Parvibaculum lavamentivorans DS-1 [gbbct]: 3636 CDS's (1176595 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  8.3(  9710)  UCU  2.4(  2813)  UAU 13.5( 15909)  UGU  1.2(  1427)
UUC 29.7( 35000)  UCC 13.2( 15538)  UAC 10.1( 11872)  UGC  6.8(  8035)
UUA  0.5(   626)  UCA  2.5(  2909)  UAA  0.5(   603)  UGA  1.9(  2224)
UUG  7.6(  8961)  UCG 17.3( 20353)  UAG  0.7(   810)  UGG 13.5( 15902)

CUU 15.5( 18226)  CCU  4.7(  5516)  CAU 11.7( 13808)  CGU  7.6(  8992)
CUC 38.8( 45676)  CCC 16.1( 18936)  CAC  8.8( 10350)  CGC 38.9( 45780)
CUA  1.3(  1533)  CCA  2.7(  3231)  CAA  5.3(  6230)  CGA  2.8(  3312)
CUG 34.8( 40971)  CCG 27.5( 32325)  CAG 22.8( 26863)  CGG 15.6( 18348)

AUU 10.2( 11962)  ACU  2.4(  2825)  AAU 10.5( 12325)  AGU  2.2(  2532)
AUC 37.8( 44518)  ACC 20.1( 23613)  AAC 15.8( 18564)  AGC 14.9( 17494)
AUA  3.3(  3841)  ACA  5.4(  6382)  AAA  9.4( 11056)  AGA  1.7(  1942)
AUG 25.3( 29809)  ACG 23.7( 27833)  AAG 26.7( 31437)  AGG  3.7(  4330)

GUU  8.9( 10474)  GCU  8.2(  9705)  GAU 22.5( 26460)  GGU  9.8( 11523)
GUC 32.8( 38620)  GCC 48.5( 57078)  GAC 34.0( 39985)  GGC 58.5( 68841)
GUA  3.4(  4009)  GCA 12.4( 14616)  GAA 32.6( 38340)  GGA  7.7(  9003)
GUG 26.7( 31392)  GCG 53.5( 62965)  GAG 32.3( 38015)  GGG 10.5( 12317)

Coding GC 62.74% 1st letter GC 65.74% 2nd letter GC 45.78% 3rd letter GC 76.71%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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