Herbaspirillum seropedicae [gbbct]: 190 CDS's (60768 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  3.2(   192)  UCU  1.3(    80)  UAU  6.9(   422)  UGU  1.0(    62)
UUC 30.3(  1840)  UCC 16.9(  1024)  UAC 17.1(  1042)  UGC  7.5(   456)
UUA  0.3(    16)  UCA  0.8(    51)  UAA  1.3(    81)  UGA  1.7(   104)
UUG  6.1(   371)  UCG 17.8(  1081)  UAG  0.1(     5)  UGG  9.1(   552)

CUU  1.3(    76)  CCU  3.0(   184)  CAU  6.7(   405)  CGU 11.3(   689)
CUC 11.3(   685)  CCC 15.1(   915)  CAC 15.0(   909)  CGC 39.1(  2373)
CUA  0.5(    32)  CCA  1.3(    77)  CAA  9.4(   570)  CGA  0.7(    45)
CUG 68.7(  4175)  CCG 25.7(  1560)  CAG 31.0(  1886)  CGG  3.1(   190)

AUU  3.9(   235)  ACU  2.3(   138)  AAU  6.5(   396)  AGU  1.3(    81)
AUC 51.4(  3124)  ACC 40.5(  2464)  AAC 26.5(  1609)  AGC 14.4(   877)
AUA  0.3(    18)  ACA  1.0(    58)  AAA  4.3(   259)  AGA  0.5(    32)
AUG 26.2(  1593)  ACG  6.3(   385)  AAG 50.1(  3044)  AGG  0.6(    38)

GUU  3.3(   198)  GCU 11.9(   724)  GAU 15.7(   954)  GGU 12.7(   772)
GUC 31.1(  1888)  GCC 69.6(  4232)  GAC 42.8(  2602)  GGC 66.3(  4029)
GUA  1.8(   109)  GCA  8.1(   491)  GAA 42.1(  2558)  GGA  2.1(   125)
GUG 40.1(  2438)  GCG 23.6(  1436)  GAG 25.2(  1529)  GGG  3.0(   182)

Coding GC 63.12% 1st letter GC 64.24% 2nd letter GC 41.97% 3rd letter GC 83.16%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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