KCC000558A_c01
[Fasta Sequence]   [Nr Search]   [EST assemble image]  

Fasta Sequence
>KCC000558A_C01 KCC000558A_c01
cgaggtgacgcgggcagaggcggtgacgcTAGGACCCAAGTTATCGCCCATCCTGTACCA
GCACCCTCTGGACACATCCTGGCTGACGGACCCGGGCCATTGGTTTGACGATGCGCGCGT
GTATCAGGTGGTGACGTGGAAGGACATGCGGACGTTCCGTGTCCCCAACACAACGGGTTT
TACACGCGAAGAGTTCATCATGGGCCAGGAGCTTATTGCCACGAGGCTGCTCCGCACCGA
GTTCAACCAGACGACCGGCGAGACCAAGTTCATTGTCGTATAACAACACCGAGCTGCACC
GACTGGCCATCATGGACCCAGTGGTGGACGGCCGCCTGACCGGCAATGTGTACTACACGA
TGTTCCGGCCCCACGACACCGGCGCCGGCGACCTGGTCCCGCACGCCTACGTGTACACCT
ACCACTACTACTTCCCCTGGAACGGCTGCAGCA


Nr search


BLASTX 2.2.2 [Dec-14-2001]

Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= KCC000558A_C01 KCC000558A_c01
         (453 letters)

Database: nr 
           1,537,769 sequences; 498,525,298 total letters

Searching..................................................done

                                                                   Score     E
Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value

ref|NP_523475.2| Salivary gland secretion 1 CG3047-PA [Drosophil...    47  1e-04
gb|AAC14229.1| mucin-like protein [Trypanosoma cruzi]                  39  0.021
gb|AAA75589.1| mucin                                                   39  0.035
ref|NP_598197.1| mucin 10 [Rattus norvegicus] gi|627969|pir||A53...    39  0.035
gb|AAC46904.1| mucin-like protein; Method: conceptual translatio...    38  0.060

>ref|NP_523475.2| Salivary gland secretion 1 CG3047-PA [Drosophila melanogaster]
            gi|28380257|gb|AAF50957.3| CG3047-PA [Drosophila
            melanogaster]
          Length = 1225

 Score = 46.6 bits (109), Expect = 1e-04
 Identities = 26/57 (45%), Positives = 31/57 (53%), Gaps = 1/57 (1%)
 Frame = +1

Query: 277  RITTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRC-SGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
            R TT +CT  P+ T       P   TT C SGPTT  P + ++T TC PTTTT   T
Sbjct: 900  RSTTTTCTSCPTTTT------PRSTTTTCTSGPTTTTPRSTTKTSTCAPTTTTPRST 950

 Score = 43.5 bits (101), Expect = 0.001
 Identities = 23/54 (42%), Positives = 29/54 (53%)
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Query: 283  TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
            TTP  T  PS ++  T    +  TT  S PTT  P + ++T TC PTTTT   T
Sbjct: 977  TTPRSTTTPSTSRPTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRSTTKTSTCAPTTTTPRST 1030

 Score = 42.0 bits (97), Expect = 0.003
 Identities = 27/57 (47%), Positives = 30/57 (52%), Gaps = 3/57 (5%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWT--QWWTAA*PAMCTTRC-SGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TTP CT  PS T  +  T   P   TT C SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 334 TTPRCTTTPSTTCTRRPTTTTPRSTTTTCTSGPTTTTPRSTTTTCTSGPTTTTPRST 390

 Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.007
 Identities = 25/57 (43%), Positives = 29/57 (50%), Gaps = 1/57 (1%)
 Frame = +1

Query: 277 RITTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRC-SGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           R TT +CT  P+ T       P   TT C SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 356 RSTTTTCTSGPTTTT------PRSTTTTCTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 406

 Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.027
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 25/54 (45%)
 Frame = +1

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           TTP CT   S     T    +  TT  S PTT  P   + T TC+PT TT   T
Sbjct: 270 TTPRCTTTTSTCAPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRCTTTTSTCSPTRTTPRST 323

 Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.10
 Identities = 24/57 (42%), Positives = 28/57 (49%), Gaps = 1/57 (1%)
 Frame = +1

Query: 277  RITTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRC-SGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
            R TT +CT  P+ T       P   TT C S PTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 868  RSTTTTCTSGPTTTT------PRSTTTTCTSCPTTTTPRSTTTTCTSCPTTTTPRST 918

 Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.10
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

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           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 817 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSCPTTTTPRST 870

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

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Sbjct: 417 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 470

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

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           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 577 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 630

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 385 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 438

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 593 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 646

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
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Sbjct: 401 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 454

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 641 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 694

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 433 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 486

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 529 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 582

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 25/55 (45%), Positives = 27/55 (48%), Gaps = 1/55 (1%)
 Frame = +1

Query: 283  TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRC-SGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
            TTP  T   S T   T   P   TT C SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 849  TTPRSTTTTS-TSCPTTTTPRSTTTTCTSGPTTTTPRSTTTTCTSCPTTTTPRST 902

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 513 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 566

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 497 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 550

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
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Sbjct: 769 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 822

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 561 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 614

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
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Sbjct: 545 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 598

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 481 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 534

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 465 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 518

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
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Sbjct: 721 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 774

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 609 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 662

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 625 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 678

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

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           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 705 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 758

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Sbjct: 657 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 710

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 673 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 726

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 689 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 742

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
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Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 449 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 502

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 801 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 854

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 737 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 790

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 753 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 806

 Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.13
 Identities = 22/54 (40%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TTP  T   S +   T    +  TT  SGPTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 785 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSGPTTTTPRST 838

 Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.30
 Identities = 20/54 (37%), Positives = 25/54 (46%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TTP  T   + ++  T    +  TT    PTT  P   + T TC PTTTT   T
Sbjct: 238 TTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTTTTRRPTTTTPRCTTTTSTCAPTTTTPRST 291

 Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.51
 Identities = 23/67 (34%), Positives = 29/67 (42%), Gaps = 11/67 (16%)
 Frame = +1

Query: 277  RITTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMC-----------TTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPT 423
            R TT +CT  P+ T   +    + C           TT  S PTT  P + + T T  PT
Sbjct: 916  RSTTTTCTSGPTTTTPRSTTKTSTCAPTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPT 975

Query: 424  TTTSPGT 444
            TTT   T
Sbjct: 976  TTTPRST 982

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.1
 Identities = 20/50 (40%), Positives = 25/50 (50%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTT 432
           TTP  T   S ++  T    +  TT  S PTT  P + + T T  PTTTT
Sbjct: 222 TTPRSTTTTSTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTTTTRRPTTTT 271

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.1
 Identities = 23/57 (40%), Positives = 27/57 (47%), Gaps = 1/57 (1%)
 Frame = +1

Query: 277  RITTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRC-SGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
            R TT + T  P+ T       P   TT C S PTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 1044 RSTTTTTTSRPTTTT------PRSTTTPCTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRST 1094

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.1
 Identities = 22/62 (35%), Positives = 27/62 (43%), Gaps = 9/62 (14%)
 Frame = +1

Query: 274 CRITTPSC---TDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCS------GPTTPAPATWSRTPTCTPTT 426
           C  TT +C   T  P  T   T + P   T RC+       PT   P + + T T  PTT
Sbjct: 274 CTTTTSTCAPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRCTTTTSTCSPTRTTPRSTTTTSTSRPTT 333

Query: 427 TT 432
           TT
Sbjct: 334 TT 335

 Score = 33.1 bits (74), Expect = 1.5
 Identities = 21/54 (38%), Positives = 24/54 (43%)
 Frame = +1

Query: 283  TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
            TTP  T   S     T    +  TT  S PTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 1009 TTPRSTTKTSTCAPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRST 1062

 Score = 32.7 bits (73), Expect = 1.9
 Identities = 20/54 (37%), Positives = 25/54 (46%)
 Frame = +1

Query: 283  TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
            TTP  T   S ++  T    +  TT  S PTT  P + +   T  PTTTT   T
Sbjct: 945  TTPRSTTTTSTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTPSTSRPTTTTPRST 998

