Verminephrobacter eiseniae EF01-2 [gbbct]: 4947 CDS's (1660741 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 10.3( 17047)  UCU  2.0(  3303)  UAU  6.1( 10184)  UGU  1.3(  2113)
UUC 23.1( 38329)  UCC  8.9( 14729)  UAC 15.5( 25785)  UGC 10.0( 16660)
UUA  0.4(   729)  UCA  2.1(  3554)  UAA  0.3(   436)  UGA  2.4(  4007)
UUG 15.1( 25041)  UCG 15.5( 25693)  UAG  0.3(   504)  UGG 14.3( 23808)

CUU  3.8(  6357)  CCU  4.0(  6722)  CAU  9.8( 16223)  CGU  5.5(  9198)
CUC 17.7( 29390)  CCC 19.3( 32085)  CAC 14.2( 23650)  CGC 44.5( 73940)
CUA  1.2(  2074)  CCA  4.4(  7234)  CAA 12.4( 20522)  CGA  2.8(  4668)
CUG 69.3(115041)  CCG 26.6( 44147)  CAG 31.0( 51455)  CGG 14.6( 24327)

AUU  7.1( 11859)  ACU  2.2(  3703)  AAU  5.8(  9665)  AGU  3.1(  5076)
AUC 36.1( 60020)  ACC 28.0( 46437)  AAC 19.5( 32380)  AGC 22.1( 36727)
AUA  2.3(  3837)  ACA  3.3(  5538)  AAA  8.7( 14378)  AGA  1.2(  2070)
AUG 24.6( 40869)  ACG 17.7( 29363)  AAG 20.8( 34521)  AGG  3.2(  5306)

GUU  4.1(  6876)  GCU  7.1( 11874)  GAU 15.3( 25358)  GGU  7.6( 12638)
GUC 23.7( 39370)  GCC 66.0(109598)  GAC 35.5( 58973)  GGC 61.4(102044)
GUA  2.3(  3746)  GCA 13.1( 21740)  GAA 19.6( 32507)  GGA  4.4(  7254)
GUG 41.8( 69393)  GCG 45.8( 76107)  GAG 26.0( 43164)  GGG 11.7( 19395)

Coding GC 65.56% 1st letter GC 66.66% 2nd letter GC 47.63% 3rd letter GC 82.39%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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