Xanthobacter autotrophicus Py2 [gbbct]: 5053 CDS's (1648938 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  3.9(  6435)  UCU  1.6(  2587)  UAU 10.7( 17604)  UGU  0.7(  1167)
UUC 32.7( 53871)  UCC 18.2( 29979)  UAC 10.0( 16446)  UGC  7.3( 12114)
UUA  0.3(   534)  UCA  1.6(  2592)  UAA  0.2(   350)  UGA  2.5(  4060)
UUG  5.2(  8531)  UCG 14.2( 23357)  UAG  0.4(   643)  UGG 12.5( 20585)

CUU  8.1( 13318)  CCU  3.1(  5159)  CAU  7.8( 12905)  CGU  5.0(  8250)
CUC 36.3( 59936)  CCC 22.3( 36770)  CAC 12.2( 20076)  CGC 44.4( 73283)
CUA  1.0(  1662)  CCA  2.4(  4005)  CAA  3.0(  4870)  CGA  2.4(  3987)
CUG 52.0( 85681)  CCG 28.7( 47335)  CAG 25.8( 42559)  CGG 19.3( 31900)

AUU  4.0(  6617)  ACU  1.8(  3031)  AAU  6.2( 10150)  AGU  1.1(  1839)
AUC 40.9( 67366)  ACC 34.0( 56125)  AAC 15.8( 26029)  AGC 13.8( 22776)
AUA  0.8(  1327)  ACA  2.0(  3252)  AAA  3.1(  5148)  AGA  0.7(  1138)
AUG 22.1( 36496)  ACG 14.2( 23390)  AAG 27.6( 45462)  AGG  2.4(  4015)

GUU  4.0(  6667)  GCU  6.6( 10820)  GAU 15.7( 25934)  GGU  6.1( 10087)
GUC 23.5( 38784)  GCC 74.5(122805)  GAC 39.8( 65556)  GGC 62.3(102746)
GUA  1.6(  2663)  GCA  6.8( 11172)  GAA 14.5( 23963)  GGA  4.9(  8121)
GUG 49.3( 81272)  GCG 49.4( 81521)  GAG 40.8( 67297)  GGG 13.8( 22818)

Coding GC 67.81% 1st letter GC 68.77% 2nd letter GC 48.08% 3rd letter GC 86.57%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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