Methanococcus aeolicus Nankai-3 [gbbct]: 1490 CDS's (440704 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 30.5( 13431)  UCU 10.7(  4737)  UAU 34.0( 14981)  UGU  9.8(  4303)
UUC  6.0(  2666)  UCC  6.9(  3027)  UAC  7.3(  3227)  UGC  4.4(  1941)
UUA 45.9( 20208)  UCA 16.6(  7314)  UAA  2.8(  1230)  UGA  0.3(   124)
UUG 16.0(  7055)  UCG  3.1(  1373)  UAG  0.3(   142)  UGG  6.1(  2703)

CUU 12.4(  5462)  CCU  8.7(  3848)  CAU 11.9(  5239)  CGU  0.5(   238)
CUC  3.3(  1462)  CCC  4.5(  1974)  CAC  4.0(  1778)  CGC  0.2(    75)
CUA  7.0(  3079)  CCA 18.8(  8278)  CAA 12.7(  5586)  CGA  2.3(  1015)
CUG  2.2(   981)  CCG  2.6(  1128)  CAG  5.0(  2220)  CGG  0.9(   410)

AUU 44.3( 19541)  ACU 12.2(  5377)  AAU 57.5( 25353)  AGU 11.4(  5020)
AUC  7.4(  3240)  ACC  8.6(  3781)  AAC 12.8(  5652)  AGC  5.4(  2367)
AUA 56.2( 24763)  ACA 23.7( 10435)  AAA 83.5( 36782)  AGA 18.8(  8277)
AUG 25.9( 11397)  ACG  3.7(  1627)  AAG 12.3(  5400)  AGG  6.8(  3007)

GUU 25.2( 11096)  GCU 13.7(  6023)  GAU 44.2( 19494)  GGU 15.0(  6624)
GUC  2.6(  1129)  GCC  9.4(  4139)  GAC 11.9(  5257)  GGC  6.6(  2889)
GUA 24.7( 10901)  GCA 28.0( 12346)  GAA 59.6( 26286)  GGA 34.6( 15268)
GUG  8.3(  3644)  GCG  2.7(  1207)  GAG 15.0(  6599)  GGG 10.3(  4548)
Coding GC 31.29% 1st letter GC 40.89% 2nd letter GC 30.73% 3rd letter GC 22.25%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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