Macaca fascicularis [gbpri]: 9092 CDS's (2451969 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 20.3( 49890)  UCU 16.3( 40007)  UAU 13.9( 34105)  UGU 11.3( 27712)
UUC 18.8( 46095)  UCC 15.8( 38753)  UAC 14.4( 35331)  UGC 11.2( 27352)
UUA  9.5( 23352)  UCA 13.0( 31948)  UAA  1.2(  2893)  UGA  1.7(  4233)
UUG 14.6( 35793)  UCG  3.8(  9268)  UAG  0.8(  2007)  UGG 13.3( 32608)

CUU 15.2( 37356)  CCU 17.5( 42958)  CAU 12.1( 29751)  CGU  4.9( 11982)
CUC 17.7( 43287)  CCC 16.1( 39493)  CAC 13.7( 33679)  CGC  8.3( 20451)
CUA  8.0( 19676)  CCA 17.2( 42109)  CAA 13.9( 34150)  CGA  6.5( 15836)
CUG 34.6( 84771)  CCG  5.4( 13300)  CAG 32.1( 78739)  CGG  9.9( 24376)

AUU 18.6( 45516)  ACU 14.2( 34832)  AAU 19.2( 46961)  AGU 13.1( 32210)
AUC 19.5( 47739)  ACC 16.9( 41474)  AAC 18.5( 45261)  AGC 16.8( 41134)
AUA  9.0( 22177)  ACA 16.4( 40196)  AAA 28.7( 70482)  AGA 14.3( 35003)
AUG 24.8( 60700)  ACG  5.2( 12860)  AAG 32.7( 80227)  AGG 12.1( 29582)

GUU 12.8( 31504)  GCU 19.9( 48896)  GAU 24.1( 59198)  GGU 11.3( 27643)
GUC 13.3( 32559)  GCC 23.6( 57769)  GAC 23.0( 56377)  GGC 18.6( 45581)
GUA  8.4( 20669)  GCA 17.4( 42626)  GAA 33.3( 81532)  GGA 17.8( 43677)
GUG 25.8( 63269)  GCG  6.1( 14979)  GAG 37.0( 90819)  GGG 14.4( 35256)

Coding GC 49.64% 1st letter GC 54.01% 2nd letter GC 41.03% 3rd letter GC 53.87%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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