Shewanella sp. MR-7 [gbbct]: 4014 CDS's (1367932 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 26.2( 35798)  UCU  8.7( 11923)  UAU 18.0( 24596)  UGU  5.2(  7155)
UUC 13.5( 18503)  UCC  7.1(  9678)  UAC 12.3( 16848)  UGC  5.1(  7043)
UUA 30.6( 41869)  UCA  8.7( 11919)  UAA  2.0(  2717)  UGA  0.4(   581)
UUG 17.2( 23516)  UCG  9.7( 13277)  UAG  0.5(   716)  UGG 12.6( 17238)

CUU 11.4( 15533)  CCU 10.8( 14764)  CAU 13.1( 17899)  CGU 16.0( 21911)
CUC 16.4( 22387)  CCC 10.6( 14557)  CAC  9.3( 12763)  CGC 16.8( 22964)
CUA  8.9( 12173)  CCA 11.4( 15583)  CAA 30.0( 41098)  CGA  3.5(  4752)
CUG 24.6( 33606)  CCG  8.1( 11048)  CAG 19.3( 26452)  CGG  3.6(  4965)

AUU 28.2( 38602)  ACU 12.9( 17678)  AAU 21.0( 28708)  AGU 12.3( 16884)
AUC 25.4( 34721)  ACC 23.4( 31950)  AAC 19.1( 26096)  AGC 18.2( 24906)
AUA  5.4(  7324)  ACA  7.8( 10678)  AAA 29.9( 40911)  AGA  3.5(  4833)
AUG 25.4( 34723)  ACG  9.4( 12815)  AAG 19.7( 26923)  AGG  2.1(  2934)

GUU 13.9( 18995)  GCU 16.1( 22064)  GAU 36.4( 49749)  GGU 24.6( 33633)
GUC 14.7( 20065)  GCC 36.6( 50016)  GAC 17.2( 23556)  GGC 29.8( 40795)
GUA 10.0( 13630)  GCA 16.4( 22448)  GAA 34.2( 46751)  GGA  6.1(  8308)
GUG 29.4( 40168)  GCG 26.8( 36693)  GAG 23.8( 32551)  GGG  8.8( 11992)

Coding GC 48.94% 1st letter GC 55.84% 2nd letter GC 39.33% 3rd letter GC 51.64%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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