Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris str. Hildenborough [gbbct]: 3531 CDS's (1081629 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  4.4(  4793)  UCU  3.4(  3700)  UAU  6.6(  7141)  UGU  3.0(  3273)
UUC 31.4( 33912)  UCC 13.2( 14276)  UAC 16.1( 17441)  UGC 11.6( 12573)
UUA  0.6(   699)  UCA  3.8(  4074)  UAA  0.4(   470)  UGA  1.5(  1644)
UUG  7.4(  8006)  UCG 15.0( 16258)  UAG  1.3(  1425)  UGG 12.0( 12959)

CUU 17.4( 18790)  CCU  6.2(  6723)  CAU  9.8( 10618)  CGU 14.3( 15459)
CUC 36.7( 39728)  CCC 25.8( 27918)  CAC 14.6( 15812)  CGC 36.3( 39271)
CUA  1.6(  1745)  CCA  3.0(  3276)  CAA  5.0(  5390)  CGA  3.7(  4053)
CUG 39.8( 43039)  CCG 17.1( 18527)  CAG 24.4( 26361)  CGG 12.2( 13152)

AUU  4.6(  4985)  ACU  2.7(  2907)  AAU  4.4(  4777)  AGU  3.4(  3704)
AUC 34.6( 37407)  ACC 27.7( 29909)  AAC 19.5( 21102)  AGC 12.6( 13632)
AUA  4.9(  5255)  ACA  6.2(  6663)  AAA  4.8(  5205)  AGA  2.7(  2870)
AUG 27.1( 29285)  ACG 18.1( 19563)  AAG 26.5( 28672)  AGG  6.5(  7052)

GUU  5.0(  5440)  GCU  7.9(  8529)  GAU 12.0( 12998)  GGU 14.1( 15284)
GUC 30.0( 32456)  GCC 60.3( 65172)  GAC 45.0( 48726)  GGC 43.1( 46573)
GUA  4.9(  5340)  GCA 17.1( 18479)  GAA 29.0( 31322)  GGA  9.4( 10114)
GUG 38.2( 41335)  GCG 28.7( 31073)  GAG 29.9( 32338)  GGG 19.4( 20956)

Coding GC 63.53% 1st letter GC 66.20% 2nd letter GC 46.19% 3rd letter GC 78.21%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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