct: 189 PSSSSSAPSAS---------SSSAPSSSSSSAPSASSSSA 219
>emb|CAB46679.1| proteophosphoglycan [Leishmania major]
Length = 873
Score = 58.9 bits (141), Expect = 2e-07
Identities = 58/198 (29%), Positives = 87/198 (43%), Gaps = 5/198 (2%)
Frame = -3
Query: 1205 PDGASSPGGLRSHTAAVAGGSHANTTSSLSLPGDGRGSDSQPASSARSSDTT*R---SCS 1035
P +SS S ++A + S A + SS S P + S +SSA SS ++ S S
Sbjct: 678 PSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSS 737
Query: 1034 SGRPSAQLTAPLATVYSGPALVSMRKRWPSSE--TSNSSMMGTYCSLPPPKKPPPLVTSV 861
S S+ +AP A+ S P+ S SS +S+SS S P ++
Sbjct: 738 SAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSAS 797
Query: 860 CHCRPRKLRRLSVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDAASAR*RIRWRR 681
P + + S PSS S+SA ++SS APS+SS S+ ++SA
Sbjct: 798 SSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAS-----SS 852
Query: 680 SAGSPSTMHESTPKCAES 627
S+ +PS S P + S
Sbjct: 853 SSSAPSASSSSAPSSSSS 870
Score = 57.0 bits (136), Expect = 7e-07
Identities = 67/216 (31%), Positives = 93/216 (43%), Gaps = 7/216 (3%)
Frame = -3
Query: 1205 PDGASSPGGLRSHTAAVAGGSHANTTSSLSLPGDGRGS-DSQPASSARSSDTT*RSC-SS 1032
P +SS S +A + S A + SS S P S S +SSA SS ++ S SS
Sbjct: 647 PSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSS 706
Query: 1031 GRPSAQLTAPLATVYSGPALVSMRKRWPS-----SETSNSSMMGTYCSLPPPKKPPPLVT 867
PS+ +AP A+ S P+ S S S +S+S+ + S P P +
Sbjct: 707 SAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSAS 766
Query: 866 SVCHCRPRKLRRLSVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDAASAR*RIRW 687
S S S PS+ S+SA S+SS APS SS S+ ++SA
Sbjct: 767 S-----------SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA----PS 811
Query: 686 RRSAGSPSTMHESTPKCAESRHFVTEAISSGKSSFP 579
S+ +PS+ S P + S A SS SS P
Sbjct: 812 ASSSSAPSSSSSSAPSASSS-----SAPSSSSSSAP 842
Score = 50.4 bits (119), Expect = 6e-05
Identities = 61/205 (29%), Positives = 84/205 (40%), Gaps = 5/205 (2%)
Frame = -3
Query: 1178 LRSHTAAVAGGSHANTTSSLSLPGDGRGSDSQPASSARSSDTT*RSCSSGRPSAQLTAPL 999
L + A T SS S P S S +SSA S+ SS PS+ +AP
Sbjct: 602 LLASDCATENACKPETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSAS------SSSAPSSSSSAPS 655
Query: 998 ATVYSGPALVSMRKRWPSSE---TSNSSMMGTYCSLPPPKKPPPLVTSVCHCRPRKLRRL 828
A+ S P+ S SS +S+SS + S P ++ P
Sbjct: 656 ASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSA 715
Query: 827 SVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDAASAR*RIRWRRSAGSPSTMHES 648
A S PSS S+SA ++SS APS+SS S+ ++SA S+ +PS S
Sbjct: 716 PSA-SSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP-----SSSSSAPSASSSS 769
Query: 647 TPKCAESRHFV--TEAISSGKSSFP 579
P + S + A SS SS P
