Neurospora crassa [gbpln]: 3953 CDS's (2048035 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 11.8( 24098)  UCU 11.9( 24466)  UAU  8.5( 17342)  UGU  3.4(  6864)
UUC 22.1( 45213)  UCC 20.0( 40934)  UAC 17.5( 35768)  UGC  7.7( 15795)
UUA  2.7(  5596)  UCA  9.2( 18878)  UAA  0.6(  1305)  UGA  0.8(  1606)
UUG 14.9( 30615)  UCG 14.5( 29720)  UAG  0.5(  1105)  UGG 13.1( 26845)

CUU 14.2( 29177)  CCU 15.1( 30898)  CAU  9.5( 19363)  CGU  8.9( 18193)
CUC 26.8( 54859)  CCC 22.4( 45919)  CAC 14.8( 30271)  CGC 17.6( 36131)
CUA  6.0( 12196)  CCA 12.4( 25320)  CAA 17.0( 34722)  CGA  7.1( 14442)
CUG 18.3( 37407)  CCG 14.6( 29827)  CAG 26.0( 53342)  CGG  8.5( 17492)

AUU 14.0( 28668)  ACU 11.2( 22851)  AAU 10.3( 21140)  AGU  8.7( 17740)
AUC 26.5( 54226)  ACC 24.7( 50609)  AAC 27.0( 55293)  AGC 17.4( 35699)
AUA  4.1(  8373)  ACA 10.7( 22008)  AAA 11.7( 23932)  AGA  7.9( 16197)
AUG 21.8( 44655)  ACG 13.5( 27722)  AAG 40.4( 82727)  AGG 11.8( 24252)

GUU 13.8( 28345)  GCU 21.1( 43267)  GAU 24.0( 49136)  GGU 18.3( 37439)
GUC 24.8( 50857)  GCC 36.0( 73666)  GAC 32.5( 66663)  GGC 29.0( 59424)
GUA  5.4( 11060)  GCA 12.6( 25733)  GAA 22.4( 45953)  GGA 13.6( 27770)
GUG 15.5( 31763)  GCG 17.3( 35344)  GAG 42.7( 87418)  GGG 10.9( 22396)

Coding GC 56.07% 1st letter GC 57.90% 2nd letter GC 45.19% 3rd letter GC 65.13%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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