Methanococcus vannielii SB [gbbct]: 1678 CDS's (491360 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 37.6( 18494)  UCU 13.4(  6585)  UAU 24.6( 12084)  UGU  8.9(  4376)
UUC  5.7(  2802)  UCC  4.7(  2299)  UAC 13.8(  6772)  UGC  4.0(  1988)
UUA 44.3( 21743)  UCA 24.4( 11978)  UAA  2.7(  1346)  UGA  0.3(   144)
UUG  8.4(  4116)  UCG  3.8(  1848)  UAG  0.4(   195)  UGG  6.0(  2943)

CUU 26.4( 12978)  CCU 11.2(  5506)  CAU  9.3(  4569)  CGU  2.4(  1182)
CUC  3.6(  1764)  CCC  3.5(  1715)  CAC  5.9(  2911)  CGC  0.4(   202)
CUA  7.8(  3825)  CCA 15.2(  7478)  CAA 11.6(  5688)  CGA  3.0(  1491)
CUG  2.2(  1078)  CCG  3.5(  1728)  CAG  6.6(  3256)  CGG  1.9(   942)

AUU 53.5( 26290)  ACU 18.3(  8986)  AAU 43.1( 21162)  AGU 12.9(  6333)
AUC 10.1(  4979)  ACC  6.0(  2952)  AAC 16.6(  8164)  AGC  5.1(  2517)
AUA 35.2( 17300)  ACA 18.0(  8835)  AAA 79.4( 39031)  AGA 15.6(  7651)
AUG 23.9( 11764)  ACG  6.1(  2999)  AAG 14.3(  7039)  AGG  8.5(  4169)

GUU 33.3( 16346)  GCU 12.2(  5987)  GAU 37.4( 18391)  GGU 16.3(  8008)
GUC  3.6(  1758)  GCC  3.9(  1899)  GAC 14.6(  7178)  GGC  8.6(  4249)
GUA 25.9( 12740)  GCA 32.8( 16131)  GAA 71.0( 34866)  GGA 30.5( 14964)
GUG  3.9(  1938)  GCG  3.5(  1727)  GAG  8.1(  4004)  GGG 10.1(  4977)

Coding GC 32.23% 1st letter GC 43.04% 2nd letter GC 31.50% 3rd letter GC 22.16%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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