 Score = 32.3 bits (72), Expect = 2.5
 Identities = 21/54 (38%), Positives = 25/54 (45%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TTP  T   S +   T    +  TT  S PTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 833 TTPRSTTTTSTSGPTTTTPRSTTTTSTSCPTTTTPRSTTTTCTSGPTTTTPRST 886

 Score = 31.6 bits (70), Expect = 4.3
 Identities = 19/54 (35%), Positives = 25/54 (46%)
 Frame = +1

Query: 283  TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
            TTP  T   + ++  T    +  T   S PTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 961  TTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTPSTSRPTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRST 1014

 Score = 31.2 bits (69), Expect = 5.6
 Identities = 21/58 (36%), Positives = 27/58 (46%), Gaps = 5/58 (8%)
 Frame = +1

Query: 286 TPSCTDWPSWTQWWTAA*P-----AMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TP+C+   + T   T A       +  TT  S PTT  P + + T T  PTTTT   T
Sbjct: 202 TPTCSTQGTQTTPCTCAQTTTTPRSTTTTSTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRST 259

 Score = 31.2 bits (69), Expect = 5.6
 Identities = 20/56 (35%), Positives = 24/56 (42%), Gaps = 6/56 (10%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCS------GPTTPAPATWSRTPTCTPTTTT 432
           T+   T  P  T   T   P   T RC+       PTT  P + + T T  PTTTT
Sbjct: 248 TSRPTTTTPRSTTTTTTRRPTTTTPRCTTTTSTCAPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTT 303

 Score = 30.8 bits (68), Expect = 7.4
 Identities = 19/54 (35%), Positives = 25/54 (46%)
 Frame = +1

Query: 283  TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
            TTP  T   + ++  T    +  TT  S PTT  P + +   T  PTTTT   T
Sbjct: 1025 TTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTTTTSRPTTTTPRSTTTPCTSRPTTTTPRST 1078

>gb|AAC14229.1| mucin-like protein [Trypanosoma cruzi]
          Length = 94

 Score = 39.3 bits (90), Expect = 0.021
 Identities = 23/61 (37%), Positives = 28/61 (45%)
 Frame = +1

Query: 262 DQVHCRITTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPG 441
           DQ     TT + T  P+ T   T   P   TT  + P T    T ++ PT T TTTT P 
Sbjct: 32  DQKQDTTTTTTTTKPPTTTTTTTTKPPTTTTTTTTKPPTTTTTTTTKPPTTTTTTTTKPP 91

Query: 442 T 444
           T
Sbjct: 92  T 92

>gb|AAA75589.1| mucin
          Length = 309

 Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.035
 Identities = 22/61 (36%), Positives = 31/61 (50%)
 Frame = +1

Query: 262 DQVHCRITTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPG 441
           D++  ++TTP+ T  P+      +  PA  T   +  TTPAP T   T + TP  TT P 
Sbjct: 112 DKIETKVTTPAQTTKPT----TDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPT 167

Query: 442 T 444
           T
Sbjct: 168 T 168

 Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.39
 Identities = 21/54 (38%), Positives = 25/54 (45%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT S T  P+      +  PA  T   +  TTPAP T   T + TP  TT P T
Sbjct: 193 TTDSTTPAPTTKPTADSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTT 246

 Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.51
 Identities = 21/54 (38%), Positives = 25/54 (45%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT S T  P+      +  PA  T   +  TTPAP T   T + TP  TT P T
Sbjct: 180 TTDSTTPAPTNKPTTDSTTPAPTTKPTADSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTT 233

 Score = 33.5 bits (75), Expect = 1.1
 Identities = 20/54 (37%), Positives = 24/54 (44%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT S T  P+      +  PA  T   +  TTPAP T   T + TP  T  P T
Sbjct: 141 TTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTNKPTT 194

 Score = 32.3 bits (72), Expect = 2.5
 Identities = 19/52 (36%), Positives = 23/52 (43%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSP 438
           TT S T  P+      +  PA  T   +  TTPAP     T + TP  TT P
Sbjct: 154 TTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTNKPTTDSTTPAPTTKP 205

