Methanococcus maripaludis C5 [gbbct]: 1822 CDS's (515977 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 32.4( 16698)  UCU 12.2(  6314)  UAU 21.1( 10880)  UGU  8.2(  4218)
UUC 10.2(  5245)  UCC  5.2(  2667)  UAC 17.9(  9233)  UGC  4.9(  2530)
UUA 37.6( 19389)  UCA 23.1( 11932)  UAA  2.9(  1509)  UGA  0.3(   165)
UUG 13.0(  6717)  UCG  4.5(  2318)  UAG  0.3(   157)  UGG  6.5(  3339)

CUU 24.2( 12467)  CCU 10.8(  5562)  CAU  7.4(  3822)  CGU  1.7(   888)
CUC  7.7(  3980)  CCC  3.1(  1592)  CAC  7.8(  4042)  CGC  0.5(   250)
CUA  5.6(  2871)  CCA 15.4(  7942)  CAA 10.2(  5240)  CGA  3.0(  1544)
CUG  3.5(  1809)  CCG  3.8(  1948)  CAG  8.7(  4482)  CGG  1.3(   679)

AUU 47.6( 24550)  ACU 16.9(  8737)  AAU 36.6( 18869)  AGU 10.7(  5507)
AUC 17.6(  9099)  ACC  7.6(  3916)  AAC 19.5( 10068)  AGC  6.4(  3288)
AUA 28.8( 14858)  ACA 19.1(  9865)  AAA 78.1( 40308)  AGA 18.6(  9616)
AUG 25.6( 13218)  ACG  5.7(  2957)  AAG 11.0(  5688)  AGG  6.6(  3398)

GUU 34.5( 17783)  GCU 14.0(  7218)  GAU 40.1( 20716)  GGU 16.9(  8710)
GUC  4.7(  2441)  GCC  3.5(  1788)  GAC 16.0(  8251)  GGC  7.9(  4052)
GUA 23.9( 12331)  GCA 33.9( 17512)  GAA 74.7( 38536)  GGA 33.8( 17456)
GUG  5.2(  2658)  GCG  4.8(  2451)  GAG  7.6(  3903)  GGG  7.4(  3800)

Coding GC 33.91% 1st letter GC 44.33% 2nd letter GC 31.82% 3rd letter GC 25.58%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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