Solanum lycopersicum [gbpln]: 1452 CDS's (634390 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 26.0( 16504)  UCU 21.2( 13464)  UAU 18.6( 11799)  UGU 10.8(  6883)
UUC 17.5( 11123)  UCC  9.9(  6268)  UAC 12.4(  7855)  UGC  6.7(  4223)
UUA 14.4(  9111)  UCA 20.7( 13102)  UAA  0.9(   598)  UGA  0.9(   553)
UUG 24.2( 15336)  UCG  5.6(  3521)  UAG  0.5(   340)  UGG 13.5(  8563)

CUU 24.9( 15814)  CCU 19.2( 12192)  CAU 15.5(  9827)  CGU  6.9(  4404)
CUC 11.2(  7127)  CCC  5.7(  3645)  CAC  7.8(  4926)  CGC  3.1(  1946)
CUA 10.0(  6348)  CCA 19.2( 12205)  CAA 21.0( 13315)  CGA  5.4(  3414)
CUG 10.5(  6665)  CCG  4.6(  2920)  CAG 14.0(  8861)  CGG  3.1(  1981)

AUU 28.2( 17914)  ACU 19.9( 12612)  AAU 30.5( 19339)  AGU 15.2(  9669)
AUC 14.0(  8906)  ACC  8.6(  5464)  AAC 17.3( 11002)  AGC  9.3(  5897)
AUA 14.0(  8893)  ACA 17.9( 11333)  AAA 31.1( 19724)  AGA 16.4( 10398)
AUG 24.7( 15651)  ACG  4.6(  2939)  AAG 31.0( 19651)  AGG 11.9(  7541)

GUU 28.0( 17762)  GCU 30.7( 19474)  GAU 39.3( 24917)  GGU 23.9( 15192)
GUC 10.1(  6382)  GCC 10.1(  6426)  GAC 15.0(  9509)  GGC  9.7(  6165)
GUA 11.2(  7126)  GCA 22.2( 14107)  GAA 34.8( 22053)  GGA 25.6( 16258)
GUG 16.0( 10181)  GCG  5.2(  3327)  GAG 26.6( 16906)  GGG 10.8(  6839)
Coding GC 42.52% 1st letter GC 50.16% 2nd letter GC 39.87% 3rd letter GC 37.53%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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