Pyrococcus horikoshii OT3 [gbbct]: 2067 CDS's (572598 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 23.9( 13662)  UCU 10.1(  5800)  UAU 19.7( 11271)  UGU  3.1(  1786)
UUC 22.0( 12583)  UCC  9.7(  5537)  UAC 18.6( 10646)  UGC  3.2(  1822)
UUA 21.5( 12291)  UCA 11.5(  6609)  UAA  1.2(   702)  UGA  1.6(   930)
UUG 11.8(  6731)  UCG  4.6(  2613)  UAG  0.8(   435)  UGG 11.7(  6701)

CUU 25.6( 14651)  CCU 12.1(  6953)  CAU  8.0(  4586)  CGU  1.2(   695)
CUC 17.5( 10025)  CCC 10.2(  5833)  CAC  6.8(  3919)  CGC  1.1(   614)
CUA 18.2( 10398)  CCA 17.5( 10026)  CAA  7.9(  4548)  CGA  1.0(   567)
CUG  8.6(  4924)  CCG  5.1(  2921)  CAG  8.3(  4779)  CGG  0.9(   528)

AUU 26.0( 14861)  ACU 13.6(  7782)  AAU 18.4( 10564)  AGU 10.3(  5910)
AUC 17.1(  9775)  ACC 10.7(  6125)  AAC 16.8(  9608)  AGC 12.1(  6900)
AUA 44.5( 25503)  ACA 10.6(  6046)  AAA 31.2( 17857)  AGA 20.1( 11537)
AUG 22.9( 13118)  ACG 10.1(  5801)  AAG 46.0( 26334)  AGG 30.1( 17210)

GUU 35.5( 20308)  GCU 21.5( 12334)  GAU 30.9( 17681)  GGU 15.1(  8668)
GUC 11.3(  6463)  GCC 16.3(  9345)  GAC 11.6(  6646)  GGC  7.1(  4093)
GUA 17.5( 10034)  GCA 18.4( 10553)  GAA 40.8( 23358)  GGA 31.6( 18090)
GUG 12.0(  6894)  GCG  7.2(  4145)  GAG 41.9( 23993)  GGG 15.7(  8976)

Coding GC 42.32% 1st letter GC 48.47% 2nd letter GC 35.53% 3rd letter GC 42.97%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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