Sbjct: 770 APSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAP 794
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.11
Identities = 48/204 (23%), Positives = 80/204 (38%)
Frame = -3
Query: 806 SLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDAASAR*RIRWRRSAGSPSTMHESTPKCAES 627
S PSS S+SA ++SS APS+SS S+ ++SA S+ +PS S P + S
Sbjct: 660 SAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAP-----SSSSSAPSASSSSAPSSSSS 714
Query: 626 RHFVTEAISSGKSSFPRQLRRLPTSRRLCITASQLSPKRLPAAGAEGGAMARSSCVSPLR 447
A S+ SS P +A S P++ + A SS
Sbjct: 715 ------APSASSSSAPSSSSS---------SAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSS 759
Query: 446 RRWACLTPALRPEHDAWLSAPVLRGPSAAASNDDGQRTVETSPRVADEAGNSRAGPETIR 267
+ + P + SAP SA +S+ + +S + + ++ + +
Sbjct: 760 SSAPSASSSSAPSSSS--SAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSA 817
Query: 266 IIKLSFVSP*RTHKHAPAACPSRA 195
S +P + AP++ S A
Sbjct: 818 PSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSA 841
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.55
Identities = 55/236 (23%), Positives = 90/236 (37%), Gaps = 7/236 (2%)
Frame = -3
Query: 881 PPLVTSVCH----CRPRKLRRLSVALFLLSLPSSPSASASCSTSSMAPSTSSRSSV*LDA 714
P L+ S C C+P S S SS S+SA ++SS APS+SS A
Sbjct: 600 PELLASDCATENACKPETESSSSAPSASSSSASSSSSSAPSASSSSAPSSSS------SA 653
Query: 713 ASAR*RIRWRRSAGSPSTMHESTPKCAES---RHFVTEAISSGKSSFPRQLRRLPTSRRL 543
SA S+ +PS+ S P + S + A S+ SS P P++
Sbjct: 654 PSA-------SSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAPSASS- 705
Query: 542 CITASQLSPKRLPAAGAEGGAMARSSCVSPLRRRWACLTPALRPEHDAWLSAPVLRGPSA 363
+++ S P+A + + SS A + + + SAP +
Sbjct: 706 --SSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSSAPSSSSSAP 763
Query: 362 AASNDDGQRTVETSPRVADEAGNSRAGPETIRIIKLSFVSP*RTHKHAPAACPSRA 195
+AS+ + ++P + + S + S +P + AP+A S A
Sbjct: 764 SASSSSAPSSSSSAPSASSSSAPSSSSSSAPSASSSS--APSSSSSSAPSASSSSA 817
>ref|NP_896691.1| possible N-terminal part of IF-2 [Synechococcus sp. WH 8102]
gi|33638816|emb|CAE07113.1| possible N-terminal part of
IF-2 [Synechococcus sp. WH 8102]
Length = 496
Score = 58.2 bits (139), Expect = 3e-07
Identities = 76/280 (27%), Positives = 95/280 (33%), Gaps = 11/280 (3%)
Frame = -1
Query: 1219 APGQCRTARPRRAA*GRTRRRWRAAHTRTRPARCRCPAMAGAATANPPAQHAAPIPRSAA 1040
AP Q + A P + A ++ A +PA PA A A PA A P+PR AA
Sbjct: 88 APAQAKPATPAKPAASASKPAAPA-----KPAAPAAPARPAPARAAAPAAPAKPVPRPAA 142
Query: 1039 APAADPPP------SSRRRWPPCTAARPWSPCGSAGRPR--RPQTAR*WARTAACRHRRS 884
AP P P S + P TA+ P P RP +P A+
Sbjct: 143 APPPRPQPAKPEVVSKPKPATPATASAPSKPTAPPARPTVVKPTVAKPTV---------- 192