 Score = 31.6 bits (70), Expect = 4.3
 Identities = 19/54 (35%), Positives = 23/54 (42%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT S T  P+      +  PA      +  TTPAP T     + TP  TT P T
Sbjct: 167 TTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTNKPTTDSTTPAPTTKPTADSTTPAPTTKPTT 220

>ref|NP_598197.1| mucin 10 [Rattus norvegicus] gi|627969|pir||A53715 apomucin
           precursor - rat gi|476097|gb|AAA20966.1| apomucin
          Length = 322

 Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.035
 Identities = 22/61 (36%), Positives = 31/61 (50%)
 Frame = +1

Query: 262 DQVHCRITTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPG 441
           D++  ++TTP+ T  P+      +  PA  T   +  TTPAP T   T + TP  TT P 
Sbjct: 112 DKIETKVTTPAQTTKPT----TDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPT 167

Query: 442 T 444
           T
Sbjct: 168 T 168

 Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.30
 Identities = 21/54 (38%), Positives = 25/54 (45%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT S T  P+      +  PA  T   +  TTPAP T   T + TP  TT P T
Sbjct: 206 TTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTT 259

 Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.30
 Identities = 21/54 (38%), Positives = 25/54 (45%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT S T  P+      +  PA  T   +  TTPAP T   T + TP  TT P T
Sbjct: 193 TTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTT 246

 Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.51
 Identities = 21/54 (38%), Positives = 25/54 (45%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT S T  P+      +  PA  T   +  TTPAP T   T + TP  TT P T
Sbjct: 180 TTDSTTPAPTNKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTT 233

 Score = 32.7 bits (73), Expect = 1.9
 Identities = 20/54 (37%), Positives = 24/54 (44%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT S T  P+      +  PA      +  TTPAP T   T + TP  TT P T
Sbjct: 167 TTDSTTPAPTNKPTTDSTTPAPTNKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTT 220

 Score = 31.6 bits (70), Expect = 4.3
 Identities = 19/54 (35%), Positives = 23/54 (42%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT S T  P+      +  PA      +  TTPAP     T + TP  TT P T
Sbjct: 154 TTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTNKPTTDSTTPAPTNKPTTDSTTPAPTTKPTT 207

 Score = 31.6 bits (70), Expect = 4.3
 Identities = 19/50 (38%), Positives = 23/50 (46%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTT 432
           TT S T  P+      +  PA  T   +  TTPAP T   T + TP  TT
Sbjct: 219 TTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTT 268

 Score = 31.6 bits (70), Expect = 4.3
 Identities = 19/54 (35%), Positives = 23/54 (42%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT S T  P+      +  PA  T   +  TTPAP     T + TP  T  P T
Sbjct: 141 TTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTTKPTTDSTTPAPTNKPTTDSTTPAPTNKPTT 194

>gb|AAC46904.1| mucin-like protein; Method: conceptual translation supplied by
           author gi|1585304|prf||2124391B mucin-like protein
          Length = 165

 Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.060
 Identities = 21/54 (38%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT + T  P+ T   T   P   TT  + P T    T ++ PT T TTTT P T
Sbjct: 49  TTTTTTKPPTTTTTTTTKPPTTTTTTTTKPPTTTTTTTTKPPTTTTTTTTKPPT 102

 Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.060
 Identities = 21/54 (38%), Positives = 26/54 (47%)
 Frame = +1

Query: 283 TTPSCTDWPSWTQWWTAA*PAMCTTRCSGPTTPAPATWSRTPTCTPTTTTSPGT 444
           TT + T  P+ T   T   P   TT  + P T    T ++ PT T TTTT P T
Sbjct: 38  TTTTTTKPPTTTTTTTTKPPTTTTTTTTKPPTTTTTTTTKPPTTTTTTTTKPPT 91



EST assemble image


clone accession position
1 CL42b07_r AV395477 1 453
2 MXL074g05_r BP097382 30 426




Chlamydomonas reinhardtii
Kazusa DNA Research Institute