Synechococcus sp. CC9311 [gbbct]: 2892 CDS's (757324 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 17.9( 13546)  UCU 10.2(  7699)  UAU  9.5(  7166)  UGU  5.1(  3853)
UUC 15.5( 11723)  UCC 11.0(  8298)  UAC  9.3(  7080)  UGC  7.9(  5984)
UUA  9.9(  7522)  UCA 10.6(  8044)  UAA  1.1(   854)  UGA  2.2(  1689)
UUG 27.4( 20781)  UCG  8.1(  6126)  UAG  0.5(   349)  UGG 17.0( 12839)

CUU 23.8( 18044)  CCU 14.7( 11102)  CAU 11.6(  8789)  CGU 14.9( 11257)
CUC 25.9( 19634)  CCC 13.8( 10461)  CAC  9.2(  6976)  CGC 21.7( 16452)
CUA  7.3(  5523)  CCA 14.1( 10688)  CAA 23.5( 17812)  CGA 10.1(  7668)
CUG 28.7( 21702)  CCG  9.6(  7280)  CAG 23.2( 17539)  CGG  8.6(  6486)

AUU 20.9( 15859)  ACU  8.9(  6728)  AAU 16.0( 12141)  AGU 11.3(  8544)
AUC 24.4( 18515)  ACC 18.1( 13714)  AAC 14.9( 11309)  AGC 19.0( 14395)
AUA  3.0(  2276)  ACA 10.7(  8134)  AAA 16.6( 12564)  AGA  5.8(  4384)
AUG 20.2( 15334)  ACG 10.9(  8289)  AAG 15.3( 11616)  AGG  5.4(  4113)

GUU 19.9( 15044)  GCU 26.4( 20011)  GAU 32.4( 24575)  GGU 20.6( 15587)
GUC 13.9( 10507)  GCC 30.8( 23358)  GAC 20.1( 15235)  GGC 25.3( 19143)
GUA  5.8(  4363)  GCA 20.7( 15707)  GAA 30.4( 23018)  GGA 20.7( 15688)
GUG 29.8( 22560)  GCG 17.6( 13354)  GAG 27.2( 20628)  GGG 12.8(  9665)

Coding GC 53.44% 1st letter GC 61.51% 2nd letter GC 44.46% 3rd letter GC 54.33%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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