Query: 883 HHRW*PASATAARESCAGCRWRYSCCRCRHRPVRVLAVPLAAWRPQPAPGHQSDWTQLQP 704
A T A+ + A + P + A A RP PA +P
Sbjct: 193 ------AKPTVAKPTVA-----------KPAPAKPAAAKPAPARPAPA----------RP 225
Query: 703 GSASGGAEALAARPPCMSQRPNAPSRGTSSPRLSPPAKAPSPGSCEGCLHHEDFA*QPRS 524
A A+ RP RP P G +S P AP PG+
Sbjct: 226 APARPSADQPKPRPAAAPSRP-TPGAGQKPQIVSRPGSAPRPGA---------------P 269
Query: 523 CRPNGCPLPGRRGA---RWPAAAVCHRCGAVGPALHRRSG 413
RP G P P R GA P R VG + RR G
Sbjct: 270 TRP-GAPAPARPGAPVKAGPPTRPTPRPELVGKPVPRRPG 308
Score = 35.8 bits (81), Expect = 1.6
Identities = 60/247 (24%), Positives = 85/247 (34%), Gaps = 11/247 (4%)
Frame = -1
Query: 1102 AGAATANPPAQHAAPIPRSAAAPAADPPPSSRRRWPPCTAARPWSPCGSAGRPRRPQTAR 923
A A PA A + AAPA P ++ P T A+P + P +P
Sbjct: 62 ASAPAPAKPAPGKAILSVKKAAPAKPAPAQAK----PATPAKPAASASKPAAPAKPAAPA 117
Query: 922 *WARTAACRHRRSHHRW*PASATAARESCAGCRWRYSCCRCRHRPVRVLAVPLAAWRPQP 743
AR A R A+A AA P + + P AA P+P
Sbjct: 118 APARPAPAR----------AAAPAA-------------------PAKPVPRPAAAPPPRP 148
Query: 742 APGHQSDWTQLQPGS-ASGGAEALAARPPCMSQ--RPNAPSRGTSSPRLSPPAKA-PSPG 575
P ++ +P + A+ A + PP +P + P ++ P A P+P
Sbjct: 149 QPAKPEVVSKPKPATPATASAPSKPTAPPARPTVVKPTVAKPTVAKPTVAKPTVAKPAPA 208
Query: 574 SCEGCLHHEDFA*QPRSCRPNGC-PLPGRRGARW----PAAAVCHRCGAVG--PALHRRS 416
+ A +P RP P P R A PAAA G P + R
Sbjct: 209 --------KPAAAKPAPARPAPARPAPARPSADQPKPRPAAAPSRPTPGAGQKPQIVSRP 260
Query: 415 GQSMTPG 395
G + PG
Sbjct: 261 GSAPRPG 267
>gb|AAK49004.1| USC3-5p [Myxococcus xanthus]
Length = 575
Score = 55.1 bits (131), Expect = 3e-06
Identities = 86/320 (26%), Positives = 113/320 (34%), Gaps = 44/320 (13%)
Frame = -1
Query: 1222 CAPGQCRT--ARP-RRAA*GRTRRRWRAAHTRTRPARCRCPAMAGAATANP-PAQHA--- 1064
CA G R A P RR + R+R RWR TRPA AM A + P PA+ A
Sbjct: 114 CAAGTARVPPAGPARRRSPSRSRNRWRL-RCGTRPAPAPWAAMTTVAGSAPAPARPARAV 172
Query: 1063 ---APIPRSAA------------APAADPPPSSRRRWP--------------PCTAARPW 971
AP+ R+AA P + PP + R WP PC P
Sbjct: 173 LPRAPLQRTAAPRAGPSGCPAARCPGSCPPGAGRSSWPMQYRRARRVRRPSPPCRLPAPP 232
Query: 970 SPCGSAGRPRRPQTAR*WARTAACRHRRSHHRW*PASATAARESCAGCRWRYSCCRCRHR 791
PC RR +A W R A C RR R P + R++ A C
Sbjct: 233 GPC-----QRRAASAVRWHRHAQCPARRWRSRTAPRRSVHTRDTSAACS----------- 276
Query: 790 PVRVLAVPLAAWR----PQPAPGHQSDWTQLQPGSASGGAEALAARPPCMSQRPNAPSRG 623
P+ A R + AP + T +P A+ A ++ +A +
Sbjct: 277 -------PMRATRRRNSNETAPISTNCGTSCEPACAASWPCACWKNSDRKNRLASAVNPS 329
Query: 622 TSSPRLSPPAKAPSPGSCEGCLHHE---DFA*QPRSCRPNGCPLPGR-RGARWPAAAVCH 455
T+ RLS P PG + PR R GC R +G R A +
Sbjct: 330 TNEARLS----MPKPGIANRVQRQQRSRHATLDPRKQRQAGCRDGERQQGGRRQQAVLAD 385
Query: 454 RCGAVGPALHRRSGQSMTPG 395
R AV R + + PG
Sbjct: 386 RDQAVAERTQRDDAEQL-PG 404
